FuNGI

A0A2H3HK48

Protein Details

Accession

A0A2H3HK48

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
98-121	AADERKARGRSRFRSKRSRGDAMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
69-79	GRFRPKNIRRD
93-118	KASERAADERKARGRSRFRSKRSRGD

Subcellular Location(s)

mito 18, nucl 7, cyto_nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MNRGRAAARGSRRGAAAASSRAAGESNAGSSTPAVADTPGSATPVPQSIAATSTRGGATTRATRAPAAGRFRPKNIRRDEAARDSLARQEEQKASERAADERKARGRSRFRSKRSRGDAMGRGGFGRVISGASGPFSSGAAGFKSDSKPGFAQASRSREARINADKLHVHTPEEDLDSEDEAMIEALNSRAVSVLPMGIYRREHKDEGVIVATTAELEAAENAQAIPPTPSKEEESLWVDGDADEPLLTDESAEDGGIWKNNSKTPVIKKEPGLDDSMDLDIEAKADAGDKDKQASETPAPQTKKPKQDPEEAMIQTDLEILANELGAVEISEGEDGKTEGPSNKDGRMYLFQFPPVLPPLKPITQPSSINKVKPEPGEGEDNVLESTPAAADTEPVDLTNDKNTTGFNVPGFEDPEQKAGFMSSLLSTGGMVGQLKVRKSGRVELDWGGSTMELNPATGMNFLTTAVIIEENDEKPRPGVIGGESIGMGKIMGRFVLAPKWDDEEDWEVSSEDLRIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.37
3	0.34
4	0.29
5	0.27
6	0.24
7	0.24
8	0.23
9	0.22
10	0.17
11	0.15
12	0.12
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.11
18	0.12
19	0.1
20	0.09
21	0.08
22	0.08
23	0.09
24	0.09
25	0.12
26	0.11
27	0.13
28	0.12
29	0.12
30	0.14
31	0.16
32	0.16
33	0.14
34	0.15
35	0.13
36	0.16
37	0.16
38	0.16
39	0.14
40	0.16
41	0.15
42	0.14
43	0.14
44	0.14
45	0.19
46	0.23
47	0.27
48	0.27
49	0.29
50	0.29
51	0.31
52	0.36
53	0.37
54	0.38
55	0.42
56	0.49
57	0.52
58	0.59
59	0.67
60	0.68
61	0.7
62	0.7
63	0.7
64	0.65
65	0.68
66	0.69
67	0.67
68	0.64
69	0.56
70	0.51
71	0.45
72	0.44
73	0.4
74	0.33
75	0.27
76	0.29
77	0.3
78	0.32
79	0.37
80	0.33
81	0.32
82	0.34
83	0.33
84	0.32
85	0.35
86	0.38
87	0.35
88	0.41
89	0.47
90	0.5
91	0.54
92	0.58
93	0.62
94	0.66
95	0.74
96	0.76
97	0.78
98	0.82
99	0.86
100	0.87
101	0.85
102	0.83
103	0.77
104	0.75
105	0.72
106	0.67
107	0.61
108	0.51
109	0.43
110	0.35
111	0.3
112	0.21
113	0.15
114	0.09
115	0.06
116	0.06
117	0.07
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.07
127	0.07
128	0.08
129	0.09
130	0.12
131	0.13
132	0.16
133	0.16
134	0.19
135	0.19
136	0.21
137	0.25
138	0.23
139	0.29
140	0.33
141	0.38
142	0.38
143	0.38
144	0.37
145	0.36
146	0.38
147	0.38
148	0.37
149	0.36
150	0.35
151	0.38
152	0.37
153	0.36
154	0.39
155	0.32
156	0.26
157	0.23
158	0.23
159	0.21
160	0.21
161	0.18
162	0.14
163	0.14
164	0.14
165	0.13
166	0.11
167	0.08
168	0.07
169	0.06
170	0.05
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.05
183	0.06
184	0.07
185	0.09
186	0.11
187	0.14
188	0.2
189	0.24
190	0.24
191	0.24
192	0.26
193	0.25
194	0.25
195	0.23
196	0.17
197	0.12
198	0.12
199	0.11
200	0.07
201	0.06
202	0.04
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.06
214	0.07
215	0.1
216	0.11
217	0.13
218	0.15
219	0.16
220	0.17
221	0.18
222	0.2
223	0.19
224	0.18
225	0.16
226	0.14
227	0.13
228	0.13
229	0.09
230	0.05
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.03
242	0.04
243	0.05
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.09
248	0.11
249	0.13
250	0.14
251	0.19
252	0.25
253	0.35
254	0.39
255	0.42
256	0.41
257	0.46
258	0.47
259	0.43
260	0.37
261	0.28
262	0.22
263	0.2
264	0.18
265	0.12
266	0.09
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.04
272	0.03
273	0.05
274	0.05
275	0.08
276	0.1
277	0.1
278	0.12
279	0.13
280	0.14
281	0.14
282	0.17
283	0.16
284	0.2
285	0.24
286	0.29
287	0.31
288	0.34
289	0.43
290	0.47
291	0.55
292	0.57
293	0.63
294	0.6
295	0.68
296	0.68
297	0.61
298	0.62
299	0.51
300	0.45
301	0.35
302	0.3
303	0.2
304	0.16
305	0.12
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.02
317	0.02
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.07
327	0.09
328	0.12
329	0.17
330	0.19
331	0.21
332	0.22
333	0.22
334	0.25
335	0.28
336	0.29
337	0.29
338	0.28
339	0.26
340	0.26
341	0.25
342	0.24
343	0.22
344	0.21
345	0.16
346	0.19
347	0.22
348	0.24
349	0.26
350	0.27
351	0.29
352	0.32
353	0.37
354	0.38
355	0.43
356	0.43
357	0.44
358	0.43
359	0.42
360	0.42
361	0.39
362	0.38
363	0.32
364	0.32
365	0.35
366	0.31
367	0.31
368	0.25
369	0.25
370	0.21
371	0.17
372	0.14
373	0.08
374	0.08
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.1
386	0.11
387	0.16
388	0.15
389	0.14
390	0.15
391	0.15
392	0.17
393	0.2
394	0.2
395	0.16
396	0.17
397	0.18
398	0.2
399	0.23
400	0.2
401	0.22
402	0.21
403	0.25
404	0.23
405	0.22
406	0.2
407	0.17
408	0.16
409	0.11
410	0.11
411	0.07
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.11
422	0.15
423	0.16
424	0.23
425	0.24
426	0.28
427	0.32
428	0.39
429	0.41
430	0.41
431	0.45
432	0.41
433	0.43
434	0.38
435	0.34
436	0.27
437	0.2
438	0.16
439	0.13
440	0.14
441	0.11
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.11
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.07
457	0.09
458	0.13
459	0.14
460	0.18
461	0.19
462	0.19
463	0.19
464	0.2
465	0.19
466	0.16
467	0.17
468	0.15
469	0.19
470	0.18
471	0.19
472	0.18
473	0.17
474	0.16
475	0.13
476	0.11
477	0.08
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.09
482	0.1
483	0.13
484	0.19
485	0.2
486	0.2
487	0.22
488	0.27
489	0.27
490	0.26
491	0.29
492	0.28
493	0.28
494	0.27
495	0.26
496	0.21
497	0.21
498	0.21

A0A2H3HK48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer