Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3HP97

Protein Details
Accession A0A2H3HP97    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-58KGAADAFKKQREKKGWKATAAHydrophilic
79-103GDDSSKSSKSSKKKSSKKDSSSSASHydrophilic
217-240DSDAKETKKDKKIKKEKEVKDSSDBasic
310-337LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-95SSKKKSSK
224-233KKDKKIKKEK
316-329KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto_nucl 7.5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MGKKSTKAAAPKNDAASAPPPGQLMDLVENFLSDHSFKGAADAFKKQREKKGWKATAATDEEGNPSLVSVYQTWEATKGDDSSKSSKSSKKKSSKKDSSSSASSDSRSDSSDAKEEDAKKQKRAASSSSSSDSSSSSSESSDSSDSSDSSDSDSSSDSDDESAKSDSGSSSSDSSSDSSSDSDSSDSDDEAAAKVPLPDSDSSSSDSDSASSDSDSDSDAKETKKDKKIKKEKEVKDSSDSSVTLDKTSPDFQSNSAYPPLPPDPVVNGNGRKKQNEPFSRIPKNIKVDAKFASNEYVSIAYSQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHDKKGIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.5
3 0.44
4 0.39
5 0.32
6 0.28
7 0.24
8 0.22
9 0.22
10 0.19
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.17
15 0.16
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.09
21 0.09
22 0.1
23 0.11
24 0.1
25 0.14
26 0.18
27 0.2
28 0.23
29 0.31
30 0.35
31 0.43
32 0.52
33 0.55
34 0.61
35 0.67
36 0.74
37 0.76
38 0.81
39 0.8
40 0.77
41 0.75
42 0.7
43 0.67
44 0.62
45 0.52
46 0.42
47 0.36
48 0.32
49 0.29
50 0.25
51 0.16
52 0.12
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.1
58 0.12
59 0.13
60 0.13
61 0.15
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.18
68 0.22
69 0.25
70 0.28
71 0.31
72 0.34
73 0.4
74 0.47
75 0.54
76 0.61
77 0.67
78 0.74
79 0.8
80 0.86
81 0.9
82 0.88
83 0.86
84 0.82
85 0.78
86 0.72
87 0.63
88 0.57
89 0.48
90 0.41
91 0.34
92 0.3
93 0.24
94 0.22
95 0.21
96 0.18
97 0.18
98 0.22
99 0.21
100 0.21
101 0.25
102 0.25
103 0.32
104 0.41
105 0.42
106 0.41
107 0.46
108 0.48
109 0.48
110 0.5
111 0.46
112 0.43
113 0.43
114 0.43
115 0.4
116 0.38
117 0.32
118 0.29
119 0.25
120 0.19
121 0.16
122 0.13
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.08
185 0.08
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.15
193 0.15
194 0.12
195 0.1
196 0.1
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.16
209 0.22
210 0.3
211 0.38
212 0.47
213 0.54
214 0.63
215 0.74
216 0.79
217 0.85
218 0.86
219 0.85
220 0.87
221 0.86
222 0.79
223 0.74
224 0.67
225 0.58
226 0.5
227 0.42
228 0.33
229 0.29
230 0.25
231 0.2
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.19
236 0.19
237 0.18
238 0.19
239 0.19
240 0.24
241 0.24
242 0.24
243 0.24
244 0.22
245 0.2
246 0.24
247 0.25
248 0.2
249 0.2
250 0.19
251 0.21
252 0.24
253 0.27
254 0.27
255 0.33
256 0.39
257 0.46
258 0.49
259 0.47
260 0.48
261 0.54
262 0.58
263 0.59
264 0.6
265 0.62
266 0.68
267 0.73
268 0.74
269 0.73
270 0.7
271 0.69
272 0.68
273 0.66
274 0.59
275 0.56
276 0.53
277 0.5
278 0.43
279 0.38
280 0.34
281 0.27
282 0.24
283 0.21
284 0.19
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.12
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.22
298 0.27
299 0.24
300 0.25
301 0.29
302 0.3
303 0.35
304 0.38
305 0.41
306 0.47
307 0.58
308 0.67
309 0.74
310 0.81
311 0.83
312 0.89
313 0.91
314 0.9
315 0.9
316 0.87
317 0.85
318 0.83
319 0.78
320 0.67
321 0.59
322 0.59
323 0.52
324 0.47
325 0.39
326 0.31
327 0.28