Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3HBM2

Protein Details
Accession A0A2H3HBM2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-445GGNPNPKPKESKPKGEKKKENDEKKTELPDRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-438RLQWGGNPNPKPKESKPKGEKKKENDEK
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 12, nucl 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001412  aa-tRNA-synth_I_CS  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002306  Trp-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004830  F:tryptophan-tRNA ligase activity  
GO:0006436  P:tryptophanyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00178  AA_TRNA_LIGASE_I  
CDD cd00806  TrpRS_core  
Amino Acid Sequences MADLNPPKTAVQDQDINPWSVEGAQGENGEVAAIDYDAICSKWNTSKIDHALLERFEQVTGKKPHRWLRRGLFFSHRDFDKILTKYEHGEPFFLYTGRGPSTGSLHLGHTIPLEFTKWLQDVFDVPLVFMLTDDEKALFKDSLSFEDTHKYALENAKDIIALGFDEKKTFIYSDLEYLGHHFLMNAYEFSKLVTFNQVRGAFGFDGSANIGKIFFPAVQCSAAFATSYPEIWSDDPSPVRTKALGKIQCLIPMGIDQDPYFRLIRDNAHRMKNPSPKPALIHSKFLTALQGAGGKMSSSNPNSAIFMTDTAKQIKNKINKFAFSGGRETLEEHREKGGNPDVDVAYIYLTYFEDDDEKLQKIYDDYKSGALLTGELKKMAIEALQSVVETFQDRRKAVTDEVLKSYMKPRRLQWGGNPNPKPKESKPKGEKKKENDEKKTELPDRTAEKSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.43
4 0.39
5 0.34
6 0.29
7 0.21
8 0.21
9 0.13
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.1
17 0.09
18 0.07
19 0.05
20 0.05
21 0.04
22 0.04
23 0.06
24 0.07
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.12
29 0.19
30 0.25
31 0.28
32 0.3
33 0.39
34 0.43
35 0.48
36 0.47
37 0.43
38 0.43
39 0.4
40 0.39
41 0.33
42 0.28
43 0.22
44 0.23
45 0.21
46 0.25
47 0.32
48 0.36
49 0.41
50 0.49
51 0.58
52 0.66
53 0.71
54 0.71
55 0.73
56 0.78
57 0.75
58 0.71
59 0.71
60 0.65
61 0.65
62 0.61
63 0.52
64 0.44
65 0.41
66 0.39
67 0.39
68 0.35
69 0.34
70 0.31
71 0.31
72 0.33
73 0.38
74 0.41
75 0.33
76 0.33
77 0.29
78 0.29
79 0.29
80 0.25
81 0.19
82 0.15
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.14
87 0.14
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.17
92 0.16
93 0.18
94 0.18
95 0.17
96 0.14
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.15
110 0.18
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.14
128 0.14
129 0.17
130 0.19
131 0.2
132 0.18
133 0.23
134 0.23
135 0.19
136 0.18
137 0.15
138 0.16
139 0.2
140 0.21
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.13
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.15
165 0.14
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.15
181 0.15
182 0.16
183 0.23
184 0.23
185 0.22
186 0.22
187 0.24
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.1
221 0.12
222 0.13
223 0.15
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.17
229 0.19
230 0.27
231 0.29
232 0.28
233 0.31
234 0.31
235 0.31
236 0.3
237 0.25
238 0.16
239 0.13
240 0.14
241 0.11
242 0.11
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.17
252 0.23
253 0.31
254 0.35
255 0.4
256 0.43
257 0.46
258 0.53
259 0.57
260 0.55
261 0.54
262 0.52
263 0.48
264 0.48
265 0.51
266 0.53
267 0.46
268 0.47
269 0.4
270 0.38
271 0.37
272 0.34
273 0.28
274 0.17
275 0.15
276 0.1
277 0.11
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.09
284 0.13
285 0.12
286 0.14
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.17
291 0.17
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.16
297 0.19
298 0.23
299 0.23
300 0.29
301 0.34
302 0.42
303 0.44
304 0.51
305 0.52
306 0.5
307 0.52
308 0.52
309 0.49
310 0.42
311 0.42
312 0.33
313 0.3
314 0.29
315 0.28
316 0.26
317 0.28
318 0.27
319 0.24
320 0.27
321 0.26
322 0.26
323 0.29
324 0.33
325 0.28
326 0.27
327 0.29
328 0.26
329 0.25
330 0.25
331 0.19
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.08
341 0.09
342 0.12
343 0.14
344 0.15
345 0.14
346 0.15
347 0.15
348 0.16
349 0.21
350 0.22
351 0.23
352 0.23
353 0.25
354 0.25
355 0.24
356 0.23
357 0.17
358 0.14
359 0.14
360 0.18
361 0.17
362 0.17
363 0.16
364 0.15
365 0.15
366 0.14
367 0.12
368 0.08
369 0.08
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.12
378 0.17
379 0.23
380 0.24
381 0.26
382 0.3
383 0.33
384 0.33
385 0.4
386 0.41
387 0.39
388 0.43
389 0.44
390 0.4
391 0.38
392 0.45
393 0.43
394 0.41
395 0.42
396 0.42
397 0.5
398 0.56
399 0.59
400 0.6
401 0.65
402 0.69
403 0.74
404 0.77
405 0.75
406 0.75
407 0.74
408 0.72
409 0.69
410 0.7
411 0.69
412 0.73
413 0.75
414 0.8
415 0.87
416 0.91
417 0.92
418 0.9
419 0.92
420 0.92
421 0.92
422 0.91
423 0.88
424 0.84
425 0.82
426 0.83
427 0.78
428 0.73
429 0.66
430 0.63
431 0.61