Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NRF3

Protein Details
Accession J3NRF3    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MARRRSKRRTHVTAPNPNQAKHydrophilic
371-415ELKAMEKRWEQKRQEKAARQKEQKANVERKKKEKEEERKKTGRGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-250KRLGAAERILNSKKGKKG
373-415KAMEKRWEQKRQEKAARQKEQKANVERKKKEKEEERKKTGRGS
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARRRSKRRTHVTAPNPNQAKGPINTGNASIRDPKSMVIRIGAGEVGSSVSQLAADVRRVMEPGTASRLKERRANRLKDYLVMCGPLGVTHLLLFSRSESGNVNLRVALAPRGPTLHFRVEKYSLAKDVQRSQRRPKGAGKEYITPPLLVMNNFSSPAADAQSKVPKHLESLTTTVFQSLFAPINPQTTPLKSIRRVLLLNREPSKEEDGSFILNFRHYAITTRAAGISKPLKRLGAAERILNSKKGKKGGLPNLGKLQDIADFMIGGEDGSGYMTDGTSGSEAETDAEVEILESAPRKVLSAKARAAARGADGADGDHNEGAPENDNVERRAVKLVELGPRMRLRLLKVEEGVCAGKVMWHEYIHKSKEELKAMEKRWEQKRQEKAARQKEQKANVERKKKEKEEERKKTGRGSGNKNGQDEMDVDESDDDDYDDGFDSEGLEGDAETQVNGRMEEDGEWEDEEEEIAGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.87
3 0.8
4 0.71
5 0.63
6 0.57
7 0.52
8 0.43
9 0.43
10 0.39
11 0.38
12 0.38
13 0.39
14 0.4
15 0.35
16 0.36
17 0.37
18 0.32
19 0.33
20 0.32
21 0.32
22 0.34
23 0.36
24 0.34
25 0.28
26 0.28
27 0.25
28 0.26
29 0.23
30 0.16
31 0.12
32 0.1
33 0.09
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.09
41 0.1
42 0.11
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.23
52 0.25
53 0.25
54 0.34
55 0.38
56 0.4
57 0.45
58 0.48
59 0.52
60 0.59
61 0.66
62 0.64
63 0.68
64 0.66
65 0.65
66 0.61
67 0.54
68 0.45
69 0.39
70 0.31
71 0.23
72 0.21
73 0.14
74 0.14
75 0.09
76 0.08
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.2
92 0.21
93 0.21
94 0.2
95 0.2
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.17
100 0.17
101 0.2
102 0.24
103 0.3
104 0.31
105 0.32
106 0.36
107 0.37
108 0.4
109 0.4
110 0.38
111 0.32
112 0.32
113 0.33
114 0.32
115 0.38
116 0.44
117 0.5
118 0.54
119 0.61
120 0.67
121 0.68
122 0.69
123 0.69
124 0.69
125 0.67
126 0.68
127 0.62
128 0.62
129 0.59
130 0.59
131 0.51
132 0.41
133 0.33
134 0.29
135 0.26
136 0.19
137 0.19
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.15
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.14
149 0.21
150 0.21
151 0.23
152 0.24
153 0.22
154 0.24
155 0.26
156 0.25
157 0.2
158 0.24
159 0.23
160 0.23
161 0.22
162 0.21
163 0.17
164 0.15
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.11
170 0.11
171 0.14
172 0.13
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.2
177 0.22
178 0.28
179 0.28
180 0.33
181 0.33
182 0.35
183 0.35
184 0.34
185 0.4
186 0.38
187 0.43
188 0.41
189 0.4
190 0.38
191 0.39
192 0.4
193 0.3
194 0.25
195 0.2
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.15
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.11
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.14
214 0.16
215 0.21
216 0.2
217 0.22
218 0.23
219 0.22
220 0.22
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.25
225 0.24
226 0.24
227 0.28
228 0.29
229 0.3
230 0.28
231 0.26
232 0.28
233 0.3
234 0.3
235 0.31
236 0.4
237 0.45
238 0.52
239 0.49
240 0.48
241 0.5
242 0.49
243 0.43
244 0.34
245 0.26
246 0.17
247 0.15
248 0.13
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.04
255 0.03
256 0.03
257 0.02
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.14
288 0.2
289 0.26
290 0.28
291 0.32
292 0.33
293 0.33
294 0.33
295 0.27
296 0.22
297 0.17
298 0.15
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.2
320 0.18
321 0.16
322 0.19
323 0.22
324 0.27
325 0.29
326 0.29
327 0.3
328 0.31
329 0.32
330 0.3
331 0.28
332 0.25
333 0.3
334 0.33
335 0.32
336 0.33
337 0.33
338 0.31
339 0.31
340 0.28
341 0.19
342 0.16
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.18
350 0.24
351 0.32
352 0.33
353 0.34
354 0.33
355 0.38
356 0.44
357 0.46
358 0.43
359 0.43
360 0.49
361 0.51
362 0.58
363 0.56
364 0.58
365 0.61
366 0.68
367 0.69
368 0.69
369 0.76
370 0.78
371 0.82
372 0.83
373 0.85
374 0.86
375 0.88
376 0.87
377 0.87
378 0.85
379 0.84
380 0.84
381 0.83
382 0.83
383 0.82
384 0.84
385 0.81
386 0.83
387 0.84
388 0.82
389 0.82
390 0.82
391 0.84
392 0.85
393 0.88
394 0.88
395 0.86
396 0.82
397 0.79
398 0.77
399 0.75
400 0.73
401 0.72
402 0.72
403 0.74
404 0.75
405 0.69
406 0.62
407 0.53
408 0.45
409 0.36
410 0.31
411 0.23
412 0.18
413 0.17
414 0.16
415 0.16
416 0.14
417 0.13
418 0.09
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.08
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.12
441 0.12
442 0.13
443 0.14
444 0.17
445 0.15
446 0.15
447 0.16
448 0.16
449 0.15
450 0.14
451 0.13