Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3JDU4

Protein Details
Accession A0A2H3JDU4    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
480-518IARSKDESKEEKKARKQAVKAERQQRRAVKKANKDQFSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
487-513SKEEKKARKQAVKAERQQRRAVKKANK
532-537KTRARK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPKSKSIYRQPGARHFQLVHRSQRDPLINDPEASQRVLKEFERGNAAKGKSRAELERLISPSDLAHDSERANIGEAALYGVYYDDTKYDYMQHLRPVGVQEVGVDSILIEAPVKKGKGKAKEPIQLLDLPPEVLPSAEVPRNYEAQENIPSSIAGFQPDMDPHLRQTLEALEDDAFVDDDLEDDFFGALVAEGERAPNERLEFEFQDEGFDDEELEQNAEPSGDGEELSWEERFAQFKKAQKAAAKSDGSDVDTYSEGRDTIGELPQFSVIGGKKRRKGSSDASGYSMSSSSMFRNEGLTTIDEQFDEIQKEYESDEDEAETSDNDDEAPELITSREDFDAIMNDFLDNYEIVGGKMRRVLAGETATEKLDTIRKSLGAVHLREDDDDEKDLMFMPLDVDEKQERWDCETILTTYSNLENHPRLIRARQEKPIPKIRLDPKTGMPIVDGNAPASRRNNLPSDTESDEEPQSSFTERVTIARSKDESKEEKKARKQAVKAERQQRRAVKKANKDQFSTEAQRHDRSLANKEKTRARKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.66
3 0.58
4 0.6
5 0.62
6 0.62
7 0.61
8 0.59
9 0.58
10 0.55
11 0.61
12 0.6
13 0.54
14 0.54
15 0.53
16 0.49
17 0.47
18 0.46
19 0.44
20 0.39
21 0.37
22 0.32
23 0.24
24 0.25
25 0.29
26 0.28
27 0.28
28 0.3
29 0.31
30 0.38
31 0.37
32 0.38
33 0.41
34 0.43
35 0.43
36 0.43
37 0.44
38 0.39
39 0.43
40 0.43
41 0.4
42 0.44
43 0.4
44 0.44
45 0.42
46 0.39
47 0.35
48 0.31
49 0.26
50 0.23
51 0.21
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.2
57 0.22
58 0.19
59 0.19
60 0.17
61 0.16
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.09
66 0.08
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.13
77 0.18
78 0.23
79 0.26
80 0.3
81 0.31
82 0.31
83 0.32
84 0.32
85 0.28
86 0.24
87 0.2
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.08
100 0.13
101 0.14
102 0.16
103 0.23
104 0.3
105 0.39
106 0.45
107 0.52
108 0.57
109 0.63
110 0.63
111 0.59
112 0.55
113 0.49
114 0.43
115 0.37
116 0.29
117 0.22
118 0.19
119 0.17
120 0.14
121 0.1
122 0.1
123 0.08
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.17
128 0.19
129 0.22
130 0.22
131 0.23
132 0.2
133 0.2
134 0.26
135 0.24
136 0.22
137 0.21
138 0.19
139 0.17
140 0.18
141 0.15
142 0.11
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.18
152 0.17
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.1
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.16
190 0.17
191 0.18
192 0.19
193 0.17
194 0.18
195 0.17
196 0.16
197 0.12
198 0.11
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.11
222 0.11
223 0.17
224 0.2
225 0.26
226 0.32
227 0.34
228 0.37
229 0.39
230 0.43
231 0.42
232 0.45
233 0.4
234 0.34
235 0.33
236 0.3
237 0.27
238 0.22
239 0.18
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.08
257 0.1
258 0.09
259 0.16
260 0.23
261 0.28
262 0.34
263 0.4
264 0.43
265 0.43
266 0.47
267 0.47
268 0.49
269 0.5
270 0.45
271 0.42
272 0.39
273 0.36
274 0.31
275 0.24
276 0.15
277 0.1
278 0.09
279 0.07
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.16
349 0.14
350 0.15
351 0.16
352 0.15
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.14
357 0.12
358 0.16
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.16
363 0.17
364 0.19
365 0.25
366 0.26
367 0.27
368 0.27
369 0.29
370 0.29
371 0.29
372 0.29
373 0.23
374 0.19
375 0.2
376 0.17
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.11
381 0.09
382 0.07
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.17
391 0.21
392 0.21
393 0.24
394 0.26
395 0.23
396 0.24
397 0.26
398 0.23
399 0.2
400 0.2
401 0.15
402 0.15
403 0.16
404 0.15
405 0.14
406 0.19
407 0.18
408 0.21
409 0.23
410 0.25
411 0.26
412 0.31
413 0.39
414 0.43
415 0.48
416 0.52
417 0.6
418 0.65
419 0.7
420 0.75
421 0.7
422 0.64
423 0.67
424 0.68
425 0.67
426 0.64
427 0.61
428 0.55
429 0.59
430 0.56
431 0.47
432 0.39
433 0.32
434 0.28
435 0.28
436 0.23
437 0.16
438 0.18
439 0.19
440 0.22
441 0.22
442 0.24
443 0.23
444 0.27
445 0.31
446 0.31
447 0.34
448 0.34
449 0.37
450 0.38
451 0.36
452 0.33
453 0.31
454 0.29
455 0.26
456 0.22
457 0.18
458 0.15
459 0.17
460 0.16
461 0.13
462 0.16
463 0.16
464 0.18
465 0.22
466 0.26
467 0.25
468 0.32
469 0.35
470 0.35
471 0.4
472 0.46
473 0.5
474 0.52
475 0.6
476 0.63
477 0.7
478 0.75
479 0.79
480 0.81
481 0.82
482 0.81
483 0.81
484 0.83
485 0.83
486 0.84
487 0.85
488 0.84
489 0.81
490 0.83
491 0.82
492 0.81
493 0.8
494 0.8
495 0.8
496 0.81
497 0.86
498 0.87
499 0.83
500 0.77
501 0.73
502 0.68
503 0.66
504 0.63
505 0.57
506 0.56
507 0.56
508 0.56
509 0.53
510 0.51
511 0.48
512 0.46
513 0.51
514 0.52
515 0.56
516 0.59
517 0.63
518 0.69