Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BML4

Protein Details
Accession G8BML4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-73QQYQKETGKKASKRKLRKVSKVKMGHGGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-67GKKASKRKLRKVSKVK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.666, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG tpf:TPHA_0A00570  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MNGIFAIEKPTGITSNQFMMKLQHLLTNSQVFSKEIQRATTERIQQYQKETGKKASKRKLRKVSKVKMGHGGTLDPLASGVLVIGIGTGTKQLANYLSGTVKVYETEALFGVSTTSGDVEGDILSQNSVKHINIENLKTIPEKFIGSLKQTPPIYAALKMNGKPLHEYAREGKPLPRAIEPRQVNIYDLVIYPDSCSKNHNYDFLRKPTDELTEVTIKDLNANMLKDSLYFSKEFCEKYNKESELADVEPAIELSEEERAMIENDANYRAPLLHFKAKVSSGTYIRSLISDIGKAMRSSSYMVKLIRLQQQDWSLEKGNVFKMSDFTENDELVWSRVLELVLKEGASVNIADATAKIKIEVAKELEEQAQLARKNALETDTIAQTTTVTDDKLNLEQLTSNKRSIDEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.24
3 0.27
4 0.26
5 0.25
6 0.27
7 0.29
8 0.3
9 0.28
10 0.26
11 0.24
12 0.26
13 0.3
14 0.32
15 0.29
16 0.28
17 0.28
18 0.25
19 0.27
20 0.31
21 0.34
22 0.3
23 0.32
24 0.33
25 0.35
26 0.41
27 0.45
28 0.47
29 0.44
30 0.49
31 0.52
32 0.52
33 0.56
34 0.59
35 0.58
36 0.57
37 0.57
38 0.59
39 0.64
40 0.68
41 0.72
42 0.73
43 0.76
44 0.79
45 0.87
46 0.88
47 0.89
48 0.92
49 0.92
50 0.92
51 0.92
52 0.89
53 0.83
54 0.81
55 0.72
56 0.64
57 0.55
58 0.45
59 0.36
60 0.29
61 0.24
62 0.14
63 0.12
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.04
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.02
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.09
117 0.12
118 0.14
119 0.2
120 0.24
121 0.26
122 0.27
123 0.25
124 0.27
125 0.25
126 0.23
127 0.19
128 0.16
129 0.15
130 0.13
131 0.17
132 0.18
133 0.21
134 0.27
135 0.26
136 0.31
137 0.31
138 0.3
139 0.28
140 0.29
141 0.26
142 0.22
143 0.22
144 0.19
145 0.23
146 0.24
147 0.27
148 0.26
149 0.25
150 0.24
151 0.25
152 0.28
153 0.25
154 0.27
155 0.26
156 0.31
157 0.32
158 0.32
159 0.33
160 0.32
161 0.34
162 0.33
163 0.34
164 0.33
165 0.34
166 0.42
167 0.4
168 0.37
169 0.37
170 0.35
171 0.3
172 0.26
173 0.23
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.14
184 0.16
185 0.22
186 0.23
187 0.29
188 0.27
189 0.34
190 0.4
191 0.43
192 0.44
193 0.37
194 0.38
195 0.34
196 0.33
197 0.26
198 0.21
199 0.19
200 0.19
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.11
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.13
220 0.16
221 0.17
222 0.18
223 0.26
224 0.25
225 0.3
226 0.38
227 0.36
228 0.34
229 0.33
230 0.32
231 0.26
232 0.25
233 0.2
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.14
259 0.17
260 0.22
261 0.23
262 0.24
263 0.27
264 0.28
265 0.29
266 0.27
267 0.27
268 0.22
269 0.24
270 0.24
271 0.22
272 0.21
273 0.19
274 0.18
275 0.15
276 0.14
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.17
287 0.19
288 0.21
289 0.22
290 0.23
291 0.27
292 0.32
293 0.37
294 0.36
295 0.33
296 0.34
297 0.39
298 0.4
299 0.38
300 0.36
301 0.31
302 0.3
303 0.3
304 0.29
305 0.27
306 0.26
307 0.25
308 0.21
309 0.21
310 0.23
311 0.26
312 0.23
313 0.26
314 0.26
315 0.25
316 0.24
317 0.24
318 0.22
319 0.18
320 0.18
321 0.13
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.12
345 0.15
346 0.17
347 0.22
348 0.23
349 0.24
350 0.26
351 0.28
352 0.27
353 0.25
354 0.23
355 0.21
356 0.24
357 0.22
358 0.22
359 0.23
360 0.22
361 0.23
362 0.25
363 0.24
364 0.19
365 0.21
366 0.23
367 0.23
368 0.22
369 0.2
370 0.19
371 0.17
372 0.16
373 0.16
374 0.13
375 0.12
376 0.12
377 0.14
378 0.18
379 0.2
380 0.23
381 0.21
382 0.2
383 0.23
384 0.29
385 0.36
386 0.36
387 0.36
388 0.34