Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3JJD4

Protein Details
Accession A0A2H3JJD4    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-50LDERNRKKAAQAKAKEQRERKEREDBasic
348-368GVSSNKPTIKKRPRSPSLSDSHydrophilic
435-460ALEEERRHEEEKRRRRKEKEMREKKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-55RNRKKAAQAKAKEQRERKEREDEARMR
63-117KREQERQRRLEQEREARERERERREQEERERLLHGPRRAPARDGRGYPAAARRPR
135-140KRKRRL
357-361KKRPR
440-460RRHEEEKRRRRKEKEMREKKA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSSFAALMALSKTQTDVSDAAAKNVLDERNRKKAAQAKAKEQRERKEREDEARMRAQQLEDEKREQERQRRLEQEREARERERERREQEERERLLHGPRRAPARDGRGYPAAARRPRGSEDDDEAGANALTREEKRKRRLEAELRYGLGSGRRAAHGGGYTKAGRRLPGGAVDITTTNASLSDPSGSMSVRQRLAAEPAMLIKLNVNKRDTRTIDEILQDRARAKSQVLQGDQAKEFSDWFGKSKGKETAVKKEASQASQTDSASTSRAHTPAATTQTTSKAISGSASPAARTPSVSKPSTGALPSKAINASQRPSATKAAPTKGAASGKAPNPASRSQSVSATSKPGVSSNKPTIKKRPRSPSLSDSPEPTPKKRSSAANDISSEIWKLFGKDRSRYVANDVYSDDEDMEAGARDLEREELRSARIARKEEELALEEERRHEEEKRRRRKEKEMREKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.14
4 0.16
5 0.25
6 0.25
7 0.26
8 0.28
9 0.27
10 0.25
11 0.3
12 0.31
13 0.28
14 0.38
15 0.43
16 0.51
17 0.54
18 0.53
19 0.56
20 0.59
21 0.64
22 0.65
23 0.65
24 0.65
25 0.72
26 0.81
27 0.83
28 0.83
29 0.82
30 0.81
31 0.82
32 0.77
33 0.77
34 0.74
35 0.73
36 0.76
37 0.71
38 0.69
39 0.7
40 0.66
41 0.58
42 0.54
43 0.46
44 0.41
45 0.44
46 0.46
47 0.42
48 0.44
49 0.45
50 0.47
51 0.54
52 0.57
53 0.57
54 0.59
55 0.61
56 0.66
57 0.73
58 0.74
59 0.75
60 0.76
61 0.77
62 0.76
63 0.76
64 0.72
65 0.66
66 0.68
67 0.68
68 0.68
69 0.68
70 0.68
71 0.66
72 0.7
73 0.74
74 0.76
75 0.76
76 0.77
77 0.71
78 0.64
79 0.61
80 0.54
81 0.55
82 0.53
83 0.49
84 0.44
85 0.45
86 0.5
87 0.49
88 0.51
89 0.49
90 0.5
91 0.51
92 0.48
93 0.49
94 0.45
95 0.44
96 0.43
97 0.43
98 0.43
99 0.41
100 0.43
101 0.41
102 0.41
103 0.44
104 0.45
105 0.42
106 0.38
107 0.38
108 0.37
109 0.34
110 0.3
111 0.27
112 0.22
113 0.17
114 0.13
115 0.08
116 0.06
117 0.07
118 0.09
119 0.18
120 0.27
121 0.36
122 0.45
123 0.53
124 0.58
125 0.62
126 0.71
127 0.72
128 0.72
129 0.72
130 0.67
131 0.6
132 0.54
133 0.48
134 0.38
135 0.31
136 0.23
137 0.17
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.16
147 0.18
148 0.19
149 0.24
150 0.23
151 0.2
152 0.2
153 0.21
154 0.19
155 0.2
156 0.2
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.12
162 0.11
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.1
175 0.14
176 0.17
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.21
182 0.19
183 0.16
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.09
190 0.13
191 0.17
192 0.21
193 0.22
194 0.25
195 0.28
196 0.35
197 0.36
198 0.35
199 0.35
200 0.33
201 0.33
202 0.33
203 0.32
204 0.27
205 0.26
206 0.22
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.14
211 0.14
212 0.16
213 0.19
214 0.24
215 0.24
216 0.26
217 0.27
218 0.3
219 0.29
220 0.24
221 0.21
222 0.16
223 0.15
224 0.12
225 0.13
226 0.1
227 0.12
228 0.15
229 0.17
230 0.17
231 0.22
232 0.25
233 0.26
234 0.32
235 0.35
236 0.41
237 0.43
238 0.43
239 0.39
240 0.43
241 0.42
242 0.36
243 0.34
244 0.24
245 0.23
246 0.26
247 0.25
248 0.18
249 0.17
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.13
259 0.16
260 0.21
261 0.19
262 0.17
263 0.19
264 0.21
265 0.23
266 0.22
267 0.17
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.11
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.17
281 0.21
282 0.27
283 0.27
284 0.27
285 0.26
286 0.27
287 0.28
288 0.26
289 0.22
290 0.17
291 0.19
292 0.19
293 0.2
294 0.19
295 0.18
296 0.2
297 0.22
298 0.22
299 0.23
300 0.25
301 0.25
302 0.28
303 0.31
304 0.28
305 0.31
306 0.34
307 0.34
308 0.35
309 0.33
310 0.32
311 0.33
312 0.33
313 0.27
314 0.24
315 0.28
316 0.27
317 0.33
318 0.32
319 0.29
320 0.32
321 0.35
322 0.37
323 0.33
324 0.35
325 0.3
326 0.32
327 0.33
328 0.32
329 0.3
330 0.29
331 0.27
332 0.24
333 0.23
334 0.25
335 0.27
336 0.28
337 0.34
338 0.4
339 0.48
340 0.53
341 0.58
342 0.65
343 0.7
344 0.76
345 0.78
346 0.79
347 0.79
348 0.81
349 0.82
350 0.8
351 0.78
352 0.76
353 0.67
354 0.61
355 0.57
356 0.58
357 0.56
358 0.51
359 0.5
360 0.46
361 0.5
362 0.51
363 0.55
364 0.53
365 0.59
366 0.62
367 0.61
368 0.58
369 0.55
370 0.5
371 0.42
372 0.36
373 0.25
374 0.2
375 0.14
376 0.15
377 0.19
378 0.26
379 0.31
380 0.36
381 0.41
382 0.46
383 0.48
384 0.48
385 0.49
386 0.48
387 0.42
388 0.39
389 0.35
390 0.32
391 0.3
392 0.29
393 0.22
394 0.15
395 0.14
396 0.12
397 0.11
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.06
402 0.07
403 0.08
404 0.12
405 0.13
406 0.15
407 0.18
408 0.2
409 0.21
410 0.27
411 0.31
412 0.34
413 0.4
414 0.41
415 0.41
416 0.45
417 0.46
418 0.42
419 0.42
420 0.37
421 0.33
422 0.33
423 0.34
424 0.29
425 0.29
426 0.31
427 0.3
428 0.3
429 0.35
430 0.41
431 0.49
432 0.59
433 0.67
434 0.74
435 0.81
436 0.86
437 0.9
438 0.91
439 0.91
440 0.92