Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8C233

Protein Details
Accession G8C233    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-63NTESITQNKNKKFNEKKKFDFSKYNTHydrophilic
395-422MESYEIVNKKYKQRKKIPKNKLGLCNHLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-413KYKQRKKIPK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041707  Pus3-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG tpf:TPHA_0P00530  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02569  PseudoU_synth_ScPus3  
Amino Acid Sequences MEEKSYGTWSKEDLIRRLEILEDNVSKHNKKTNDKIENTESITQNKNKKFNEKKKFDFSKYNTRFIALKFAYLGWNYNGLAIQKEPTALPTVEGVIVDAMNKCKLIPSINPSDFKFSRCGRTDKGVSAMNQVISLNVRSNLTPEQQMNSEFDSKEIQYINILNQLLPDDIRISAVCLRPPTGFDARFSCQYRHYKYLFKKDGLNISAMETAASYFKGEHDFRNFCKLDGSKQITNFKRTMMSSQILQVNEEFYCFDLIGSAFLWHQVRCMTAILFLVGQNLEVPEIVSQLVDVASNPQKPIYDMASDIPLILYDCKFPEMDWIMNNVNDYNSIKYSKIVEGLTLGYQLKSTVATIFQDILPSADQDFQNKTRINLGDGKGKIVGTYEKLFKRKVMESYEIVNKKYKQRKKIPKNKLGLCNHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.39
4 0.38
5 0.34
6 0.32
7 0.29
8 0.3
9 0.27
10 0.28
11 0.33
12 0.38
13 0.38
14 0.4
15 0.44
16 0.46
17 0.53
18 0.61
19 0.65
20 0.7
21 0.72
22 0.75
23 0.74
24 0.71
25 0.67
26 0.63
27 0.55
28 0.5
29 0.52
30 0.52
31 0.55
32 0.57
33 0.61
34 0.59
35 0.68
36 0.74
37 0.78
38 0.82
39 0.82
40 0.83
41 0.85
42 0.88
43 0.84
44 0.83
45 0.79
46 0.8
47 0.76
48 0.75
49 0.64
50 0.57
51 0.54
52 0.44
53 0.47
54 0.36
55 0.31
56 0.25
57 0.26
58 0.26
59 0.24
60 0.25
61 0.16
62 0.19
63 0.17
64 0.17
65 0.18
66 0.15
67 0.16
68 0.14
69 0.14
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.11
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.15
93 0.19
94 0.24
95 0.33
96 0.38
97 0.41
98 0.4
99 0.47
100 0.44
101 0.41
102 0.41
103 0.34
104 0.38
105 0.4
106 0.44
107 0.4
108 0.47
109 0.48
110 0.44
111 0.44
112 0.39
113 0.36
114 0.35
115 0.33
116 0.25
117 0.23
118 0.2
119 0.17
120 0.14
121 0.14
122 0.11
123 0.1
124 0.11
125 0.1
126 0.13
127 0.15
128 0.16
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.19
133 0.21
134 0.2
135 0.2
136 0.22
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.17
143 0.14
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.15
148 0.15
149 0.13
150 0.12
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.12
161 0.13
162 0.14
163 0.14
164 0.16
165 0.15
166 0.17
167 0.2
168 0.21
169 0.21
170 0.21
171 0.24
172 0.25
173 0.31
174 0.32
175 0.28
176 0.3
177 0.36
178 0.4
179 0.42
180 0.42
181 0.44
182 0.49
183 0.58
184 0.56
185 0.5
186 0.5
187 0.47
188 0.5
189 0.43
190 0.38
191 0.27
192 0.23
193 0.22
194 0.18
195 0.14
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.1
204 0.11
205 0.13
206 0.19
207 0.22
208 0.23
209 0.32
210 0.31
211 0.27
212 0.31
213 0.29
214 0.27
215 0.33
216 0.37
217 0.31
218 0.36
219 0.44
220 0.42
221 0.46
222 0.42
223 0.35
224 0.32
225 0.3
226 0.28
227 0.24
228 0.22
229 0.19
230 0.22
231 0.25
232 0.22
233 0.22
234 0.19
235 0.16
236 0.14
237 0.14
238 0.1
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.1
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.09
281 0.13
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.17
287 0.2
288 0.18
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.12
296 0.1
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.17
306 0.19
307 0.21
308 0.2
309 0.24
310 0.24
311 0.25
312 0.25
313 0.18
314 0.15
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.17
321 0.19
322 0.22
323 0.21
324 0.23
325 0.21
326 0.18
327 0.18
328 0.19
329 0.18
330 0.17
331 0.16
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.14
343 0.13
344 0.14
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.12
350 0.15
351 0.16
352 0.18
353 0.24
354 0.25
355 0.32
356 0.33
357 0.33
358 0.35
359 0.36
360 0.37
361 0.39
362 0.4
363 0.41
364 0.4
365 0.41
366 0.36
367 0.34
368 0.3
369 0.24
370 0.25
371 0.21
372 0.25
373 0.31
374 0.36
375 0.41
376 0.43
377 0.44
378 0.47
379 0.48
380 0.5
381 0.5
382 0.49
383 0.47
384 0.52
385 0.58
386 0.55
387 0.52
388 0.52
389 0.5
390 0.54
391 0.62
392 0.65
393 0.66
394 0.73
395 0.82
396 0.86
397 0.92
398 0.93
399 0.93
400 0.94
401 0.93
402 0.92