Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3JD16

Protein Details
Accession A0A2H3JD16    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-181DSRSGGRSRGGQRRRSRTRSGSRSPSRTRRRYDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-106EKARAKEGQQENKKKRGR
153-179GGRSRGGQRRRSRTRSGSRSPSRTRRR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 13.333, mito 9.5, cyto_nucl 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039715  ZCCHC10  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13917  zf-CCHC_3  
Amino Acid Sequences MSKFAPHRRSANNPRATASTVCQKCLGTGHYTYECKSTRPYISRPSRTQQLENPRLLAKLKAGGEPSVEVPEEFKSKSGTANRILEEREKARAKEGQQENKKKRGRSSSSSSHSDSDSDSDSSGSSSDSDSDSDSGSDSSDSDSDSSSDSRSGGRSRGGQRRRSRTRSGSRSPSRTRRRYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.61
3 0.58
4 0.49
5 0.43
6 0.43
7 0.35
8 0.35
9 0.34
10 0.31
11 0.29
12 0.3
13 0.28
14 0.22
15 0.23
16 0.27
17 0.3
18 0.32
19 0.32
20 0.35
21 0.33
22 0.3
23 0.33
24 0.33
25 0.35
26 0.39
27 0.44
28 0.47
29 0.57
30 0.64
31 0.65
32 0.66
33 0.66
34 0.65
35 0.64
36 0.61
37 0.62
38 0.6
39 0.56
40 0.52
41 0.44
42 0.41
43 0.37
44 0.31
45 0.21
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.13
55 0.12
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.17
65 0.2
66 0.22
67 0.26
68 0.29
69 0.29
70 0.28
71 0.29
72 0.26
73 0.25
74 0.23
75 0.24
76 0.24
77 0.23
78 0.24
79 0.27
80 0.27
81 0.33
82 0.4
83 0.42
84 0.5
85 0.6
86 0.63
87 0.68
88 0.72
89 0.65
90 0.64
91 0.65
92 0.62
93 0.59
94 0.61
95 0.6
96 0.61
97 0.63
98 0.58
99 0.49
100 0.42
101 0.36
102 0.29
103 0.22
104 0.18
105 0.14
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.15
139 0.18
140 0.18
141 0.22
142 0.29
143 0.37
144 0.47
145 0.54
146 0.6
147 0.67
148 0.76
149 0.82
150 0.82
151 0.83
152 0.83
153 0.86
154 0.86
155 0.85
156 0.85
157 0.85
158 0.87
159 0.88
160 0.88
161 0.88