Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3HTA3

Protein Details
Accession A0A2H3HTA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-121ERITTRAPRKKGQRKSRKPIHSLRSVVHydrophilic
287-316LRVRGPKEVTKLLKKKRRTKKEIAAEAEAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-113RAPRKKGQRKSRKP
291-307GPKEVTKLLKKKRRTKK
Subcellular Location(s) mito 21, cyto_mito 13, nucl 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
Amino Acid Sequences MSQLSRPIPALYAVYVLRSTKRHASIYIGSTPHPPRRLNQHNGIARGGAVRTAKDTLRPWEVMILITGFPSSIAALKFEWALTNPHLTTHISTEERITTRAPRKKGQRKSRKPIHSLRSVVSNLHLLVGVSSFARWPLTLHFFVPEPKKAWDNWLKNKETTPREGIKITEDYAPDEGSNGTKSVEPWGIHALPLDYAPIKPYIEKAHNVVKFEREGDCVHCHEALESGKGLQPMCPHDGCEAMGHLDCWSKHALKGEPKETLLPLSCTCPSCGGKINWSDMMKELTLRVRGPKEVTKLLKKKRRTKKEIAAEAEAEEDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.18
4 0.21
5 0.22
6 0.26
7 0.31
8 0.37
9 0.38
10 0.37
11 0.42
12 0.44
13 0.47
14 0.48
15 0.41
16 0.37
17 0.42
18 0.47
19 0.48
20 0.48
21 0.45
22 0.44
23 0.53
24 0.62
25 0.63
26 0.65
27 0.67
28 0.67
29 0.68
30 0.63
31 0.52
32 0.43
33 0.36
34 0.27
35 0.21
36 0.16
37 0.14
38 0.16
39 0.19
40 0.19
41 0.22
42 0.26
43 0.28
44 0.32
45 0.32
46 0.3
47 0.3
48 0.3
49 0.24
50 0.22
51 0.17
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.09
68 0.12
69 0.13
70 0.17
71 0.16
72 0.16
73 0.18
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.21
78 0.18
79 0.18
80 0.19
81 0.22
82 0.21
83 0.21
84 0.21
85 0.24
86 0.33
87 0.39
88 0.43
89 0.46
90 0.56
91 0.65
92 0.74
93 0.77
94 0.79
95 0.83
96 0.89
97 0.92
98 0.9
99 0.88
100 0.87
101 0.83
102 0.8
103 0.72
104 0.62
105 0.58
106 0.49
107 0.41
108 0.33
109 0.27
110 0.18
111 0.16
112 0.14
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.08
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.2
131 0.23
132 0.22
133 0.19
134 0.2
135 0.22
136 0.21
137 0.28
138 0.33
139 0.38
140 0.45
141 0.51
142 0.52
143 0.51
144 0.54
145 0.54
146 0.47
147 0.43
148 0.39
149 0.34
150 0.34
151 0.33
152 0.31
153 0.26
154 0.24
155 0.22
156 0.18
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.1
171 0.14
172 0.13
173 0.14
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.14
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.16
190 0.19
191 0.21
192 0.23
193 0.3
194 0.32
195 0.34
196 0.33
197 0.3
198 0.28
199 0.28
200 0.26
201 0.2
202 0.19
203 0.21
204 0.23
205 0.22
206 0.22
207 0.21
208 0.19
209 0.17
210 0.19
211 0.17
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.14
216 0.16
217 0.15
218 0.14
219 0.16
220 0.18
221 0.23
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.22
226 0.2
227 0.18
228 0.15
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.17
237 0.17
238 0.19
239 0.24
240 0.3
241 0.35
242 0.43
243 0.46
244 0.45
245 0.45
246 0.46
247 0.41
248 0.38
249 0.31
250 0.27
251 0.23
252 0.24
253 0.26
254 0.25
255 0.26
256 0.28
257 0.27
258 0.27
259 0.33
260 0.31
261 0.35
262 0.37
263 0.41
264 0.41
265 0.4
266 0.38
267 0.33
268 0.34
269 0.28
270 0.25
271 0.23
272 0.22
273 0.25
274 0.26
275 0.31
276 0.31
277 0.35
278 0.4
279 0.44
280 0.45
281 0.51
282 0.57
283 0.6
284 0.67
285 0.74
286 0.77
287 0.81
288 0.85
289 0.87
290 0.9
291 0.89
292 0.9
293 0.9
294 0.92
295 0.91
296 0.87
297 0.81
298 0.71
299 0.62