FuNGI

A0A2H3GMM2

Protein Details

Accession

A0A2H3GMM2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-46	PGYPNGAPKKQKPNPLRPLRKNPKANPLVSRR	Hydrophilic
183-209	APVAKDPNPKRPKKQKEEKTTFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-52	APKKQKPNPLRPLRKNPKANPLVSRRPPPRPT
186-201	AKDPNPKRPKKQKEEK
484-503	SGKKPEGSKKSKSLKRAGSP
515-518	RKKL
568-568	K

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPPGNPPANAPGYPNGAPKKQKPNPLRPLRKNPKANPLVSRRPPPRPTTPSASGRPNGTKPNIEEIRRQNGGWSEPPPAKYNDIPIMTTKKDLLDGIRYHMMKFTQSKAGGKSIDPTDQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKTEAPEAPQADEEEVERQAQRKAEREAQRAIDQAKIAPVAKDPNPKRPKKQKEEKTTFNRAPKTETAKKASDLRYEEALPWHLEDAEGKNVWVGNFVDTLSGSNVAFMIDQSVFRMIPLEKWYKFTSKPPFQTYDIDEVEAFMSKKVDVGRWVMRDEEKKAGRKDLEATRKMFYGSGPMVKTESATFKAASRSEKLEHDEIDMSGDEFQDDDEAPMFERNDDEDTKDSKDRIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELDEQLREEILRQKLGKATKKALIKRDREDIYESDDSEENPWSSSSDDNSSDEEEEEDKKDDEKKEVNKDDKNQSGSGSKGTNTPSGKKPEGSKKSKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKLKKNVTSATGSRSGTPLLQGGAARRPTAPGSGSDGEATAGEMSDGAAPKRKKLKLVSSSARGTPSASRAGSPNPTQGAASPGSPGASAVEPSEILDKIPAEGITVNELIKLFNHRLGDRPGQMSKTEWIQLVKKLCDYGPDKRLRRRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.36
3	0.39
4	0.39
5	0.41
6	0.41
7	0.44
8	0.51
9	0.56
10	0.63
11	0.64
12	0.72
13	0.75
14	0.8
15	0.83
16	0.87
17	0.89
18	0.88
19	0.93
20	0.94
21	0.94
22	0.93
23	0.9
24	0.9
25	0.87
26	0.82
27	0.8
28	0.79
29	0.79
30	0.76
31	0.79
32	0.76
33	0.77
34	0.79
35	0.77
36	0.78
37	0.75
38	0.74
39	0.73
40	0.73
41	0.71
42	0.7
43	0.71
44	0.63
45	0.62
46	0.62
47	0.58
48	0.58
49	0.55
50	0.54
51	0.5
52	0.57
53	0.58
54	0.54
55	0.58
56	0.57
57	0.6
58	0.56
59	0.53
60	0.47
61	0.44
62	0.46
63	0.41
64	0.37
65	0.35
66	0.37
67	0.4
68	0.39
69	0.38
70	0.37
71	0.35
72	0.39
73	0.39
74	0.37
75	0.35
76	0.37
77	0.4
78	0.37
79	0.37
80	0.32
81	0.25
82	0.25
83	0.25
84	0.23
85	0.25
86	0.25
87	0.28
88	0.34
89	0.33
90	0.32
91	0.34
92	0.31
93	0.29
94	0.31
95	0.3
96	0.31
97	0.34
98	0.38
99	0.38
100	0.42
101	0.38
102	0.35
103	0.36
104	0.32
105	0.33
106	0.31
107	0.32
108	0.29
109	0.3
110	0.3
111	0.27
112	0.25
113	0.21
114	0.22
115	0.17
116	0.2
117	0.28
118	0.33
119	0.38
120	0.41
121	0.48
122	0.52
123	0.62
124	0.64
125	0.65
126	0.64
127	0.63
128	0.67
129	0.67
130	0.62
131	0.56
132	0.55
133	0.5
134	0.48
135	0.47
136	0.38
137	0.35
138	0.36
139	0.34
140	0.28
141	0.24
142	0.21
143	0.17
144	0.16
145	0.14
146	0.13
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.14
151	0.16
152	0.21
153	0.24
154	0.27
155	0.33
156	0.4
157	0.48
158	0.51
159	0.53
160	0.53
161	0.52
162	0.49
163	0.45
164	0.38
165	0.3
166	0.26
167	0.22
168	0.2
169	0.18
170	0.15
171	0.16
172	0.18
173	0.22
174	0.32
175	0.33
176	0.42
177	0.52
178	0.58
179	0.67
180	0.73
181	0.79
182	0.8
183	0.88
184	0.87
185	0.89
186	0.91
187	0.9
188	0.88
189	0.87
190	0.82
191	0.79
192	0.74
193	0.64
194	0.61
195	0.57
196	0.57
197	0.56
198	0.56
199	0.54
200	0.5
201	0.52
202	0.54
203	0.52
204	0.49
205	0.45
206	0.41
207	0.38
208	0.36
209	0.34
210	0.29
211	0.26
212	0.2
213	0.17
214	0.15
215	0.12
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.13
224	0.13
225	0.14
226	0.12
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.08
246	0.07
247	0.07
248	0.1
249	0.08
250	0.1
251	0.16
252	0.21
253	0.21
254	0.25
255	0.27
256	0.29
257	0.31
258	0.36
259	0.41
260	0.44
261	0.49
262	0.5
263	0.52
264	0.5
265	0.52
266	0.47
267	0.43
268	0.35
269	0.3
270	0.25
271	0.21
272	0.19
273	0.17
274	0.14
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.11
282	0.15
283	0.19
284	0.2
285	0.21
286	0.21
287	0.24
288	0.26
289	0.27
290	0.3
291	0.3
292	0.35
293	0.35
294	0.39
295	0.36
296	0.35
297	0.38
298	0.38
299	0.43
300	0.41
301	0.41
302	0.37
303	0.37
304	0.36
305	0.3
306	0.21
307	0.17
308	0.14
309	0.16
310	0.15
311	0.15
312	0.15
313	0.15
314	0.15
315	0.12
316	0.13
317	0.11
318	0.12
319	0.12
320	0.13
321	0.16
322	0.18
323	0.19
324	0.19
325	0.2
326	0.21
327	0.22
328	0.25
329	0.23
330	0.22
331	0.21
332	0.19
333	0.16
334	0.15
335	0.13
336	0.1
337	0.08
338	0.08
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.07
352	0.08
353	0.1
354	0.11
355	0.12
356	0.14
357	0.16
358	0.19
359	0.2
360	0.2
361	0.22
362	0.28
363	0.32
364	0.38
365	0.44
366	0.46
367	0.48
368	0.51
369	0.52
370	0.49
371	0.44
372	0.36
373	0.27
374	0.22
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.06
384	0.05
385	0.06
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.11
394	0.16
395	0.17
396	0.21
397	0.2
398	0.22
399	0.25
400	0.33
401	0.38
402	0.37
403	0.39
404	0.41
405	0.48
406	0.52
407	0.57
408	0.59
409	0.58
410	0.57
411	0.61
412	0.57
413	0.52
414	0.5
415	0.42
416	0.4
417	0.34
418	0.31
419	0.25
420	0.23
421	0.21
422	0.19
423	0.19
424	0.12
425	0.11
426	0.11
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.12
431	0.14
432	0.15
433	0.16
434	0.17
435	0.18
436	0.18
437	0.17
438	0.16
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.15
443	0.14
444	0.15
445	0.21
446	0.21
447	0.25
448	0.31
449	0.36
450	0.44
451	0.52
452	0.58
453	0.58
454	0.64
455	0.67
456	0.65
457	0.62
458	0.52
459	0.46
460	0.41
461	0.36
462	0.32
463	0.26
464	0.2
465	0.2
466	0.22
467	0.26
468	0.27
469	0.31
470	0.34
471	0.4
472	0.42
473	0.42
474	0.47
475	0.52
476	0.59
477	0.62
478	0.62
479	0.65
480	0.73
481	0.75
482	0.75
483	0.73
484	0.72
485	0.71
486	0.72
487	0.67
488	0.61
489	0.57
490	0.51
491	0.44
492	0.36
493	0.29
494	0.22
495	0.23
496	0.22
497	0.21
498	0.22
499	0.22
500	0.27
501	0.36
502	0.41
503	0.4
504	0.47
505	0.57
506	0.63
507	0.7
508	0.72
509	0.7
510	0.69
511	0.67
512	0.63
513	0.59
514	0.5
515	0.41
516	0.35
517	0.29
518	0.23
519	0.22
520	0.17
521	0.12
522	0.13
523	0.13
524	0.15
525	0.2
526	0.21
527	0.21
528	0.2
529	0.22
530	0.21
531	0.23
532	0.22
533	0.17
534	0.23
535	0.23
536	0.24
537	0.22
538	0.21
539	0.18
540	0.17
541	0.15
542	0.08
543	0.06
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.08
548	0.09
549	0.1
550	0.17
551	0.18
552	0.26
553	0.35
554	0.38
555	0.43
556	0.5
557	0.6
558	0.62
559	0.71
560	0.72
561	0.7
562	0.71
563	0.67
564	0.6
565	0.5
566	0.43
567	0.37
568	0.32
569	0.31
570	0.27
571	0.26
572	0.26
573	0.31
574	0.35
575	0.34
576	0.36
577	0.32
578	0.32
579	0.31
580	0.29
581	0.28
582	0.23
583	0.21
584	0.17
585	0.15
586	0.15
587	0.14
588	0.13
589	0.11
590	0.11
591	0.11
592	0.1
593	0.11
594	0.11
595	0.12
596	0.14
597	0.12
598	0.11
599	0.13
600	0.12
601	0.12
602	0.14
603	0.13
604	0.12
605	0.13
606	0.13
607	0.15
608	0.16
609	0.15
610	0.14
611	0.15
612	0.14
613	0.14
614	0.2
615	0.19
616	0.22
617	0.27
618	0.26
619	0.32
620	0.39
621	0.45
622	0.44
623	0.47
624	0.47
625	0.45
626	0.46
627	0.43
628	0.4
629	0.37
630	0.35
631	0.33
632	0.33
633	0.35
634	0.4
635	0.44
636	0.44
637	0.41
638	0.4
639	0.38
640	0.41
641	0.43
642	0.46
643	0.48
644	0.56
645	0.61

A0A2H3GMM2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer