FuNGI

J3PI81

Protein Details

Accession

J3PI81

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-51	TEAPTASRKLDKKSKKEKKRVRDDEESTTPRKHKRSKSEAVPAVE	Hydrophilic
56-86	NTDEEATRPKKDKKKKKHRKSKDVTDPVAPE	Basic
95-121	VPETPIKAKKPQKEKRRNKESAEDQPE	Hydrophilic
130-153	ADVEVPQKKKRSRRKPQADEIAQS	Hydrophilic
446-469	ALLAKEKERERARRVRNNRSGMLT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-43	RKLDKKSKKEKKRVRDDEESTTPRKHKRSK
63-77	RPKKDKKKKKHRKSK
101-113	KAKKPQKEKRRNK
137-144	KKKRSRRK
453-459	ERERARR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MPSAVDTEAPTASRKLDKKSKKEKKRVRDDEESTTPRKHKRSKSEAVPAVEVTEQNTDEEATRPKKDKKKKKHRKSKDVTDPVAPEPEPADTEVVPETPIKAKKPQKEKRRNKESAEDQPEAVGEPEEGADVEVPQKKKRSRRKPQADEIAQSPQPQDARDNSGEPDNDGMDVDDIAVQAAGGVLQPAHAPANPVFPFVTQTVSLYVPLFPSGFDQPLTKVAEQHLKPLLNHYSPLLKGVLLDYRHVTLAETPTRADPRAPPTDRTPTVLVCRDEYAVGFGWLTAEVYLFRPRRGAWMEGTVNLHSEGHLGVVCWGRFNASLEARRVPRGWRFVDVVQRAEDAKKARFRNAGKKTAAAVADDASVASWQVNGQDGPNNNNNEDEAPEDLENSLQQMHATGYWIDAEGRRVQGKLRFRIKNYDVGTAGDHGYISIEGTMLDEDAERALLAKEKERERARRVRNNRSGMLTREMRPVPKFSVTNFGPEDDEDDGPKKQPMYFASRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.38
3	0.47
4	0.57
5	0.65
6	0.75
7	0.83
8	0.86
9	0.92
10	0.93
11	0.94
12	0.95
13	0.95
14	0.92
15	0.92
16	0.87
17	0.84
18	0.84
19	0.79
20	0.72
21	0.68
22	0.67
23	0.65
24	0.69
25	0.7
26	0.7
27	0.75
28	0.8
29	0.83
30	0.86
31	0.88
32	0.85
33	0.79
34	0.72
35	0.61
36	0.53
37	0.44
38	0.34
39	0.25
40	0.21
41	0.18
42	0.16
43	0.16
44	0.14
45	0.14
46	0.17
47	0.23
48	0.25
49	0.31
50	0.38
51	0.47
52	0.57
53	0.67
54	0.75
55	0.78
56	0.85
57	0.9
58	0.94
59	0.96
60	0.97
61	0.97
62	0.97
63	0.96
64	0.96
65	0.95
66	0.87
67	0.82
68	0.74
69	0.65
70	0.59
71	0.47
72	0.37
73	0.27
74	0.25
75	0.19
76	0.17
77	0.17
78	0.12
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.17
86	0.21
87	0.23
88	0.32
89	0.4
90	0.48
91	0.59
92	0.67
93	0.71
94	0.79
95	0.87
96	0.89
97	0.92
98	0.91
99	0.86
100	0.86
101	0.84
102	0.83
103	0.8
104	0.7
105	0.59
106	0.51
107	0.45
108	0.35
109	0.27
110	0.16
111	0.08
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.1
120	0.15
121	0.17
122	0.22
123	0.3
124	0.37
125	0.47
126	0.58
127	0.64
128	0.71
129	0.8
130	0.87
131	0.89
132	0.92
133	0.93
134	0.87
135	0.78
136	0.7
137	0.65
138	0.54
139	0.46
140	0.36
141	0.28
142	0.24
143	0.22
144	0.22
145	0.18
146	0.24
147	0.24
148	0.25
149	0.24
150	0.27
151	0.26
152	0.23
153	0.21
154	0.15
155	0.13
156	0.12
157	0.11
158	0.07
159	0.06
160	0.06
161	0.05
162	0.05
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.02
170	0.02
171	0.02
172	0.03
173	0.03
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.08
178	0.08
179	0.16
180	0.16
181	0.17
182	0.16
183	0.16
184	0.18
185	0.16
186	0.18
187	0.1
188	0.11
189	0.12
190	0.12
191	0.12
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.09
196	0.08
197	0.07
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.1
204	0.15
205	0.18
206	0.15
207	0.15
208	0.17
209	0.24
210	0.24
211	0.27
212	0.28
213	0.26
214	0.26
215	0.29
216	0.31
217	0.24
218	0.24
219	0.21
220	0.2
221	0.18
222	0.2
223	0.15
224	0.11
225	0.1
226	0.11
227	0.14
228	0.11
229	0.12
230	0.11
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.09
236	0.13
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.15
241	0.17
242	0.17
243	0.16
244	0.15
245	0.19
246	0.28
247	0.3
248	0.3
249	0.33
250	0.41
251	0.4
252	0.4
253	0.35
254	0.28
255	0.3
256	0.32
257	0.29
258	0.22
259	0.22
260	0.19
261	0.18
262	0.16
263	0.14
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.06
275	0.14
276	0.14
277	0.15
278	0.16
279	0.16
280	0.22
281	0.24
282	0.25
283	0.19
284	0.25
285	0.26
286	0.26
287	0.28
288	0.22
289	0.2
290	0.18
291	0.16
292	0.09
293	0.09
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.07
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.14
306	0.16
307	0.18
308	0.22
309	0.24
310	0.29
311	0.29
312	0.31
313	0.3
314	0.3
315	0.31
316	0.34
317	0.34
318	0.32
319	0.34
320	0.35
321	0.43
322	0.41
323	0.36
324	0.3
325	0.29
326	0.27
327	0.24
328	0.25
329	0.2
330	0.23
331	0.29
332	0.3
333	0.35
334	0.42
335	0.47
336	0.55
337	0.6
338	0.62
339	0.57
340	0.56
341	0.52
342	0.49
343	0.43
344	0.33
345	0.25
346	0.17
347	0.16
348	0.13
349	0.11
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.13
361	0.14
362	0.19
363	0.25
364	0.27
365	0.26
366	0.26
367	0.26
368	0.22
369	0.21
370	0.18
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.11
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.09
389	0.09
390	0.1
391	0.1
392	0.13
393	0.15
394	0.18
395	0.19
396	0.19
397	0.23
398	0.29
399	0.37
400	0.44
401	0.5
402	0.54
403	0.56
404	0.66
405	0.64
406	0.66
407	0.6
408	0.56
409	0.47
410	0.41
411	0.39
412	0.31
413	0.28
414	0.2
415	0.17
416	0.11
417	0.11
418	0.09
419	0.08
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.06
427	0.05
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.06
433	0.07
434	0.11
435	0.13
436	0.19
437	0.27
438	0.31
439	0.4
440	0.49
441	0.57
442	0.61
443	0.7
444	0.74
445	0.78
446	0.84
447	0.86
448	0.87
449	0.86
450	0.81
451	0.79
452	0.74
453	0.67
454	0.66
455	0.6
456	0.53
457	0.53
458	0.52
459	0.5
460	0.48
461	0.48
462	0.45
463	0.46
464	0.45
465	0.39
466	0.45
467	0.4
468	0.44
469	0.41
470	0.38
471	0.32
472	0.3
473	0.31
474	0.25
475	0.25
476	0.21
477	0.23
478	0.23
479	0.24
480	0.26
481	0.25
482	0.23
483	0.28
484	0.3
485	0.37
486	0.41
487	0.48
488	0.49
489	0.51

J3PI81

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer