FuNGI

J3NYK6

Protein Details

Accession

J3NYK6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-107	GSLFSSQKPRPRKEQQASSTT	Hydrophilic
182-225	VRSSKKYTAPRTKQPQAKKRPGGDEEPPRKPKVRPPKRPNGSVV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
189-220	TAPRTKQPQAKKRPGGDEEPPRKPKVRPPKRP

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 12, cyto_nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MPPLSRHGVNQLLSMVNGRPRRSAARPPLGDEPSSSPIRASPEEEPSSPTAQPVDDEALINAPPESSSDEDNDDASRSVSTKGDIKGSLFSSQKPRPRKEQQASSTTSAAETTSAKARSEQGLRKSPERASRRLSSKAKNDQKAGVDVSDDEIDAVDQPTKRPEKSRTKSELGAHLEAQIFVRSSKKYTAPRTKQPQAKKRPGGDEEPPRKPKVRPPKRPNGSVVDAAAGPATKRPRFIMPVDSEAPDTPAGTRFKAFDSVISPPSGDSKKPSFKGRPVTDSPLRGGAKFKMLDLDTEDDKSPTSRQKEPLAKSRGRALSVSSSSSSLTELESVQSDGPDLCPMCDAPIDADLLDGLTAITMSIAKQQKICQLHKRREANAQWKEKGYPTIDWDLLESRFERQHDHLDKVLRAEVDSHYRDVYSRRVDSGKGRTLLTSEKEAGGSLTPGYYGFRGARLMSEWLIRRFSASLRKRAVKDRLVAARGHTTYVQSVLVPELAARLVAEDLKIKPEAARDVLRESARLGELVHEELRDVVRNEPSDGEDGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.24
3	0.25
4	0.3
5	0.3
6	0.3
7	0.34
8	0.41
9	0.46
10	0.53
11	0.56
12	0.61
13	0.62
14	0.64
15	0.68
16	0.64
17	0.58
18	0.5
19	0.46
20	0.41
21	0.4
22	0.35
23	0.27
24	0.26
25	0.31
26	0.31
27	0.29
28	0.28
29	0.34
30	0.39
31	0.39
32	0.4
33	0.38
34	0.39
35	0.34
36	0.31
37	0.24
38	0.2
39	0.2
40	0.19
41	0.19
42	0.17
43	0.17
44	0.16
45	0.16
46	0.16
47	0.15
48	0.12
49	0.08
50	0.07
51	0.08
52	0.12
53	0.12
54	0.14
55	0.16
56	0.19
57	0.19
58	0.2
59	0.2
60	0.17
61	0.16
62	0.14
63	0.13
64	0.11
65	0.13
66	0.13
67	0.14
68	0.19
69	0.2
70	0.24
71	0.24
72	0.25
73	0.27
74	0.28
75	0.31
76	0.27
77	0.3
78	0.35
79	0.42
80	0.48
81	0.54
82	0.57
83	0.62
84	0.7
85	0.77
86	0.78
87	0.81
88	0.8
89	0.79
90	0.78
91	0.72
92	0.63
93	0.52
94	0.42
95	0.32
96	0.24
97	0.18
98	0.13
99	0.12
100	0.16
101	0.18
102	0.18
103	0.2
104	0.22
105	0.27
106	0.34
107	0.39
108	0.41
109	0.49
110	0.52
111	0.54
112	0.55
113	0.55
114	0.57
115	0.56
116	0.54
117	0.52
118	0.56
119	0.58
120	0.63
121	0.66
122	0.64
123	0.68
124	0.73
125	0.75
126	0.73
127	0.71
128	0.66
129	0.61
130	0.56
131	0.48
132	0.37
133	0.28
134	0.22
135	0.21
136	0.16
137	0.13
138	0.09
139	0.08
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.18
147	0.22
148	0.24
149	0.3
150	0.39
151	0.48
152	0.55
153	0.64
154	0.64
155	0.65
156	0.68
157	0.66
158	0.64
159	0.58
160	0.53
161	0.43
162	0.38
163	0.33
164	0.28
165	0.25
166	0.17
167	0.12
168	0.11
169	0.14
170	0.12
171	0.14
172	0.18
173	0.24
174	0.31
175	0.41
176	0.52
177	0.56
178	0.65
179	0.72
180	0.77
181	0.78
182	0.8
183	0.8
184	0.8
185	0.83
186	0.81
187	0.77
188	0.76
189	0.72
190	0.67
191	0.65
192	0.65
193	0.63
194	0.64
195	0.62
196	0.58
197	0.57
198	0.54
199	0.56
200	0.56
201	0.59
202	0.62
203	0.67
204	0.75
205	0.79
206	0.81
207	0.77
208	0.72
209	0.64
210	0.55
211	0.45
212	0.35
213	0.28
214	0.22
215	0.18
216	0.11
217	0.07
218	0.09
219	0.14
220	0.13
221	0.15
222	0.17
223	0.2
224	0.24
225	0.26
226	0.3
227	0.28
228	0.32
229	0.32
230	0.31
231	0.28
232	0.25
233	0.24
234	0.16
235	0.13
236	0.09
237	0.12
238	0.13
239	0.13
240	0.14
241	0.13
242	0.14
243	0.17
244	0.17
245	0.13
246	0.15
247	0.17
248	0.17
249	0.16
250	0.15
251	0.12
252	0.17
253	0.16
254	0.14
255	0.15
256	0.2
257	0.27
258	0.3
259	0.36
260	0.37
261	0.42
262	0.51
263	0.5
264	0.51
265	0.48
266	0.52
267	0.49
268	0.46
269	0.4
270	0.38
271	0.35
272	0.29
273	0.27
274	0.21
275	0.23
276	0.21
277	0.2
278	0.17
279	0.16
280	0.16
281	0.17
282	0.18
283	0.14
284	0.16
285	0.16
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.14
290	0.17
291	0.21
292	0.25
293	0.28
294	0.37
295	0.45
296	0.48
297	0.55
298	0.57
299	0.55
300	0.51
301	0.55
302	0.49
303	0.42
304	0.38
305	0.31
306	0.29
307	0.28
308	0.28
309	0.21
310	0.19
311	0.18
312	0.17
313	0.16
314	0.1
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.06
325	0.07
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.03
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.03
349	0.03
350	0.11
351	0.14
352	0.15
353	0.17
354	0.2
355	0.27
356	0.35
357	0.41
358	0.44
359	0.51
360	0.6
361	0.67
362	0.72
363	0.68
364	0.7
365	0.73
366	0.73
367	0.72
368	0.71
369	0.65
370	0.6
371	0.59
372	0.52
373	0.48
374	0.4
375	0.33
376	0.29
377	0.31
378	0.29
379	0.27
380	0.27
381	0.24
382	0.22
383	0.21
384	0.17
385	0.15
386	0.18
387	0.18
388	0.21
389	0.21
390	0.31
391	0.34
392	0.37
393	0.38
394	0.4
395	0.4
396	0.38
397	0.38
398	0.28
399	0.24
400	0.22
401	0.21
402	0.24
403	0.25
404	0.24
405	0.21
406	0.21
407	0.23
408	0.23
409	0.28
410	0.27
411	0.27
412	0.29
413	0.31
414	0.33
415	0.39
416	0.45
417	0.45
418	0.41
419	0.4
420	0.36
421	0.37
422	0.39
423	0.35
424	0.31
425	0.25
426	0.24
427	0.23
428	0.23
429	0.21
430	0.17
431	0.14
432	0.1
433	0.08
434	0.07
435	0.08
436	0.09
437	0.08
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.14
442	0.14
443	0.15
444	0.16
445	0.18
446	0.17
447	0.22
448	0.25
449	0.27
450	0.29
451	0.27
452	0.27
453	0.25
454	0.29
455	0.34
456	0.36
457	0.43
458	0.49
459	0.57
460	0.59
461	0.67
462	0.71
463	0.68
464	0.66
465	0.66
466	0.66
467	0.61
468	0.57
469	0.51
470	0.51
471	0.44
472	0.41
473	0.33
474	0.27
475	0.25
476	0.26
477	0.23
478	0.15
479	0.15
480	0.14
481	0.13
482	0.11
483	0.1
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.07
489	0.07
490	0.08
491	0.09
492	0.12
493	0.13
494	0.17
495	0.18
496	0.17
497	0.18
498	0.22
499	0.26
500	0.28
501	0.32
502	0.31
503	0.35
504	0.4
505	0.4
506	0.36
507	0.32
508	0.31
509	0.26
510	0.24
511	0.2
512	0.18
513	0.19
514	0.22
515	0.22
516	0.18
517	0.17
518	0.19
519	0.21
520	0.22
521	0.21
522	0.22
523	0.27
524	0.29
525	0.3
526	0.3
527	0.31

J3NYK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer