Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2B7WJT4

Protein Details
Accession A0A2B7WJT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-88VNGANNRQPARPRKEPQKPGDPASRLHydrophilic
401-421ENPLHRSKPPSPKTRRRTVAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
CDD cd22265  UDM1_RNF168  
Amino Acid Sequences MATAVSTKPPAPKIKRPAPSYIQTGINGARSSQPSPSPLGPATNRVAGVKQPGASTPTSAAAVNGANNRQPARPRKEPQKPGDPASRLQRLSMKSSGADGALGDRKQHKKFPEPYVKTSSYILKKYSKVPPSLTIHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKVMIEHIKAGTVPHDMVEELLKGGVRFYENCLIVRVVDHKSVSAQPNPSSSSSSGEKSSPFSLHNYNQHVTPSPFVPYPQQNQSKIKSTSNSPESQKPDVQSSSQSNSQSSDSKADTDGSGSSKQPAPKPKVFTTVLHPTPQSLLAELTLLSMTPDPRVINRRQSQVFPASRTGSIPQPSTPLSALPSSPATDRGPPAKRQKMMIEPHELLEAEAKLIHATAPPLYLEPVDGLAASANLLKFLENPLHRSKPPSPKTRRRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLGPTMSANGAAAKAPNVDDESGAAPFEPRFSRFKTLEKIRADHEEKAKLEHEKKLQQDHAKRLQQEAEREKRRAHEQKMAEEQSKEDFKRQQAAAAAQHAQVQAQLAAQNRRPQSRGNPPMGIPHQPQPQQMIPASQGLQSSPVVRNTTPHSSSPLVGNIMGSQMNQAIPMAMTSSAQGAGSPPQATASVQHGHPAVMGHPMAASRSQQGPSRHGTPQMPQGTPAMSHATPIMRNVTPTQRMTRASPNASTMAQTPVMNHAMMANPHMNGVMMTPQQQQAAILHQRQIMLQRNMQGNGPPLTAQHVAQIQAIQQAQQNINLQHAQQQQQQQQQQQQNIYMQHPQQVQQQHPQQPQPQHFPNPAAYSNAMRNQMGQLQMNQQQPQPTHGQQQGSPQQLPQQQAMAAAQMNGTGQTQGGLPPKYRQIYLQRQAMLVSEHRPRYEKQYGHYHSWPENIRQQFHITMDKAAKQFLIEYMKQEGQQRAAQLHIQNQAHAQAQAQAHAIQQQQQQSMMGNGMGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.76
4 0.78
5 0.76
6 0.74
7 0.7
8 0.64
9 0.59
10 0.5
11 0.49
12 0.42
13 0.39
14 0.33
15 0.27
16 0.28
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.31
21 0.29
22 0.35
23 0.35
24 0.34
25 0.32
26 0.38
27 0.36
28 0.38
29 0.39
30 0.37
31 0.36
32 0.32
33 0.32
34 0.28
35 0.33
36 0.31
37 0.29
38 0.26
39 0.27
40 0.29
41 0.29
42 0.28
43 0.23
44 0.21
45 0.2
46 0.19
47 0.17
48 0.15
49 0.16
50 0.18
51 0.2
52 0.21
53 0.22
54 0.26
55 0.28
56 0.31
57 0.39
58 0.45
59 0.49
60 0.57
61 0.64
62 0.72
63 0.8
64 0.86
65 0.86
66 0.86
67 0.83
68 0.8
69 0.8
70 0.73
71 0.68
72 0.67
73 0.67
74 0.56
75 0.54
76 0.54
77 0.48
78 0.5
79 0.47
80 0.4
81 0.32
82 0.34
83 0.31
84 0.25
85 0.21
86 0.15
87 0.16
88 0.2
89 0.2
90 0.22
91 0.29
92 0.37
93 0.42
94 0.48
95 0.5
96 0.55
97 0.63
98 0.7
99 0.73
100 0.72
101 0.74
102 0.77
103 0.72
104 0.64
105 0.58
106 0.56
107 0.52
108 0.49
109 0.48
110 0.46
111 0.47
112 0.52
113 0.59
114 0.57
115 0.55
116 0.55
117 0.57
118 0.58
119 0.6
120 0.57
121 0.5
122 0.49
123 0.47
124 0.46
125 0.42
126 0.38
127 0.38
128 0.35
129 0.35
130 0.33
131 0.33
132 0.39
133 0.36
134 0.39
135 0.36
136 0.4
137 0.38
138 0.34
139 0.33
140 0.28
141 0.27
142 0.22
143 0.19
144 0.15
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.15
172 0.22
173 0.23
174 0.23
175 0.25
176 0.24
177 0.22
178 0.23
179 0.22
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.18
184 0.21
185 0.27
186 0.29
187 0.3
188 0.31
189 0.3
190 0.33
191 0.36
192 0.34
193 0.32
194 0.28
195 0.28
196 0.26
197 0.27
198 0.25
199 0.24
200 0.24
201 0.24
202 0.26
203 0.23
204 0.22
205 0.23
206 0.28
207 0.33
208 0.39
209 0.41
210 0.39
211 0.38
212 0.39
213 0.39
214 0.34
215 0.3
216 0.24
217 0.21
218 0.2
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.31
223 0.39
224 0.45
225 0.48
226 0.53
227 0.57
228 0.59
229 0.56
230 0.55
231 0.49
232 0.47
233 0.5
234 0.5
235 0.51
236 0.46
237 0.5
238 0.51
239 0.53
240 0.51
241 0.44
242 0.43
243 0.39
244 0.37
245 0.35
246 0.34
247 0.33
248 0.35
249 0.34
250 0.29
251 0.29
252 0.3
253 0.28
254 0.25
255 0.25
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.2
260 0.18
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.16
265 0.15
266 0.17
267 0.2
268 0.23
269 0.28
270 0.36
271 0.41
272 0.45
273 0.51
274 0.51
275 0.55
276 0.54
277 0.5
278 0.48
279 0.49
280 0.45
281 0.41
282 0.38
283 0.31
284 0.3
285 0.3
286 0.23
287 0.14
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.09
300 0.09
301 0.13
302 0.19
303 0.23
304 0.32
305 0.37
306 0.44
307 0.45
308 0.46
309 0.47
310 0.5
311 0.49
312 0.42
313 0.41
314 0.36
315 0.34
316 0.33
317 0.3
318 0.26
319 0.25
320 0.23
321 0.2
322 0.21
323 0.21
324 0.21
325 0.2
326 0.15
327 0.14
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.15
335 0.15
336 0.16
337 0.19
338 0.25
339 0.28
340 0.34
341 0.44
342 0.48
343 0.48
344 0.49
345 0.52
346 0.52
347 0.55
348 0.52
349 0.49
350 0.42
351 0.4
352 0.38
353 0.33
354 0.25
355 0.2
356 0.15
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.07
387 0.13
388 0.12
389 0.17
390 0.23
391 0.27
392 0.27
393 0.33
394 0.4
395 0.45
396 0.53
397 0.59
398 0.63
399 0.7
400 0.77
401 0.81
402 0.8
403 0.74
404 0.72
405 0.66
406 0.63
407 0.55
408 0.48
409 0.39
410 0.31
411 0.26
412 0.2
413 0.15
414 0.07
415 0.05
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.04
425 0.04
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.07
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.05
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.12
459 0.15
460 0.22
461 0.23
462 0.28
463 0.33
464 0.39
465 0.45
466 0.45
467 0.43
468 0.39
469 0.45
470 0.44
471 0.4
472 0.38
473 0.35
474 0.33
475 0.34
476 0.34
477 0.32
478 0.32
479 0.32
480 0.34
481 0.34
482 0.37
483 0.41
484 0.44
485 0.46
486 0.49
487 0.52
488 0.56
489 0.54
490 0.52
491 0.49
492 0.49
493 0.44
494 0.45
495 0.46
496 0.47
497 0.48
498 0.49
499 0.48
500 0.46
501 0.53
502 0.53
503 0.49
504 0.48
505 0.46
506 0.5
507 0.56
508 0.56
509 0.48
510 0.4
511 0.36
512 0.32
513 0.34
514 0.28
515 0.24
516 0.26
517 0.25
518 0.31
519 0.3
520 0.29
521 0.26
522 0.29
523 0.26
524 0.25
525 0.24
526 0.18
527 0.2
528 0.17
529 0.15
530 0.12
531 0.11
532 0.08
533 0.07
534 0.09
535 0.11
536 0.14
537 0.17
538 0.23
539 0.25
540 0.27
541 0.28
542 0.29
543 0.34
544 0.42
545 0.46
546 0.45
547 0.44
548 0.42
549 0.47
550 0.46
551 0.43
552 0.34
553 0.33
554 0.35
555 0.35
556 0.36
557 0.34
558 0.33
559 0.31
560 0.3
561 0.25
562 0.2
563 0.19
564 0.19
565 0.16
566 0.15
567 0.12
568 0.13
569 0.12
570 0.14
571 0.14
572 0.16
573 0.17
574 0.16
575 0.19
576 0.22
577 0.28
578 0.27
579 0.26
580 0.28
581 0.27
582 0.28
583 0.27
584 0.24
585 0.18
586 0.16
587 0.15
588 0.11
589 0.11
590 0.1
591 0.08
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.06
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.04
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.07
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.09
614 0.1
615 0.1
616 0.11
617 0.13
618 0.14
619 0.14
620 0.16
621 0.16
622 0.15
623 0.16
624 0.14
625 0.11
626 0.11
627 0.11
628 0.09
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.13
636 0.15
637 0.21
638 0.24
639 0.27
640 0.31
641 0.35
642 0.34
643 0.35
644 0.35
645 0.33
646 0.39
647 0.4
648 0.36
649 0.32
650 0.31
651 0.27
652 0.26
653 0.24
654 0.2
655 0.14
656 0.14
657 0.15
658 0.16
659 0.15
660 0.16
661 0.19
662 0.15
663 0.17
664 0.2
665 0.25
666 0.28
667 0.31
668 0.34
669 0.34
670 0.36
671 0.38
672 0.44
673 0.44
674 0.42
675 0.4
676 0.38
677 0.36
678 0.34
679 0.31
680 0.23
681 0.2
682 0.18
683 0.17
684 0.15
685 0.17
686 0.18
687 0.17
688 0.15
689 0.13
690 0.13
691 0.14
692 0.16
693 0.13
694 0.12
695 0.12
696 0.12
697 0.11
698 0.09
699 0.09
700 0.1
701 0.1
702 0.12
703 0.15
704 0.16
705 0.16
706 0.16
707 0.16
708 0.13
709 0.2
710 0.23
711 0.23
712 0.25
713 0.26
714 0.26
715 0.27
716 0.33
717 0.35
718 0.33
719 0.33
720 0.36
721 0.39
722 0.39
723 0.39
724 0.34
725 0.29
726 0.27
727 0.25
728 0.19
729 0.16
730 0.2
731 0.2
732 0.18
733 0.17
734 0.17
735 0.17
736 0.18
737 0.18
738 0.14
739 0.18
740 0.18
741 0.15
742 0.16
743 0.2
744 0.2
745 0.23
746 0.27
747 0.22
748 0.26
749 0.26
750 0.24
751 0.27
752 0.32
753 0.32
754 0.33
755 0.41
756 0.45
757 0.52
758 0.57
759 0.56
760 0.6
761 0.62
762 0.62
763 0.57
764 0.54
765 0.5
766 0.48
767 0.44
768 0.41
769 0.36
770 0.37
771 0.36
772 0.34
773 0.36
774 0.39
775 0.41
776 0.44
777 0.51
778 0.54
779 0.58
780 0.62
781 0.63
782 0.65
783 0.68
784 0.68
785 0.65
786 0.63
787 0.61
788 0.57
789 0.55
790 0.51
791 0.45
792 0.4
793 0.35
794 0.32
795 0.34
796 0.36
797 0.34
798 0.29
799 0.29
800 0.28
801 0.3
802 0.3
803 0.26
804 0.24
805 0.27
806 0.34
807 0.38
808 0.37
809 0.36
810 0.38
811 0.37
812 0.39
813 0.39
814 0.36
815 0.39
816 0.42
817 0.43
818 0.39
819 0.48
820 0.52
821 0.5
822 0.48
823 0.41
824 0.43
825 0.45
826 0.45
827 0.37
828 0.32
829 0.26
830 0.27
831 0.26
832 0.21
833 0.17
834 0.14
835 0.12
836 0.1
837 0.1
838 0.09
839 0.09
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.11
845 0.17
846 0.19
847 0.21
848 0.25
849 0.33
850 0.36
851 0.36
852 0.39
853 0.43
854 0.52
855 0.58
856 0.61
857 0.55
858 0.53
859 0.52
860 0.46
861 0.4
862 0.32
863 0.29
864 0.3
865 0.32
866 0.34
867 0.37
868 0.38
869 0.44
870 0.5
871 0.48
872 0.47
873 0.54
874 0.57
875 0.62
876 0.64
877 0.61
878 0.55
879 0.59
880 0.57
881 0.52
882 0.55
883 0.53
884 0.51
885 0.49
886 0.5
887 0.46
888 0.45
889 0.46
890 0.39
891 0.39
892 0.41
893 0.44
894 0.4
895 0.38
896 0.34
897 0.27
898 0.27
899 0.26
900 0.29
901 0.25
902 0.27
903 0.32
904 0.34
905 0.36
906 0.42
907 0.4
908 0.37
909 0.39
910 0.39
911 0.34
912 0.34
913 0.37
914 0.35
915 0.37
916 0.41
917 0.38
918 0.37
919 0.37
920 0.37
921 0.34
922 0.3
923 0.25
924 0.22
925 0.22
926 0.23
927 0.23
928 0.21
929 0.19
930 0.24
931 0.25
932 0.25
933 0.3
934 0.34
935 0.33
936 0.34
937 0.34
938 0.3
939 0.3
940 0.25