Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3JHJ0

Protein Details
Accession A0A2H3JHJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-258HQPGHLSRHCPKKKKGTGRPRGKARKAEEDSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-253PKKKKGTGRPRGKARK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MIKINPPDVFDGERSDMQNFINQCNSWFTMYETSFQNDIQRVIFILSYISSKGKTGQWKQNYHRVHTDPTTRRFFPPSLAQFDTDFQKAFGADKKDIDDYITEFNNMAGKAQYDRYSPDGNALLITLFEKGLPDHTMRYIIGMRPMPDNIDAWQEAASYYENTYKIFLRRDKGAQVKKKDWRSSMPQHSGNTSTSTSTLRDPNAMDIDRLTAEERQDHIMKGKCFNCHQPGHLSRHCPKKKKGTGRPRGKARKAEEDSPEPDTTIEEISDEGEAEYITANRAVTAIRTLKAKNPELLSKLLDGTDFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.28
4 0.25
5 0.29
6 0.25
7 0.24
8 0.26
9 0.24
10 0.25
11 0.28
12 0.29
13 0.26
14 0.25
15 0.25
16 0.27
17 0.28
18 0.29
19 0.27
20 0.28
21 0.28
22 0.28
23 0.3
24 0.24
25 0.25
26 0.22
27 0.2
28 0.17
29 0.17
30 0.16
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.11
36 0.12
37 0.11
38 0.12
39 0.15
40 0.2
41 0.29
42 0.36
43 0.45
44 0.53
45 0.62
46 0.67
47 0.73
48 0.73
49 0.68
50 0.68
51 0.62
52 0.59
53 0.55
54 0.6
55 0.58
56 0.61
57 0.62
58 0.56
59 0.55
60 0.53
61 0.48
62 0.43
63 0.44
64 0.42
65 0.42
66 0.41
67 0.4
68 0.36
69 0.38
70 0.36
71 0.28
72 0.22
73 0.16
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.17
78 0.19
79 0.19
80 0.21
81 0.23
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.18
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.14
93 0.13
94 0.11
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.13
99 0.14
100 0.13
101 0.15
102 0.18
103 0.2
104 0.19
105 0.2
106 0.19
107 0.17
108 0.16
109 0.14
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.15
129 0.15
130 0.16
131 0.15
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.1
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.06
146 0.07
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.13
152 0.15
153 0.2
154 0.23
155 0.23
156 0.26
157 0.28
158 0.34
159 0.41
160 0.47
161 0.49
162 0.53
163 0.58
164 0.63
165 0.69
166 0.68
167 0.62
168 0.59
169 0.6
170 0.63
171 0.64
172 0.63
173 0.59
174 0.54
175 0.53
176 0.5
177 0.42
178 0.35
179 0.26
180 0.2
181 0.17
182 0.17
183 0.16
184 0.16
185 0.19
186 0.16
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.22
191 0.21
192 0.19
193 0.16
194 0.16
195 0.14
196 0.15
197 0.13
198 0.11
199 0.11
200 0.14
201 0.15
202 0.18
203 0.19
204 0.19
205 0.24
206 0.28
207 0.29
208 0.34
209 0.36
210 0.36
211 0.38
212 0.45
213 0.47
214 0.44
215 0.44
216 0.47
217 0.5
218 0.54
219 0.55
220 0.56
221 0.55
222 0.63
223 0.69
224 0.68
225 0.7
226 0.73
227 0.78
228 0.82
229 0.86
230 0.86
231 0.88
232 0.91
233 0.92
234 0.92
235 0.93
236 0.9
237 0.88
238 0.83
239 0.83
240 0.78
241 0.75
242 0.71
243 0.67
244 0.62
245 0.58
246 0.52
247 0.41
248 0.35
249 0.29
250 0.24
251 0.18
252 0.14
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.16
272 0.18
273 0.19
274 0.24
275 0.26
276 0.32
277 0.41
278 0.44
279 0.43
280 0.45
281 0.5
282 0.49
283 0.51
284 0.46
285 0.4
286 0.36
287 0.31