Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PCT3

Protein Details
Accession J3PCT3    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-147APKTTKKAPASKKPVTSYKKHydrophilic
251-270EDVKPRKKPAAKPRAAPKAKBasic
1009-1033DEDDIKKDKYIKQPKAKAKKAAAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-41GGAAPAKPAPKKDDASAKKGGAARGKSRK
63-65RKK
203-207RGARK
224-240RATTKGKASAAGRKRKS
254-270KPRKKPAAKPRAAPKAK
445-457KARKAEAEKAAKA
1016-1040DKYIKQPKAKAKKAAAASSKKTTKK
1058-1081KSARGKGRPKGTGAAPKGKGKGKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12.833, cyto 9.5, cyto_mito 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006272  P:leading strand elongation  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0000278  P:mitotic cell cycle  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF00533  BRCT  
PF08519  RFC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
CDD cd00009  AAA  
cd17752  BRCT_RFC1  
cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MPADIRSFFGAKGGAAPAKPAPKKDDASAKKGGAARGKSRKVLDDSDEEEPAPAKPATRSTPRKKAGAAEPVKGVAISASDYFASSASGDKKAQPTPKAASKIKSEIEIRISPRTKEKTTADPTPDVAPKTTKKAPASKKPVTSYKKHDSDDAFMDDDDGGGDDDIFAADVRGRNKRKNEEYVEDDSEDEHLPQPKRIASRVRGARKGAVKDESEEEVDVKPSRATTKGKASAAGRKRKSPESDSEDEEEEDVKPRKKPAAKPRAAPKAKAADAEDPGIRAILDNVPTVRPPTPPPKDPNAKFDWRKAAAGGGNSGPPPDAGAIDLPEGEEDCLSGLTFVFTGLLKTLSREEGQALVKRYGGKVTGAPSGKTSFVVLGDDAGPSKLAKIKHHGIKTIDEVGLFHLIKTLPAQGGSGKGAEKARQKREEQEEQVKKAAAEMEAEEKARKAEAEKAAKARQAAGSRGSVVPPPPAPNSQLWTSKYAPTQISHICGNKAQVDRIKAWLENWPKSRKYDFKKRGADGMGGERAIIISGPPGIGKTTAAHMAARLAGYDVIESNASDTRSKKLVENGVSDVINNTSLLGFFSGEGKKVDETKKNIVLIMDEVDGMSAGDRGGVGALAKFCKKSEVPLILICNERRLPKMKPFDHAAFDIRFNRPTVEQIRSRIMTICHREGLGKMPAQVIDALIEGCNKDIRQIINMLHSIKLDGAALNYDQTKTMTKAWEKHVILKPWDICQKMLGGGLFSPASKSTLNDKIELYFNDHEFSYLMIQENYLGTRPHLLNGKNFGSKRQENLKYLELVEQASESISDGDLVDRMIHGPQQQWSLMPTHAVFSSVRPASYVSGQLMGSSFTAWLGMNSKTGKLGRFVREIHSHMRLKSSGDHNEIRQQYLPVLWDQLIKRLADEGKDAVEDVIELMDSYYLTRDDFDAIKELGVGYQDESKASIETQTKAAFTRTYNSMSHPIPFMKASNVTAPKAAAKDVPDLEEAIEDDDDAAVVAEPAEAEDEDDIKKDKYIKQPKAKAKKAAAASSKKTTKKSAAAADDFIDDDDDDEAKSARGKGRPKGTGAAPKGKGKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.22
4 0.25
5 0.34
6 0.38
7 0.39
8 0.42
9 0.46
10 0.5
11 0.54
12 0.59
13 0.56
14 0.59
15 0.62
16 0.57
17 0.55
18 0.55
19 0.54
20 0.51
21 0.51
22 0.55
23 0.58
24 0.63
25 0.63
26 0.63
27 0.65
28 0.62
29 0.61
30 0.56
31 0.52
32 0.51
33 0.48
34 0.46
35 0.39
36 0.34
37 0.29
38 0.24
39 0.21
40 0.17
41 0.15
42 0.17
43 0.23
44 0.3
45 0.4
46 0.5
47 0.56
48 0.67
49 0.7
50 0.72
51 0.69
52 0.7
53 0.68
54 0.68
55 0.63
56 0.56
57 0.53
58 0.48
59 0.45
60 0.37
61 0.28
62 0.17
63 0.13
64 0.11
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.08
73 0.13
74 0.15
75 0.18
76 0.2
77 0.25
78 0.3
79 0.36
80 0.44
81 0.43
82 0.46
83 0.5
84 0.57
85 0.61
86 0.61
87 0.59
88 0.59
89 0.62
90 0.57
91 0.56
92 0.5
93 0.46
94 0.47
95 0.48
96 0.44
97 0.47
98 0.48
99 0.45
100 0.52
101 0.54
102 0.51
103 0.52
104 0.53
105 0.54
106 0.58
107 0.63
108 0.59
109 0.54
110 0.53
111 0.51
112 0.51
113 0.42
114 0.38
115 0.36
116 0.35
117 0.4
118 0.45
119 0.46
120 0.49
121 0.57
122 0.65
123 0.69
124 0.75
125 0.75
126 0.77
127 0.77
128 0.8
129 0.77
130 0.76
131 0.74
132 0.75
133 0.75
134 0.68
135 0.67
136 0.61
137 0.58
138 0.55
139 0.49
140 0.39
141 0.31
142 0.3
143 0.23
144 0.2
145 0.15
146 0.1
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.07
157 0.1
158 0.15
159 0.25
160 0.31
161 0.38
162 0.47
163 0.57
164 0.63
165 0.69
166 0.72
167 0.7
168 0.71
169 0.7
170 0.65
171 0.56
172 0.48
173 0.38
174 0.33
175 0.26
176 0.21
177 0.18
178 0.21
179 0.22
180 0.24
181 0.27
182 0.29
183 0.32
184 0.37
185 0.43
186 0.4
187 0.49
188 0.56
189 0.62
190 0.63
191 0.63
192 0.64
193 0.62
194 0.62
195 0.57
196 0.53
197 0.45
198 0.42
199 0.42
200 0.38
201 0.32
202 0.27
203 0.23
204 0.19
205 0.2
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.17
211 0.21
212 0.25
213 0.28
214 0.37
215 0.43
216 0.43
217 0.47
218 0.48
219 0.52
220 0.56
221 0.61
222 0.55
223 0.55
224 0.6
225 0.63
226 0.66
227 0.62
228 0.62
229 0.6
230 0.61
231 0.57
232 0.55
233 0.49
234 0.42
235 0.37
236 0.28
237 0.2
238 0.22
239 0.23
240 0.24
241 0.25
242 0.28
243 0.36
244 0.43
245 0.53
246 0.58
247 0.64
248 0.67
249 0.72
250 0.78
251 0.81
252 0.77
253 0.69
254 0.65
255 0.62
256 0.57
257 0.53
258 0.46
259 0.39
260 0.38
261 0.38
262 0.31
263 0.23
264 0.21
265 0.18
266 0.14
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.17
276 0.16
277 0.16
278 0.2
279 0.29
280 0.35
281 0.41
282 0.46
283 0.53
284 0.62
285 0.63
286 0.65
287 0.62
288 0.65
289 0.62
290 0.62
291 0.61
292 0.53
293 0.51
294 0.44
295 0.41
296 0.34
297 0.31
298 0.27
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.16
303 0.12
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.06
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.13
339 0.16
340 0.19
341 0.22
342 0.24
343 0.22
344 0.24
345 0.24
346 0.24
347 0.21
348 0.19
349 0.16
350 0.15
351 0.17
352 0.21
353 0.21
354 0.21
355 0.21
356 0.22
357 0.21
358 0.19
359 0.17
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.1
373 0.12
374 0.15
375 0.21
376 0.3
377 0.37
378 0.39
379 0.43
380 0.42
381 0.42
382 0.42
383 0.39
384 0.31
385 0.24
386 0.22
387 0.18
388 0.2
389 0.17
390 0.14
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.09
397 0.09
398 0.1
399 0.08
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.09
404 0.12
405 0.13
406 0.17
407 0.25
408 0.32
409 0.4
410 0.46
411 0.48
412 0.53
413 0.6
414 0.64
415 0.62
416 0.64
417 0.62
418 0.58
419 0.58
420 0.5
421 0.41
422 0.34
423 0.29
424 0.18
425 0.13
426 0.11
427 0.13
428 0.13
429 0.14
430 0.13
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.1
435 0.08
436 0.15
437 0.22
438 0.28
439 0.31
440 0.35
441 0.38
442 0.39
443 0.38
444 0.32
445 0.29
446 0.26
447 0.24
448 0.22
449 0.2
450 0.2
451 0.2
452 0.19
453 0.16
454 0.14
455 0.14
456 0.13
457 0.15
458 0.16
459 0.17
460 0.19
461 0.19
462 0.21
463 0.23
464 0.27
465 0.26
466 0.28
467 0.29
468 0.3
469 0.29
470 0.3
471 0.27
472 0.23
473 0.25
474 0.22
475 0.22
476 0.22
477 0.22
478 0.19
479 0.19
480 0.2
481 0.21
482 0.2
483 0.21
484 0.21
485 0.23
486 0.23
487 0.25
488 0.25
489 0.2
490 0.2
491 0.25
492 0.27
493 0.3
494 0.35
495 0.37
496 0.38
497 0.41
498 0.46
499 0.47
500 0.5
501 0.56
502 0.59
503 0.63
504 0.69
505 0.66
506 0.66
507 0.58
508 0.52
509 0.42
510 0.36
511 0.27
512 0.2
513 0.18
514 0.13
515 0.11
516 0.09
517 0.07
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.05
544 0.04
545 0.05
546 0.07
547 0.08
548 0.1
549 0.11
550 0.13
551 0.15
552 0.16
553 0.17
554 0.2
555 0.25
556 0.26
557 0.28
558 0.27
559 0.27
560 0.26
561 0.24
562 0.19
563 0.13
564 0.11
565 0.08
566 0.06
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.04
572 0.04
573 0.08
574 0.08
575 0.09
576 0.1
577 0.11
578 0.11
579 0.16
580 0.21
581 0.23
582 0.28
583 0.32
584 0.36
585 0.35
586 0.35
587 0.3
588 0.26
589 0.21
590 0.17
591 0.12
592 0.08
593 0.07
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.04
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.04
607 0.05
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.09
612 0.12
613 0.12
614 0.15
615 0.21
616 0.24
617 0.25
618 0.27
619 0.29
620 0.27
621 0.31
622 0.27
623 0.24
624 0.22
625 0.22
626 0.22
627 0.25
628 0.27
629 0.32
630 0.42
631 0.41
632 0.42
633 0.47
634 0.47
635 0.45
636 0.43
637 0.38
638 0.29
639 0.3
640 0.3
641 0.26
642 0.24
643 0.22
644 0.21
645 0.18
646 0.23
647 0.24
648 0.25
649 0.27
650 0.29
651 0.33
652 0.32
653 0.33
654 0.29
655 0.28
656 0.29
657 0.32
658 0.31
659 0.27
660 0.27
661 0.26
662 0.25
663 0.27
664 0.24
665 0.19
666 0.18
667 0.18
668 0.18
669 0.17
670 0.17
671 0.12
672 0.08
673 0.07
674 0.07
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.07
680 0.07
681 0.08
682 0.11
683 0.12
684 0.13
685 0.16
686 0.17
687 0.19
688 0.22
689 0.21
690 0.19
691 0.18
692 0.17
693 0.14
694 0.13
695 0.09
696 0.07
697 0.06
698 0.07
699 0.07
700 0.08
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.09
705 0.11
706 0.12
707 0.16
708 0.2
709 0.24
710 0.3
711 0.34
712 0.43
713 0.41
714 0.49
715 0.52
716 0.51
717 0.49
718 0.49
719 0.45
720 0.42
721 0.46
722 0.38
723 0.32
724 0.28
725 0.26
726 0.22
727 0.22
728 0.16
729 0.11
730 0.1
731 0.11
732 0.1
733 0.09
734 0.09
735 0.08
736 0.1
737 0.1
738 0.11
739 0.16
740 0.24
741 0.25
742 0.26
743 0.26
744 0.26
745 0.29
746 0.28
747 0.28
748 0.23
749 0.22
750 0.22
751 0.21
752 0.19
753 0.16
754 0.16
755 0.11
756 0.1
757 0.1
758 0.09
759 0.09
760 0.1
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.09
765 0.08
766 0.14
767 0.14
768 0.17
769 0.22
770 0.23
771 0.26
772 0.32
773 0.36
774 0.37
775 0.37
776 0.39
777 0.42
778 0.43
779 0.45
780 0.49
781 0.51
782 0.48
783 0.52
784 0.5
785 0.44
786 0.42
787 0.39
788 0.3
789 0.23
790 0.2
791 0.16
792 0.13
793 0.1
794 0.09
795 0.06
796 0.06
797 0.05
798 0.05
799 0.05
800 0.06
801 0.06
802 0.06
803 0.06
804 0.06
805 0.06
806 0.07
807 0.09
808 0.1
809 0.12
810 0.15
811 0.18
812 0.18
813 0.18
814 0.19
815 0.19
816 0.17
817 0.17
818 0.15
819 0.13
820 0.13
821 0.14
822 0.13
823 0.12
824 0.2
825 0.18
826 0.18
827 0.17
828 0.18
829 0.19
830 0.2
831 0.21
832 0.14
833 0.16
834 0.16
835 0.15
836 0.14
837 0.13
838 0.11
839 0.09
840 0.08
841 0.06
842 0.07
843 0.06
844 0.07
845 0.09
846 0.1
847 0.13
848 0.15
849 0.15
850 0.19
851 0.21
852 0.22
853 0.25
854 0.32
855 0.33
856 0.38
857 0.39
858 0.41
859 0.45
860 0.47
861 0.47
862 0.48
863 0.47
864 0.42
865 0.45
866 0.4
867 0.36
868 0.4
869 0.41
870 0.4
871 0.42
872 0.44
873 0.42
874 0.5
875 0.49
876 0.45
877 0.39
878 0.33
879 0.28
880 0.26
881 0.25
882 0.18
883 0.18
884 0.16
885 0.2
886 0.19
887 0.25
888 0.26
889 0.24
890 0.23
891 0.26
892 0.27
893 0.23
894 0.25
895 0.2
896 0.18
897 0.19
898 0.19
899 0.13
900 0.11
901 0.1
902 0.08
903 0.06
904 0.05
905 0.04
906 0.04
907 0.05
908 0.05
909 0.05
910 0.06
911 0.07
912 0.07
913 0.08
914 0.09
915 0.11
916 0.12
917 0.13
918 0.16
919 0.16
920 0.15
921 0.15
922 0.14
923 0.12
924 0.12
925 0.11
926 0.09
927 0.13
928 0.13
929 0.13
930 0.15
931 0.15
932 0.14
933 0.14
934 0.19
935 0.18
936 0.19
937 0.23
938 0.24
939 0.24
940 0.24
941 0.26
942 0.23
943 0.22
944 0.25
945 0.25
946 0.28
947 0.28
948 0.31
949 0.35
950 0.34
951 0.34
952 0.32
953 0.3
954 0.28
955 0.29
956 0.26
957 0.24
958 0.26
959 0.26
960 0.31
961 0.34
962 0.33
963 0.32
964 0.32
965 0.32
966 0.3
967 0.29
968 0.23
969 0.21
970 0.27
971 0.27
972 0.28
973 0.25
974 0.24
975 0.23
976 0.21
977 0.19
978 0.14
979 0.12
980 0.1
981 0.09
982 0.08
983 0.07
984 0.06
985 0.06
986 0.04
987 0.04
988 0.04
989 0.04
990 0.04
991 0.05
992 0.06
993 0.06
994 0.06
995 0.07
996 0.09
997 0.1
998 0.12
999 0.14
1000 0.13
1001 0.16
1002 0.22
1003 0.28
1004 0.38
1005 0.48
1006 0.57
1007 0.66
1008 0.75
1009 0.83
1010 0.89
1011 0.9
1012 0.89
1013 0.85
1014 0.83
1015 0.79
1016 0.78
1017 0.77
1018 0.75
1019 0.73
1020 0.73
1021 0.74
1022 0.72
1023 0.7
1024 0.68
1025 0.66
1026 0.65
1027 0.66
1028 0.65
1029 0.65
1030 0.63
1031 0.6
1032 0.54
1033 0.47
1034 0.4
1035 0.32
1036 0.24
1037 0.15
1038 0.12
1039 0.11
1040 0.1
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.1
1044 0.1
1045 0.13
1046 0.17
1047 0.23
1048 0.29
1049 0.37
1050 0.45
1051 0.55
1052 0.6
1053 0.61
1054 0.62
1055 0.64
1056 0.67
1057 0.67
1058 0.68
1059 0.64
1060 0.65
1061 0.67