FuNGI

A0A2B7Y8Y7

Protein Details

Accession

A0A2B7Y8Y7

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-52	GPFMKVRRQKADPLVRPKKKPPPRPPGQGLSGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-74	RPPPGPNGPFMKVRRQKADPLVRPKKKPPPRPPGQGLSGGPLPNGIAAPKPRPPQAAPKAHP
427-433	GKRVRKA
505-526	PKHTDPLNKKVASRSARKRPGS
538-586	SRKKPKSKHAADAQPDSRPMSPAPGAQRKPAPADQASKKRARNGPGAGG
609-633	AKKPKLNPPGVKSKTGTPRGSRAGS

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSSTPPNQPPPGRPPPGPNGPFMKVRRQKADPLVRPKKKPPPRPPGQGLSGGPLPNGIAAPKPRPPQAAPKAHPPAVPPKPTILSADDLTVNGFSGPLLSESYVDYPLVTTKRAWREGLKHHVAKFASKKHIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRASNIGPAADKNDQPPRKPGDHLTEAEREELEAKKAAREKERAENLAQIAPSASTTQKKTNAPKQRTQQVFKSEMTPQEIARARIKYEEALPWHLDDFDNKGTWVGNYEAAMSETYAMFVLQNDGKMRMVPIDKWYKFNTKSPFKTLTIEEAEKFMAKKIKDPRWFMEKEQDRAQKKELEAYAKQNKLFTGRSRTETFPGATEGFEGDDLDFEEDRFADDEEHVGIFDEDEDAKTAERRIKEDQLKANIFDLKDEKMYDEEENQEKREKEELKNFGKRVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDDESSEDSEAERQKEEQRKLEEERLRKEKGKDSDKNNSGTSTKGTNTPSGRPKHTDPLNKKVASRSARKRPGSPNLSEASGTDTSRKKPKSKHAADAQPDSRPMSPAPGAQRKPAPADQASKKRARNGPGAGGGSGSGSDGERGAGSGGEMSDAAAKKPKLNPPGVKSKTGTPRGSRAGSPAVPGRGPGSGASSPDPTGRGSQPRTSTPVPPNGGAFPTAAEIHSSIPATGIASGELLKIFRPRIGDSKENHRRFIAIVRDVTIYGKEDRLLRPGTLKGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.66
3	0.71
4	0.66
5	0.62
6	0.58
7	0.56
8	0.61
9	0.57
10	0.59
11	0.57
12	0.63
13	0.66
14	0.64
15	0.69
16	0.71
17	0.78
18	0.76
19	0.79
20	0.82
21	0.83
22	0.85
23	0.87
24	0.87
25	0.86
26	0.88
27	0.88
28	0.87
29	0.88
30	0.91
31	0.89
32	0.86
33	0.8
34	0.76
35	0.66
36	0.6
37	0.55
38	0.45
39	0.36
40	0.29
41	0.24
42	0.17
43	0.17
44	0.12
45	0.13
46	0.17
47	0.23
48	0.3
49	0.35
50	0.39
51	0.44
52	0.47
53	0.53
54	0.59
55	0.64
56	0.61
57	0.66
58	0.7
59	0.68
60	0.65
61	0.58
62	0.58
63	0.56
64	0.58
65	0.49
66	0.46
67	0.45
68	0.45
69	0.44
70	0.37
71	0.32
72	0.27
73	0.28
74	0.23
75	0.2
76	0.2
77	0.16
78	0.13
79	0.09
80	0.08
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.08
86	0.08
87	0.08
88	0.1
89	0.12
90	0.13
91	0.12
92	0.11
93	0.11
94	0.15
95	0.16
96	0.16
97	0.17
98	0.24
99	0.33
100	0.37
101	0.4
102	0.42
103	0.48
104	0.56
105	0.64
106	0.65
107	0.62
108	0.6
109	0.63
110	0.57
111	0.57
112	0.55
113	0.53
114	0.54
115	0.51
116	0.54
117	0.58
118	0.66
119	0.62
120	0.6
121	0.59
122	0.6
123	0.61
124	0.58
125	0.53
126	0.52
127	0.49
128	0.5
129	0.45
130	0.44
131	0.51
132	0.57
133	0.62
134	0.65
135	0.74
136	0.76
137	0.75
138	0.73
139	0.71
140	0.65
141	0.59
142	0.52
143	0.44
144	0.37
145	0.34
146	0.32
147	0.27
148	0.26
149	0.27
150	0.34
151	0.36
152	0.37
153	0.44
154	0.46
155	0.46
156	0.48
157	0.49
158	0.48
159	0.5
160	0.5
161	0.47
162	0.46
163	0.43
164	0.4
165	0.34
166	0.26
167	0.22
168	0.21
169	0.18
170	0.16
171	0.16
172	0.2
173	0.25
174	0.3
175	0.34
176	0.39
177	0.42
178	0.48
179	0.55
180	0.52
181	0.49
182	0.48
183	0.43
184	0.39
185	0.34
186	0.24
187	0.18
188	0.15
189	0.14
190	0.12
191	0.13
192	0.14
193	0.17
194	0.23
195	0.29
196	0.36
197	0.44
198	0.52
199	0.6
200	0.63
201	0.68
202	0.71
203	0.74
204	0.76
205	0.72
206	0.69
207	0.66
208	0.64
209	0.56
210	0.52
211	0.46
212	0.41
213	0.4
214	0.34
215	0.27
216	0.3
217	0.32
218	0.31
219	0.33
220	0.31
221	0.27
222	0.28
223	0.29
224	0.23
225	0.23
226	0.24
227	0.22
228	0.24
229	0.24
230	0.22
231	0.22
232	0.21
233	0.18
234	0.15
235	0.16
236	0.15
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.07
259	0.07
260	0.09
261	0.1
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.13
267	0.13
268	0.13
269	0.19
270	0.28
271	0.29
272	0.32
273	0.35
274	0.4
275	0.41
276	0.46
277	0.49
278	0.48
279	0.51
280	0.54
281	0.56
282	0.49
283	0.5
284	0.44
285	0.4
286	0.35
287	0.33
288	0.27
289	0.23
290	0.22
291	0.2
292	0.19
293	0.16
294	0.16
295	0.15
296	0.21
297	0.29
298	0.38
299	0.45
300	0.49
301	0.51
302	0.54
303	0.56
304	0.51
305	0.52
306	0.49
307	0.45
308	0.49
309	0.53
310	0.47
311	0.48
312	0.49
313	0.44
314	0.38
315	0.4
316	0.34
317	0.32
318	0.31
319	0.37
320	0.42
321	0.4
322	0.4
323	0.35
324	0.33
325	0.31
326	0.32
327	0.28
328	0.29
329	0.29
330	0.32
331	0.35
332	0.36
333	0.34
334	0.34
335	0.3
336	0.22
337	0.21
338	0.17
339	0.14
340	0.12
341	0.1
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.05
346	0.04
347	0.05
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.09
374	0.12
375	0.13
376	0.16
377	0.2
378	0.28
379	0.34
380	0.39
381	0.43
382	0.46
383	0.46
384	0.44
385	0.41
386	0.35
387	0.29
388	0.25
389	0.21
390	0.15
391	0.15
392	0.14
393	0.13
394	0.11
395	0.13
396	0.12
397	0.12
398	0.15
399	0.19
400	0.21
401	0.21
402	0.25
403	0.24
404	0.25
405	0.3
406	0.31
407	0.31
408	0.38
409	0.45
410	0.49
411	0.55
412	0.55
413	0.54
414	0.57
415	0.54
416	0.54
417	0.53
418	0.55
419	0.58
420	0.67
421	0.72
422	0.74
423	0.78
424	0.78
425	0.73
426	0.69
427	0.61
428	0.53
429	0.48
430	0.39
431	0.36
432	0.3
433	0.27
434	0.22
435	0.21
436	0.19
437	0.14
438	0.13
439	0.12
440	0.1
441	0.11
442	0.11
443	0.13
444	0.14
445	0.13
446	0.13
447	0.11
448	0.15
449	0.17
450	0.17
451	0.15
452	0.16
453	0.24
454	0.32
455	0.36
456	0.39
457	0.41
458	0.45
459	0.49
460	0.56
461	0.55
462	0.53
463	0.57
464	0.57
465	0.57
466	0.57
467	0.57
468	0.56
469	0.58
470	0.62
471	0.61
472	0.62
473	0.68
474	0.67
475	0.66
476	0.59
477	0.52
478	0.42
479	0.36
480	0.31
481	0.24
482	0.2
483	0.22
484	0.23
485	0.26
486	0.28
487	0.34
488	0.4
489	0.42
490	0.46
491	0.46
492	0.48
493	0.51
494	0.56
495	0.59
496	0.58
497	0.62
498	0.67
499	0.63
500	0.61
501	0.56
502	0.57
503	0.53
504	0.57
505	0.57
506	0.59
507	0.67
508	0.69
509	0.72
510	0.72
511	0.75
512	0.72
513	0.65
514	0.59
515	0.51
516	0.49
517	0.42
518	0.33
519	0.28
520	0.24
521	0.22
522	0.22
523	0.23
524	0.27
525	0.36
526	0.42
527	0.44
528	0.5
529	0.61
530	0.66
531	0.7
532	0.75
533	0.76
534	0.79
535	0.78
536	0.78
537	0.7
538	0.61
539	0.55
540	0.48
541	0.39
542	0.32
543	0.26
544	0.22
545	0.21
546	0.22
547	0.3
548	0.37
549	0.38
550	0.41
551	0.45
552	0.43
553	0.47
554	0.46
555	0.43
556	0.39
557	0.46
558	0.5
559	0.56
560	0.6
561	0.62
562	0.62
563	0.65
564	0.67
565	0.64
566	0.63
567	0.58
568	0.57
569	0.55
570	0.53
571	0.44
572	0.37
573	0.32
574	0.23
575	0.18
576	0.11
577	0.07
578	0.05
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.1
593	0.11
594	0.12
595	0.18
596	0.19
597	0.24
598	0.31
599	0.39
600	0.42
601	0.51
602	0.58
603	0.58
604	0.69
605	0.68
606	0.66
607	0.61
608	0.61
609	0.62
610	0.63
611	0.63
612	0.56
613	0.6
614	0.61
615	0.62
616	0.54
617	0.49
618	0.47
619	0.41
620	0.4
621	0.37
622	0.33
623	0.3
624	0.3
625	0.27
626	0.21
627	0.21
628	0.17
629	0.18
630	0.17
631	0.19
632	0.21
633	0.21
634	0.22
635	0.22
636	0.23
637	0.19
638	0.22
639	0.26
640	0.32
641	0.35
642	0.41
643	0.44
644	0.47
645	0.53
646	0.52
647	0.54
648	0.53
649	0.57
650	0.53
651	0.5
652	0.48
653	0.43
654	0.41
655	0.33
656	0.26
657	0.18
658	0.17
659	0.16
660	0.14
661	0.13
662	0.12
663	0.13
664	0.15
665	0.15
666	0.12
667	0.12
668	0.12
669	0.12
670	0.11
671	0.1
672	0.08
673	0.08
674	0.09
675	0.09
676	0.09
677	0.09
678	0.1
679	0.15
680	0.16
681	0.18
682	0.21
683	0.25
684	0.33
685	0.4
686	0.45
687	0.46
688	0.56
689	0.64
690	0.65
691	0.64
692	0.56
693	0.5
694	0.45
695	0.49
696	0.47
697	0.43
698	0.4
699	0.39
700	0.4
701	0.39
702	0.38
703	0.31
704	0.25
705	0.21
706	0.21
707	0.21
708	0.25
709	0.27
710	0.32
711	0.33
712	0.31
713	0.34

A0A2B7Y8Y7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer