FuNGI

A0A2H3JSM1

Protein Details

Accession

A0A2H3JSM1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
976-1006	GAAKSKKGAAKGKKGKKKVGRPRTQTSTQSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
978-998	AKSKKGAAKGKKGKKKVGRPR

Subcellular Location(s)

pero 10, cyto 9, nucl 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MDVDVITEGETEEPEYEIPFNLDTLRKHLSQVVLARRVLPNDVAARQKLLEESVYDVAVERLKHQSELIEDLGLGNKGLQNVDLRTWMWNWHLKLQVRLKAEVDALQEEERRIPTGSGRRSDPYRASALGPFLSLLKPEKLSLIAILELMHLQGTGGVIDGMKTARALLAVGKAVELEYKAEMCKKHNVAIPTSTGRPNERGYFTALAYRELHNHRIAAQKYLEDAEDWTSDWTQAVRVKIGSFLVDALMDVATVVRTAVDKKTGEVVTEEQPAFFHSYEYIRGYKLGVIKLNPEIAEKMAKESLRETLHPRHLPMLVKPKPWLNYDQGGYLFNRTYAMRFKDSQEQQNYLRHAAQMGNLELIFAGLDVLGSTPWQINRSVFDVVLEVWNSGVRWEKIPPAAYDVAEPGKPENHETEPKARVYYMMRMKNWQLQKAANHSDRCSVNYKIEIARAFLGDTIYFPHNVDFRGRAYPLPPHLSHIGDDLSRGLLKFGEAKPLGERGLRWLKIHLANLYGFDKADFDERVAFVDRQLDDIFDSATNPIHGRRWWTKADDPWQCLATCMELKAALESPNPYDYECALPVHQDGTCNGLQHYAALGGDAQGAKQVNLDVTERPADVYTYVANMVEQSMIEDREKGDYFATLLSGKIARKVVKQTVMTTVYGVTYIGAREQIEKQLKDRGDISAEECWGASAYVAKKVLGCIGDLFHGAKEIQNWLSVTARLISKSIPPERLEGTESPGTQSSSVESSDAQSSSTRFMNKSTLKKEQMTSVIWTTPLGLPIVQPYRATKRKQIITSLQTVYISDPSSPTIVNSQKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTALECQTRGLTFASVHDSYWTHAGSIDEMSAIIRETFIALHSSDVLGKLAEEFRERYKGYKIPLTSINSAKLIQSLGLCLDSEIVAHNLDGTPAGTVPLSEVIRSNDDDADELADADEAEDKVSAAESEEGATESEEGAAKSKKGAAKGKKGKKKVGRPRTQTSTQSFSVQQLKNIFRESGFEGKFVELVDILPPLPKKGQFDVATIKKSLYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.11
3	0.11
4	0.12
5	0.13
6	0.12
7	0.12
8	0.15
9	0.19
10	0.19
11	0.24
12	0.28
13	0.28
14	0.29
15	0.33
16	0.32
17	0.34
18	0.41
19	0.45
20	0.46
21	0.46
22	0.48
23	0.46
24	0.45
25	0.41
26	0.34
27	0.31
28	0.29
29	0.34
30	0.35
31	0.34
32	0.34
33	0.32
34	0.32
35	0.28
36	0.25
37	0.21
38	0.17
39	0.2
40	0.19
41	0.19
42	0.17
43	0.16
44	0.16
45	0.18
46	0.17
47	0.15
48	0.21
49	0.22
50	0.23
51	0.24
52	0.25
53	0.25
54	0.29
55	0.27
56	0.2
57	0.19
58	0.19
59	0.2
60	0.17
61	0.14
62	0.11
63	0.11
64	0.12
65	0.12
66	0.13
67	0.15
68	0.17
69	0.19
70	0.2
71	0.19
72	0.21
73	0.22
74	0.23
75	0.25
76	0.3
77	0.31
78	0.35
79	0.42
80	0.43
81	0.51
82	0.56
83	0.58
84	0.55
85	0.55
86	0.49
87	0.44
88	0.42
89	0.36
90	0.31
91	0.26
92	0.24
93	0.24
94	0.25
95	0.23
96	0.25
97	0.22
98	0.21
99	0.21
100	0.2
101	0.25
102	0.33
103	0.39
104	0.4
105	0.43
106	0.47
107	0.5
108	0.55
109	0.52
110	0.47
111	0.44
112	0.41
113	0.39
114	0.36
115	0.35
116	0.29
117	0.24
118	0.2
119	0.17
120	0.16
121	0.16
122	0.17
123	0.17
124	0.18
125	0.18
126	0.19
127	0.19
128	0.19
129	0.18
130	0.16
131	0.13
132	0.12
133	0.12
134	0.11
135	0.1
136	0.09
137	0.07
138	0.05
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.06
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.07
154	0.07
155	0.08
156	0.1
157	0.12
158	0.12
159	0.11
160	0.11
161	0.11
162	0.12
163	0.1
164	0.09
165	0.09
166	0.1
167	0.12
168	0.16
169	0.18
170	0.21
171	0.3
172	0.31
173	0.35
174	0.39
175	0.4
176	0.4
177	0.41
178	0.43
179	0.38
180	0.39
181	0.37
182	0.36
183	0.36
184	0.36
185	0.37
186	0.37
187	0.36
188	0.34
189	0.35
190	0.34
191	0.31
192	0.33
193	0.29
194	0.26
195	0.25
196	0.25
197	0.27
198	0.29
199	0.33
200	0.29
201	0.29
202	0.3
203	0.36
204	0.36
205	0.34
206	0.31
207	0.28
208	0.28
209	0.28
210	0.25
211	0.17
212	0.17
213	0.14
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.12
219	0.12
220	0.11
221	0.13
222	0.16
223	0.17
224	0.17
225	0.17
226	0.17
227	0.19
228	0.19
229	0.16
230	0.12
231	0.11
232	0.1
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.06
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.03
244	0.05
245	0.07
246	0.09
247	0.14
248	0.15
249	0.16
250	0.23
251	0.22
252	0.22
253	0.22
254	0.24
255	0.22
256	0.27
257	0.26
258	0.2
259	0.2
260	0.2
261	0.21
262	0.18
263	0.15
264	0.11
265	0.13
266	0.16
267	0.19
268	0.18
269	0.16
270	0.16
271	0.16
272	0.18
273	0.2
274	0.21
275	0.21
276	0.2
277	0.23
278	0.24
279	0.26
280	0.23
281	0.2
282	0.18
283	0.16
284	0.19
285	0.16
286	0.17
287	0.19
288	0.19
289	0.19
290	0.19
291	0.24
292	0.23
293	0.25
294	0.28
295	0.32
296	0.41
297	0.42
298	0.42
299	0.39
300	0.4
301	0.4
302	0.4
303	0.42
304	0.38
305	0.39
306	0.4
307	0.42
308	0.42
309	0.42
310	0.41
311	0.35
312	0.35
313	0.34
314	0.34
315	0.3
316	0.29
317	0.26
318	0.24
319	0.19
320	0.14
321	0.14
322	0.12
323	0.13
324	0.18
325	0.21
326	0.23
327	0.25
328	0.28
329	0.36
330	0.41
331	0.47
332	0.46
333	0.46
334	0.45
335	0.49
336	0.48
337	0.4
338	0.36
339	0.28
340	0.25
341	0.22
342	0.21
343	0.18
344	0.16
345	0.15
346	0.13
347	0.13
348	0.11
349	0.1
350	0.07
351	0.04
352	0.03
353	0.02
354	0.02
355	0.02
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.05
361	0.06
362	0.08
363	0.09
364	0.1
365	0.12
366	0.15
367	0.16
368	0.14
369	0.13
370	0.13
371	0.12
372	0.13
373	0.11
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.11
380	0.1
381	0.11
382	0.13
383	0.16
384	0.19
385	0.21
386	0.21
387	0.21
388	0.22
389	0.21
390	0.2
391	0.19
392	0.17
393	0.15
394	0.15
395	0.11
396	0.12
397	0.13
398	0.14
399	0.16
400	0.19
401	0.23
402	0.26
403	0.31
404	0.32
405	0.32
406	0.31
407	0.27
408	0.26
409	0.23
410	0.29
411	0.31
412	0.34
413	0.34
414	0.36
415	0.38
416	0.43
417	0.44
418	0.4
419	0.34
420	0.31
421	0.34
422	0.38
423	0.44
424	0.42
425	0.41
426	0.38
427	0.41
428	0.38
429	0.37
430	0.34
431	0.28
432	0.25
433	0.24
434	0.25
435	0.21
436	0.23
437	0.2
438	0.17
439	0.17
440	0.14
441	0.13
442	0.11
443	0.1
444	0.07
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.09
449	0.09
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.13
454	0.12
455	0.13
456	0.15
457	0.16
458	0.15
459	0.15
460	0.19
461	0.21
462	0.24
463	0.23
464	0.23
465	0.24
466	0.24
467	0.23
468	0.2
469	0.18
470	0.12
471	0.12
472	0.1
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.1
480	0.1
481	0.17
482	0.17
483	0.17
484	0.18
485	0.2
486	0.2
487	0.16
488	0.16
489	0.15
490	0.23
491	0.23
492	0.23
493	0.22
494	0.26
495	0.28
496	0.3
497	0.24
498	0.18
499	0.17
500	0.19
501	0.19
502	0.14
503	0.11
504	0.09
505	0.09
506	0.07
507	0.09
508	0.07
509	0.07
510	0.08
511	0.08
512	0.1
513	0.11
514	0.11
515	0.09
516	0.13
517	0.13
518	0.14
519	0.14
520	0.12
521	0.1
522	0.11
523	0.11
524	0.06
525	0.07
526	0.05
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.09
532	0.09
533	0.15
534	0.19
535	0.24
536	0.26
537	0.3
538	0.33
539	0.37
540	0.45
541	0.44
542	0.43
543	0.4
544	0.38
545	0.33
546	0.3
547	0.25
548	0.18
549	0.13
550	0.11
551	0.09
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.09
556	0.08
557	0.09
558	0.09
559	0.1
560	0.11
561	0.12
562	0.11
563	0.11
564	0.11
565	0.12
566	0.12
567	0.11
568	0.1
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.1
573	0.09
574	0.08
575	0.12
576	0.12
577	0.12
578	0.12
579	0.12
580	0.11
581	0.11
582	0.11
583	0.07
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.06
589	0.05
590	0.05
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.08
598	0.1
599	0.08
600	0.09
601	0.11
602	0.1
603	0.1
604	0.1
605	0.09
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.05
616	0.04
617	0.05
618	0.06
619	0.07
620	0.08
621	0.08
622	0.08
623	0.12
624	0.13
625	0.12
626	0.11
627	0.1
628	0.1
629	0.1
630	0.1
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.1
635	0.1
636	0.13
637	0.16
638	0.17
639	0.2
640	0.26
641	0.3
642	0.34
643	0.35
644	0.33
645	0.36
646	0.36
647	0.33
648	0.28
649	0.23
650	0.17
651	0.15
652	0.13
653	0.07
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.06
658	0.06
659	0.09
660	0.1
661	0.18
662	0.24
663	0.25
664	0.26
665	0.32
666	0.32
667	0.31
668	0.31
669	0.25
670	0.21
671	0.21
672	0.22
673	0.17
674	0.17
675	0.15
676	0.14
677	0.12
678	0.1
679	0.09
680	0.07
681	0.08
682	0.09
683	0.13
684	0.14
685	0.14
686	0.14
687	0.14
688	0.17
689	0.13
690	0.13
691	0.09
692	0.1
693	0.1
694	0.11
695	0.11
696	0.08
697	0.09
698	0.09
699	0.09
700	0.09
701	0.11
702	0.11
703	0.13
704	0.13
705	0.13
706	0.15
707	0.14
708	0.14
709	0.13
710	0.14
711	0.12
712	0.13
713	0.12
714	0.15
715	0.22
716	0.26
717	0.28
718	0.28
719	0.3
720	0.32
721	0.33
722	0.32
723	0.25
724	0.26
725	0.25
726	0.24
727	0.23
728	0.22
729	0.21
730	0.18
731	0.17
732	0.13
733	0.12
734	0.12
735	0.11
736	0.1
737	0.11
738	0.12
739	0.12
740	0.12
741	0.11
742	0.12
743	0.14
744	0.17
745	0.18
746	0.16
747	0.18
748	0.26
749	0.32
750	0.4
751	0.44
752	0.5
753	0.53
754	0.56
755	0.55
756	0.52
757	0.49
758	0.42
759	0.39
760	0.33
761	0.28
762	0.25
763	0.23
764	0.2
765	0.16
766	0.15
767	0.12
768	0.1
769	0.09
770	0.15
771	0.18
772	0.17
773	0.17
774	0.21
775	0.3
776	0.37
777	0.41
778	0.43
779	0.49
780	0.56
781	0.59
782	0.62
783	0.61
784	0.58
785	0.61
786	0.55
787	0.47
788	0.4
789	0.36
790	0.3
791	0.24
792	0.2
793	0.13
794	0.12
795	0.12
796	0.13
797	0.12
798	0.12
799	0.17
800	0.21
801	0.23
802	0.26
803	0.26
804	0.28
805	0.29
806	0.3
807	0.25
808	0.31
809	0.29
810	0.29
811	0.29
812	0.29
813	0.29
814	0.28
815	0.27
816	0.17
817	0.18
818	0.16
819	0.17
820	0.15
821	0.13
822	0.13
823	0.11
824	0.11
825	0.09
826	0.11
827	0.1
828	0.1
829	0.1
830	0.1
831	0.11
832	0.11
833	0.12
834	0.1
835	0.1
836	0.1
837	0.12
838	0.18
839	0.18
840	0.18
841	0.18
842	0.18
843	0.18
844	0.2
845	0.18
846	0.12
847	0.13
848	0.14
849	0.13
850	0.13
851	0.12
852	0.09
853	0.08
854	0.08
855	0.07
856	0.07
857	0.06
858	0.05
859	0.05
860	0.06
861	0.06
862	0.07
863	0.08
864	0.08
865	0.09
866	0.09
867	0.1
868	0.1
869	0.11
870	0.1
871	0.08
872	0.08
873	0.1
874	0.11
875	0.13
876	0.15
877	0.16
878	0.2
879	0.27
880	0.27
881	0.28
882	0.33
883	0.36
884	0.38
885	0.43
886	0.4
887	0.38
888	0.45
889	0.48
890	0.47
891	0.46
892	0.44
893	0.38
894	0.37
895	0.33
896	0.27
897	0.21
898	0.18
899	0.14
900	0.12
901	0.12
902	0.12
903	0.11
904	0.1
905	0.1
906	0.08
907	0.08
908	0.09
909	0.08
910	0.08
911	0.08
912	0.09
913	0.08
914	0.08
915	0.09
916	0.07
917	0.07
918	0.07
919	0.08
920	0.06
921	0.06
922	0.08
923	0.12
924	0.13
925	0.13
926	0.15
927	0.17
928	0.21
929	0.22
930	0.23
931	0.19
932	0.19
933	0.19
934	0.18
935	0.17
936	0.13
937	0.12
938	0.1
939	0.09
940	0.08
941	0.07
942	0.09
943	0.07
944	0.08
945	0.08
946	0.08
947	0.08
948	0.08
949	0.08
950	0.07
951	0.09
952	0.08
953	0.09
954	0.1
955	0.1
956	0.1
957	0.1
958	0.09
959	0.08
960	0.09
961	0.09
962	0.09
963	0.13
964	0.15
965	0.15
966	0.17
967	0.22
968	0.24
969	0.32
970	0.41
971	0.46
972	0.56
973	0.66
974	0.75
975	0.8
976	0.85
977	0.88
978	0.88
979	0.9
980	0.9
981	0.9
982	0.9
983	0.89
984	0.9
985	0.88
986	0.86
987	0.83
988	0.78
989	0.74
990	0.65
991	0.6
992	0.52
993	0.5
994	0.51
995	0.44
996	0.43
997	0.45
998	0.47
999	0.47
1000	0.48
1001	0.44
1002	0.34
1003	0.37
1004	0.36
1005	0.38
1006	0.34
1007	0.31
1008	0.29
1009	0.28
1010	0.29
1011	0.25
1012	0.21
1013	0.12
1014	0.11
1015	0.12
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.14
1019	0.15
1020	0.17
1021	0.22
1022	0.25
1023	0.29
1024	0.33
1025	0.43
1026	0.4
1027	0.45
1028	0.52
1029	0.54
1030	0.54
1031	0.5
1032	0.46
1033	0.4

A0A2H3JSM1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer