Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2B7YQ28

Protein Details
Accession A0A2B7YQ28    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-359GGTPIRRKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
442-469GGWSDRSKQAKRKGAKGKRGKNGNEALGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
344-349RRKKRK
448-462SKQAKRKGAKGKRGK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRKQWIDKKSATTYQLFHRPQHDPLIHDPEAQDRVLHRVAGPPPPTTTSESSSSSSKISKHLADLEEEFEGAGVRKNEGEAANYGVYYDDSKYDYMQHMRDLGEGGGHFVEVAAKGKGKAKQMSLEDALRQSTLDDVDASISMRGPGSLYDADGLSTASTFSRKPTYEDQQNIPDTISGFQPDMDPRLREALEALEDEEFVEMGSDEDIFAELVKGGDTAEMDPSDWRDTYIEDDEDDGWESDVTEKAPVQHSTSTTTTTHLPEDIEDGGVSLKKKTVPDDTNIPDTTPTDDDWLKNFAQYKKDMKSSTKKPITPSARGMDNASDLRSAASTMFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSIARTEGHRLLDDRFERIEALYTLDEEGDEFLDDGSSMVDGVSVVSGMSKFSQAPSLVSEGGSVALREDFDSIMDGFLGGWSDRSKQAKRKGAKGKRGKNGNEALGIMMLDEVREGLGPARVRGKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.59
3 0.57
4 0.61
5 0.57
6 0.53
7 0.53
8 0.52
9 0.51
10 0.58
11 0.53
12 0.47
13 0.5
14 0.55
15 0.49
16 0.47
17 0.43
18 0.39
19 0.39
20 0.34
21 0.29
22 0.21
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.21
27 0.25
28 0.29
29 0.35
30 0.36
31 0.32
32 0.34
33 0.36
34 0.39
35 0.37
36 0.37
37 0.33
38 0.35
39 0.36
40 0.35
41 0.34
42 0.32
43 0.3
44 0.29
45 0.27
46 0.28
47 0.3
48 0.3
49 0.32
50 0.37
51 0.35
52 0.36
53 0.35
54 0.32
55 0.27
56 0.25
57 0.2
58 0.14
59 0.13
60 0.1
61 0.12
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.16
67 0.16
68 0.18
69 0.15
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.17
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.16
83 0.2
84 0.23
85 0.24
86 0.24
87 0.25
88 0.25
89 0.25
90 0.23
91 0.18
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.11
105 0.17
106 0.21
107 0.27
108 0.31
109 0.32
110 0.38
111 0.4
112 0.44
113 0.42
114 0.39
115 0.35
116 0.32
117 0.29
118 0.23
119 0.2
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.09
151 0.15
152 0.16
153 0.2
154 0.27
155 0.35
156 0.42
157 0.46
158 0.48
159 0.48
160 0.49
161 0.45
162 0.38
163 0.3
164 0.23
165 0.19
166 0.16
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.18
177 0.18
178 0.16
179 0.15
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.12
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.08
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.19
243 0.19
244 0.2
245 0.18
246 0.19
247 0.19
248 0.18
249 0.17
250 0.14
251 0.13
252 0.1
253 0.12
254 0.11
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.11
264 0.12
265 0.15
266 0.23
267 0.23
268 0.26
269 0.34
270 0.35
271 0.37
272 0.37
273 0.34
274 0.26
275 0.24
276 0.24
277 0.17
278 0.15
279 0.13
280 0.14
281 0.15
282 0.16
283 0.18
284 0.16
285 0.17
286 0.22
287 0.23
288 0.25
289 0.3
290 0.35
291 0.35
292 0.41
293 0.42
294 0.44
295 0.5
296 0.54
297 0.6
298 0.61
299 0.6
300 0.58
301 0.65
302 0.64
303 0.6
304 0.58
305 0.5
306 0.45
307 0.43
308 0.4
309 0.31
310 0.28
311 0.24
312 0.19
313 0.15
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.1
327 0.12
328 0.19
329 0.26
330 0.36
331 0.43
332 0.48
333 0.57
334 0.64
335 0.72
336 0.76
337 0.78
338 0.78
339 0.8
340 0.81
341 0.72
342 0.65
343 0.54
344 0.44
345 0.35
346 0.26
347 0.19
348 0.15
349 0.14
350 0.12
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.19
356 0.21
357 0.22
358 0.23
359 0.24
360 0.25
361 0.32
362 0.31
363 0.27
364 0.25
365 0.24
366 0.22
367 0.21
368 0.22
369 0.14
370 0.16
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.09
377 0.09
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.1
402 0.15
403 0.14
404 0.16
405 0.17
406 0.2
407 0.19
408 0.19
409 0.18
410 0.13
411 0.14
412 0.13
413 0.1
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.06
430 0.08
431 0.09
432 0.12
433 0.19
434 0.27
435 0.35
436 0.43
437 0.53
438 0.61
439 0.67
440 0.74
441 0.79
442 0.82
443 0.85
444 0.87
445 0.87
446 0.87
447 0.9
448 0.85
449 0.83
450 0.81
451 0.74
452 0.66
453 0.56
454 0.47
455 0.37
456 0.31
457 0.22
458 0.14
459 0.1
460 0.07
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.07
467 0.13
468 0.14
469 0.18