Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8C1Y4

Protein Details
Accession G8C1Y4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-46MPYRLLKRVLKQMKKDQLIRVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.833, cyto 5.5, cyto_mito 3.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG tpf:TPHA_0O01960  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MITSLQEVAELHLVRNHKLVEDTGNMPYRLLKRVLKQMKKDQLIRVEQKNVILIFDDNELWLNFLKQDFPTSIHDSFTTKKNNIINYYLDFIKKNDLKFYNNNSSYIEGILKMKVVKDLSSNKYLIPYRMLYLKYEIDEIRKAEESTERLRIQMREIQKKREEKQTIQVDHSFYINNKSSRKSNKNRYVNSARSHVFKTVLNGRTTIMNNFKNTDGSIPRNKNHRIAFGGQVGGTFNKPEYENDISEEHQSPIDKNESVPVSNKSDNLKRSFDSMSSPVKRRPGITNIFLNKTRTSDMSRSQVRKKFDLSSKEQTIHSKVTETKITSENSGSDPIMEMKFFSKRSPKYVSNNRPTLGTKKKSRIFSSNQQDFSSGPSADSSKVYIHVKPSTKHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.25
4 0.2
5 0.22
6 0.23
7 0.24
8 0.27
9 0.28
10 0.31
11 0.35
12 0.33
13 0.32
14 0.36
15 0.34
16 0.34
17 0.38
18 0.37
19 0.38
20 0.49
21 0.6
22 0.63
23 0.69
24 0.74
25 0.79
26 0.81
27 0.81
28 0.77
29 0.76
30 0.77
31 0.76
32 0.72
33 0.68
34 0.62
35 0.57
36 0.54
37 0.45
38 0.35
39 0.29
40 0.22
41 0.17
42 0.17
43 0.15
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.13
53 0.12
54 0.15
55 0.16
56 0.19
57 0.24
58 0.29
59 0.29
60 0.28
61 0.28
62 0.28
63 0.3
64 0.34
65 0.35
66 0.3
67 0.35
68 0.38
69 0.43
70 0.44
71 0.44
72 0.4
73 0.35
74 0.37
75 0.34
76 0.31
77 0.26
78 0.23
79 0.29
80 0.3
81 0.29
82 0.33
83 0.35
84 0.38
85 0.45
86 0.52
87 0.54
88 0.52
89 0.52
90 0.45
91 0.43
92 0.38
93 0.32
94 0.24
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.15
102 0.15
103 0.14
104 0.2
105 0.28
106 0.31
107 0.34
108 0.34
109 0.31
110 0.36
111 0.37
112 0.32
113 0.27
114 0.24
115 0.21
116 0.25
117 0.26
118 0.21
119 0.23
120 0.23
121 0.2
122 0.22
123 0.21
124 0.19
125 0.21
126 0.2
127 0.2
128 0.19
129 0.19
130 0.17
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.28
135 0.25
136 0.25
137 0.29
138 0.28
139 0.28
140 0.3
141 0.35
142 0.39
143 0.42
144 0.49
145 0.53
146 0.6
147 0.61
148 0.65
149 0.62
150 0.55
151 0.61
152 0.62
153 0.58
154 0.53
155 0.52
156 0.43
157 0.37
158 0.35
159 0.26
160 0.17
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.25
166 0.32
167 0.4
168 0.5
169 0.54
170 0.61
171 0.67
172 0.75
173 0.75
174 0.77
175 0.76
176 0.71
177 0.65
178 0.59
179 0.5
180 0.43
181 0.42
182 0.34
183 0.27
184 0.22
185 0.22
186 0.25
187 0.28
188 0.25
189 0.25
190 0.24
191 0.26
192 0.26
193 0.26
194 0.24
195 0.23
196 0.23
197 0.24
198 0.24
199 0.21
200 0.2
201 0.21
202 0.18
203 0.2
204 0.28
205 0.31
206 0.34
207 0.41
208 0.44
209 0.47
210 0.46
211 0.44
212 0.39
213 0.37
214 0.37
215 0.31
216 0.29
217 0.22
218 0.2
219 0.17
220 0.14
221 0.11
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.15
228 0.18
229 0.18
230 0.2
231 0.22
232 0.21
233 0.23
234 0.24
235 0.19
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.18
241 0.15
242 0.14
243 0.18
244 0.18
245 0.19
246 0.21
247 0.22
248 0.24
249 0.25
250 0.28
251 0.28
252 0.33
253 0.38
254 0.4
255 0.39
256 0.34
257 0.36
258 0.35
259 0.31
260 0.29
261 0.29
262 0.33
263 0.36
264 0.39
265 0.4
266 0.44
267 0.45
268 0.44
269 0.45
270 0.44
271 0.45
272 0.46
273 0.51
274 0.49
275 0.52
276 0.52
277 0.49
278 0.42
279 0.38
280 0.35
281 0.29
282 0.3
283 0.31
284 0.34
285 0.39
286 0.47
287 0.51
288 0.58
289 0.61
290 0.6
291 0.59
292 0.57
293 0.57
294 0.56
295 0.58
296 0.57
297 0.61
298 0.61
299 0.59
300 0.58
301 0.54
302 0.51
303 0.46
304 0.39
305 0.34
306 0.33
307 0.34
308 0.38
309 0.34
310 0.34
311 0.35
312 0.35
313 0.33
314 0.31
315 0.28
316 0.25
317 0.26
318 0.22
319 0.18
320 0.17
321 0.18
322 0.17
323 0.15
324 0.14
325 0.15
326 0.2
327 0.21
328 0.26
329 0.33
330 0.36
331 0.43
332 0.51
333 0.55
334 0.61
335 0.71
336 0.75
337 0.76
338 0.78
339 0.72
340 0.68
341 0.64
342 0.63
343 0.62
344 0.61
345 0.6
346 0.64
347 0.7
348 0.74
349 0.77
350 0.77
351 0.75
352 0.76
353 0.78
354 0.76
355 0.72
356 0.65
357 0.59
358 0.5
359 0.47
360 0.41
361 0.3
362 0.22
363 0.21
364 0.22
365 0.23
366 0.24
367 0.2
368 0.17
369 0.22
370 0.25
371 0.26
372 0.3
373 0.37
374 0.43