Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BU86

Protein Details
Accession G8BU86    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-87EHTQSKSVGKYKKKHRGKKSNSVIKINSHydrophilic
113-142NSNSNNGKKSSRRRSKKKKPSTTDEGKDKEHydrophilic
160-192NANMKQTSSKKNNNRKKTNKKKHQDSSNVNKKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-78GKYKKKHRGKK
119-132GKKSSRRRSKKKKP
169-182KKNNNRKKTNKKKH
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tpf:TPHA_0E03750  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MSDSKEDIENVVKSEVEKEDSQIPIQESKSFILAPKPSQSPWKNGEVDGTNIPEQVISIEHTQSKSVGKYKKKHRGKKSNSVIKINSNTKWEAIQPVIVVADEVGNKTSNSNNSNSNNGKKSSRRRSKKKKPSTTDEGKDKESSKQNEDQQHSANGNKSNANMKQTSSKKNNNRKKTNKKKHQDSSNVNKKSEPDSKSYKDTESKKHNNNHNRNLYHGDHQNTDQRTYYSLKPIIDSVNAVAHQIEYYLSKENLEKDTYLMPKLSKDGYISMYPLSKFFRLVNLSFGGNISILLAALREIVVNENATITVSSGAFLDLNIEDSENILRQFFLRGKDWESYKGDIVNNKEESSYIIEKELSGNDLDQYMIFNVKGSNHRRSVDANHEGKENANATNTEEPKAEPEMETEKEDVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.23
4 0.22
5 0.23
6 0.27
7 0.29
8 0.29
9 0.29
10 0.29
11 0.3
12 0.31
13 0.31
14 0.28
15 0.27
16 0.28
17 0.25
18 0.24
19 0.26
20 0.29
21 0.3
22 0.35
23 0.37
24 0.37
25 0.46
26 0.49
27 0.49
28 0.5
29 0.54
30 0.5
31 0.47
32 0.51
33 0.43
34 0.42
35 0.37
36 0.37
37 0.29
38 0.26
39 0.26
40 0.19
41 0.16
42 0.13
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.14
47 0.17
48 0.18
49 0.19
50 0.2
51 0.23
52 0.25
53 0.31
54 0.37
55 0.43
56 0.52
57 0.62
58 0.71
59 0.79
60 0.84
61 0.87
62 0.9
63 0.91
64 0.92
65 0.92
66 0.92
67 0.88
68 0.86
69 0.78
70 0.75
71 0.73
72 0.68
73 0.6
74 0.54
75 0.48
76 0.41
77 0.39
78 0.32
79 0.28
80 0.23
81 0.21
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.11
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.11
95 0.14
96 0.18
97 0.2
98 0.22
99 0.29
100 0.3
101 0.38
102 0.42
103 0.45
104 0.44
105 0.44
106 0.48
107 0.49
108 0.58
109 0.61
110 0.67
111 0.71
112 0.78
113 0.87
114 0.92
115 0.95
116 0.95
117 0.95
118 0.93
119 0.91
120 0.9
121 0.88
122 0.85
123 0.83
124 0.75
125 0.67
126 0.62
127 0.54
128 0.51
129 0.49
130 0.45
131 0.42
132 0.45
133 0.49
134 0.54
135 0.56
136 0.52
137 0.46
138 0.46
139 0.41
140 0.37
141 0.35
142 0.3
143 0.28
144 0.26
145 0.25
146 0.27
147 0.28
148 0.3
149 0.27
150 0.24
151 0.31
152 0.36
153 0.44
154 0.46
155 0.53
156 0.59
157 0.69
158 0.78
159 0.79
160 0.84
161 0.86
162 0.9
163 0.92
164 0.93
165 0.93
166 0.93
167 0.93
168 0.91
169 0.9
170 0.88
171 0.86
172 0.85
173 0.85
174 0.79
175 0.69
176 0.61
177 0.53
178 0.5
179 0.49
180 0.4
181 0.35
182 0.38
183 0.41
184 0.44
185 0.44
186 0.41
187 0.4
188 0.42
189 0.45
190 0.48
191 0.54
192 0.57
193 0.63
194 0.69
195 0.72
196 0.77
197 0.78
198 0.77
199 0.69
200 0.63
201 0.61
202 0.54
203 0.48
204 0.44
205 0.36
206 0.29
207 0.3
208 0.34
209 0.29
210 0.28
211 0.24
212 0.2
213 0.2
214 0.22
215 0.22
216 0.22
217 0.24
218 0.23
219 0.23
220 0.24
221 0.22
222 0.19
223 0.18
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.05
234 0.07
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.13
239 0.15
240 0.17
241 0.18
242 0.17
243 0.15
244 0.2
245 0.21
246 0.2
247 0.19
248 0.17
249 0.17
250 0.19
251 0.19
252 0.15
253 0.14
254 0.15
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.18
260 0.17
261 0.18
262 0.18
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.21
267 0.22
268 0.23
269 0.24
270 0.23
271 0.22
272 0.21
273 0.2
274 0.15
275 0.11
276 0.1
277 0.07
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.06
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.08
304 0.06
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.14
317 0.16
318 0.19
319 0.22
320 0.25
321 0.28
322 0.33
323 0.35
324 0.38
325 0.38
326 0.37
327 0.35
328 0.36
329 0.36
330 0.36
331 0.38
332 0.39
333 0.37
334 0.35
335 0.33
336 0.29
337 0.28
338 0.3
339 0.27
340 0.21
341 0.2
342 0.2
343 0.2
344 0.22
345 0.21
346 0.16
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.11
359 0.16
360 0.25
361 0.3
362 0.37
363 0.41
364 0.43
365 0.45
366 0.48
367 0.51
368 0.52
369 0.56
370 0.52
371 0.48
372 0.49
373 0.47
374 0.43
375 0.41
376 0.33
377 0.25
378 0.23
379 0.22
380 0.25
381 0.33
382 0.34
383 0.3
384 0.29
385 0.28
386 0.29
387 0.32
388 0.29
389 0.21
390 0.24
391 0.27
392 0.29
393 0.31