Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3HWW5

Protein Details
Accession A0A2H3HWW5    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-171EVIKITGKSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTTKKQSSKAASKDHHydrophilic
175-201KDNDDDKQKKVKPTKPRKKTGTMSSHFBasic
318-342MAHDKSPTKKAPKKKKPRTITELATHydrophilic
380-408KNAKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPKPVLLSHydrophilic
667-694ATPPATTSSPKKPRGRPRKNSINAPEPQHydrophilic
697-722PPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-194KSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTTKKQSSKAASKDHSPAKDNDDDKQKKVKPTKPRKKT
323-335SPTKKAPKKKKPR
382-403AKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPK
676-748PKKPRGRPRKNSINAPEPQEPPPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSTPGAASPSKPKSAAKPQRVVASPRRKKA
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MVSSNAFGTSPLGDTRRQPLHVNSSSPDLPSLRDVLTTKTTSQPSAHSGSGAAALSIDGPSGFISARQLYPATESAPKVVSTPSTGLPWTLSHPGEVTGLAEDVSGNGGFIAGDNEPPKEREEHIEVIKITGKSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTTKKQSSKAASKDHSPAKDNDDDKQKKVKPTKPRKKTGTMSSHFPPPKESKDLEKVKQIDVNEPLHLEQTPARRLDWTPPAQKTIVDLDSDSSVFKNLGSSEADQRLPVFKNLVDGYSCMEGPNESISHSITNASDEDSSFLKKRKRIELLATMGTDAPAMAHDKSPTKKAPKKKKPRTITELATAAYRVPSQPDTEPPNASILDHFSTTNKEAGSLADEQTKNAKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPKPVLLSPSAALAQVANQDFVFGTSSQLAREESPTVLRDLQAALRQSDQNHDMDFAMPLNSDAIESPQQRSNLWDAAARDAEGDLFDVEVINLADDTGLSEVGHVSNPFGYQLGADDSVICVESRVLDDHIPPAKPRNDIPSPDEKDLVDSRASSPCFSDSELSTSTNVHRPPLAQTEVSQANQMTTAEEPESLPELPAQPPRPNYEAFTDIRLAREIKRFGFKPIKRRSAMIALLDQCWQSKTRMGQASLHTSTKLSSPTKTTRATPPATTSSPKKPRGRPRKNSINAPEPQEPPPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSTPGAASPSKPKSAAKPQRVVASPRRKKATAKSVIEIPDSEDNKSDEFASSPDTNAEQMFSSPPPLDMSLTTNDGTPLTATQSDQEALLFDHITNAVTSAPRTTNPQEPSWHEKILIYDPIVLEDLAAWLNTGELSRVGYDGEVNPNDVKKWCESKSICCLWRISLRGKERKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.31
3 0.36
4 0.38
5 0.41
6 0.44
7 0.52
8 0.54
9 0.54
10 0.48
11 0.49
12 0.47
13 0.43
14 0.39
15 0.3
16 0.27
17 0.26
18 0.27
19 0.2
20 0.23
21 0.23
22 0.25
23 0.3
24 0.31
25 0.31
26 0.35
27 0.37
28 0.36
29 0.37
30 0.36
31 0.35
32 0.37
33 0.35
34 0.28
35 0.26
36 0.24
37 0.25
38 0.2
39 0.15
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.11
52 0.14
53 0.15
54 0.16
55 0.17
56 0.17
57 0.21
58 0.22
59 0.21
60 0.23
61 0.23
62 0.24
63 0.25
64 0.24
65 0.21
66 0.22
67 0.2
68 0.19
69 0.21
70 0.2
71 0.21
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.23
78 0.22
79 0.2
80 0.2
81 0.21
82 0.2
83 0.19
84 0.15
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.08
99 0.06
100 0.1
101 0.11
102 0.14
103 0.16
104 0.17
105 0.19
106 0.2
107 0.22
108 0.26
109 0.3
110 0.34
111 0.35
112 0.4
113 0.37
114 0.36
115 0.4
116 0.33
117 0.28
118 0.29
119 0.3
120 0.32
121 0.43
122 0.51
123 0.56
124 0.67
125 0.76
126 0.8
127 0.86
128 0.89
129 0.88
130 0.89
131 0.86
132 0.83
133 0.81
134 0.75
135 0.71
136 0.67
137 0.66
138 0.64
139 0.67
140 0.67
141 0.7
142 0.76
143 0.81
144 0.85
145 0.87
146 0.88
147 0.9
148 0.88
149 0.89
150 0.86
151 0.84
152 0.81
153 0.8
154 0.72
155 0.67
156 0.68
157 0.65
158 0.61
159 0.56
160 0.51
161 0.48
162 0.53
163 0.49
164 0.47
165 0.5
166 0.5
167 0.5
168 0.57
169 0.56
170 0.58
171 0.67
172 0.68
173 0.68
174 0.76
175 0.82
176 0.83
177 0.88
178 0.86
179 0.86
180 0.86
181 0.85
182 0.85
183 0.77
184 0.73
185 0.65
186 0.67
187 0.6
188 0.52
189 0.48
190 0.43
191 0.45
192 0.45
193 0.44
194 0.43
195 0.5
196 0.58
197 0.55
198 0.58
199 0.55
200 0.51
201 0.52
202 0.46
203 0.41
204 0.38
205 0.37
206 0.29
207 0.27
208 0.25
209 0.23
210 0.21
211 0.17
212 0.16
213 0.2
214 0.23
215 0.23
216 0.23
217 0.25
218 0.26
219 0.32
220 0.37
221 0.39
222 0.42
223 0.43
224 0.46
225 0.44
226 0.43
227 0.38
228 0.34
229 0.28
230 0.21
231 0.19
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.1
243 0.12
244 0.14
245 0.19
246 0.22
247 0.22
248 0.21
249 0.21
250 0.24
251 0.23
252 0.22
253 0.18
254 0.15
255 0.19
256 0.19
257 0.2
258 0.16
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.2
286 0.24
287 0.28
288 0.34
289 0.41
290 0.47
291 0.49
292 0.53
293 0.56
294 0.55
295 0.54
296 0.48
297 0.39
298 0.32
299 0.27
300 0.2
301 0.12
302 0.07
303 0.05
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.1
308 0.15
309 0.17
310 0.23
311 0.29
312 0.37
313 0.44
314 0.53
315 0.63
316 0.69
317 0.79
318 0.84
319 0.88
320 0.88
321 0.9
322 0.88
323 0.84
324 0.77
325 0.7
326 0.61
327 0.51
328 0.42
329 0.32
330 0.24
331 0.17
332 0.13
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.18
339 0.23
340 0.25
341 0.26
342 0.24
343 0.25
344 0.22
345 0.21
346 0.17
347 0.14
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.13
353 0.14
354 0.16
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.12
361 0.12
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.2
366 0.23
367 0.21
368 0.2
369 0.22
370 0.19
371 0.28
372 0.38
373 0.46
374 0.5
375 0.59
376 0.68
377 0.69
378 0.77
379 0.79
380 0.8
381 0.8
382 0.82
383 0.82
384 0.84
385 0.9
386 0.9
387 0.89
388 0.85
389 0.8
390 0.76
391 0.7
392 0.63
393 0.54
394 0.45
395 0.35
396 0.28
397 0.22
398 0.17
399 0.12
400 0.08
401 0.07
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.14
434 0.14
435 0.16
436 0.17
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.06
452 0.1
453 0.11
454 0.13
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.19
459 0.2
460 0.17
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.16
465 0.17
466 0.14
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.07
471 0.07
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.06
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.09
517 0.14
518 0.17
519 0.17
520 0.17
521 0.22
522 0.24
523 0.26
524 0.27
525 0.3
526 0.31
527 0.33
528 0.38
529 0.42
530 0.43
531 0.43
532 0.42
533 0.34
534 0.34
535 0.32
536 0.28
537 0.19
538 0.15
539 0.16
540 0.19
541 0.2
542 0.17
543 0.16
544 0.16
545 0.16
546 0.16
547 0.16
548 0.12
549 0.15
550 0.16
551 0.16
552 0.15
553 0.16
554 0.17
555 0.2
556 0.2
557 0.17
558 0.16
559 0.16
560 0.2
561 0.24
562 0.24
563 0.2
564 0.2
565 0.24
566 0.26
567 0.26
568 0.23
569 0.18
570 0.15
571 0.16
572 0.15
573 0.11
574 0.08
575 0.09
576 0.08
577 0.09
578 0.08
579 0.09
580 0.11
581 0.1
582 0.1
583 0.09
584 0.11
585 0.13
586 0.19
587 0.22
588 0.24
589 0.26
590 0.31
591 0.33
592 0.32
593 0.32
594 0.3
595 0.31
596 0.28
597 0.28
598 0.26
599 0.24
600 0.24
601 0.23
602 0.21
603 0.21
604 0.27
605 0.27
606 0.27
607 0.33
608 0.33
609 0.39
610 0.48
611 0.48
612 0.53
613 0.6
614 0.66
615 0.6
616 0.61
617 0.58
618 0.55
619 0.53
620 0.45
621 0.41
622 0.33
623 0.33
624 0.32
625 0.28
626 0.21
627 0.19
628 0.17
629 0.13
630 0.16
631 0.18
632 0.25
633 0.31
634 0.32
635 0.36
636 0.39
637 0.45
638 0.44
639 0.42
640 0.34
641 0.29
642 0.27
643 0.24
644 0.27
645 0.21
646 0.2
647 0.26
648 0.32
649 0.38
650 0.4
651 0.41
652 0.44
653 0.49
654 0.5
655 0.46
656 0.45
657 0.44
658 0.45
659 0.46
660 0.43
661 0.46
662 0.52
663 0.59
664 0.63
665 0.67
666 0.75
667 0.82
668 0.87
669 0.87
670 0.88
671 0.9
672 0.88
673 0.89
674 0.85
675 0.82
676 0.75
677 0.72
678 0.67
679 0.59
680 0.54
681 0.49
682 0.42
683 0.37
684 0.4
685 0.37
686 0.33
687 0.32
688 0.35
689 0.39
690 0.47
691 0.52
692 0.53
693 0.57
694 0.65
695 0.73
696 0.78
697 0.81
698 0.83
699 0.84
700 0.87
701 0.88
702 0.84
703 0.82
704 0.79
705 0.75
706 0.64
707 0.55
708 0.47
709 0.37
710 0.34
711 0.28
712 0.23
713 0.25
714 0.29
715 0.3
716 0.32
717 0.33
718 0.39
719 0.49
720 0.57
721 0.57
722 0.6
723 0.61
724 0.66
725 0.68
726 0.67
727 0.66
728 0.67
729 0.66
730 0.67
731 0.7
732 0.65
733 0.68
734 0.71
735 0.71
736 0.7
737 0.67
738 0.62
739 0.62
740 0.61
741 0.56
742 0.46
743 0.4
744 0.38
745 0.33
746 0.31
747 0.27
748 0.26
749 0.25
750 0.25
751 0.22
752 0.14
753 0.14
754 0.14
755 0.17
756 0.16
757 0.16
758 0.17
759 0.17
760 0.17
761 0.17
762 0.17
763 0.12
764 0.12
765 0.14
766 0.13
767 0.15
768 0.15
769 0.15
770 0.17
771 0.17
772 0.17
773 0.16
774 0.19
775 0.19
776 0.22
777 0.21
778 0.19
779 0.18
780 0.17
781 0.16
782 0.13
783 0.11
784 0.12
785 0.13
786 0.13
787 0.14
788 0.16
789 0.16
790 0.15
791 0.14
792 0.12
793 0.12
794 0.13
795 0.12
796 0.09
797 0.11
798 0.11
799 0.11
800 0.1
801 0.1
802 0.1
803 0.11
804 0.12
805 0.14
806 0.16
807 0.16
808 0.23
809 0.27
810 0.34
811 0.37
812 0.41
813 0.43
814 0.48
815 0.56
816 0.54
817 0.52
818 0.44
819 0.42
820 0.41
821 0.4
822 0.38
823 0.3
824 0.28
825 0.26
826 0.26
827 0.26
828 0.21
829 0.16
830 0.11
831 0.11
832 0.09
833 0.08
834 0.07
835 0.06
836 0.06
837 0.07
838 0.07
839 0.06
840 0.07
841 0.08
842 0.09
843 0.09
844 0.1
845 0.09
846 0.12
847 0.14
848 0.21
849 0.21
850 0.23
851 0.26
852 0.27
853 0.29
854 0.29
855 0.29
856 0.29
857 0.36
858 0.36
859 0.44
860 0.46
861 0.52
862 0.59
863 0.65
864 0.61
865 0.56
866 0.56
867 0.52
868 0.56
869 0.53
870 0.52
871 0.52
872 0.59
873 0.66