FuNGI

A0A2H3JTP2

Protein Details

Accession

A0A2H3JTP2

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
191-216	GDRGKDKVPAKKRFQRKTKQVFMVPD	Hydrophilic
619-641	DDSAAPAKPKKRKAQGVPEGTEL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
15-21	KKKRTGA
25-56	FHPKKRPAPASAASPAPASAPSPAPPSPEKKG
72-75	PRAP
195-207	KDKVPAKKRFQRK
622-631	AAPAKPKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAPKKSQQELLFHPKKKRTGADLLFHPKKRPAPASAASPAPASAPSPAPPSPEKKGDGAAPGQAQAHPIVRPRAPRPKPSTDVAEPPPPEGPYAEYRLLSSALNGWKYDVMKFDSRRTVDIASWAAPVKLNRKEPRREGDDVVDAAPQPVGPMLGPDGKPVIGIDGKIVMVDSEGRPIRPGEASAILDLGGDRGKDKVPAKKRFQRKTKQVFMVPDAVRQLRKEERFPWVMEDAAQKEVWVGKMEEASKSETYAMFMPAANDIFKFVPAHRWYKFQKKPSYRVPTLEEAESLMARIQKNKDPERWLLRKRNGQGPSEATAALFKAEREGSTGPITASGSLGPGGRRLQAVDNGTGSLFGDDDDEEGIDTKRRRERELGAEGDIDEFDFEETFQDDEEKMEPDADDEETKELEERLKREYRTANKTREGYIDESEEEDDVTLTRAGKTLQKTLQKHEKDGGYEESDEENPYASEPEEEEEEPIPVYTGPAIIPPEPKPARPASQPPATPIPGASTNGVKAPTSSQPSQVKTEPSADSLPIPTSPVSPSLGGHSVVAMRATSPKAPKPKHAGASRAGSPLAGVGSTSPTASRATSPVAGSPTLSNGTGLAPKLVGKRKATDDSAAPAKPKKRKAQGVPEGTELKDSMVIEWLRNTPGATTRDCIHHFTPYLTDEATKQRFTALVKEVAQLSKGVLVLRPAYREDGAGSPAPAATPAAV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.75
3	0.75
4	0.74
5	0.7
6	0.71
7	0.72
8	0.71
9	0.72
10	0.75
11	0.76
12	0.72
13	0.69
14	0.65
15	0.64
16	0.65
17	0.61
18	0.56
19	0.56
20	0.57
21	0.6
22	0.58
23	0.53
24	0.45
25	0.4
26	0.34
27	0.27
28	0.22
29	0.16
30	0.15
31	0.15
32	0.16
33	0.21
34	0.22
35	0.26
36	0.31
37	0.37
38	0.4
39	0.45
40	0.45
41	0.42
42	0.45
43	0.43
44	0.43
45	0.38
46	0.36
47	0.31
48	0.3
49	0.29
50	0.26
51	0.23
52	0.21
53	0.21
54	0.19
55	0.23
56	0.27
57	0.3
58	0.37
59	0.44
60	0.53
61	0.58
62	0.65
63	0.69
64	0.72
65	0.73
66	0.71
67	0.7
68	0.64
69	0.65
70	0.6
71	0.6
72	0.51
73	0.48
74	0.46
75	0.38
76	0.34
77	0.27
78	0.26
79	0.22
80	0.27
81	0.28
82	0.25
83	0.25
84	0.26
85	0.26
86	0.22
87	0.17
88	0.18
89	0.2
90	0.21
91	0.21
92	0.21
93	0.23
94	0.24
95	0.25
96	0.23
97	0.23
98	0.3
99	0.33
100	0.39
101	0.43
102	0.44
103	0.44
104	0.44
105	0.41
106	0.34
107	0.35
108	0.3
109	0.23
110	0.23
111	0.22
112	0.19
113	0.19
114	0.22
115	0.25
116	0.3
117	0.39
118	0.46
119	0.54
120	0.63
121	0.68
122	0.73
123	0.73
124	0.7
125	0.64
126	0.6
127	0.56
128	0.48
129	0.4
130	0.33
131	0.26
132	0.21
133	0.17
134	0.12
135	0.08
136	0.07
137	0.06
138	0.05
139	0.06
140	0.08
141	0.13
142	0.14
143	0.15
144	0.16
145	0.15
146	0.15
147	0.14
148	0.15
149	0.11
150	0.11
151	0.1
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.07
157	0.06
158	0.09
159	0.08
160	0.14
161	0.15
162	0.15
163	0.16
164	0.17
165	0.19
166	0.17
167	0.18
168	0.14
169	0.17
170	0.17
171	0.16
172	0.16
173	0.14
174	0.13
175	0.12
176	0.09
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.08
182	0.14
183	0.19
184	0.28
185	0.37
186	0.47
187	0.57
188	0.65
189	0.75
190	0.79
191	0.85
192	0.86
193	0.87
194	0.88
195	0.88
196	0.85
197	0.8
198	0.74
199	0.67
200	0.66
201	0.55
202	0.47
203	0.41
204	0.36
205	0.32
206	0.29
207	0.31
208	0.3
209	0.33
210	0.35
211	0.35
212	0.39
213	0.41
214	0.41
215	0.4
216	0.33
217	0.29
218	0.26
219	0.27
220	0.22
221	0.2
222	0.19
223	0.15
224	0.14
225	0.15
226	0.14
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.14
231	0.15
232	0.16
233	0.16
234	0.19
235	0.17
236	0.17
237	0.17
238	0.14
239	0.14
240	0.14
241	0.13
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.11
247	0.09
248	0.08
249	0.09
250	0.08
251	0.09
252	0.1
253	0.09
254	0.17
255	0.21
256	0.27
257	0.26
258	0.33
259	0.38
260	0.47
261	0.54
262	0.55
263	0.61
264	0.64
265	0.7
266	0.74
267	0.78
268	0.7
269	0.67
270	0.63
271	0.58
272	0.52
273	0.45
274	0.34
275	0.25
276	0.22
277	0.18
278	0.14
279	0.09
280	0.1
281	0.1
282	0.15
283	0.17
284	0.21
285	0.29
286	0.34
287	0.38
288	0.4
289	0.46
290	0.51
291	0.57
292	0.61
293	0.63
294	0.65
295	0.67
296	0.66
297	0.68
298	0.63
299	0.56
300	0.5
301	0.44
302	0.4
303	0.33
304	0.29
305	0.21
306	0.17
307	0.15
308	0.12
309	0.09
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.1
315	0.11
316	0.12
317	0.13
318	0.13
319	0.11
320	0.12
321	0.12
322	0.09
323	0.09
324	0.07
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.06
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.1
334	0.11
335	0.14
336	0.16
337	0.15
338	0.14
339	0.14
340	0.13
341	0.12
342	0.11
343	0.06
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.08
355	0.09
356	0.15
357	0.19
358	0.21
359	0.25
360	0.28
361	0.33
362	0.38
363	0.43
364	0.4
365	0.36
366	0.34
367	0.31
368	0.27
369	0.22
370	0.13
371	0.07
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.03
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.11
399	0.13
400	0.14
401	0.2
402	0.25
403	0.25
404	0.3
405	0.38
406	0.42
407	0.49
408	0.56
409	0.56
410	0.57
411	0.58
412	0.55
413	0.5
414	0.45
415	0.37
416	0.31
417	0.26
418	0.2
419	0.19
420	0.18
421	0.15
422	0.12
423	0.09
424	0.07
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.13
433	0.16
434	0.21
435	0.26
436	0.34
437	0.36
438	0.44
439	0.53
440	0.5
441	0.5
442	0.49
443	0.46
444	0.39
445	0.4
446	0.35
447	0.27
448	0.26
449	0.24
450	0.21
451	0.19
452	0.18
453	0.15
454	0.12
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.08
462	0.1
463	0.1
464	0.12
465	0.11
466	0.11
467	0.11
468	0.1
469	0.09
470	0.07
471	0.07
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.07
476	0.09
477	0.1
478	0.13
479	0.14
480	0.24
481	0.25
482	0.26
483	0.28
484	0.31
485	0.34
486	0.36
487	0.43
488	0.4
489	0.46
490	0.46
491	0.46
492	0.47
493	0.44
494	0.38
495	0.31
496	0.27
497	0.23
498	0.23
499	0.2
500	0.16
501	0.16
502	0.17
503	0.18
504	0.14
505	0.13
506	0.15
507	0.19
508	0.24
509	0.25
510	0.31
511	0.36
512	0.39
513	0.43
514	0.43
515	0.4
516	0.36
517	0.4
518	0.33
519	0.3
520	0.29
521	0.25
522	0.23
523	0.21
524	0.2
525	0.15
526	0.15
527	0.12
528	0.12
529	0.13
530	0.13
531	0.14
532	0.13
533	0.14
534	0.16
535	0.17
536	0.16
537	0.15
538	0.14
539	0.13
540	0.13
541	0.13
542	0.09
543	0.07
544	0.1
545	0.13
546	0.17
547	0.21
548	0.27
549	0.37
550	0.41
551	0.48
552	0.54
553	0.6
554	0.64
555	0.65
556	0.64
557	0.59
558	0.62
559	0.57
560	0.5
561	0.42
562	0.32
563	0.27
564	0.22
565	0.17
566	0.1
567	0.07
568	0.05
569	0.08
570	0.08
571	0.09
572	0.08
573	0.09
574	0.1
575	0.12
576	0.13
577	0.13
578	0.16
579	0.18
580	0.19
581	0.21
582	0.22
583	0.21
584	0.2
585	0.19
586	0.18
587	0.17
588	0.17
589	0.14
590	0.12
591	0.13
592	0.15
593	0.15
594	0.13
595	0.11
596	0.15
597	0.22
598	0.29
599	0.34
600	0.35
601	0.4
602	0.46
603	0.52
604	0.52
605	0.48
606	0.43
607	0.43
608	0.45
609	0.42
610	0.38
611	0.39
612	0.45
613	0.5
614	0.56
615	0.6
616	0.65
617	0.73
618	0.79
619	0.84
620	0.86
621	0.87
622	0.81
623	0.76
624	0.69
625	0.59
626	0.5
627	0.39
628	0.29
629	0.23
630	0.2
631	0.15
632	0.18
633	0.19
634	0.18
635	0.21
636	0.22
637	0.21
638	0.21
639	0.21
640	0.17
641	0.23
642	0.26
643	0.25
644	0.26
645	0.27
646	0.34
647	0.36
648	0.4
649	0.34
650	0.38
651	0.36
652	0.35
653	0.37
654	0.31
655	0.31
656	0.26
657	0.25
658	0.22
659	0.3
660	0.33
661	0.3
662	0.29
663	0.28
664	0.3
665	0.31
666	0.36
667	0.32
668	0.34
669	0.34
670	0.37
671	0.39
672	0.37
673	0.35
674	0.28
675	0.23
676	0.19
677	0.18
678	0.17
679	0.15
680	0.17
681	0.21
682	0.24
683	0.26
684	0.25
685	0.28
686	0.28
687	0.27
688	0.27
689	0.24
690	0.25
691	0.24
692	0.23
693	0.19
694	0.19
695	0.18
696	0.15

A0A2H3JTP2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer