Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3P1C8

Protein Details
Accession J3P1C8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-85EEERRAQAARDRKRRSKAKQKVQVKMGHGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-77RRAQAARDRKRRSKAKQK
284-286KRK
296-301KKQMKR
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MKRAIGNLAVQMAQATGLDGVFAINKPMGMSSAQVIRDCQSYFNPSRLFKPALEREEEERRAQAARDRKRRSKAKQKVQVKMGHGGTLDPLATGVLILGVGRGTKSLQNFLECTKTYETVVLFGASTDTYDRVGRILQRRSYDDVTRDKVEAALGSFRGRYRQMPPLYSALKMNGKPLYEYAREGKPIPREIETREVEVTDLELVEWYEPGSHPHRWPAEEAGIAEKSLAERVWSAEQEQTTGKKLTPEQEQEEDRAFAAHQSFKEKAEERQDKLIFDKQTGRKRKADGSDQPLSKKQMKREQRAAQRGAGHQRPEPMMSGALGELPPGGPPKGRGSDLVPKAPAADAPPPWSDKGPPACRVRMTVTSGFYVRSFCHELGEKVGSAAMMAELERSRQGDYVLGKDNCIEYDVLAKGEPVWGPHVERILHTWSSTHLPNVGALKSIYGDAEAVKSEMANPTAEAEAAKEPKNGVTCDDEEWTGISDAAAPAETKAEEKAAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.05
7 0.06
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.1
17 0.11
18 0.12
19 0.18
20 0.2
21 0.21
22 0.22
23 0.22
24 0.25
25 0.25
26 0.24
27 0.22
28 0.29
29 0.31
30 0.37
31 0.41
32 0.39
33 0.43
34 0.47
35 0.47
36 0.41
37 0.48
38 0.5
39 0.49
40 0.52
41 0.51
42 0.51
43 0.57
44 0.58
45 0.5
46 0.43
47 0.39
48 0.36
49 0.34
50 0.36
51 0.36
52 0.43
53 0.52
54 0.6
55 0.67
56 0.76
57 0.84
58 0.87
59 0.89
60 0.89
61 0.9
62 0.9
63 0.91
64 0.9
65 0.88
66 0.84
67 0.77
68 0.74
69 0.64
70 0.56
71 0.46
72 0.37
73 0.3
74 0.23
75 0.19
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.06
91 0.1
92 0.12
93 0.17
94 0.19
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.3
99 0.27
100 0.3
101 0.27
102 0.26
103 0.24
104 0.26
105 0.23
106 0.19
107 0.19
108 0.15
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.12
121 0.18
122 0.25
123 0.32
124 0.35
125 0.39
126 0.42
127 0.47
128 0.49
129 0.47
130 0.45
131 0.44
132 0.44
133 0.42
134 0.39
135 0.33
136 0.3
137 0.26
138 0.2
139 0.15
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.13
144 0.13
145 0.16
146 0.17
147 0.19
148 0.21
149 0.3
150 0.33
151 0.33
152 0.36
153 0.39
154 0.38
155 0.36
156 0.32
157 0.27
158 0.29
159 0.28
160 0.29
161 0.25
162 0.24
163 0.24
164 0.25
165 0.26
166 0.22
167 0.24
168 0.24
169 0.24
170 0.25
171 0.26
172 0.29
173 0.28
174 0.31
175 0.31
176 0.3
177 0.3
178 0.32
179 0.38
180 0.35
181 0.32
182 0.28
183 0.25
184 0.22
185 0.2
186 0.17
187 0.09
188 0.07
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.08
198 0.12
199 0.15
200 0.16
201 0.22
202 0.24
203 0.24
204 0.26
205 0.26
206 0.24
207 0.21
208 0.21
209 0.18
210 0.16
211 0.14
212 0.12
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.2
234 0.24
235 0.27
236 0.28
237 0.31
238 0.32
239 0.31
240 0.3
241 0.26
242 0.2
243 0.16
244 0.12
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.14
250 0.16
251 0.16
252 0.21
253 0.21
254 0.24
255 0.32
256 0.37
257 0.36
258 0.43
259 0.43
260 0.39
261 0.41
262 0.42
263 0.32
264 0.28
265 0.35
266 0.34
267 0.43
268 0.5
269 0.52
270 0.51
271 0.54
272 0.58
273 0.55
274 0.57
275 0.55
276 0.54
277 0.57
278 0.54
279 0.53
280 0.51
281 0.5
282 0.48
283 0.44
284 0.45
285 0.47
286 0.55
287 0.61
288 0.67
289 0.71
290 0.73
291 0.78
292 0.73
293 0.67
294 0.61
295 0.58
296 0.56
297 0.51
298 0.43
299 0.36
300 0.37
301 0.34
302 0.31
303 0.27
304 0.2
305 0.16
306 0.14
307 0.13
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.1
319 0.15
320 0.18
321 0.19
322 0.2
323 0.24
324 0.33
325 0.36
326 0.38
327 0.33
328 0.3
329 0.29
330 0.28
331 0.23
332 0.17
333 0.17
334 0.15
335 0.18
336 0.2
337 0.21
338 0.22
339 0.23
340 0.21
341 0.24
342 0.33
343 0.35
344 0.4
345 0.44
346 0.46
347 0.46
348 0.48
349 0.45
350 0.4
351 0.41
352 0.37
353 0.34
354 0.33
355 0.32
356 0.3
357 0.25
358 0.22
359 0.17
360 0.18
361 0.2
362 0.18
363 0.21
364 0.23
365 0.23
366 0.26
367 0.27
368 0.22
369 0.18
370 0.18
371 0.14
372 0.11
373 0.11
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.06
378 0.06
379 0.08
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.15
386 0.17
387 0.21
388 0.28
389 0.28
390 0.27
391 0.27
392 0.28
393 0.23
394 0.23
395 0.18
396 0.09
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.13
401 0.13
402 0.12
403 0.14
404 0.14
405 0.11
406 0.13
407 0.15
408 0.17
409 0.2
410 0.24
411 0.22
412 0.22
413 0.25
414 0.27
415 0.25
416 0.23
417 0.21
418 0.2
419 0.24
420 0.24
421 0.22
422 0.19
423 0.18
424 0.21
425 0.24
426 0.22
427 0.19
428 0.18
429 0.17
430 0.16
431 0.16
432 0.12
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.12
446 0.14
447 0.14
448 0.15
449 0.13
450 0.12
451 0.18
452 0.21
453 0.23
454 0.23
455 0.24
456 0.28
457 0.32
458 0.3
459 0.27
460 0.29
461 0.29
462 0.3
463 0.32
464 0.28
465 0.24
466 0.24
467 0.23
468 0.17
469 0.15
470 0.12
471 0.12
472 0.11
473 0.12
474 0.11
475 0.09
476 0.09
477 0.11
478 0.12
479 0.11
480 0.12