FuNGI

G8BSB6

Protein Details

Accession

G8BSB6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
88-107	DGVAPRAKMNQQRSRRIRTA	Hydrophilic
1227-1246	QFGWFQKKENTDRRDLKNKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 12, mito 3, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR016494 5_3_exoribonuclease_1 IPR041385 SH3_12 IPR040992 XRN1_D1 IPR047007 XRN1_D1_sf IPR041106 XRN1_D2_D3 IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR047008 XRN1_SH3_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	tpf:TPHA_0D00960 -
Pfam	View protein in Pfam PF18129 SH3_12 PF18332 XRN1_D1 PF18334 XRN1_D2_D3 PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPKFFRYISERWPMILQQVEPDKTPGFDYLYLDMNSIFHMATHSNDVSDDVGKGTTDEVIYSRIFTYIDHIFLMIKPTTIIYMAIDGVAPRAKMNQQRSRRIRTAMDAEKAIDAMKNAIGEENWDSSMEPFDKNSITPGTEFMAQLTINLKYFIHEKKTNDSNWRDVQVIFSGHEVPGEGEHKIMDYIRKLKSQRDYDPNSRHCIYGSDADLIILGLSTHIPHLAVLREEMIFGRKKDIRAGLEAQNFLLLHMSILREYLELEFEDLKTKLSFKYDFERIIDDFVLILFVIGNDFLPNLPDLHLNKGAFPVILETFKKALMSLDSYINFNGTINLERLGVWLDYLSHFEFMNFKQKVFTVQWFNEQLNKIPTINKNVNDQNDLQKKLNLINSMLHWVTKMDTEILSPSSFAINREQIKDIYHFFNKLSEGYGFEISKDQSENYIISKTQNANDVNYIKSSLTELLICYEDLIKDQNKTKSNVQDIYNEDKFKSWKQNYYKSKLEFSETSYGEDLRNLTANYVEGLQWVLDYYYKECPSWSWYYKYHYAPRISDLRDGLKQRIVFDQDEPFTPFQQLMAVLPSRSSKLIPSIFRPLMLDPSSPIIDFYPTTVKFDKNGKAADWEAVVLISFVDQDRLINAMKPFLNLLTPEEASRNAHGSNIMFFYDSKNNSTYQTSLKGAFKDIINDKCIELEFTIDVPEEVKYGFLKGTLEKSNMRPKFPSLYYLKFTNKLLNCGCLIFESPTQQSSMSINIPNRQMSEKALQKFILMNLGKVAFTSWPYLELSRVTSFITDEYEYTQIGRDDNDKKKGMGYISRKLTTKEKADFHKLKTSIIRKLQKTSAVILQSITVLVKVQCFERLEKNINGSFKKIFKNNFEYHPLQVVIFNGNTKLLKEFNYTQGPSLSFEEQFPKDTFIVCLGKENYGNYGQIVDNLNGKKLHIKCSHNISPDDYINLAKQLKLKSMDDVKYYPTHKVCKLLKISPLFLANITSRFVVIDAKDNAINIAIPMRFKNIDKKIMGYTYKNNNLWMYSEKAINLLLKFKKKFPALFQRLSNTKDRFIRIKNIFPDVSADDLITVLKDVKKWINEETVSFIKVSNSCHMLNDESVQCIEEYQKSRSNELIDTNKSDLITNAKFIKRPETFTNNLISQTFNLGDRILFVQSYGKVPFASKGTVIGLDTLNNRPLIRVICDSEITSATNYGGILQTQRIVTSDASDILNLSNKQFGWFQKKENTDRRDLKNKSTTSAADKERVSVRNIQNQHKKVQLQHKEISKNREVIEITNELTQADIPVPLYQSAISKPFEFKTFDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.41
3	0.41
4	0.41
5	0.33
6	0.31
7	0.38
8	0.38
9	0.36
10	0.39
11	0.34
12	0.3
13	0.32
14	0.26
15	0.22
16	0.23
17	0.25
18	0.24
19	0.28
20	0.27
21	0.26
22	0.23
23	0.19
24	0.18
25	0.16
26	0.13
27	0.08
28	0.1
29	0.11
30	0.12
31	0.18
32	0.18
33	0.17
34	0.18
35	0.19
36	0.19
37	0.19
38	0.17
39	0.12
40	0.12
41	0.12
42	0.12
43	0.11
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.13
49	0.13
50	0.14
51	0.14
52	0.13
53	0.13
54	0.12
55	0.16
56	0.16
57	0.17
58	0.16
59	0.16
60	0.16
61	0.17
62	0.21
63	0.17
64	0.14
65	0.13
66	0.13
67	0.14
68	0.14
69	0.13
70	0.09
71	0.11
72	0.11
73	0.1
74	0.1
75	0.09
76	0.11
77	0.12
78	0.12
79	0.11
80	0.15
81	0.21
82	0.3
83	0.4
84	0.48
85	0.55
86	0.66
87	0.75
88	0.8
89	0.8
90	0.77
91	0.72
92	0.69
93	0.69
94	0.66
95	0.61
96	0.53
97	0.48
98	0.43
99	0.38
100	0.31
101	0.22
102	0.15
103	0.13
104	0.12
105	0.12
106	0.11
107	0.12
108	0.12
109	0.13
110	0.16
111	0.16
112	0.15
113	0.15
114	0.15
115	0.15
116	0.2
117	0.19
118	0.17
119	0.16
120	0.19
121	0.19
122	0.19
123	0.22
124	0.19
125	0.19
126	0.19
127	0.2
128	0.19
129	0.2
130	0.2
131	0.17
132	0.17
133	0.15
134	0.16
135	0.16
136	0.15
137	0.14
138	0.15
139	0.14
140	0.13
141	0.19
142	0.24
143	0.3
144	0.34
145	0.37
146	0.44
147	0.52
148	0.56
149	0.6
150	0.59
151	0.59
152	0.59
153	0.58
154	0.51
155	0.44
156	0.4
157	0.34
158	0.3
159	0.23
160	0.2
161	0.19
162	0.17
163	0.17
164	0.14
165	0.11
166	0.13
167	0.14
168	0.12
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.12
173	0.14
174	0.15
175	0.19
176	0.26
177	0.3
178	0.38
179	0.4
180	0.46
181	0.54
182	0.58
183	0.61
184	0.64
185	0.68
186	0.71
187	0.79
188	0.76
189	0.73
190	0.66
191	0.58
192	0.48
193	0.42
194	0.35
195	0.31
196	0.28
197	0.23
198	0.22
199	0.21
200	0.21
201	0.18
202	0.14
203	0.08
204	0.06
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.08
213	0.1
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.16
221	0.18
222	0.18
223	0.25
224	0.27
225	0.29
226	0.34
227	0.4
228	0.38
229	0.39
230	0.44
231	0.43
232	0.44
233	0.44
234	0.37
235	0.33
236	0.3
237	0.24
238	0.21
239	0.13
240	0.08
241	0.09
242	0.1
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.14
255	0.14
256	0.15
257	0.14
258	0.16
259	0.15
260	0.19
261	0.21
262	0.21
263	0.29
264	0.32
265	0.34
266	0.34
267	0.36
268	0.31
269	0.32
270	0.28
271	0.21
272	0.16
273	0.13
274	0.11
275	0.07
276	0.07
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.13
290	0.14
291	0.19
292	0.25
293	0.24
294	0.24
295	0.25
296	0.24
297	0.19
298	0.17
299	0.15
300	0.12
301	0.15
302	0.15
303	0.16
304	0.17
305	0.17
306	0.17
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.15
311	0.15
312	0.18
313	0.19
314	0.2
315	0.2
316	0.19
317	0.16
318	0.13
319	0.12
320	0.1
321	0.11
322	0.1
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.1
329	0.08
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.11
334	0.11
335	0.1
336	0.1
337	0.1
338	0.13
339	0.14
340	0.24
341	0.22
342	0.21
343	0.22
344	0.22
345	0.27
346	0.28
347	0.32
348	0.29
349	0.3
350	0.36
351	0.38
352	0.38
353	0.39
354	0.36
355	0.34
356	0.29
357	0.3
358	0.24
359	0.27
360	0.3
361	0.33
362	0.37
363	0.36
364	0.4
365	0.43
366	0.45
367	0.43
368	0.41
369	0.43
370	0.44
371	0.46
372	0.4
373	0.37
374	0.35
375	0.36
376	0.37
377	0.29
378	0.24
379	0.22
380	0.22
381	0.25
382	0.23
383	0.19
384	0.15
385	0.14
386	0.13
387	0.12
388	0.12
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.1
393	0.12
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.11
398	0.11
399	0.12
400	0.15
401	0.2
402	0.22
403	0.25
404	0.26
405	0.25
406	0.26
407	0.28
408	0.26
409	0.25
410	0.25
411	0.23
412	0.22
413	0.23
414	0.22
415	0.2
416	0.19
417	0.14
418	0.14
419	0.15
420	0.18
421	0.15
422	0.14
423	0.16
424	0.15
425	0.15
426	0.14
427	0.12
428	0.11
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.13
433	0.12
434	0.13
435	0.17
436	0.18
437	0.18
438	0.24
439	0.23
440	0.23
441	0.27
442	0.28
443	0.24
444	0.23
445	0.22
446	0.15
447	0.15
448	0.15
449	0.11
450	0.1
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.11
461	0.11
462	0.14
463	0.2
464	0.26
465	0.29
466	0.33
467	0.38
468	0.42
469	0.46
470	0.48
471	0.44
472	0.43
473	0.43
474	0.47
475	0.45
476	0.39
477	0.33
478	0.31
479	0.31
480	0.31
481	0.37
482	0.33
483	0.39
484	0.46
485	0.56
486	0.62
487	0.66
488	0.69
489	0.61
490	0.61
491	0.54
492	0.51
493	0.41
494	0.37
495	0.38
496	0.31
497	0.31
498	0.26
499	0.26
500	0.21
501	0.21
502	0.17
503	0.1
504	0.12
505	0.1
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.08
510	0.08
511	0.07
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.06
520	0.08
521	0.13
522	0.14
523	0.14
524	0.14
525	0.15
526	0.19
527	0.25
528	0.27
529	0.26
530	0.28
531	0.34
532	0.4
533	0.44
534	0.46
535	0.45
536	0.45
537	0.42
538	0.43
539	0.44
540	0.4
541	0.37
542	0.32
543	0.29
544	0.3
545	0.31
546	0.29
547	0.26
548	0.25
549	0.24
550	0.25
551	0.25
552	0.22
553	0.21
554	0.23
555	0.21
556	0.21
557	0.23
558	0.2
559	0.17
560	0.16
561	0.14
562	0.1
563	0.1
564	0.09
565	0.07
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.09
570	0.09
571	0.1
572	0.1
573	0.1
574	0.08
575	0.14
576	0.19
577	0.2
578	0.22
579	0.29
580	0.28
581	0.28
582	0.29
583	0.23
584	0.23
585	0.22
586	0.19
587	0.12
588	0.14
589	0.14
590	0.13
591	0.13
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.13
597	0.13
598	0.17
599	0.18
600	0.18
601	0.2
602	0.26
603	0.29
604	0.26
605	0.27
606	0.24
607	0.25
608	0.25
609	0.23
610	0.17
611	0.13
612	0.09
613	0.08
614	0.08
615	0.05
616	0.04
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.04
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.06
625	0.06
626	0.08
627	0.09
628	0.11
629	0.11
630	0.12
631	0.12
632	0.1
633	0.11
634	0.09
635	0.1
636	0.09
637	0.1
638	0.1
639	0.1
640	0.11
641	0.11
642	0.12
643	0.11
644	0.09
645	0.09
646	0.1
647	0.09
648	0.09
649	0.09
650	0.09
651	0.08
652	0.08
653	0.11
654	0.15
655	0.15
656	0.16
657	0.17
658	0.17
659	0.18
660	0.2
661	0.18
662	0.15
663	0.17
664	0.17
665	0.19
666	0.2
667	0.19
668	0.19
669	0.19
670	0.17
671	0.19
672	0.22
673	0.21
674	0.21
675	0.21
676	0.2
677	0.19
678	0.19
679	0.15
680	0.1
681	0.08
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.06
695	0.06
696	0.07
697	0.08
698	0.12
699	0.14
700	0.16
701	0.18
702	0.23
703	0.33
704	0.34
705	0.35
706	0.32
707	0.32
708	0.35
709	0.33
710	0.35
711	0.3
712	0.32
713	0.33
714	0.36
715	0.36
716	0.32
717	0.33
718	0.34
719	0.29
720	0.31
721	0.29
722	0.26
723	0.24
724	0.22
725	0.21
726	0.14
727	0.14
728	0.11
729	0.11
730	0.12
731	0.12
732	0.12
733	0.13
734	0.12
735	0.12
736	0.11
737	0.13
738	0.12
739	0.15
740	0.16
741	0.19
742	0.21
743	0.21
744	0.21
745	0.2
746	0.19
747	0.19
748	0.24
749	0.27
750	0.27
751	0.29
752	0.27
753	0.26
754	0.26
755	0.23
756	0.25
757	0.19
758	0.17
759	0.16
760	0.16
761	0.15
762	0.14
763	0.15
764	0.07
765	0.08
766	0.1
767	0.08
768	0.09
769	0.1
770	0.11
771	0.11
772	0.11
773	0.13
774	0.12
775	0.13
776	0.12
777	0.11
778	0.11
779	0.1
780	0.12
781	0.09
782	0.09
783	0.1
784	0.11
785	0.1
786	0.1
787	0.11
788	0.1
789	0.1
790	0.1
791	0.14
792	0.22
793	0.28
794	0.34
795	0.34
796	0.33
797	0.34
798	0.36
799	0.33
800	0.33
801	0.34
802	0.35
803	0.4
804	0.43
805	0.42
806	0.42
807	0.45
808	0.43
809	0.43
810	0.41
811	0.41
812	0.44
813	0.53
814	0.56
815	0.53
816	0.56
817	0.5
818	0.47
819	0.5
820	0.5
821	0.47
822	0.51
823	0.56
824	0.5
825	0.54
826	0.54
827	0.51
828	0.47
829	0.42
830	0.38
831	0.31
832	0.28
833	0.24
834	0.2
835	0.15
836	0.14
837	0.11
838	0.06
839	0.06
840	0.06
841	0.07
842	0.07
843	0.08
844	0.12
845	0.13
846	0.16
847	0.21
848	0.26
849	0.3
850	0.31
851	0.35
852	0.35
853	0.38
854	0.36
855	0.33
856	0.32
857	0.32
858	0.35
859	0.36
860	0.37
861	0.4
862	0.47
863	0.48
864	0.49
865	0.5
866	0.48
867	0.44
868	0.42
869	0.35
870	0.27
871	0.24
872	0.2
873	0.15
874	0.14
875	0.13
876	0.1
877	0.11
878	0.11
879	0.11
880	0.12
881	0.12
882	0.13
883	0.18
884	0.2
885	0.25
886	0.31
887	0.31
888	0.3
889	0.31
890	0.3
891	0.27
892	0.27
893	0.23
894	0.17
895	0.18
896	0.22
897	0.21
898	0.23
899	0.21
900	0.21
901	0.2
902	0.2
903	0.19
904	0.19
905	0.2
906	0.17
907	0.22
908	0.2
909	0.22
910	0.22
911	0.22
912	0.2
913	0.2
914	0.2
915	0.14
916	0.15
917	0.13
918	0.15
919	0.17
920	0.14
921	0.19
922	0.19
923	0.22
924	0.2
925	0.2
926	0.25
927	0.25
928	0.34
929	0.36
930	0.4
931	0.42
932	0.51
933	0.58
934	0.55
935	0.54
936	0.48
937	0.45
938	0.41
939	0.37
940	0.29
941	0.23
942	0.19
943	0.21
944	0.18
945	0.16
946	0.2
947	0.2
948	0.24
949	0.28
950	0.28
951	0.3
952	0.37
953	0.38
954	0.37
955	0.37
956	0.35
957	0.36
958	0.37
959	0.38
960	0.35
961	0.38
962	0.36
963	0.44
964	0.45
965	0.47
966	0.52
967	0.5
968	0.52
969	0.5
970	0.5
971	0.44
972	0.42
973	0.34
974	0.28
975	0.26
976	0.2
977	0.18
978	0.17
979	0.14
980	0.12
981	0.12
982	0.12
983	0.12
984	0.11
985	0.17
986	0.17
987	0.19
988	0.19
989	0.19
990	0.19
991	0.16
992	0.15
993	0.08
994	0.11
995	0.1
996	0.11
997	0.12
998	0.15
999	0.17
1000	0.19
1001	0.29
1002	0.32
1003	0.39
1004	0.39
1005	0.41
1006	0.41
1007	0.45
1008	0.47
1009	0.42
1010	0.43
1011	0.45
1012	0.52
1013	0.5
1014	0.49
1015	0.43
1016	0.4
1017	0.39
1018	0.34
1019	0.29
1020	0.23
1021	0.23
1022	0.21
1023	0.21
1024	0.21
1025	0.21
1026	0.19
1027	0.23
1028	0.27
1029	0.34
1030	0.36
1031	0.4
1032	0.46
1033	0.48
1034	0.52
1035	0.53
1036	0.59
1037	0.59
1038	0.62
1039	0.62
1040	0.62
1041	0.62
1042	0.61
1043	0.6
1044	0.52
1045	0.5
1046	0.49
1047	0.5
1048	0.5
1049	0.49
1050	0.56
1051	0.53
1052	0.58
1053	0.55
1054	0.56
1055	0.51
1056	0.44
1057	0.44
1058	0.35
1059	0.32
1060	0.24
1061	0.2
1062	0.14
1063	0.14
1064	0.13
1065	0.09
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.1
1069	0.11
1070	0.15
1071	0.2
1072	0.24
1073	0.26
1074	0.3
1075	0.35
1076	0.34
1077	0.34
1078	0.37
1079	0.34
1080	0.31
1081	0.28
1082	0.25
1083	0.21
1084	0.22
1085	0.24
1086	0.23
1087	0.24
1088	0.24
1089	0.25
1090	0.27
1091	0.26
1092	0.25
1093	0.26
1094	0.22
1095	0.2
1096	0.19
1097	0.18
1098	0.16
1099	0.14
1100	0.16
1101	0.18
1102	0.21
1103	0.24
1104	0.31
1105	0.33
1106	0.36
1107	0.38
1108	0.39
1109	0.35
1110	0.38
1111	0.42
1112	0.38
1113	0.4
1114	0.4
1115	0.38
1116	0.35
1117	0.33
1118	0.27
1119	0.26
1120	0.24
1121	0.24
1122	0.29
1123	0.3
1124	0.33
1125	0.34
1126	0.43
1127	0.39
1128	0.43
1129	0.47
1130	0.48
1131	0.49
1132	0.49
1133	0.53
1134	0.45
1135	0.43
1136	0.38
1137	0.31
1138	0.24
1139	0.24
1140	0.22
1141	0.17
1142	0.16
1143	0.15
1144	0.14
1145	0.14
1146	0.15
1147	0.13
1148	0.11
1149	0.11
1150	0.14
1151	0.15
1152	0.19
1153	0.18
1154	0.17
1155	0.17
1156	0.18
1157	0.22
1158	0.2
1159	0.21
1160	0.18
1161	0.19
1162	0.19
1163	0.2
1164	0.19
1165	0.18
1166	0.15
1167	0.16
1168	0.19
1169	0.2
1170	0.21
1171	0.22
1172	0.21
1173	0.2
1174	0.23
1175	0.23
1176	0.24
1177	0.25
1178	0.26
1179	0.28
1180	0.29
1181	0.29
1182	0.28
1183	0.26
1184	0.23
1185	0.19
1186	0.16
1187	0.14
1188	0.13
1189	0.12
1190	0.11
1191	0.11
1192	0.1
1193	0.12
1194	0.12
1195	0.15
1196	0.14
1197	0.15
1198	0.15
1199	0.16
1200	0.15
1201	0.16
1202	0.17
1203	0.16
1204	0.16
1205	0.15
1206	0.15
1207	0.14
1208	0.2
1209	0.18
1210	0.18
1211	0.2
1212	0.19
1213	0.22
1214	0.26
1215	0.32
1216	0.36
1217	0.39
1218	0.44
1219	0.49
1220	0.58
1221	0.66
1222	0.71
1223	0.7
1224	0.7
1225	0.76
1226	0.78
1227	0.8
1228	0.76
1229	0.76
1230	0.76
1231	0.71
1232	0.64
1233	0.61
1234	0.55
1235	0.52
1236	0.56
1237	0.51
1238	0.47
1239	0.46
1240	0.47
1241	0.49
1242	0.48
1243	0.44
1244	0.45
1245	0.48
1246	0.51
1247	0.58
1248	0.64
1249	0.67
1250	0.69
1251	0.71
1252	0.69
1253	0.67
1254	0.67
1255	0.71
1256	0.71
1257	0.68
1258	0.71
1259	0.74
1260	0.76
1261	0.77
1262	0.77
1263	0.73
1264	0.69
1265	0.62
1266	0.61
1267	0.53
1268	0.46
1269	0.45
1270	0.39
1271	0.34
1272	0.3
1273	0.29
1274	0.22
1275	0.21
1276	0.18
1277	0.14
1278	0.11
1279	0.11
1280	0.1
1281	0.12
1282	0.14
1283	0.13
1284	0.14
1285	0.14
1286	0.16
1287	0.19
1288	0.22
1289	0.23
1290	0.24
1291	0.27
1292	0.3
1293	0.33

G8BSB6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer