Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G8BU30

Protein Details
Accession G8BU30    Localization Confidence Low Confidence Score 9.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
669-688QNSHYKPNSHHNSNFNRHNNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tpf:TPHA_0E03180  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MKGGNFSNKKQSGGSSYHNSNRSHATSQAMFAESPETLASFTDRQDYLFVNSIGSEVTATLFSGTKFSGILSAYNPESKEGIEIVLKFPKLVDVGFSDIDTKDSETKLGETLLFHGKDVAELELNNISFSLDEKYEQANKKREIISQQPIKQQNTTSHTEQSSKFKTDVDISKSAPKIKERELQKWAPEADDSSALNQGLDDGSSNWDQFAVNEKKFGVTSSYDEHFYTTKIDKSHPEYRKRLQEAEKLAKEIESQGSSNIHVAEDRGLIIDDSGMDEEDKYSGVDRRGDELLAALKSNTKPIENKPSKYVPPTLRHQPHHIDPAIISSVTEQSTVGAPASTMKAGPTLNTKNIEGKSDSTKISYSNVVKNGIQKTIYSVGTSTKENFNSKETQIEDLKKFSQKFKVPFKVPEDMKEVVKKSEEPKDSNSTKGSSKASSSGKGTDGKRPSISSRRRHATIFFGSQGLPHSNNRKKEIFNNNFNMFESAKASYDKNIEKAESEMGKEEKIMQPFIIEKPYFTAPTWESTIEKSHKALFPDERVLVQKAQMRLQQRQMRSYDPNMGNHQMQMAMGGMIGYPMSTAGINPLMNGGMSMYVPMQQPMMYPGMVPQMVGVMGSSGKEGAKGMSPQQQYQSLGYGGPAPVHLGNPYMYQGGMTFNQGMAGHSQPQNSHYKPNSHHNSNFNRHNNNNNIYYYNNNNYKNNNNSHYNNHYRNNNANGHPTKNQGNGSESNKNSNTQEPTSKNVNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.44
3 0.5
4 0.55
5 0.6
6 0.57
7 0.54
8 0.55
9 0.53
10 0.48
11 0.43
12 0.42
13 0.37
14 0.38
15 0.38
16 0.32
17 0.27
18 0.24
19 0.24
20 0.17
21 0.16
22 0.14
23 0.11
24 0.09
25 0.1
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.21
33 0.23
34 0.23
35 0.27
36 0.26
37 0.2
38 0.2
39 0.19
40 0.17
41 0.15
42 0.11
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.12
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.17
60 0.18
61 0.22
62 0.22
63 0.21
64 0.2
65 0.19
66 0.19
67 0.16
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.18
72 0.23
73 0.23
74 0.21
75 0.2
76 0.21
77 0.19
78 0.17
79 0.16
80 0.14
81 0.17
82 0.18
83 0.18
84 0.18
85 0.17
86 0.18
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.13
98 0.16
99 0.23
100 0.22
101 0.21
102 0.21
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.18
107 0.11
108 0.11
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.12
114 0.11
115 0.09
116 0.11
117 0.12
118 0.09
119 0.1
120 0.12
121 0.17
122 0.25
123 0.33
124 0.4
125 0.46
126 0.48
127 0.54
128 0.55
129 0.55
130 0.55
131 0.56
132 0.58
133 0.59
134 0.62
135 0.63
136 0.67
137 0.66
138 0.61
139 0.56
140 0.55
141 0.51
142 0.51
143 0.46
144 0.44
145 0.43
146 0.45
147 0.44
148 0.45
149 0.44
150 0.41
151 0.39
152 0.34
153 0.34
154 0.37
155 0.4
156 0.38
157 0.37
158 0.36
159 0.42
160 0.44
161 0.47
162 0.43
163 0.42
164 0.41
165 0.44
166 0.49
167 0.48
168 0.53
169 0.56
170 0.57
171 0.55
172 0.56
173 0.5
174 0.44
175 0.38
176 0.32
177 0.26
178 0.23
179 0.19
180 0.15
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.12
185 0.1
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.06
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.19
198 0.23
199 0.22
200 0.24
201 0.24
202 0.25
203 0.25
204 0.25
205 0.18
206 0.14
207 0.16
208 0.19
209 0.2
210 0.21
211 0.21
212 0.22
213 0.19
214 0.17
215 0.19
216 0.17
217 0.19
218 0.19
219 0.22
220 0.25
221 0.32
222 0.42
223 0.46
224 0.53
225 0.57
226 0.63
227 0.7
228 0.69
229 0.69
230 0.65
231 0.64
232 0.64
233 0.67
234 0.61
235 0.52
236 0.48
237 0.41
238 0.34
239 0.29
240 0.23
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.13
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.09
271 0.11
272 0.15
273 0.16
274 0.19
275 0.19
276 0.19
277 0.17
278 0.15
279 0.16
280 0.12
281 0.12
282 0.08
283 0.11
284 0.12
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.18
289 0.23
290 0.34
291 0.37
292 0.39
293 0.41
294 0.46
295 0.46
296 0.47
297 0.49
298 0.45
299 0.44
300 0.48
301 0.53
302 0.54
303 0.55
304 0.56
305 0.53
306 0.49
307 0.5
308 0.45
309 0.35
310 0.28
311 0.27
312 0.23
313 0.18
314 0.14
315 0.08
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.08
323 0.07
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.14
335 0.16
336 0.19
337 0.21
338 0.21
339 0.24
340 0.25
341 0.26
342 0.21
343 0.21
344 0.22
345 0.23
346 0.23
347 0.19
348 0.19
349 0.17
350 0.18
351 0.2
352 0.19
353 0.2
354 0.22
355 0.23
356 0.23
357 0.28
358 0.28
359 0.25
360 0.22
361 0.18
362 0.19
363 0.21
364 0.2
365 0.14
366 0.13
367 0.14
368 0.15
369 0.16
370 0.15
371 0.15
372 0.18
373 0.19
374 0.2
375 0.21
376 0.23
377 0.22
378 0.25
379 0.22
380 0.23
381 0.25
382 0.29
383 0.27
384 0.26
385 0.28
386 0.29
387 0.3
388 0.3
389 0.34
390 0.35
391 0.41
392 0.48
393 0.54
394 0.53
395 0.57
396 0.57
397 0.57
398 0.52
399 0.48
400 0.43
401 0.37
402 0.35
403 0.34
404 0.31
405 0.24
406 0.25
407 0.24
408 0.23
409 0.3
410 0.32
411 0.3
412 0.34
413 0.41
414 0.41
415 0.41
416 0.39
417 0.33
418 0.3
419 0.32
420 0.29
421 0.22
422 0.22
423 0.25
424 0.25
425 0.26
426 0.26
427 0.24
428 0.24
429 0.29
430 0.3
431 0.32
432 0.33
433 0.33
434 0.33
435 0.33
436 0.36
437 0.4
438 0.47
439 0.48
440 0.53
441 0.56
442 0.57
443 0.57
444 0.53
445 0.49
446 0.45
447 0.4
448 0.32
449 0.27
450 0.25
451 0.24
452 0.23
453 0.19
454 0.16
455 0.17
456 0.26
457 0.32
458 0.37
459 0.42
460 0.43
461 0.43
462 0.5
463 0.58
464 0.56
465 0.58
466 0.6
467 0.58
468 0.55
469 0.53
470 0.46
471 0.35
472 0.27
473 0.21
474 0.15
475 0.14
476 0.14
477 0.14
478 0.15
479 0.2
480 0.21
481 0.22
482 0.23
483 0.22
484 0.21
485 0.22
486 0.24
487 0.2
488 0.19
489 0.19
490 0.18
491 0.17
492 0.17
493 0.19
494 0.18
495 0.19
496 0.19
497 0.15
498 0.16
499 0.18
500 0.19
501 0.23
502 0.19
503 0.17
504 0.2
505 0.22
506 0.22
507 0.2
508 0.23
509 0.18
510 0.21
511 0.23
512 0.21
513 0.2
514 0.2
515 0.27
516 0.25
517 0.26
518 0.24
519 0.27
520 0.28
521 0.3
522 0.33
523 0.31
524 0.32
525 0.35
526 0.34
527 0.31
528 0.31
529 0.31
530 0.27
531 0.26
532 0.26
533 0.24
534 0.28
535 0.3
536 0.33
537 0.36
538 0.45
539 0.48
540 0.47
541 0.51
542 0.49
543 0.51
544 0.5
545 0.49
546 0.49
547 0.45
548 0.46
549 0.45
550 0.45
551 0.4
552 0.35
553 0.32
554 0.23
555 0.19
556 0.15
557 0.11
558 0.07
559 0.06
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.06
571 0.09
572 0.09
573 0.09
574 0.1
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.07
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.05
583 0.08
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.1
589 0.12
590 0.14
591 0.11
592 0.1
593 0.11
594 0.16
595 0.15
596 0.15
597 0.12
598 0.11
599 0.1
600 0.1
601 0.09
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.12
612 0.14
613 0.18
614 0.25
615 0.28
616 0.3
617 0.34
618 0.37
619 0.36
620 0.35
621 0.33
622 0.25
623 0.23
624 0.21
625 0.19
626 0.15
627 0.13
628 0.12
629 0.12
630 0.12
631 0.13
632 0.13
633 0.11
634 0.12
635 0.13
636 0.15
637 0.13
638 0.12
639 0.11
640 0.11
641 0.13
642 0.13
643 0.14
644 0.13
645 0.12
646 0.15
647 0.15
648 0.15
649 0.15
650 0.16
651 0.2
652 0.22
653 0.24
654 0.23
655 0.27
656 0.36
657 0.35
658 0.42
659 0.41
660 0.47
661 0.51
662 0.61
663 0.66
664 0.65
665 0.7
666 0.7
667 0.75
668 0.76
669 0.8
670 0.78
671 0.77
672 0.74
673 0.76
674 0.75
675 0.71
676 0.67
677 0.59
678 0.53
679 0.47
680 0.47
681 0.44
682 0.45
683 0.47
684 0.47
685 0.49
686 0.52
687 0.58
688 0.62
689 0.63
690 0.6
691 0.6
692 0.59
693 0.63
694 0.66
695 0.68
696 0.67
697 0.67
698 0.67
699 0.66
700 0.69
701 0.7
702 0.68
703 0.62
704 0.64
705 0.61
706 0.61
707 0.58
708 0.55
709 0.53
710 0.52
711 0.52
712 0.45
713 0.46
714 0.47
715 0.5
716 0.55
717 0.5
718 0.53
719 0.51
720 0.51
721 0.49
722 0.49
723 0.48
724 0.45
725 0.52
726 0.47
727 0.51