Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3IXZ3

Protein Details
Accession A0A2H3IXZ3    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-264YIKPQEEKGKRERQRKEKNFLEVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-82PAQRHGKRDAPKEAPSAAPPAAPRGGARGGRGGREG
248-258KGKRERQRKEK
271-304PRGRGNGPRGSGGRGRGGRGGRGDGPRREGGGRG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKNLYELLGIFSLPPYLPIPRNDPELDSDREPEPPTKTIDKPAQRHGKRDAPKEAPSAAPPAAPRGGARGGRGGREGGNEGAFRDRNAGSYNNRNRPVDEVKEAGRRGYRGRDDRGARTRTDRHPVRTAHTDTEKQVGQGWGAKKGDAEWNDEKAGEAIAKAEEAEPQTPLEGGEAAAAAEEADKAKSYADYLAEQAAKGRGELGVKEARAPNEGSKDKKWQNAKELKRDDEEENYIKPQEEKGKRERQRKEKNFLEVDMRFVEQPRGRGNGPRGSGGRGRGGRGGRGDGPRREGGGRGGAAAGPTVQVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.13
4 0.14
5 0.12
6 0.13
7 0.11
8 0.16
9 0.21
10 0.24
11 0.3
12 0.32
13 0.38
14 0.37
15 0.37
16 0.37
17 0.39
18 0.4
19 0.36
20 0.36
21 0.31
22 0.33
23 0.34
24 0.33
25 0.32
26 0.29
27 0.33
28 0.36
29 0.38
30 0.42
31 0.49
32 0.54
33 0.55
34 0.63
35 0.68
36 0.66
37 0.69
38 0.68
39 0.68
40 0.68
41 0.7
42 0.69
43 0.65
44 0.66
45 0.63
46 0.58
47 0.5
48 0.44
49 0.4
50 0.31
51 0.26
52 0.22
53 0.22
54 0.21
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.23
59 0.22
60 0.23
61 0.27
62 0.27
63 0.28
64 0.29
65 0.27
66 0.22
67 0.23
68 0.24
69 0.17
70 0.18
71 0.16
72 0.16
73 0.2
74 0.19
75 0.17
76 0.18
77 0.17
78 0.16
79 0.19
80 0.22
81 0.22
82 0.33
83 0.42
84 0.47
85 0.51
86 0.5
87 0.49
88 0.51
89 0.52
90 0.46
91 0.4
92 0.34
93 0.33
94 0.38
95 0.38
96 0.34
97 0.3
98 0.27
99 0.27
100 0.32
101 0.37
102 0.37
103 0.41
104 0.47
105 0.49
106 0.55
107 0.6
108 0.55
109 0.49
110 0.49
111 0.51
112 0.49
113 0.55
114 0.52
115 0.48
116 0.53
117 0.53
118 0.52
119 0.52
120 0.5
121 0.45
122 0.44
123 0.41
124 0.35
125 0.36
126 0.31
127 0.24
128 0.24
129 0.19
130 0.15
131 0.18
132 0.17
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.16
137 0.17
138 0.22
139 0.18
140 0.24
141 0.21
142 0.23
143 0.23
144 0.23
145 0.21
146 0.16
147 0.15
148 0.09
149 0.06
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.18
200 0.2
201 0.2
202 0.21
203 0.22
204 0.21
205 0.26
206 0.31
207 0.32
208 0.33
209 0.42
210 0.45
211 0.5
212 0.56
213 0.53
214 0.59
215 0.65
216 0.69
217 0.7
218 0.72
219 0.68
220 0.63
221 0.61
222 0.53
223 0.48
224 0.47
225 0.39
226 0.34
227 0.32
228 0.3
229 0.27
230 0.25
231 0.25
232 0.29
233 0.34
234 0.39
235 0.47
236 0.57
237 0.65
238 0.74
239 0.79
240 0.8
241 0.84
242 0.87
243 0.87
244 0.83
245 0.84
246 0.77
247 0.69
248 0.67
249 0.56
250 0.5
251 0.42
252 0.36
253 0.27
254 0.25
255 0.3
256 0.25
257 0.28
258 0.28
259 0.31
260 0.31
261 0.38
262 0.43
263 0.42
264 0.42
265 0.44
266 0.41
267 0.42
268 0.45
269 0.41
270 0.43
271 0.38
272 0.38
273 0.38
274 0.39
275 0.39
276 0.38
277 0.39
278 0.37
279 0.43
280 0.49
281 0.47
282 0.51
283 0.49
284 0.49
285 0.45
286 0.41
287 0.36
288 0.34
289 0.3
290 0.25
291 0.23
292 0.21
293 0.2
294 0.18
295 0.14
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.13
302 0.19
303 0.21
304 0.24
305 0.24