Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BP40

Protein Details
Accession G8BP40    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
535-561YIQRRNSSPRKLSPKRVVKKSPSKAQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
543-555PRKLSPKRVVKKS
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004536  F:DNA nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG tpf:TPHA_0A05940  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGIPQVWEKLKQYTDNSRVPFKKFVADFYQERNRSPRIAIDCYQWLYECGFFIKDLPELQQVVNEQPSKPILNFISRIRDFLSLDITFILVFDGPMKPSFKNKHKLTNSLISNETLNIDLTNYKELWDNHLKSHLNFDHCMMNEYNNDTRAIKELKKLLKLFNISFIDSCGEAEAQCSWLQKNNFVDFVLSNDSDNILFGCTKILKNYSRYREDIGSTHVTKDNRPVRRNSKETYVTVVDMDKIALLANERFDKPAILLLTVFLGADYNKGIKGLGKEKSIILSSLRNPDFSNQFLSIFNSLNTSDLEQESKYQSFQQEITEYSRNNSLKLFGRNYKSLFSSPKLDGWPSKTAIMYYVNPFVIPNFEPSCFSKEYTNISGSSSFIEIDYNPIRNFLNDLEIKQIAYFDKWFCETLSISFLLKFIKLPNNNNLCKYMEIIEERVLKINNGEFEIDSWKIGFNPFLEKSGNIFSRESTDRNPIHVPHKDLSDSSRSLESTLIYGPTENKANKSHYLFYYWIAKNLIPKNNDLISNFYIQRRNSSPRKLSPKRVVKKSPSKAQTVQKNNLDSFLSKHASPIKIQIGTIFDNNKSKPYTTNEDDSPVIQPHKEVRRKLFVEEIEDDYYHWSSDSDSPIVYEQNDIVNKIKLSPKKERNHAVIDLTEDNNFIASNENSPLKEKKLSSEVYNKPNILSKEAQSFAPNKPEVHVPMLNKSISFLDDITTGLSFSYQSSSSNGTASPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.61
3 0.62
4 0.65
5 0.66
6 0.65
7 0.64
8 0.56
9 0.57
10 0.5
11 0.52
12 0.49
13 0.51
14 0.5
15 0.51
16 0.59
17 0.52
18 0.55
19 0.55
20 0.51
21 0.47
22 0.46
23 0.45
24 0.42
25 0.46
26 0.45
27 0.44
28 0.47
29 0.46
30 0.45
31 0.37
32 0.31
33 0.27
34 0.25
35 0.21
36 0.16
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.16
41 0.16
42 0.17
43 0.19
44 0.21
45 0.22
46 0.22
47 0.24
48 0.23
49 0.25
50 0.31
51 0.29
52 0.25
53 0.27
54 0.3
55 0.29
56 0.28
57 0.3
58 0.27
59 0.31
60 0.34
61 0.36
62 0.43
63 0.4
64 0.42
65 0.38
66 0.38
67 0.33
68 0.3
69 0.32
70 0.22
71 0.22
72 0.2
73 0.18
74 0.14
75 0.13
76 0.12
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.09
81 0.1
82 0.13
83 0.16
84 0.17
85 0.26
86 0.36
87 0.44
88 0.53
89 0.57
90 0.65
91 0.69
92 0.75
93 0.73
94 0.72
95 0.67
96 0.61
97 0.56
98 0.47
99 0.41
100 0.34
101 0.28
102 0.19
103 0.16
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.18
112 0.19
113 0.26
114 0.34
115 0.34
116 0.34
117 0.42
118 0.43
119 0.38
120 0.47
121 0.45
122 0.39
123 0.38
124 0.37
125 0.35
126 0.34
127 0.37
128 0.28
129 0.26
130 0.24
131 0.28
132 0.29
133 0.24
134 0.26
135 0.23
136 0.23
137 0.25
138 0.28
139 0.26
140 0.29
141 0.36
142 0.4
143 0.48
144 0.5
145 0.49
146 0.5
147 0.53
148 0.48
149 0.48
150 0.44
151 0.38
152 0.35
153 0.32
154 0.26
155 0.2
156 0.2
157 0.12
158 0.1
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.11
166 0.18
167 0.19
168 0.24
169 0.29
170 0.3
171 0.3
172 0.28
173 0.29
174 0.23
175 0.25
176 0.23
177 0.18
178 0.15
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.13
183 0.1
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.09
188 0.11
189 0.12
190 0.14
191 0.2
192 0.23
193 0.31
194 0.4
195 0.45
196 0.48
197 0.5
198 0.51
199 0.48
200 0.46
201 0.4
202 0.37
203 0.35
204 0.3
205 0.31
206 0.32
207 0.29
208 0.28
209 0.36
210 0.39
211 0.42
212 0.45
213 0.51
214 0.57
215 0.66
216 0.7
217 0.64
218 0.64
219 0.61
220 0.58
221 0.54
222 0.46
223 0.37
224 0.32
225 0.29
226 0.21
227 0.15
228 0.14
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.09
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.12
242 0.16
243 0.14
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.12
261 0.18
262 0.21
263 0.22
264 0.23
265 0.24
266 0.25
267 0.24
268 0.2
269 0.16
270 0.16
271 0.18
272 0.25
273 0.25
274 0.24
275 0.24
276 0.27
277 0.27
278 0.24
279 0.25
280 0.17
281 0.18
282 0.17
283 0.19
284 0.17
285 0.15
286 0.14
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.09
296 0.11
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.16
307 0.2
308 0.21
309 0.2
310 0.19
311 0.25
312 0.24
313 0.23
314 0.22
315 0.21
316 0.22
317 0.27
318 0.3
319 0.29
320 0.33
321 0.36
322 0.37
323 0.35
324 0.32
325 0.3
326 0.29
327 0.26
328 0.26
329 0.24
330 0.25
331 0.25
332 0.24
333 0.23
334 0.24
335 0.26
336 0.22
337 0.22
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.19
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.12
354 0.14
355 0.16
356 0.2
357 0.18
358 0.19
359 0.17
360 0.17
361 0.21
362 0.22
363 0.22
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.16
368 0.15
369 0.11
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.1
375 0.11
376 0.13
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.11
383 0.15
384 0.13
385 0.14
386 0.16
387 0.16
388 0.16
389 0.14
390 0.15
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.09
395 0.1
396 0.11
397 0.12
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.11
411 0.18
412 0.22
413 0.25
414 0.34
415 0.42
416 0.43
417 0.44
418 0.43
419 0.37
420 0.33
421 0.31
422 0.23
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.19
427 0.2
428 0.2
429 0.21
430 0.19
431 0.16
432 0.16
433 0.17
434 0.13
435 0.12
436 0.13
437 0.1
438 0.11
439 0.14
440 0.13
441 0.11
442 0.1
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.07
448 0.13
449 0.14
450 0.16
451 0.16
452 0.16
453 0.18
454 0.23
455 0.24
456 0.2
457 0.2
458 0.18
459 0.23
460 0.25
461 0.25
462 0.22
463 0.28
464 0.27
465 0.3
466 0.32
467 0.3
468 0.35
469 0.37
470 0.39
471 0.32
472 0.34
473 0.31
474 0.3
475 0.3
476 0.28
477 0.25
478 0.22
479 0.22
480 0.2
481 0.19
482 0.19
483 0.16
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.09
488 0.1
489 0.1
490 0.12
491 0.17
492 0.17
493 0.19
494 0.22
495 0.26
496 0.31
497 0.34
498 0.36
499 0.32
500 0.35
501 0.33
502 0.31
503 0.37
504 0.32
505 0.31
506 0.28
507 0.28
508 0.31
509 0.37
510 0.41
511 0.33
512 0.34
513 0.36
514 0.37
515 0.38
516 0.32
517 0.3
518 0.26
519 0.29
520 0.3
521 0.29
522 0.31
523 0.3
524 0.34
525 0.35
526 0.41
527 0.44
528 0.51
529 0.55
530 0.59
531 0.7
532 0.73
533 0.77
534 0.79
535 0.82
536 0.83
537 0.85
538 0.85
539 0.84
540 0.87
541 0.86
542 0.86
543 0.8
544 0.77
545 0.75
546 0.74
547 0.74
548 0.72
549 0.71
550 0.67
551 0.67
552 0.6
553 0.55
554 0.48
555 0.38
556 0.32
557 0.31
558 0.27
559 0.22
560 0.25
561 0.29
562 0.29
563 0.3
564 0.33
565 0.32
566 0.31
567 0.31
568 0.3
569 0.27
570 0.27
571 0.3
572 0.27
573 0.24
574 0.29
575 0.29
576 0.31
577 0.3
578 0.29
579 0.3
580 0.34
581 0.4
582 0.39
583 0.44
584 0.41
585 0.42
586 0.42
587 0.38
588 0.34
589 0.29
590 0.26
591 0.2
592 0.21
593 0.26
594 0.35
595 0.42
596 0.45
597 0.49
598 0.57
599 0.59
600 0.6
601 0.6
602 0.52
603 0.51
604 0.47
605 0.44
606 0.37
607 0.35
608 0.32
609 0.27
610 0.25
611 0.19
612 0.16
613 0.11
614 0.12
615 0.16
616 0.2
617 0.17
618 0.17
619 0.18
620 0.19
621 0.21
622 0.18
623 0.15
624 0.13
625 0.18
626 0.19
627 0.2
628 0.21
629 0.23
630 0.23
631 0.26
632 0.33
633 0.33
634 0.39
635 0.48
636 0.56
637 0.62
638 0.71
639 0.75
640 0.74
641 0.75
642 0.71
643 0.64
644 0.55
645 0.51
646 0.45
647 0.37
648 0.31
649 0.24
650 0.2
651 0.17
652 0.15
653 0.1
654 0.11
655 0.11
656 0.13
657 0.17
658 0.2
659 0.21
660 0.25
661 0.29
662 0.29
663 0.36
664 0.34
665 0.37
666 0.42
667 0.44
668 0.47
669 0.54
670 0.57
671 0.58
672 0.64
673 0.58
674 0.51
675 0.55
676 0.5
677 0.46
678 0.42
679 0.38
680 0.39
681 0.4
682 0.4
683 0.37
684 0.39
685 0.38
686 0.43
687 0.41
688 0.34
689 0.35
690 0.4
691 0.39
692 0.42
693 0.42
694 0.36
695 0.4
696 0.44
697 0.43
698 0.36
699 0.34
700 0.29
701 0.25
702 0.23
703 0.17
704 0.14
705 0.13
706 0.14
707 0.13
708 0.12
709 0.11
710 0.09
711 0.09
712 0.08
713 0.08
714 0.11
715 0.11
716 0.12
717 0.15
718 0.19
719 0.2
720 0.21