Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NTL8

Protein Details
Accession J3NTL8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
488-512RDSEEARLRKRQKRAEDEERKKKGGBasic
577-596LDSLSRKKKGKRTYSWMGAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
494-511RLRKRQKRAEDEERKKKG
583-587KKKGK
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 10.833, nucl 6.5, cyto_nucl 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQHQQLPLPSAPPPRPYSPAQLSPALPNSQAPYSGNPPPKRQRTSPGPGSSQPGSPFVASPSYMHSPGAMATPPPMSNAPSPVPYPNHIALPPNNLVQQPYINGNAHNNGLPLNHSMQSLSPGLTMPGRTPGTPPVMSPSQILPVPSQATTPLTPAPAPSPYATTNATLAPMSQVLMPTGAMGPPSKPAERPVKEVQYDVDDSLAGTGIDLREEEQFMAQFYAGSTRAEARTGFPANTPGAAGSMYGAGLANQPAQAISQDQIQFEVEQAKVAWQDAAAKLSVVRGHEVKNPFSNLAVLHGRAHRIANEYGLGLVLDVKNGGMGKMKLGDEFPEPSVDVITKVVGPDAVVSTTKSFLPVESFLAEQIGLLSIATKHRLRQLVEDADRVARTRQQTSHGVAPPEWVDVAVPIKTVDAGLALEMSSPAPGDEHGADPGVNPLKRSLDASESDPAAISASGKPATVVSGPGASFNLSAALRETSKSERDSEEARLRKRQKRAEDEERKKKGGDAAASTAGSRAGSVAPGTPGGADADAPPPVKVPTKKELKAKAAAAQKSLDSMNTATANSTTQHFLDSLSRKKKGKRTYSWMGAGAGSGASTPRGPGGTPATPGGLAAGAAAALGRNKVPEVAALTQDGRYRHGDFRENGEKGKNIQLRDWIQVLEREQHLEFRALQKAYLMLDSSAPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.49
4 0.46
5 0.49
6 0.51
7 0.55
8 0.55
9 0.58
10 0.55
11 0.54
12 0.51
13 0.52
14 0.53
15 0.45
16 0.38
17 0.33
18 0.32
19 0.28
20 0.29
21 0.25
22 0.25
23 0.28
24 0.36
25 0.44
26 0.45
27 0.54
28 0.62
29 0.7
30 0.72
31 0.73
32 0.74
33 0.75
34 0.8
35 0.8
36 0.77
37 0.73
38 0.68
39 0.68
40 0.61
41 0.55
42 0.47
43 0.4
44 0.34
45 0.29
46 0.26
47 0.22
48 0.23
49 0.19
50 0.18
51 0.22
52 0.24
53 0.24
54 0.23
55 0.21
56 0.19
57 0.19
58 0.2
59 0.15
60 0.11
61 0.12
62 0.15
63 0.15
64 0.17
65 0.18
66 0.18
67 0.2
68 0.24
69 0.25
70 0.25
71 0.27
72 0.3
73 0.32
74 0.32
75 0.36
76 0.33
77 0.33
78 0.32
79 0.35
80 0.32
81 0.36
82 0.35
83 0.32
84 0.32
85 0.29
86 0.29
87 0.26
88 0.25
89 0.2
90 0.21
91 0.23
92 0.22
93 0.23
94 0.24
95 0.25
96 0.25
97 0.23
98 0.21
99 0.17
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.19
109 0.18
110 0.16
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.11
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.2
121 0.24
122 0.28
123 0.28
124 0.27
125 0.26
126 0.28
127 0.28
128 0.28
129 0.24
130 0.22
131 0.22
132 0.23
133 0.18
134 0.19
135 0.2
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.17
149 0.16
150 0.18
151 0.18
152 0.21
153 0.21
154 0.2
155 0.19
156 0.17
157 0.18
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.12
175 0.15
176 0.16
177 0.17
178 0.23
179 0.33
180 0.35
181 0.41
182 0.45
183 0.49
184 0.48
185 0.48
186 0.43
187 0.37
188 0.36
189 0.29
190 0.22
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.06
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.17
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.19
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.11
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.16
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.06
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.11
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.19
278 0.22
279 0.23
280 0.24
281 0.25
282 0.23
283 0.22
284 0.2
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.13
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.13
295 0.15
296 0.15
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.08
303 0.05
304 0.06
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.11
321 0.13
322 0.12
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.06
356 0.05
357 0.04
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.05
363 0.09
364 0.1
365 0.11
366 0.16
367 0.21
368 0.21
369 0.25
370 0.3
371 0.35
372 0.36
373 0.35
374 0.31
375 0.28
376 0.27
377 0.24
378 0.18
379 0.14
380 0.16
381 0.19
382 0.2
383 0.24
384 0.27
385 0.3
386 0.36
387 0.35
388 0.34
389 0.3
390 0.29
391 0.25
392 0.21
393 0.18
394 0.1
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.03
415 0.03
416 0.04
417 0.04
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.12
426 0.16
427 0.15
428 0.15
429 0.16
430 0.18
431 0.18
432 0.2
433 0.18
434 0.16
435 0.18
436 0.2
437 0.21
438 0.2
439 0.19
440 0.17
441 0.15
442 0.12
443 0.1
444 0.09
445 0.06
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.08
462 0.1
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.14
470 0.15
471 0.19
472 0.21
473 0.22
474 0.22
475 0.25
476 0.27
477 0.32
478 0.37
479 0.4
480 0.42
481 0.5
482 0.57
483 0.62
484 0.69
485 0.7
486 0.71
487 0.75
488 0.8
489 0.82
490 0.84
491 0.87
492 0.88
493 0.86
494 0.78
495 0.68
496 0.6
497 0.55
498 0.49
499 0.42
500 0.35
501 0.33
502 0.33
503 0.33
504 0.31
505 0.25
506 0.2
507 0.15
508 0.11
509 0.08
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.06
522 0.07
523 0.09
524 0.11
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.14
529 0.21
530 0.24
531 0.29
532 0.35
533 0.45
534 0.51
535 0.58
536 0.65
537 0.64
538 0.66
539 0.63
540 0.6
541 0.59
542 0.55
543 0.49
544 0.42
545 0.35
546 0.31
547 0.29
548 0.22
549 0.16
550 0.14
551 0.15
552 0.15
553 0.15
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.13
558 0.15
559 0.14
560 0.12
561 0.14
562 0.13
563 0.14
564 0.21
565 0.27
566 0.35
567 0.41
568 0.48
569 0.53
570 0.61
571 0.69
572 0.71
573 0.75
574 0.75
575 0.76
576 0.79
577 0.82
578 0.78
579 0.71
580 0.62
581 0.51
582 0.41
583 0.32
584 0.22
585 0.13
586 0.08
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.08
592 0.09
593 0.09
594 0.13
595 0.19
596 0.21
597 0.23
598 0.23
599 0.23
600 0.22
601 0.22
602 0.18
603 0.12
604 0.09
605 0.07
606 0.05
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.05
612 0.06
613 0.06
614 0.08
615 0.08
616 0.1
617 0.1
618 0.12
619 0.16
620 0.18
621 0.2
622 0.21
623 0.22
624 0.24
625 0.27
626 0.26
627 0.24
628 0.26
629 0.28
630 0.32
631 0.37
632 0.42
633 0.41
634 0.49
635 0.56
636 0.53
637 0.52
638 0.51
639 0.48
640 0.43
641 0.51
642 0.47
643 0.39
644 0.41
645 0.46
646 0.46
647 0.47
648 0.45
649 0.37
650 0.35
651 0.37
652 0.37
653 0.34
654 0.32
655 0.31
656 0.3
657 0.33
658 0.32
659 0.31
660 0.31
661 0.3
662 0.36
663 0.32
664 0.32
665 0.29
666 0.29
667 0.27
668 0.26
669 0.22
670 0.15