Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3JGW4

Protein Details
Accession A0A2H3JGW4    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-136VAKPADQKEKRPRKFSRRKLGRRGSKSVPBasic
161-186PAEEGAKPKKKKKNNRKNKARKAAAABasic
213-239AGEATPKKPRARKPRPQRPQRPAGEDPBasic
273-296VTSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-133QKEKRPRKFSRRKLGRRGSK
165-185GAKPKKKKKNNRKNKARKAAA
218-233PKKPRARKPRPQRPQR
280-290RRRWGKPRKSK
Subcellular Location(s) cyto 16, cyto_nucl 13.333, nucl 8.5, mito_nucl 6.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAPVTENGVPEAAQDKVVEETPGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVQSDILSAQVIHRTTRAGISRSTGYGFVAIATAEAAQKAVELLDKKELDGRPVIVEVAKPADQKEKRPRKFSRRKLGRRGSKSVPGEISEAEANGEAEGEAAKPEGFVPPAEEGAKPKKKKKNNRKNKARKAAAAAAAAAAAGEGEGAPDAGAPPPAEDAVAGEATPKKPRARKPRPQRPQRPAGEDPVGEPSKTVLFVANLGFSVDDAGLSALFTDADIPVTSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDVGSEENQTKAIELLQGKEVEGRAIAVKIAVNSQTEEGAEFDVPATEEDAEFDAPATDAKPETDTTPEATVVAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.16
4 0.13
5 0.12
6 0.11
7 0.12
8 0.13
9 0.15
10 0.15
11 0.13
12 0.16
13 0.18
14 0.2
15 0.19
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.21
20 0.2
21 0.17
22 0.15
23 0.16
24 0.17
25 0.16
26 0.17
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.11
38 0.12
39 0.14
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.15
52 0.16
53 0.22
54 0.25
55 0.23
56 0.23
57 0.26
58 0.28
59 0.28
60 0.28
61 0.22
62 0.18
63 0.16
64 0.15
65 0.11
66 0.09
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.08
79 0.09
80 0.11
81 0.18
82 0.18
83 0.19
84 0.25
85 0.25
86 0.25
87 0.25
88 0.24
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.13
93 0.13
94 0.11
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.14
99 0.24
100 0.25
101 0.35
102 0.45
103 0.53
104 0.58
105 0.67
106 0.75
107 0.77
108 0.86
109 0.87
110 0.87
111 0.88
112 0.91
113 0.92
114 0.93
115 0.92
116 0.88
117 0.84
118 0.78
119 0.76
120 0.68
121 0.61
122 0.51
123 0.42
124 0.36
125 0.29
126 0.25
127 0.16
128 0.14
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.13
152 0.22
153 0.3
154 0.33
155 0.42
156 0.5
157 0.59
158 0.7
159 0.78
160 0.8
161 0.83
162 0.89
163 0.92
164 0.94
165 0.95
166 0.95
167 0.88
168 0.8
169 0.74
170 0.68
171 0.59
172 0.48
173 0.37
174 0.26
175 0.21
176 0.18
177 0.11
178 0.06
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.01
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.08
203 0.1
204 0.14
205 0.17
206 0.22
207 0.29
208 0.38
209 0.49
210 0.58
211 0.67
212 0.75
213 0.83
214 0.88
215 0.92
216 0.94
217 0.91
218 0.9
219 0.86
220 0.82
221 0.74
222 0.69
223 0.61
224 0.5
225 0.42
226 0.4
227 0.34
228 0.26
229 0.23
230 0.18
231 0.15
232 0.15
233 0.14
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.07
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.1
263 0.14
264 0.2
265 0.22
266 0.29
267 0.39
268 0.47
269 0.58
270 0.66
271 0.72
272 0.77
273 0.87
274 0.89
275 0.87
276 0.84
277 0.82
278 0.8
279 0.74
280 0.65
281 0.55
282 0.46
283 0.38
284 0.34
285 0.25
286 0.18
287 0.14
288 0.12
289 0.12
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.13
295 0.14
296 0.16
297 0.19
298 0.19
299 0.19
300 0.21
301 0.21
302 0.16
303 0.15
304 0.14
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.12
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.11
342 0.13
343 0.14
344 0.16
345 0.2
346 0.21
347 0.22
348 0.24
349 0.23