Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2B7YKW1

Protein Details
Accession A0A2B7YKW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-25ATAVSTKPPAHPPKIKRPPPTFVQHydrophilic
65-84NGANSRPTARPRKESQRSGDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MATAVSTKPPAHPPKIKRPPPTFVQTGVNGIRSSQPSPSPLAAANRTSSMKQSGSVTPTAGAVANGANSRPTARPRKESQRSGDPASRLQRPSAKINGADGANGDRRQSKKFPEPYVKTTSYILNKYSKCTPSLTIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKLIIEHLKAGTVPHDMVEELIKGGVRFYENCLIVRVVDHKSVATQPTPSPTSSSSEKSAPFSLHNYNQHITPSPYVPYPQQNQPHLKPKDDKAQPSPNAASGSSEPIKNRTESSEGSGNGKQQASKPKVFTTVLHPTPQSLQAELTLLSMTPDPRANNRRQSQAYSGSRAGSSNQQPPTPLSALPSSPVLDRAPPAKRQKMMVEPQELLDFEAKLIRATAPPLYLDPVDSLAASEKLLKFLENPLHRARPPSPKTRRRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTTSSGAGGAKSTVDDESGAAPFEPRFSRFKTLENIRMQHEEKAKLEHERKVQQDHTKRQQQEAEREKRRILEQRQAEEQAREDARRQHVAAQQAAVQAQAHAQLAAAQNRRPPSQGSGVIPVGHPQPSQIVNAVTQAQQSSPVVRNTTPHASSPLVGNVMAPQTTQGIPMTMTSSAQGAGSPPQVTAGLQHGHPGVMAHPMVVSRSQQSQSRHGTPQIHQGTPAMSHATPVMRNTTPVQRMTHASPIASTMAHAPAAGHTVMPGQHVNGMGMTPQQQQHAMLQRQHILAQQQGMQLTPQQMAQLHANTHAHQSIQQAQQQQMLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQAQQAQQAQQQQHPNVNLQTQAYQAQLMRVQLAQMQQASQNHQQQGNPAQPSQTPLMPTGQAGNPNDPRTKAMARYNTMYNQHLHRARADMSQRLMPQYGHPAAWPPAIRQQYVDGLEKASKIWIANLMRHEGQQRAQMAAQAQAQAMQQQQQQQQQQQQQQHGLMQNGMGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.8
3 0.84
4 0.85
5 0.84
6 0.81
7 0.79
8 0.78
9 0.71
10 0.64
11 0.61
12 0.52
13 0.52
14 0.47
15 0.42
16 0.34
17 0.31
18 0.34
19 0.31
20 0.31
21 0.29
22 0.29
23 0.29
24 0.34
25 0.34
26 0.3
27 0.31
28 0.36
29 0.36
30 0.35
31 0.34
32 0.34
33 0.35
34 0.34
35 0.34
36 0.32
37 0.29
38 0.28
39 0.3
40 0.32
41 0.33
42 0.34
43 0.31
44 0.26
45 0.25
46 0.23
47 0.19
48 0.14
49 0.1
50 0.09
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.15
57 0.19
58 0.27
59 0.36
60 0.42
61 0.5
62 0.59
63 0.69
64 0.76
65 0.81
66 0.8
67 0.8
68 0.78
69 0.78
70 0.75
71 0.67
72 0.64
73 0.62
74 0.62
75 0.53
76 0.53
77 0.53
78 0.5
79 0.54
80 0.54
81 0.53
82 0.46
83 0.47
84 0.46
85 0.39
86 0.35
87 0.29
88 0.26
89 0.27
90 0.26
91 0.26
92 0.27
93 0.3
94 0.36
95 0.41
96 0.44
97 0.49
98 0.57
99 0.64
100 0.69
101 0.73
102 0.73
103 0.76
104 0.7
105 0.62
106 0.55
107 0.53
108 0.49
109 0.45
110 0.43
111 0.43
112 0.42
113 0.44
114 0.5
115 0.46
116 0.41
117 0.4
118 0.41
119 0.38
120 0.45
121 0.47
122 0.44
123 0.49
124 0.5
125 0.49
126 0.49
127 0.45
128 0.44
129 0.39
130 0.37
131 0.33
132 0.33
133 0.39
134 0.36
135 0.39
136 0.36
137 0.4
138 0.38
139 0.34
140 0.33
141 0.28
142 0.27
143 0.22
144 0.19
145 0.15
146 0.15
147 0.18
148 0.2
149 0.17
150 0.18
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.1
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.15
173 0.22
174 0.23
175 0.23
176 0.25
177 0.24
178 0.22
179 0.23
180 0.22
181 0.18
182 0.19
183 0.19
184 0.17
185 0.19
186 0.22
187 0.23
188 0.2
189 0.2
190 0.2
191 0.26
192 0.28
193 0.26
194 0.25
195 0.24
196 0.27
197 0.29
198 0.31
199 0.28
200 0.3
201 0.31
202 0.31
203 0.32
204 0.29
205 0.27
206 0.28
207 0.32
208 0.35
209 0.39
210 0.4
211 0.39
212 0.38
213 0.38
214 0.36
215 0.32
216 0.27
217 0.24
218 0.21
219 0.21
220 0.22
221 0.24
222 0.28
223 0.31
224 0.36
225 0.42
226 0.47
227 0.54
228 0.59
229 0.65
230 0.61
231 0.63
232 0.61
233 0.6
234 0.62
235 0.61
236 0.61
237 0.59
238 0.66
239 0.62
240 0.61
241 0.57
242 0.5
243 0.45
244 0.38
245 0.32
246 0.23
247 0.27
248 0.23
249 0.24
250 0.22
251 0.24
252 0.26
253 0.25
254 0.25
255 0.23
256 0.25
257 0.24
258 0.28
259 0.29
260 0.28
261 0.31
262 0.31
263 0.29
264 0.29
265 0.29
266 0.25
267 0.25
268 0.34
269 0.36
270 0.39
271 0.4
272 0.38
273 0.42
274 0.42
275 0.39
276 0.36
277 0.4
278 0.37
279 0.37
280 0.35
281 0.31
282 0.32
283 0.35
284 0.28
285 0.19
286 0.17
287 0.15
288 0.16
289 0.15
290 0.13
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.11
298 0.12
299 0.2
300 0.27
301 0.34
302 0.42
303 0.46
304 0.52
305 0.53
306 0.55
307 0.52
308 0.56
309 0.52
310 0.47
311 0.44
312 0.37
313 0.35
314 0.31
315 0.27
316 0.25
317 0.26
318 0.28
319 0.29
320 0.28
321 0.29
322 0.3
323 0.34
324 0.28
325 0.23
326 0.19
327 0.19
328 0.18
329 0.18
330 0.18
331 0.14
332 0.12
333 0.14
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.17
338 0.2
339 0.27
340 0.35
341 0.39
342 0.4
343 0.42
344 0.46
345 0.49
346 0.52
347 0.51
348 0.47
349 0.41
350 0.4
351 0.38
352 0.33
353 0.26
354 0.19
355 0.13
356 0.08
357 0.1
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.1
380 0.09
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.15
386 0.22
387 0.21
388 0.25
389 0.27
390 0.31
391 0.32
392 0.36
393 0.36
394 0.4
395 0.43
396 0.5
397 0.56
398 0.62
399 0.67
400 0.72
401 0.75
402 0.69
403 0.7
404 0.63
405 0.6
406 0.53
407 0.47
408 0.39
409 0.31
410 0.26
411 0.2
412 0.15
413 0.07
414 0.05
415 0.04
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.05
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.08
454 0.08
455 0.1
456 0.12
457 0.15
458 0.22
459 0.22
460 0.26
461 0.31
462 0.35
463 0.41
464 0.42
465 0.42
466 0.38
467 0.41
468 0.39
469 0.37
470 0.36
471 0.3
472 0.27
473 0.28
474 0.27
475 0.3
476 0.32
477 0.32
478 0.34
479 0.38
480 0.39
481 0.41
482 0.45
483 0.47
484 0.52
485 0.56
486 0.59
487 0.61
488 0.6
489 0.59
490 0.59
491 0.56
492 0.57
493 0.58
494 0.59
495 0.57
496 0.58
497 0.55
498 0.51
499 0.51
500 0.5
501 0.45
502 0.43
503 0.43
504 0.44
505 0.46
506 0.47
507 0.43
508 0.35
509 0.31
510 0.28
511 0.23
512 0.21
513 0.2
514 0.23
515 0.25
516 0.27
517 0.26
518 0.27
519 0.29
520 0.32
521 0.3
522 0.25
523 0.23
524 0.21
525 0.21
526 0.15
527 0.12
528 0.08
529 0.07
530 0.08
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.08
535 0.11
536 0.16
537 0.18
538 0.17
539 0.21
540 0.23
541 0.24
542 0.22
543 0.21
544 0.2
545 0.24
546 0.27
547 0.26
548 0.27
549 0.27
550 0.26
551 0.24
552 0.22
553 0.17
554 0.15
555 0.13
556 0.09
557 0.11
558 0.12
559 0.13
560 0.13
561 0.12
562 0.11
563 0.13
564 0.14
565 0.11
566 0.11
567 0.1
568 0.09
569 0.1
570 0.1
571 0.12
572 0.14
573 0.16
574 0.17
575 0.17
576 0.19
577 0.22
578 0.27
579 0.25
580 0.22
581 0.24
582 0.22
583 0.22
584 0.22
585 0.19
586 0.14
587 0.13
588 0.12
589 0.1
590 0.1
591 0.09
592 0.08
593 0.07
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.06
609 0.06
610 0.08
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.09
615 0.1
616 0.09
617 0.1
618 0.12
619 0.11
620 0.11
621 0.13
622 0.12
623 0.12
624 0.12
625 0.11
626 0.08
627 0.1
628 0.09
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.09
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.14
637 0.16
638 0.21
639 0.25
640 0.32
641 0.38
642 0.42
643 0.43
644 0.44
645 0.47
646 0.43
647 0.5
648 0.47
649 0.4
650 0.36
651 0.33
652 0.29
653 0.25
654 0.24
655 0.17
656 0.12
657 0.12
658 0.13
659 0.14
660 0.14
661 0.15
662 0.18
663 0.15
664 0.18
665 0.2
666 0.27
667 0.29
668 0.31
669 0.32
670 0.29
671 0.33
672 0.34
673 0.37
674 0.3
675 0.26
676 0.23
677 0.23
678 0.21
679 0.17
680 0.15
681 0.1
682 0.1
683 0.1
684 0.1
685 0.08
686 0.08
687 0.1
688 0.1
689 0.08
690 0.07
691 0.08
692 0.09
693 0.11
694 0.1
695 0.09
696 0.11
697 0.11
698 0.11
699 0.1
700 0.09
701 0.08
702 0.09
703 0.11
704 0.13
705 0.14
706 0.15
707 0.16
708 0.17
709 0.22
710 0.3
711 0.33
712 0.33
713 0.35
714 0.37
715 0.37
716 0.37
717 0.34
718 0.27
719 0.24
720 0.22
721 0.22
722 0.2
723 0.2
724 0.19
725 0.17
726 0.17
727 0.17
728 0.15
729 0.13
730 0.13
731 0.13
732 0.16
733 0.18
734 0.18
735 0.17
736 0.21
737 0.22
738 0.21
739 0.24
740 0.22
741 0.19
742 0.19
743 0.22
744 0.26
745 0.29
746 0.32
747 0.33
748 0.33
749 0.37
750 0.36
751 0.34
752 0.33
753 0.33
754 0.32
755 0.34
756 0.41
757 0.43
758 0.49
759 0.53
760 0.53
761 0.56
762 0.62
763 0.64
764 0.65
765 0.66
766 0.67
767 0.69
768 0.71
769 0.7
770 0.69
771 0.66
772 0.63
773 0.62
774 0.59
775 0.53
776 0.5
777 0.48
778 0.43
779 0.43
780 0.44
781 0.4
782 0.41
783 0.46
784 0.45
785 0.46
786 0.45
787 0.44
788 0.4
789 0.39
790 0.36
791 0.29
792 0.27
793 0.24
794 0.23
795 0.19
796 0.19
797 0.17
798 0.18
799 0.19
800 0.18
801 0.17
802 0.16
803 0.16
804 0.16
805 0.17
806 0.18
807 0.16
808 0.17
809 0.2
810 0.22
811 0.28
812 0.33
813 0.38
814 0.4
815 0.42
816 0.41
817 0.43
818 0.47
819 0.48
820 0.44
821 0.38
822 0.35
823 0.33
824 0.37
825 0.34
826 0.29
827 0.24
828 0.22
829 0.25
830 0.23
831 0.23
832 0.23
833 0.22
834 0.26
835 0.27
836 0.33
837 0.36
838 0.4
839 0.43
840 0.4
841 0.4
842 0.4
843 0.42
844 0.41
845 0.44
846 0.48
847 0.49
848 0.52
849 0.54
850 0.55
851 0.54
852 0.5
853 0.45
854 0.41
855 0.46
856 0.47
857 0.44
858 0.4
859 0.4
860 0.39
861 0.43
862 0.44
863 0.41
864 0.39
865 0.43
866 0.43
867 0.42
868 0.41
869 0.34
870 0.32
871 0.35
872 0.34
873 0.29
874 0.27
875 0.29
876 0.3
877 0.34
878 0.32
879 0.27
880 0.33
881 0.36
882 0.36
883 0.33
884 0.34
885 0.36
886 0.38
887 0.39
888 0.32
889 0.31
890 0.32
891 0.31
892 0.27
893 0.22
894 0.2
895 0.16
896 0.17
897 0.23
898 0.24
899 0.29
900 0.32
901 0.36
902 0.35
903 0.38
904 0.4
905 0.36
906 0.36
907 0.37
908 0.36
909 0.33
910 0.32
911 0.32
912 0.3
913 0.3
914 0.29
915 0.24
916 0.22
917 0.21
918 0.21
919 0.22
920 0.22
921 0.23
922 0.24
923 0.3
924 0.37
925 0.42
926 0.5
927 0.54
928 0.6
929 0.63
930 0.69
931 0.68
932 0.69
933 0.67
934 0.62
935 0.61
936 0.57
937 0.51
938 0.44