Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3IWD6

Protein Details
Accession A0A2H3IWD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-242DNGGRPAKKKGRPTKREKVKKAKDALNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-237GRPAKKKGRPTKREKVKKAK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 5, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MSTDAGPSTNRGDITLQPSYFTSSLYVVPLRDDINMLIRSFAEQYMHISSMLQPFALFKKVWAEQGWCWLHFKVFDARARESFINVTERLFLERMVETEPLLARVVALFALYAFYFTQPSTSSPALRSLKHIAIAVDLYEATLALPAQLADPSLLPLRPFATYVLTSLLRAQAFHILPHSSLRPYNPSLLPREVFMQDGQESAFLAALTGGSAQDNGGRPAKKKGRPTKREKVKKAKDALNALEKYLDKNTTTVLPERPNDTGLTEDGGPADPPQVTHSLIAQPPNTTRRFYRTHKAEVMDILDNCADATPSGSSAQATDGDQAAVSIGQWALRRGNEAVLARLKHIDALAAEKGLEVGSEGGEKTGLARVERAVRDMYSGNPQTPRGGILGLLDGAGLADSETESASQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.35
3 0.32
4 0.3
5 0.31
6 0.34
7 0.32
8 0.27
9 0.22
10 0.17
11 0.18
12 0.2
13 0.22
14 0.17
15 0.18
16 0.2
17 0.19
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.2
22 0.22
23 0.21
24 0.2
25 0.19
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.15
30 0.13
31 0.16
32 0.19
33 0.2
34 0.18
35 0.17
36 0.2
37 0.23
38 0.23
39 0.19
40 0.15
41 0.17
42 0.19
43 0.22
44 0.18
45 0.14
46 0.21
47 0.23
48 0.27
49 0.28
50 0.3
51 0.28
52 0.38
53 0.4
54 0.34
55 0.35
56 0.31
57 0.3
58 0.26
59 0.28
60 0.26
61 0.29
62 0.33
63 0.36
64 0.39
65 0.39
66 0.43
67 0.41
68 0.34
69 0.3
70 0.27
71 0.27
72 0.23
73 0.22
74 0.2
75 0.2
76 0.21
77 0.2
78 0.17
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.12
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.11
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.03
97 0.05
98 0.04
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.18
111 0.27
112 0.29
113 0.28
114 0.31
115 0.31
116 0.31
117 0.31
118 0.31
119 0.22
120 0.2
121 0.2
122 0.15
123 0.1
124 0.09
125 0.07
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.14
164 0.14
165 0.16
166 0.16
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.17
171 0.18
172 0.22
173 0.23
174 0.25
175 0.27
176 0.29
177 0.27
178 0.23
179 0.24
180 0.2
181 0.19
182 0.16
183 0.14
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.06
202 0.07
203 0.09
204 0.13
205 0.15
206 0.16
207 0.25
208 0.34
209 0.38
210 0.47
211 0.56
212 0.63
213 0.71
214 0.8
215 0.81
216 0.84
217 0.89
218 0.89
219 0.9
220 0.88
221 0.87
222 0.85
223 0.81
224 0.76
225 0.7
226 0.64
227 0.61
228 0.52
229 0.43
230 0.38
231 0.32
232 0.28
233 0.25
234 0.22
235 0.14
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.17
240 0.18
241 0.2
242 0.23
243 0.24
244 0.27
245 0.26
246 0.25
247 0.23
248 0.2
249 0.18
250 0.14
251 0.14
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.13
266 0.16
267 0.18
268 0.21
269 0.2
270 0.2
271 0.23
272 0.29
273 0.3
274 0.28
275 0.28
276 0.31
277 0.38
278 0.42
279 0.48
280 0.48
281 0.54
282 0.57
283 0.56
284 0.52
285 0.47
286 0.44
287 0.38
288 0.31
289 0.25
290 0.19
291 0.17
292 0.15
293 0.13
294 0.1
295 0.05
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.08
317 0.09
318 0.12
319 0.14
320 0.15
321 0.18
322 0.18
323 0.19
324 0.22
325 0.22
326 0.25
327 0.28
328 0.28
329 0.27
330 0.27
331 0.26
332 0.22
333 0.21
334 0.18
335 0.12
336 0.16
337 0.16
338 0.14
339 0.14
340 0.12
341 0.13
342 0.11
343 0.1
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.18
358 0.26
359 0.27
360 0.29
361 0.27
362 0.25
363 0.28
364 0.27
365 0.26
366 0.28
367 0.3
368 0.31
369 0.33
370 0.34
371 0.33
372 0.32
373 0.31
374 0.23
375 0.2
376 0.17
377 0.15
378 0.15
379 0.13
380 0.12
381 0.1
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.05
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.05
390 0.05