Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PBB1

Protein Details
Accession J3PBB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-126DATAAIPSKKSKKKSKRKKKAKKADPEPPVKEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-118SKKSKKKSKRKKKAKKAD
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MSSRQLRKLQERKEAQELKELRERKLREQQALGQHDAPADIPEDDEPIIRQPRANLFSGFASLVEDGGDDDEDDDDDDIDDGAGQQTAAPNPSDATAAIPSKKSKKKSKRKKKAKKADPEPPVKEAPETGGMDEIDRALQQLKAAEPTPVGTSDSEPTDWYSAELAKLLSINTMHLKVVNEMRNLFGRDAIAASSADSDPQAGVDLRAMQREGQTLEQYLKGRPGQKISEVLLRRNPFVEGKSYWPKAPAGGLTMKRVDESEDSDQFTEFAFAHDHGYESLEAVFFQCVQTHDPMMLVHFLHQNPYHVSSLIQVSKVAKQDQNSALAGDLCERALFTFGRVTLSSFRNKLKDGRARLSFSRPENRQFWLAAYNYVRSLMIKGTYRTALEWAKMLLSFSPADDYGMLNLIHGIAIRCHEAAWFIELVCENDLFSYHMARHVPNRDYVKQTAVLAKLQLGDAAGARKLLKEGMETLPWLYCALLSALNMDAPKSIWGIQARSPSEELYTALYISQAKDLWNTQQASALLKEVATSLARPPVHETLPEAEDVAESTARFVYLDNTPSLMALVPHALMHASPNFDFDPLPPPLEENIFSSVAQRLPWDGTQAHPSTSHLGELFARLFPAEQRRWEQLFQGQGLGDVEGLEEQDELVDGVPEEDIEAMVQLRAAVAESRNDPGVLARLAQMAEFMFGRPRDAAANEAEDEPTIDAAASRGEDDAMQQEDRNPAPSDTHGGRGDNTNRQGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.71
3 0.71
4 0.65
5 0.61
6 0.61
7 0.58
8 0.53
9 0.54
10 0.57
11 0.57
12 0.64
13 0.66
14 0.64
15 0.67
16 0.69
17 0.7
18 0.7
19 0.65
20 0.56
21 0.49
22 0.42
23 0.36
24 0.29
25 0.2
26 0.16
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.18
35 0.23
36 0.23
37 0.24
38 0.27
39 0.36
40 0.39
41 0.41
42 0.35
43 0.32
44 0.33
45 0.33
46 0.28
47 0.19
48 0.17
49 0.14
50 0.13
51 0.1
52 0.09
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.06
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.11
82 0.12
83 0.15
84 0.18
85 0.2
86 0.23
87 0.29
88 0.38
89 0.46
90 0.53
91 0.6
92 0.67
93 0.76
94 0.84
95 0.9
96 0.91
97 0.95
98 0.97
99 0.97
100 0.97
101 0.97
102 0.96
103 0.95
104 0.94
105 0.92
106 0.91
107 0.84
108 0.78
109 0.7
110 0.6
111 0.51
112 0.41
113 0.35
114 0.31
115 0.27
116 0.22
117 0.21
118 0.2
119 0.19
120 0.18
121 0.16
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.12
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.14
140 0.16
141 0.18
142 0.17
143 0.16
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.11
159 0.12
160 0.14
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.18
165 0.25
166 0.28
167 0.27
168 0.27
169 0.29
170 0.3
171 0.31
172 0.28
173 0.22
174 0.17
175 0.15
176 0.15
177 0.13
178 0.1
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.12
193 0.12
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.17
199 0.18
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.2
205 0.21
206 0.19
207 0.22
208 0.24
209 0.28
210 0.29
211 0.33
212 0.31
213 0.33
214 0.36
215 0.33
216 0.37
217 0.34
218 0.35
219 0.37
220 0.37
221 0.34
222 0.31
223 0.31
224 0.25
225 0.24
226 0.25
227 0.2
228 0.25
229 0.33
230 0.34
231 0.33
232 0.32
233 0.31
234 0.27
235 0.27
236 0.21
237 0.16
238 0.21
239 0.22
240 0.23
241 0.24
242 0.23
243 0.22
244 0.21
245 0.2
246 0.15
247 0.19
248 0.21
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.22
253 0.2
254 0.19
255 0.15
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.08
285 0.09
286 0.12
287 0.12
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.2
293 0.19
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.18
298 0.17
299 0.15
300 0.14
301 0.14
302 0.18
303 0.2
304 0.22
305 0.2
306 0.2
307 0.26
308 0.27
309 0.29
310 0.25
311 0.23
312 0.19
313 0.18
314 0.16
315 0.11
316 0.09
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.14
330 0.17
331 0.2
332 0.21
333 0.24
334 0.24
335 0.26
336 0.29
337 0.34
338 0.38
339 0.4
340 0.44
341 0.45
342 0.46
343 0.47
344 0.48
345 0.44
346 0.41
347 0.44
348 0.4
349 0.41
350 0.4
351 0.4
352 0.36
353 0.31
354 0.27
355 0.23
356 0.2
357 0.19
358 0.18
359 0.17
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.1
364 0.11
365 0.08
366 0.09
367 0.11
368 0.11
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.16
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.06
391 0.08
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.17
426 0.23
427 0.24
428 0.29
429 0.34
430 0.35
431 0.38
432 0.39
433 0.35
434 0.31
435 0.31
436 0.29
437 0.24
438 0.22
439 0.17
440 0.17
441 0.15
442 0.13
443 0.12
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.08
453 0.09
454 0.08
455 0.08
456 0.12
457 0.13
458 0.14
459 0.14
460 0.14
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.08
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.07
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.11
481 0.13
482 0.15
483 0.19
484 0.25
485 0.26
486 0.27
487 0.27
488 0.24
489 0.23
490 0.21
491 0.18
492 0.13
493 0.13
494 0.1
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.09
501 0.1
502 0.12
503 0.13
504 0.15
505 0.21
506 0.21
507 0.2
508 0.23
509 0.23
510 0.24
511 0.23
512 0.2
513 0.14
514 0.13
515 0.13
516 0.09
517 0.1
518 0.08
519 0.08
520 0.09
521 0.15
522 0.16
523 0.16
524 0.21
525 0.23
526 0.24
527 0.24
528 0.24
529 0.22
530 0.23
531 0.22
532 0.17
533 0.13
534 0.12
535 0.12
536 0.11
537 0.08
538 0.07
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.09
545 0.11
546 0.14
547 0.13
548 0.14
549 0.14
550 0.14
551 0.14
552 0.12
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.06
560 0.06
561 0.09
562 0.1
563 0.11
564 0.11
565 0.14
566 0.15
567 0.15
568 0.16
569 0.14
570 0.18
571 0.17
572 0.19
573 0.16
574 0.17
575 0.18
576 0.2
577 0.2
578 0.16
579 0.19
580 0.18
581 0.18
582 0.18
583 0.19
584 0.18
585 0.17
586 0.15
587 0.13
588 0.15
589 0.16
590 0.18
591 0.16
592 0.18
593 0.25
594 0.25
595 0.25
596 0.22
597 0.24
598 0.24
599 0.24
600 0.23
601 0.16
602 0.17
603 0.16
604 0.18
605 0.17
606 0.13
607 0.13
608 0.11
609 0.11
610 0.15
611 0.23
612 0.25
613 0.29
614 0.33
615 0.4
616 0.44
617 0.45
618 0.44
619 0.4
620 0.42
621 0.37
622 0.35
623 0.27
624 0.24
625 0.24
626 0.2
627 0.15
628 0.09
629 0.08
630 0.06
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.05
647 0.04
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.06
656 0.08
657 0.09
658 0.13
659 0.15
660 0.17
661 0.18
662 0.18
663 0.18
664 0.17
665 0.2
666 0.16
667 0.15
668 0.14
669 0.15
670 0.16
671 0.15
672 0.15
673 0.11
674 0.11
675 0.11
676 0.1
677 0.14
678 0.14
679 0.17
680 0.17
681 0.18
682 0.19
683 0.2
684 0.22
685 0.2
686 0.23
687 0.23
688 0.23
689 0.22
690 0.19
691 0.19
692 0.16
693 0.13
694 0.1
695 0.08
696 0.07
697 0.07
698 0.09
699 0.08
700 0.08
701 0.08
702 0.09
703 0.09
704 0.1
705 0.14
706 0.16
707 0.17
708 0.17
709 0.2
710 0.25
711 0.26
712 0.29
713 0.27
714 0.25
715 0.27
716 0.29
717 0.33
718 0.3
719 0.35
720 0.34
721 0.33
722 0.34
723 0.4
724 0.44
725 0.46