Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PDF6

Protein Details
Accession J3PDF6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
619-645AEDALKLVRDRKKKKAKQLLSRNGLEWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
627-635RDRKKKKAK
Subcellular Location(s) plas 9, mito 6, cyto_nucl 6, nucl 5.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13374  TPR_10  
Amino Acid Sequences MLLHHAARPGIPYSQIEQSLNEFPEELISAYETSLDGQAKSRKFGEVQLERRRQVFVFLVAAQTSVTLEMITAALDFAPEHSAEHIYTLCRPLVTITGEKERHNNGPVNNETVTIKKENDGFYNYAAQFWSIHLAKVMKPPPELVQLAGNFLRMRQFVYWSEYRTQQDDDFTGIGSSRSRLGEFEKRLPDTDQRTLGLEDFFVMPYRDLADAYRERQEKDKVLQWLALRQLGFWYFFNAVVDKMADVRERVAKGLTEILGAEHPLTLRARSEVAFAYISLDEFEKAYAAYSEVAEVQRRVLHGDNRRELYTTLMHRGQAEYFLTHFSRSSRTQEEAVHGFLQVGGPTSHGYLSTRMWQACTLLQRGFVDESLEIMEAVHKTRKNRFGDDDGFAVYVEQHLGTIYRQLGRRARAVAVLEHSLATRKGGCSPGSNLVIDAELSLAVAYREFGELGAASRILAQVKEHLRREDGTIRYFEEYCQYVHVDALVQFEDGEREITEQVLHAFVLGTDREKENRALLWARLDLADMMRARGEKDEALALFGGLVKPLVPLLIPALADTFDDNTAVAGPNRQDHETSSSSDPLSSTDDDGSHKVEYIDELDYDSGEELESPSVLAIAEDALKLVRDRKKKKAKQLLSRNGLEWARPKDLWLWHGVPPADTGSIRRLSTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.3
4 0.29
5 0.32
6 0.35
7 0.33
8 0.3
9 0.24
10 0.2
11 0.21
12 0.2
13 0.16
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.11
19 0.09
20 0.1
21 0.13
22 0.14
23 0.13
24 0.19
25 0.27
26 0.28
27 0.32
28 0.33
29 0.33
30 0.33
31 0.38
32 0.43
33 0.45
34 0.53
35 0.6
36 0.67
37 0.65
38 0.65
39 0.62
40 0.51
41 0.47
42 0.4
43 0.32
44 0.27
45 0.26
46 0.26
47 0.23
48 0.23
49 0.17
50 0.14
51 0.11
52 0.08
53 0.07
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.16
75 0.18
76 0.17
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.21
82 0.22
83 0.24
84 0.32
85 0.35
86 0.37
87 0.41
88 0.41
89 0.42
90 0.43
91 0.45
92 0.38
93 0.44
94 0.45
95 0.44
96 0.39
97 0.36
98 0.32
99 0.29
100 0.3
101 0.24
102 0.23
103 0.22
104 0.26
105 0.27
106 0.29
107 0.31
108 0.29
109 0.28
110 0.35
111 0.32
112 0.28
113 0.26
114 0.23
115 0.19
116 0.17
117 0.22
118 0.15
119 0.15
120 0.17
121 0.19
122 0.21
123 0.29
124 0.33
125 0.3
126 0.31
127 0.32
128 0.33
129 0.37
130 0.35
131 0.27
132 0.28
133 0.25
134 0.27
135 0.26
136 0.24
137 0.18
138 0.18
139 0.21
140 0.15
141 0.17
142 0.15
143 0.19
144 0.19
145 0.26
146 0.28
147 0.28
148 0.31
149 0.34
150 0.36
151 0.35
152 0.35
153 0.29
154 0.29
155 0.26
156 0.25
157 0.2
158 0.17
159 0.15
160 0.12
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.19
169 0.27
170 0.31
171 0.38
172 0.41
173 0.41
174 0.43
175 0.45
176 0.46
177 0.43
178 0.43
179 0.38
180 0.33
181 0.34
182 0.33
183 0.31
184 0.24
185 0.17
186 0.13
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.15
198 0.17
199 0.2
200 0.27
201 0.27
202 0.28
203 0.33
204 0.37
205 0.36
206 0.37
207 0.4
208 0.37
209 0.37
210 0.39
211 0.34
212 0.34
213 0.31
214 0.3
215 0.23
216 0.19
217 0.19
218 0.17
219 0.18
220 0.14
221 0.14
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.1
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.16
242 0.14
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.06
250 0.05
251 0.07
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.19
289 0.26
290 0.34
291 0.37
292 0.38
293 0.39
294 0.38
295 0.35
296 0.31
297 0.27
298 0.22
299 0.22
300 0.21
301 0.21
302 0.2
303 0.21
304 0.18
305 0.15
306 0.14
307 0.1
308 0.09
309 0.11
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.14
315 0.15
316 0.2
317 0.2
318 0.22
319 0.24
320 0.24
321 0.27
322 0.24
323 0.23
324 0.19
325 0.16
326 0.13
327 0.11
328 0.1
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.13
341 0.16
342 0.15
343 0.16
344 0.16
345 0.17
346 0.18
347 0.19
348 0.17
349 0.14
350 0.16
351 0.15
352 0.16
353 0.16
354 0.13
355 0.12
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.08
360 0.06
361 0.05
362 0.07
363 0.06
364 0.08
365 0.12
366 0.13
367 0.17
368 0.24
369 0.33
370 0.35
371 0.39
372 0.43
373 0.45
374 0.47
375 0.45
376 0.39
377 0.31
378 0.27
379 0.23
380 0.18
381 0.11
382 0.07
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.07
390 0.09
391 0.13
392 0.14
393 0.2
394 0.25
395 0.27
396 0.3
397 0.29
398 0.28
399 0.27
400 0.27
401 0.23
402 0.21
403 0.19
404 0.16
405 0.14
406 0.14
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.12
413 0.15
414 0.16
415 0.17
416 0.2
417 0.25
418 0.25
419 0.25
420 0.22
421 0.19
422 0.18
423 0.15
424 0.12
425 0.06
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.04
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.14
449 0.21
450 0.28
451 0.31
452 0.32
453 0.33
454 0.34
455 0.39
456 0.4
457 0.37
458 0.32
459 0.31
460 0.31
461 0.31
462 0.31
463 0.26
464 0.22
465 0.19
466 0.17
467 0.17
468 0.16
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.11
473 0.1
474 0.12
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.08
495 0.08
496 0.09
497 0.11
498 0.13
499 0.15
500 0.17
501 0.19
502 0.19
503 0.2
504 0.23
505 0.23
506 0.23
507 0.25
508 0.23
509 0.22
510 0.2
511 0.19
512 0.15
513 0.13
514 0.16
515 0.13
516 0.13
517 0.13
518 0.14
519 0.14
520 0.15
521 0.17
522 0.13
523 0.14
524 0.17
525 0.15
526 0.16
527 0.15
528 0.13
529 0.11
530 0.11
531 0.1
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.04
539 0.05
540 0.06
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.09
545 0.09
546 0.09
547 0.1
548 0.1
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.09
556 0.11
557 0.13
558 0.18
559 0.21
560 0.22
561 0.22
562 0.23
563 0.29
564 0.28
565 0.31
566 0.3
567 0.3
568 0.28
569 0.28
570 0.25
571 0.21
572 0.23
573 0.2
574 0.18
575 0.17
576 0.18
577 0.2
578 0.22
579 0.22
580 0.19
581 0.18
582 0.16
583 0.15
584 0.15
585 0.15
586 0.15
587 0.12
588 0.13
589 0.13
590 0.12
591 0.12
592 0.11
593 0.09
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.1
612 0.18
613 0.25
614 0.35
615 0.43
616 0.54
617 0.65
618 0.73
619 0.83
620 0.86
621 0.89
622 0.89
623 0.93
624 0.93
625 0.9
626 0.84
627 0.74
628 0.7
629 0.61
630 0.54
631 0.51
632 0.46
633 0.44
634 0.4
635 0.4
636 0.4
637 0.44
638 0.42
639 0.42
640 0.39
641 0.37
642 0.44
643 0.42
644 0.36
645 0.33
646 0.32
647 0.27
648 0.25
649 0.23
650 0.23
651 0.28