Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BYH0

Protein Details
Accession G8BYH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-121VTAAVQSVRRNRKRSKKNFITPNNSKNTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-108RNRKRSK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.5, cyto 8, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR007147  TF_Vhr  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG tpf:TPHA_0J00900  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MSEKTTTNTSQFRISKNSASGNGTTSKIREQLNFKDDRKWKQFSSRRLELIDKFGLSNKKASEQDDNIRQIATILRTEFNYPVSYSPEFEKLVTAAVQSVRRNRKRSKKNFITPNNSKNTSTAEVSSTPPSDDDNNNGNVSRVLSPVPSQFATPMTFTINASMQNSNKQYQLPSMQPKLGHVLTTDKNNKGKSASMPKLNLPSSYSSPSVRTEPTNPLSNSYNDIIKSVISEIVNNIIPLSEQFKKEGSDIPNLSDFALSTQDHKLLSISNDNTGNKGTRGNDDVLSLPGFLRKNILIHIQRSRTCSEMALPEGSIDNYENLEILGEMSIKSAIVFVIERFFSNLLPNSMQYISSKTMSKETLASLSVKLFDSATNHNLAVLPIDNVQIKLFYLLLGGIIKDFGFDPILYPLSEIIHHIVVKQYPVESSNQTGAGISTSTNHNQQVSISSSIRTAVLCTTSMKPQQANEDVNRKVLIKFKDRQQLFKFPLLSNGTPTVNEILESSRSLFNIVKKSDVLGLYHNNNLVVEDNELVKLFNGFPTSNEIILEIKEKEFNENLPKIYSVPSIKHHVTNLTTTSGDQNESLGLRILSAVSLGIKDESNVDNQKVTHTLPITNPLLSKNMRHSDSVSKLDNIISRISSEPALAPVSSKPNLKGSFENGNLPQPMFQPLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.52
4 0.55
5 0.5
6 0.5
7 0.46
8 0.42
9 0.41
10 0.36
11 0.33
12 0.3
13 0.3
14 0.31
15 0.33
16 0.36
17 0.4
18 0.47
19 0.53
20 0.6
21 0.57
22 0.62
23 0.66
24 0.69
25 0.7
26 0.68
27 0.65
28 0.67
29 0.74
30 0.74
31 0.76
32 0.73
33 0.7
34 0.68
35 0.69
36 0.61
37 0.6
38 0.54
39 0.45
40 0.38
41 0.39
42 0.41
43 0.36
44 0.38
45 0.33
46 0.36
47 0.39
48 0.42
49 0.44
50 0.44
51 0.51
52 0.55
53 0.56
54 0.5
55 0.46
56 0.42
57 0.35
58 0.32
59 0.26
60 0.21
61 0.19
62 0.2
63 0.22
64 0.24
65 0.25
66 0.23
67 0.22
68 0.2
69 0.19
70 0.23
71 0.23
72 0.22
73 0.24
74 0.26
75 0.25
76 0.24
77 0.23
78 0.18
79 0.19
80 0.18
81 0.15
82 0.13
83 0.16
84 0.21
85 0.25
86 0.34
87 0.43
88 0.51
89 0.59
90 0.66
91 0.73
92 0.79
93 0.86
94 0.88
95 0.88
96 0.9
97 0.92
98 0.92
99 0.92
100 0.9
101 0.89
102 0.86
103 0.78
104 0.69
105 0.6
106 0.55
107 0.48
108 0.41
109 0.33
110 0.27
111 0.26
112 0.27
113 0.29
114 0.24
115 0.21
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.21
120 0.23
121 0.24
122 0.26
123 0.27
124 0.27
125 0.25
126 0.21
127 0.22
128 0.19
129 0.15
130 0.13
131 0.13
132 0.15
133 0.17
134 0.2
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.2
150 0.19
151 0.25
152 0.28
153 0.27
154 0.28
155 0.28
156 0.27
157 0.27
158 0.31
159 0.31
160 0.36
161 0.38
162 0.39
163 0.38
164 0.38
165 0.39
166 0.34
167 0.27
168 0.2
169 0.23
170 0.23
171 0.32
172 0.36
173 0.36
174 0.41
175 0.41
176 0.41
177 0.37
178 0.38
179 0.37
180 0.42
181 0.42
182 0.44
183 0.45
184 0.47
185 0.51
186 0.49
187 0.42
188 0.33
189 0.32
190 0.29
191 0.3
192 0.28
193 0.23
194 0.24
195 0.26
196 0.27
197 0.24
198 0.24
199 0.24
200 0.3
201 0.32
202 0.38
203 0.35
204 0.36
205 0.36
206 0.34
207 0.34
208 0.28
209 0.27
210 0.19
211 0.19
212 0.16
213 0.14
214 0.13
215 0.11
216 0.12
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.19
234 0.24
235 0.23
236 0.27
237 0.27
238 0.27
239 0.28
240 0.27
241 0.26
242 0.2
243 0.16
244 0.1
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.11
254 0.13
255 0.16
256 0.16
257 0.17
258 0.21
259 0.21
260 0.22
261 0.22
262 0.21
263 0.15
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.18
268 0.19
269 0.18
270 0.18
271 0.18
272 0.16
273 0.15
274 0.12
275 0.09
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.13
283 0.2
284 0.19
285 0.23
286 0.29
287 0.32
288 0.34
289 0.37
290 0.37
291 0.31
292 0.28
293 0.25
294 0.21
295 0.18
296 0.17
297 0.14
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.09
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.07
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.16
343 0.14
344 0.17
345 0.17
346 0.17
347 0.15
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.14
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.1
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.11
368 0.08
369 0.07
370 0.06
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.08
395 0.09
396 0.08
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.11
407 0.11
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.11
413 0.13
414 0.13
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.14
419 0.14
420 0.12
421 0.1
422 0.09
423 0.07
424 0.07
425 0.09
426 0.11
427 0.14
428 0.15
429 0.15
430 0.15
431 0.15
432 0.17
433 0.18
434 0.2
435 0.18
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.17
440 0.14
441 0.11
442 0.08
443 0.09
444 0.1
445 0.12
446 0.14
447 0.18
448 0.22
449 0.24
450 0.24
451 0.25
452 0.31
453 0.34
454 0.36
455 0.36
456 0.4
457 0.39
458 0.39
459 0.38
460 0.32
461 0.29
462 0.31
463 0.31
464 0.31
465 0.36
466 0.43
467 0.51
468 0.51
469 0.58
470 0.58
471 0.62
472 0.58
473 0.59
474 0.54
475 0.45
476 0.51
477 0.48
478 0.42
479 0.35
480 0.34
481 0.29
482 0.25
483 0.26
484 0.2
485 0.15
486 0.14
487 0.12
488 0.11
489 0.12
490 0.13
491 0.14
492 0.13
493 0.13
494 0.15
495 0.17
496 0.21
497 0.27
498 0.27
499 0.27
500 0.26
501 0.27
502 0.29
503 0.27
504 0.23
505 0.2
506 0.24
507 0.25
508 0.27
509 0.26
510 0.22
511 0.21
512 0.2
513 0.17
514 0.13
515 0.11
516 0.1
517 0.1
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.2
529 0.22
530 0.21
531 0.2
532 0.19
533 0.17
534 0.18
535 0.2
536 0.14
537 0.14
538 0.17
539 0.18
540 0.21
541 0.22
542 0.25
543 0.31
544 0.32
545 0.33
546 0.3
547 0.31
548 0.28
549 0.29
550 0.3
551 0.25
552 0.25
553 0.28
554 0.34
555 0.36
556 0.38
557 0.37
558 0.37
559 0.36
560 0.36
561 0.34
562 0.29
563 0.27
564 0.25
565 0.27
566 0.24
567 0.22
568 0.18
569 0.16
570 0.16
571 0.15
572 0.15
573 0.13
574 0.11
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.07
579 0.07
580 0.07
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.12
588 0.12
589 0.19
590 0.22
591 0.23
592 0.24
593 0.25
594 0.27
595 0.27
596 0.27
597 0.26
598 0.25
599 0.27
600 0.26
601 0.34
602 0.33
603 0.31
604 0.31
605 0.27
606 0.31
607 0.3
608 0.33
609 0.34
610 0.4
611 0.41
612 0.42
613 0.44
614 0.47
615 0.52
616 0.54
617 0.48
618 0.41
619 0.4
620 0.42
621 0.41
622 0.33
623 0.29
624 0.23
625 0.23
626 0.23
627 0.24
628 0.21
629 0.18
630 0.17
631 0.17
632 0.18
633 0.16
634 0.16
635 0.18
636 0.24
637 0.27
638 0.29
639 0.3
640 0.37
641 0.4
642 0.43
643 0.43
644 0.42
645 0.48
646 0.47
647 0.51
648 0.44
649 0.47
650 0.45
651 0.41
652 0.38
653 0.29