Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3IPY5

Protein Details
Accession A0A2H3IPY5    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
301-322ETPPHLKKKKDQEAKKPVRDNEBasic
381-400DEPTKPKPRQRTPPTQEEPEAcidic
416-436TPSPPKPKKETRTETAPKKKGBasic
473-492QQRHAPSKHQTLPKKGKKLGBasic
516-540DLDAGPSKSKQRKKIPSTSPSPPPAHydrophilic
562-584SAEQKANKKREELKRQLDAKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-364PQKKAMGRIGGPKAVP
419-452PPKPKKETRTETAPKKKGVLGKIGGKKPEPKKAP
484-501LPKKGKKLGLIGGGKKKP
523-592KSKQRKKIPSTSPSPPPAISRSPSPVPKRVPKAEPEPELSAEQKANKKREELKRQLDAKSKAPTKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSPRWNNLPTRNISAPPLLYRFIYTSQSYEFLLTDLTYIWQESLQHKQILEKAEDIGTSIDPSEDANQYDVFMRKIQDALDGAKNTSVTIALGQKSDSVVVTTSTKLPAGLNPLKWTFTLSKEPPSAVTRHLLLPLLKSERDHEQREQSLFEHIREKDTVLSKIFDKIDPSQLTSMFPGTAGVRHGKLRTSDLIRHIKGATRFDEKEWKGSQADEENLANGLAESVYAQGGFTSADSARTRDATWWKSLGDVDDTRSPSPERPQAATKNEVSSRGRAASEEQAAADEDMSTEDEDEFQRQETPPHLKKKKDQEAKKPVRDNESDIATESDQDTESDDGRDSIRAPIQKPQKKAMGRIGGPKAVPLGRSRKESVADETDSDDEPTKPKPRQRTPPTQEEPELDDDTESDSEPERLPTPSPPKPKKETRTETAPKKKGVLGKIGGKKPEPKKAPTPEPPADNDIGQPSSDEDDLQQRHAPSKHQTLPKKGKKLGLIGGGKKKPQAATPQPETDDTDEDLDAGPSKSKQRKKIPSTSPSPPPAISRSPSPVPKRVPKAEPEPELSAEQKANKKREELKRQLDAKSKAPTKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.42
4 0.4
5 0.33
6 0.3
7 0.3
8 0.3
9 0.28
10 0.3
11 0.27
12 0.26
13 0.27
14 0.28
15 0.26
16 0.24
17 0.21
18 0.16
19 0.16
20 0.13
21 0.11
22 0.09
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.1
27 0.1
28 0.14
29 0.17
30 0.26
31 0.3
32 0.32
33 0.32
34 0.36
35 0.39
36 0.41
37 0.4
38 0.32
39 0.29
40 0.27
41 0.27
42 0.23
43 0.2
44 0.15
45 0.13
46 0.12
47 0.1
48 0.09
49 0.1
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.19
57 0.2
58 0.18
59 0.18
60 0.19
61 0.19
62 0.2
63 0.2
64 0.2
65 0.2
66 0.22
67 0.26
68 0.26
69 0.25
70 0.26
71 0.25
72 0.21
73 0.19
74 0.15
75 0.09
76 0.11
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.14
85 0.1
86 0.09
87 0.11
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.15
95 0.15
96 0.22
97 0.26
98 0.27
99 0.31
100 0.32
101 0.32
102 0.31
103 0.34
104 0.27
105 0.26
106 0.33
107 0.31
108 0.37
109 0.38
110 0.38
111 0.38
112 0.38
113 0.35
114 0.28
115 0.29
116 0.24
117 0.23
118 0.24
119 0.23
120 0.21
121 0.21
122 0.24
123 0.25
124 0.24
125 0.23
126 0.24
127 0.31
128 0.37
129 0.4
130 0.4
131 0.43
132 0.48
133 0.48
134 0.47
135 0.39
136 0.41
137 0.37
138 0.34
139 0.33
140 0.29
141 0.31
142 0.29
143 0.3
144 0.27
145 0.29
146 0.3
147 0.24
148 0.26
149 0.23
150 0.28
151 0.29
152 0.24
153 0.24
154 0.24
155 0.3
156 0.3
157 0.31
158 0.28
159 0.27
160 0.27
161 0.24
162 0.22
163 0.13
164 0.12
165 0.11
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.19
174 0.2
175 0.23
176 0.26
177 0.29
178 0.32
179 0.37
180 0.45
181 0.43
182 0.43
183 0.4
184 0.39
185 0.38
186 0.38
187 0.33
188 0.31
189 0.32
190 0.32
191 0.41
192 0.37
193 0.4
194 0.37
195 0.36
196 0.3
197 0.3
198 0.3
199 0.24
200 0.24
201 0.2
202 0.19
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.11
207 0.07
208 0.06
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.14
228 0.17
229 0.24
230 0.22
231 0.25
232 0.25
233 0.24
234 0.24
235 0.24
236 0.2
237 0.18
238 0.16
239 0.16
240 0.19
241 0.21
242 0.2
243 0.21
244 0.21
245 0.19
246 0.24
247 0.26
248 0.24
249 0.25
250 0.31
251 0.36
252 0.39
253 0.41
254 0.37
255 0.36
256 0.34
257 0.36
258 0.32
259 0.27
260 0.25
261 0.23
262 0.21
263 0.17
264 0.19
265 0.18
266 0.17
267 0.16
268 0.14
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.09
273 0.06
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.13
289 0.22
290 0.28
291 0.38
292 0.43
293 0.46
294 0.53
295 0.62
296 0.69
297 0.7
298 0.71
299 0.72
300 0.78
301 0.84
302 0.85
303 0.8
304 0.73
305 0.69
306 0.63
307 0.56
308 0.48
309 0.4
310 0.32
311 0.26
312 0.24
313 0.18
314 0.17
315 0.13
316 0.1
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.23
333 0.33
334 0.38
335 0.41
336 0.44
337 0.48
338 0.48
339 0.52
340 0.53
341 0.51
342 0.47
343 0.52
344 0.49
345 0.44
346 0.41
347 0.36
348 0.3
349 0.23
350 0.22
351 0.19
352 0.25
353 0.26
354 0.3
355 0.32
356 0.33
357 0.35
358 0.36
359 0.36
360 0.32
361 0.3
362 0.26
363 0.25
364 0.24
365 0.22
366 0.2
367 0.17
368 0.13
369 0.13
370 0.18
371 0.23
372 0.26
373 0.32
374 0.41
375 0.49
376 0.6
377 0.68
378 0.74
379 0.74
380 0.8
381 0.8
382 0.74
383 0.67
384 0.58
385 0.53
386 0.46
387 0.4
388 0.29
389 0.23
390 0.18
391 0.18
392 0.16
393 0.13
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.11
398 0.12
399 0.11
400 0.12
401 0.14
402 0.2
403 0.28
404 0.34
405 0.45
406 0.51
407 0.57
408 0.64
409 0.73
410 0.75
411 0.77
412 0.77
413 0.73
414 0.76
415 0.78
416 0.8
417 0.81
418 0.78
419 0.69
420 0.64
421 0.62
422 0.57
423 0.52
424 0.49
425 0.44
426 0.47
427 0.54
428 0.55
429 0.54
430 0.51
431 0.57
432 0.55
433 0.6
434 0.56
435 0.54
436 0.59
437 0.65
438 0.72
439 0.72
440 0.74
441 0.69
442 0.67
443 0.64
444 0.59
445 0.52
446 0.42
447 0.35
448 0.29
449 0.24
450 0.2
451 0.17
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.13
456 0.11
457 0.18
458 0.2
459 0.22
460 0.24
461 0.23
462 0.29
463 0.31
464 0.35
465 0.34
466 0.42
467 0.48
468 0.54
469 0.6
470 0.65
471 0.74
472 0.79
473 0.81
474 0.77
475 0.75
476 0.71
477 0.69
478 0.64
479 0.62
480 0.6
481 0.58
482 0.63
483 0.61
484 0.58
485 0.54
486 0.52
487 0.45
488 0.42
489 0.45
490 0.46
491 0.51
492 0.56
493 0.59
494 0.57
495 0.57
496 0.55
497 0.48
498 0.4
499 0.32
500 0.28
501 0.22
502 0.2
503 0.18
504 0.15
505 0.14
506 0.12
507 0.13
508 0.14
509 0.23
510 0.32
511 0.4
512 0.5
513 0.59
514 0.69
515 0.76
516 0.84
517 0.85
518 0.85
519 0.85
520 0.83
521 0.81
522 0.75
523 0.7
524 0.61
525 0.55
526 0.51
527 0.49
528 0.44
529 0.41
530 0.42
531 0.46
532 0.54
533 0.56
534 0.59
535 0.62
536 0.69
537 0.73
538 0.74
539 0.73
540 0.72
541 0.75
542 0.75
543 0.72
544 0.68
545 0.62
546 0.57
547 0.54
548 0.48
549 0.41
550 0.36
551 0.38
552 0.41
553 0.45
554 0.5
555 0.51
556 0.58
557 0.64
558 0.71
559 0.75
560 0.77
561 0.78
562 0.81
563 0.83
564 0.83
565 0.82
566 0.76
567 0.72
568 0.72
569 0.71
570 0.7
571 0.74
572 0.77