Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R8D4

Protein Details
Accession C4R8D4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-248SSTPTYSASNNKKKNNKKKGLKDDYEPRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-240KKKNNKKKG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 15, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038609  HDA1_su2/3_sf  
IPR021006  Hda2/3  
Gene Ontology GO:0070823  C:HDA1 complex  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
KEGG ppa:PAS_chr4_0599  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11496  HDA2-3  
Amino Acid Sequences MDITRLLGGEEDQDSFVAKDVSMGDYSRQYVPNVRNPDELYYLLVPTSIEQRELVEQVIRLHRSHLESLILGVKQEPNSGAEGDLTMENLSSAELLELLEDNLQLVNNHPNLLVQHYIPKSLILMEPHERLVATSGKFQALDQIIFLLQDQEKHIVIVSRESKELDLVEGTMLGKQINYHRYSGGSLYDQFVKSHENVNRPQHRHHYHQTIQFSNNRSDDSSTPTYSASNNKKKNNKKKGLKDDYEPRISKNNPLLAQLNKDYPVNFHLITSNQLKNFRFPENANLDMIISLDPYLDIKSDYIMEVRTINTLPSDTVNNLIPVFKLVTVNSVEHAILASNVHNSKQAVLDMLFCRNDEFDADEMFNDLKKLQPWFHSPLQTQFPLPLKIPKLRSASSSEQLLKSLEPVEHLQVYGSKSAGDANSIPSIPKHLTYQNYAETLAALVRFTNDRALNLIEEAQKKIDEINLKETVRQAEIEQSNIDIGERYKLLKDLENKAEAAERRAIRTEQEAKQWQESTEELQEQLDTMKRVIAGESVEQKDIGKVKQELKDLEEELKQLEKSNEELRLQYQEKSTIASEQSFQVAALEKSQKELKEKHDRPILELVDAAREAEKRKLQEQVDRLTRETEFNTAYIEKLESILRQKDSTLPNYVSRSTRMSRSATPNLKTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.14
4 0.12
5 0.1
6 0.11
7 0.12
8 0.14
9 0.15
10 0.16
11 0.17
12 0.19
13 0.23
14 0.25
15 0.26
16 0.25
17 0.32
18 0.38
19 0.45
20 0.5
21 0.5
22 0.51
23 0.51
24 0.53
25 0.48
26 0.41
27 0.36
28 0.3
29 0.26
30 0.21
31 0.19
32 0.15
33 0.13
34 0.19
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.21
40 0.22
41 0.22
42 0.18
43 0.18
44 0.23
45 0.3
46 0.31
47 0.28
48 0.3
49 0.33
50 0.35
51 0.36
52 0.32
53 0.27
54 0.24
55 0.26
56 0.28
57 0.23
58 0.19
59 0.19
60 0.21
61 0.19
62 0.21
63 0.2
64 0.17
65 0.19
66 0.19
67 0.17
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.21
100 0.21
101 0.15
102 0.22
103 0.22
104 0.24
105 0.23
106 0.22
107 0.19
108 0.19
109 0.21
110 0.15
111 0.19
112 0.22
113 0.23
114 0.24
115 0.23
116 0.21
117 0.19
118 0.2
119 0.2
120 0.17
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.23
125 0.22
126 0.26
127 0.23
128 0.22
129 0.17
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.12
135 0.1
136 0.12
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.15
144 0.21
145 0.25
146 0.24
147 0.25
148 0.26
149 0.25
150 0.24
151 0.24
152 0.17
153 0.12
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.09
163 0.15
164 0.21
165 0.23
166 0.23
167 0.24
168 0.25
169 0.26
170 0.25
171 0.22
172 0.18
173 0.17
174 0.17
175 0.21
176 0.2
177 0.19
178 0.19
179 0.19
180 0.18
181 0.24
182 0.27
183 0.29
184 0.35
185 0.46
186 0.54
187 0.54
188 0.59
189 0.62
190 0.63
191 0.65
192 0.66
193 0.65
194 0.62
195 0.66
196 0.66
197 0.6
198 0.58
199 0.56
200 0.51
201 0.46
202 0.41
203 0.35
204 0.3
205 0.29
206 0.26
207 0.28
208 0.29
209 0.24
210 0.24
211 0.23
212 0.23
213 0.22
214 0.3
215 0.33
216 0.39
217 0.45
218 0.53
219 0.62
220 0.72
221 0.81
222 0.84
223 0.84
224 0.85
225 0.88
226 0.91
227 0.92
228 0.85
229 0.81
230 0.8
231 0.76
232 0.74
233 0.64
234 0.55
235 0.52
236 0.49
237 0.47
238 0.43
239 0.42
240 0.34
241 0.37
242 0.38
243 0.32
244 0.35
245 0.31
246 0.27
247 0.22
248 0.22
249 0.19
250 0.17
251 0.17
252 0.16
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.17
258 0.21
259 0.22
260 0.21
261 0.26
262 0.26
263 0.29
264 0.32
265 0.31
266 0.29
267 0.26
268 0.32
269 0.32
270 0.32
271 0.29
272 0.25
273 0.22
274 0.19
275 0.19
276 0.1
277 0.06
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.12
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.08
345 0.09
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.06
355 0.07
356 0.09
357 0.11
358 0.12
359 0.16
360 0.21
361 0.27
362 0.31
363 0.34
364 0.33
365 0.36
366 0.38
367 0.35
368 0.3
369 0.28
370 0.27
371 0.23
372 0.23
373 0.24
374 0.23
375 0.28
376 0.31
377 0.34
378 0.36
379 0.35
380 0.36
381 0.38
382 0.39
383 0.36
384 0.38
385 0.33
386 0.29
387 0.29
388 0.27
389 0.2
390 0.16
391 0.16
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.13
400 0.14
401 0.12
402 0.11
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.1
414 0.14
415 0.13
416 0.13
417 0.14
418 0.17
419 0.2
420 0.24
421 0.27
422 0.27
423 0.27
424 0.26
425 0.23
426 0.18
427 0.16
428 0.13
429 0.09
430 0.06
431 0.05
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.13
436 0.12
437 0.13
438 0.15
439 0.16
440 0.15
441 0.15
442 0.17
443 0.17
444 0.18
445 0.19
446 0.18
447 0.17
448 0.16
449 0.16
450 0.17
451 0.18
452 0.19
453 0.24
454 0.3
455 0.3
456 0.31
457 0.33
458 0.31
459 0.27
460 0.25
461 0.19
462 0.21
463 0.22
464 0.22
465 0.2
466 0.18
467 0.17
468 0.16
469 0.15
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.14
477 0.15
478 0.2
479 0.26
480 0.31
481 0.35
482 0.36
483 0.35
484 0.34
485 0.37
486 0.33
487 0.3
488 0.29
489 0.26
490 0.26
491 0.29
492 0.29
493 0.25
494 0.32
495 0.37
496 0.33
497 0.41
498 0.46
499 0.45
500 0.5
501 0.49
502 0.42
503 0.37
504 0.34
505 0.3
506 0.27
507 0.25
508 0.2
509 0.19
510 0.18
511 0.16
512 0.16
513 0.15
514 0.12
515 0.12
516 0.13
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.12
522 0.15
523 0.22
524 0.23
525 0.23
526 0.23
527 0.22
528 0.24
529 0.26
530 0.24
531 0.23
532 0.26
533 0.33
534 0.38
535 0.43
536 0.41
537 0.41
538 0.44
539 0.4
540 0.38
541 0.33
542 0.28
543 0.25
544 0.26
545 0.23
546 0.22
547 0.22
548 0.2
549 0.23
550 0.27
551 0.31
552 0.28
553 0.3
554 0.29
555 0.35
556 0.35
557 0.35
558 0.33
559 0.31
560 0.3
561 0.31
562 0.29
563 0.25
564 0.26
565 0.24
566 0.22
567 0.2
568 0.21
569 0.18
570 0.17
571 0.14
572 0.15
573 0.14
574 0.19
575 0.23
576 0.22
577 0.25
578 0.3
579 0.32
580 0.36
581 0.42
582 0.46
583 0.52
584 0.56
585 0.61
586 0.65
587 0.62
588 0.59
589 0.62
590 0.54
591 0.43
592 0.4
593 0.32
594 0.27
595 0.26
596 0.22
597 0.16
598 0.17
599 0.19
600 0.24
601 0.29
602 0.3
603 0.34
604 0.41
605 0.44
606 0.5
607 0.55
608 0.57
609 0.6
610 0.59
611 0.57
612 0.53
613 0.49
614 0.44
615 0.39
616 0.34
617 0.27
618 0.24
619 0.26
620 0.23
621 0.23
622 0.21
623 0.2
624 0.15
625 0.15
626 0.17
627 0.17
628 0.24
629 0.3
630 0.31
631 0.31
632 0.32
633 0.39
634 0.43
635 0.44
636 0.44
637 0.41
638 0.44
639 0.48
640 0.51
641 0.46
642 0.43
643 0.45
644 0.42
645 0.45
646 0.45
647 0.46
648 0.5
649 0.55
650 0.62
651 0.64