Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P1F0

Protein Details
Accession J3P1F0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
856-876TASPPGPKLRRRSRSEDKSGAHydrophilic
1146-1168RAGPRVDRKNYHHLWRRRHLGRVBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 9, nucl 8.5, cyto_nucl 6.5, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MSGPRADTRDCARQTPPPRLKHASGARHHQLGILLCCGAAQLTTLCVTGQWVHCCLLCPSCSLFHTLDRYSPERVFQYLRSCHRLRAHLITMGFPFVYICDLLQLLEDNAPSRVKSDASIIRQWFVCHQNDLNRNDVDLCAVASTLLPARRPDRVYGIQARSLGNIVARALCLGRSRIEQLKQYERPGSGRDLAESVEAILAETPNSLDSERPVCVEEIDATLHAIAAKSRFSSPAVRSSLRGSPKARDVHAPLQSLYRRLDPMPAKWLTRLILKDFSPVDLDSAPVLRLLDTLLPVLLKIYDDLPTAIDRLRHAREASRMATPALTAAELAGQFKPMLGVKVGRQPWLKGRSIKHCLQMGHGRMSVEKKMDGEYCQVHIDLSKGANCIQIFSKSGKDSTRDRANLHPAISASLALGKEECRLQKGCILEGELVVYNQRDGKILPFEKIRKHVSRSGSFFHRSALDSQAHPWEKLMIVYYDVLVVDDESLLGACHSERFRRLSQLVIATPGVAELVKREVIDFGWHLGAFKLRQAFARCITAREEGLVLKPDDPYFDFGGIRRPYSCSAIKLKKEYIGGFGDVGDFAVVGARYDPVAAKSYHLPGLKWTHFYVGCLDNKRDVLRCNAKPRFMVTNVVELNSSQIEHFRLYVNPESLQPEKNKTTTLHFEPGIDDGKRPSVIFPSPPVFDIRCFSFIREGNVSYHTPRFPMVTKVHCDRAWRDVIEFEELQRLAREENEAAAPDDSQELVDWITRLEAADPGGVAVDAISQQTGCSRQTTSQESLFSARLGDVPPAPASPALPSSPHHQGDATSDETNAWSTAKSPNAAPVVDLTLSPCRNQRKRPSQDGDGPHTVTASPPGPKLRRRSRSEDKSGAVSPTMTQSHPPPSTSRRGPLEDMTASSSDRTNSHPVGQNPDGKKSPVQQAESSQQPRLPESPFGVPAHQTAGGVGTVTSAGEYSGVKHASNGGARHPLPLDVEGLPLAGSAGVCKHHGKDCTLGEYVFLLAPCIAQTPWVTEDLLQGHGVYSFETDMNRWSRLYLSQSAAPAPPCDGSPNTRRSSAAALIEERAQRRRANRPRLMVLVEPRREEASASFLTRLKALRQEGESAGAGGGRCEYAGVFDWRILEDVAEQEARTVSAEGRGQRAGPRVDRKNYHHLWRRRHLGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.63
3 0.65
4 0.63
5 0.68
6 0.71
7 0.7
8 0.71
9 0.73
10 0.72
11 0.7
12 0.73
13 0.7
14 0.66
15 0.62
16 0.54
17 0.48
18 0.44
19 0.39
20 0.31
21 0.24
22 0.2
23 0.2
24 0.18
25 0.14
26 0.08
27 0.07
28 0.06
29 0.07
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.16
36 0.21
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.26
41 0.29
42 0.29
43 0.28
44 0.24
45 0.23
46 0.24
47 0.26
48 0.26
49 0.29
50 0.28
51 0.29
52 0.34
53 0.33
54 0.35
55 0.37
56 0.39
57 0.4
58 0.39
59 0.38
60 0.35
61 0.37
62 0.36
63 0.35
64 0.41
65 0.45
66 0.5
67 0.54
68 0.53
69 0.57
70 0.61
71 0.62
72 0.59
73 0.58
74 0.55
75 0.52
76 0.51
77 0.47
78 0.41
79 0.36
80 0.29
81 0.21
82 0.17
83 0.12
84 0.12
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.11
94 0.12
95 0.11
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.21
104 0.26
105 0.31
106 0.39
107 0.39
108 0.41
109 0.41
110 0.41
111 0.39
112 0.38
113 0.36
114 0.33
115 0.36
116 0.42
117 0.49
118 0.5
119 0.5
120 0.44
121 0.41
122 0.38
123 0.33
124 0.26
125 0.18
126 0.15
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.19
136 0.22
137 0.29
138 0.31
139 0.33
140 0.37
141 0.4
142 0.46
143 0.51
144 0.52
145 0.49
146 0.5
147 0.47
148 0.4
149 0.35
150 0.28
151 0.2
152 0.17
153 0.14
154 0.12
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.12
159 0.13
160 0.14
161 0.16
162 0.18
163 0.23
164 0.29
165 0.34
166 0.38
167 0.43
168 0.51
169 0.53
170 0.55
171 0.56
172 0.51
173 0.49
174 0.46
175 0.44
176 0.39
177 0.35
178 0.32
179 0.28
180 0.26
181 0.23
182 0.2
183 0.15
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.11
197 0.14
198 0.14
199 0.15
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.14
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.14
219 0.16
220 0.23
221 0.25
222 0.32
223 0.36
224 0.36
225 0.36
226 0.39
227 0.43
228 0.42
229 0.45
230 0.4
231 0.39
232 0.45
233 0.49
234 0.46
235 0.45
236 0.47
237 0.48
238 0.51
239 0.48
240 0.41
241 0.44
242 0.44
243 0.41
244 0.36
245 0.31
246 0.28
247 0.26
248 0.34
249 0.3
250 0.32
251 0.36
252 0.37
253 0.35
254 0.34
255 0.36
256 0.3
257 0.32
258 0.31
259 0.28
260 0.3
261 0.29
262 0.33
263 0.3
264 0.29
265 0.26
266 0.23
267 0.2
268 0.15
269 0.16
270 0.11
271 0.12
272 0.11
273 0.09
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.18
299 0.21
300 0.23
301 0.24
302 0.27
303 0.31
304 0.35
305 0.35
306 0.32
307 0.3
308 0.27
309 0.26
310 0.22
311 0.17
312 0.12
313 0.1
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.13
329 0.21
330 0.23
331 0.27
332 0.28
333 0.29
334 0.36
335 0.41
336 0.43
337 0.42
338 0.47
339 0.51
340 0.57
341 0.59
342 0.56
343 0.54
344 0.5
345 0.49
346 0.5
347 0.44
348 0.41
349 0.38
350 0.33
351 0.31
352 0.33
353 0.31
354 0.25
355 0.22
356 0.18
357 0.2
358 0.21
359 0.2
360 0.21
361 0.19
362 0.19
363 0.19
364 0.18
365 0.16
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.16
374 0.15
375 0.16
376 0.15
377 0.16
378 0.16
379 0.17
380 0.21
381 0.18
382 0.21
383 0.22
384 0.25
385 0.27
386 0.33
387 0.4
388 0.39
389 0.41
390 0.44
391 0.49
392 0.48
393 0.44
394 0.38
395 0.29
396 0.27
397 0.25
398 0.19
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.12
407 0.13
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.19
412 0.2
413 0.2
414 0.18
415 0.19
416 0.15
417 0.14
418 0.14
419 0.11
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.08
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.11
429 0.18
430 0.19
431 0.21
432 0.26
433 0.29
434 0.33
435 0.39
436 0.43
437 0.4
438 0.44
439 0.48
440 0.49
441 0.52
442 0.51
443 0.5
444 0.48
445 0.46
446 0.42
447 0.37
448 0.31
449 0.26
450 0.24
451 0.24
452 0.2
453 0.18
454 0.19
455 0.26
456 0.25
457 0.24
458 0.22
459 0.18
460 0.17
461 0.16
462 0.16
463 0.08
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.05
471 0.05
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.06
482 0.08
483 0.1
484 0.13
485 0.17
486 0.19
487 0.25
488 0.25
489 0.24
490 0.26
491 0.28
492 0.25
493 0.22
494 0.21
495 0.15
496 0.14
497 0.12
498 0.09
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.09
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.1
516 0.08
517 0.1
518 0.11
519 0.11
520 0.14
521 0.17
522 0.2
523 0.2
524 0.27
525 0.25
526 0.24
527 0.26
528 0.25
529 0.21
530 0.19
531 0.18
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.11
536 0.1
537 0.11
538 0.1
539 0.11
540 0.11
541 0.13
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.19
547 0.19
548 0.19
549 0.17
550 0.18
551 0.19
552 0.23
553 0.24
554 0.2
555 0.28
556 0.34
557 0.36
558 0.38
559 0.37
560 0.36
561 0.37
562 0.34
563 0.29
564 0.23
565 0.2
566 0.16
567 0.15
568 0.12
569 0.09
570 0.09
571 0.05
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.05
582 0.05
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.11
587 0.12
588 0.17
589 0.17
590 0.16
591 0.18
592 0.24
593 0.24
594 0.25
595 0.23
596 0.23
597 0.22
598 0.23
599 0.22
600 0.2
601 0.22
602 0.23
603 0.23
604 0.22
605 0.23
606 0.24
607 0.23
608 0.2
609 0.24
610 0.3
611 0.34
612 0.43
613 0.45
614 0.45
615 0.44
616 0.46
617 0.43
618 0.35
619 0.36
620 0.27
621 0.3
622 0.28
623 0.28
624 0.24
625 0.19
626 0.19
627 0.14
628 0.13
629 0.06
630 0.07
631 0.08
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.1
636 0.13
637 0.16
638 0.16
639 0.15
640 0.16
641 0.19
642 0.2
643 0.23
644 0.22
645 0.24
646 0.26
647 0.26
648 0.27
649 0.25
650 0.28
651 0.3
652 0.32
653 0.3
654 0.28
655 0.27
656 0.25
657 0.26
658 0.25
659 0.2
660 0.16
661 0.13
662 0.14
663 0.14
664 0.14
665 0.12
666 0.12
667 0.14
668 0.15
669 0.17
670 0.18
671 0.18
672 0.19
673 0.2
674 0.18
675 0.17
676 0.18
677 0.17
678 0.18
679 0.18
680 0.18
681 0.21
682 0.22
683 0.25
684 0.25
685 0.24
686 0.21
687 0.24
688 0.24
689 0.21
690 0.23
691 0.19
692 0.18
693 0.17
694 0.18
695 0.16
696 0.22
697 0.24
698 0.26
699 0.3
700 0.33
701 0.37
702 0.37
703 0.38
704 0.34
705 0.35
706 0.35
707 0.3
708 0.28
709 0.24
710 0.24
711 0.25
712 0.23
713 0.17
714 0.17
715 0.16
716 0.16
717 0.15
718 0.14
719 0.1
720 0.11
721 0.13
722 0.09
723 0.1
724 0.1
725 0.11
726 0.11
727 0.11
728 0.1
729 0.08
730 0.08
731 0.07
732 0.06
733 0.06
734 0.05
735 0.05
736 0.06
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.05
741 0.05
742 0.06
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.06
747 0.06
748 0.06
749 0.05
750 0.04
751 0.03
752 0.03
753 0.03
754 0.03
755 0.04
756 0.03
757 0.04
758 0.06
759 0.08
760 0.08
761 0.1
762 0.11
763 0.15
764 0.2
765 0.26
766 0.27
767 0.28
768 0.29
769 0.28
770 0.29
771 0.27
772 0.22
773 0.16
774 0.13
775 0.12
776 0.11
777 0.11
778 0.09
779 0.1
780 0.11
781 0.1
782 0.11
783 0.1
784 0.09
785 0.09
786 0.11
787 0.1
788 0.11
789 0.12
790 0.17
791 0.24
792 0.25
793 0.24
794 0.22
795 0.22
796 0.24
797 0.26
798 0.24
799 0.17
800 0.17
801 0.16
802 0.16
803 0.16
804 0.13
805 0.1
806 0.07
807 0.08
808 0.12
809 0.14
810 0.15
811 0.14
812 0.19
813 0.21
814 0.21
815 0.2
816 0.17
817 0.17
818 0.16
819 0.15
820 0.12
821 0.16
822 0.17
823 0.18
824 0.23
825 0.31
826 0.38
827 0.47
828 0.56
829 0.61
830 0.69
831 0.78
832 0.79
833 0.77
834 0.78
835 0.75
836 0.72
837 0.65
838 0.57
839 0.46
840 0.4
841 0.32
842 0.24
843 0.21
844 0.16
845 0.14
846 0.16
847 0.24
848 0.3
849 0.36
850 0.46
851 0.53
852 0.61
853 0.66
854 0.73
855 0.76
856 0.8
857 0.83
858 0.79
859 0.71
860 0.65
861 0.6
862 0.52
863 0.41
864 0.31
865 0.23
866 0.21
867 0.21
868 0.16
869 0.16
870 0.18
871 0.26
872 0.27
873 0.28
874 0.29
875 0.33
876 0.41
877 0.44
878 0.47
879 0.44
880 0.47
881 0.49
882 0.46
883 0.46
884 0.38
885 0.35
886 0.31
887 0.26
888 0.22
889 0.2
890 0.18
891 0.14
892 0.15
893 0.18
894 0.21
895 0.22
896 0.27
897 0.33
898 0.34
899 0.4
900 0.44
901 0.48
902 0.44
903 0.49
904 0.45
905 0.41
906 0.42
907 0.39
908 0.44
909 0.43
910 0.45
911 0.41
912 0.44
913 0.47
914 0.53
915 0.51
916 0.44
917 0.39
918 0.36
919 0.37
920 0.35
921 0.32
922 0.26
923 0.27
924 0.28
925 0.3
926 0.3
927 0.29
928 0.27
929 0.25
930 0.24
931 0.21
932 0.17
933 0.13
934 0.13
935 0.11
936 0.1
937 0.09
938 0.06
939 0.06
940 0.05
941 0.05
942 0.04
943 0.04
944 0.05
945 0.05
946 0.07
947 0.12
948 0.13
949 0.13
950 0.14
951 0.16
952 0.2
953 0.24
954 0.23
955 0.22
956 0.28
957 0.29
958 0.31
959 0.29
960 0.26
961 0.24
962 0.24
963 0.23
964 0.15
965 0.16
966 0.13
967 0.13
968 0.11
969 0.09
970 0.08
971 0.05
972 0.05
973 0.04
974 0.06
975 0.08
976 0.1
977 0.13
978 0.16
979 0.21
980 0.25
981 0.27
982 0.32
983 0.34
984 0.36
985 0.36
986 0.33
987 0.28
988 0.25
989 0.23
990 0.18
991 0.14
992 0.1
993 0.09
994 0.09
995 0.08
996 0.09
997 0.08
998 0.09
999 0.1
1000 0.13
1001 0.14
1002 0.16
1003 0.16
1004 0.15
1005 0.19
1006 0.19
1007 0.2
1008 0.16
1009 0.14
1010 0.13
1011 0.14
1012 0.13
1013 0.1
1014 0.09
1015 0.09
1016 0.1
1017 0.1
1018 0.11
1019 0.16
1020 0.19
1021 0.21
1022 0.2
1023 0.19
1024 0.21
1025 0.24
1026 0.3
1027 0.29
1028 0.29
1029 0.31
1030 0.32
1031 0.34
1032 0.34
1033 0.31
1034 0.26
1035 0.23
1036 0.2
1037 0.17
1038 0.2
1039 0.21
1040 0.24
1041 0.31
1042 0.39
1043 0.4
1044 0.42
1045 0.42
1046 0.4
1047 0.43
1048 0.42
1049 0.38
1050 0.34
1051 0.32
1052 0.32
1053 0.36
1054 0.38
1055 0.36
1056 0.36
1057 0.35
1058 0.37
1059 0.42
1060 0.52
1061 0.58
1062 0.64
1063 0.69
1064 0.72
1065 0.74
1066 0.73
1067 0.7
1068 0.65
1069 0.64
1070 0.63
1071 0.59
1072 0.53
1073 0.49
1074 0.46
1075 0.42
1076 0.37
1077 0.29
1078 0.25
1079 0.24
1080 0.24
1081 0.25
1082 0.25
1083 0.26
1084 0.28
1085 0.28
1086 0.26
1087 0.31
1088 0.33
1089 0.36
1090 0.36
1091 0.4
1092 0.38
1093 0.39
1094 0.35
1095 0.28
1096 0.24
1097 0.2
1098 0.17
1099 0.13
1100 0.12
1101 0.09
1102 0.08
1103 0.08
1104 0.07
1105 0.08
1106 0.12
1107 0.16
1108 0.16
1109 0.18
1110 0.19
1111 0.19
1112 0.21
1113 0.18
1114 0.15
1115 0.12
1116 0.13
1117 0.15
1118 0.15
1119 0.14
1120 0.14
1121 0.14
1122 0.14
1123 0.14
1124 0.14
1125 0.11
1126 0.16
1127 0.21
1128 0.22
1129 0.26
1130 0.27
1131 0.27
1132 0.31
1133 0.38
1134 0.39
1135 0.44
1136 0.51
1137 0.56
1138 0.64
1139 0.71
1140 0.73
1141 0.76
1142 0.77
1143 0.79
1144 0.79
1145 0.79
1146 0.8
1147 0.82
1148 0.85