Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BMI2

Protein Details
Accession G8BMI2    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
516-538EQWKLNKKKMTENPKNNSKQNFFHydrophilic
584-628NSTTGANPKAKKPRKNAKKADGETQAKKKRVTKKKQAAGASNTKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
571-627KQTKGRGAAKRVANSTTGANPKAKKPRKNAKKADGETQAKKKRVTKKKQAAGASNTK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG tpf:TPHA_0A00250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MENANLANFPLGVPVNQANQMNRQIDTSNNNMMSPSGQSPLQQQIFGSPVNRPQQLNQNQQLKNVPASTNINNNVPSVPQMQANQKYASQNISPQQQMLQQKILQQKKQQQAMINYENQFHQMSMTINKKPKRLYNFVEDINSILQKYKQYKPSFEFHIFENNYKICAPANTRLQQQQKSPELNSEGLILTKNNPMLKEFLEYVARSRIPEAIMEVLKDCNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDIKTKENKATANTPSSATQPDQNTNGPGNNVDNVKSTTSVNATTDSTNDNNNKNSNDNRTNMQKIDNSTTIKRPRVYRTLLRPNDLTTYCDMMTYADQSRFSDSIYQLLEAELLAITKRNILLDVPLNPYGYKDNLEADAFIEPIKVNDDPKDVRFCHREVSNIPGSKGVVGHIEQFEELPQRSSNYEQLMLIAADRTTSSTLSTLAIALTKQALGSSNNKSSLKNNSALEEDYVDNKLNGEATGKNSNKAKIAAAAANANNHNDNNQFSRIKFIEQWKLNKKKMTENPKNNSKQNFFNMKISMTSNSSTNIQNMSEQDGYKPSAKQAQGKQTKGRGAAKRVANSTTGANPKAKKPRKNAKKADGETQAKKKRVTKKKQAAGASNTKATKANNKANASNTKTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.24
4 0.27
5 0.26
6 0.32
7 0.4
8 0.38
9 0.36
10 0.35
11 0.32
12 0.34
13 0.36
14 0.35
15 0.36
16 0.34
17 0.33
18 0.31
19 0.3
20 0.27
21 0.25
22 0.22
23 0.17
24 0.17
25 0.18
26 0.22
27 0.31
28 0.31
29 0.28
30 0.26
31 0.27
32 0.28
33 0.29
34 0.27
35 0.21
36 0.27
37 0.33
38 0.37
39 0.35
40 0.37
41 0.46
42 0.54
43 0.61
44 0.62
45 0.65
46 0.62
47 0.65
48 0.66
49 0.59
50 0.53
51 0.47
52 0.39
53 0.34
54 0.39
55 0.38
56 0.4
57 0.4
58 0.39
59 0.36
60 0.36
61 0.32
62 0.27
63 0.26
64 0.21
65 0.19
66 0.19
67 0.22
68 0.3
69 0.36
70 0.39
71 0.38
72 0.4
73 0.41
74 0.4
75 0.4
76 0.33
77 0.33
78 0.34
79 0.38
80 0.35
81 0.32
82 0.33
83 0.35
84 0.38
85 0.36
86 0.36
87 0.32
88 0.37
89 0.46
90 0.52
91 0.52
92 0.55
93 0.61
94 0.65
95 0.7
96 0.67
97 0.65
98 0.64
99 0.66
100 0.63
101 0.6
102 0.53
103 0.48
104 0.44
105 0.39
106 0.33
107 0.24
108 0.18
109 0.14
110 0.14
111 0.2
112 0.25
113 0.3
114 0.37
115 0.41
116 0.46
117 0.5
118 0.56
119 0.58
120 0.6
121 0.59
122 0.6
123 0.61
124 0.59
125 0.55
126 0.47
127 0.4
128 0.34
129 0.29
130 0.2
131 0.16
132 0.16
133 0.2
134 0.26
135 0.32
136 0.39
137 0.43
138 0.5
139 0.52
140 0.56
141 0.57
142 0.55
143 0.49
144 0.42
145 0.47
146 0.42
147 0.39
148 0.39
149 0.32
150 0.29
151 0.27
152 0.26
153 0.17
154 0.19
155 0.22
156 0.24
157 0.32
158 0.34
159 0.38
160 0.45
161 0.52
162 0.52
163 0.53
164 0.54
165 0.53
166 0.54
167 0.51
168 0.48
169 0.44
170 0.4
171 0.35
172 0.28
173 0.21
174 0.17
175 0.17
176 0.13
177 0.11
178 0.13
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.19
185 0.2
186 0.18
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.19
191 0.22
192 0.21
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.1
211 0.11
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.11
216 0.11
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.17
228 0.16
229 0.21
230 0.26
231 0.3
232 0.32
233 0.34
234 0.35
235 0.3
236 0.36
237 0.35
238 0.33
239 0.29
240 0.28
241 0.27
242 0.26
243 0.25
244 0.2
245 0.21
246 0.2
247 0.21
248 0.23
249 0.23
250 0.23
251 0.22
252 0.22
253 0.18
254 0.16
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.17
275 0.2
276 0.2
277 0.22
278 0.24
279 0.25
280 0.26
281 0.29
282 0.32
283 0.33
284 0.32
285 0.33
286 0.36
287 0.37
288 0.35
289 0.34
290 0.29
291 0.27
292 0.3
293 0.3
294 0.28
295 0.27
296 0.33
297 0.36
298 0.37
299 0.38
300 0.38
301 0.4
302 0.44
303 0.47
304 0.47
305 0.5
306 0.57
307 0.56
308 0.54
309 0.49
310 0.44
311 0.43
312 0.36
313 0.28
314 0.19
315 0.19
316 0.16
317 0.16
318 0.14
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.13
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.07
338 0.08
339 0.04
340 0.04
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.05
345 0.06
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.1
351 0.13
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.16
356 0.17
357 0.16
358 0.15
359 0.14
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.08
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.15
377 0.16
378 0.19
379 0.25
380 0.24
381 0.29
382 0.31
383 0.3
384 0.31
385 0.3
386 0.31
387 0.26
388 0.32
389 0.34
390 0.32
391 0.32
392 0.28
393 0.27
394 0.24
395 0.22
396 0.16
397 0.11
398 0.1
399 0.13
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.13
406 0.13
407 0.11
408 0.12
409 0.13
410 0.14
411 0.17
412 0.19
413 0.18
414 0.19
415 0.17
416 0.17
417 0.17
418 0.15
419 0.12
420 0.09
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.08
442 0.1
443 0.15
444 0.2
445 0.24
446 0.29
447 0.31
448 0.32
449 0.34
450 0.4
451 0.4
452 0.39
453 0.36
454 0.33
455 0.34
456 0.34
457 0.31
458 0.24
459 0.2
460 0.17
461 0.17
462 0.15
463 0.13
464 0.13
465 0.12
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.14
471 0.24
472 0.25
473 0.29
474 0.32
475 0.34
476 0.34
477 0.34
478 0.31
479 0.25
480 0.27
481 0.25
482 0.23
483 0.25
484 0.23
485 0.26
486 0.26
487 0.24
488 0.22
489 0.2
490 0.21
491 0.18
492 0.2
493 0.2
494 0.25
495 0.26
496 0.24
497 0.32
498 0.31
499 0.33
500 0.35
501 0.39
502 0.43
503 0.47
504 0.57
505 0.6
506 0.68
507 0.7
508 0.7
509 0.66
510 0.67
511 0.7
512 0.71
513 0.72
514 0.73
515 0.77
516 0.82
517 0.87
518 0.83
519 0.82
520 0.75
521 0.72
522 0.71
523 0.7
524 0.63
525 0.6
526 0.55
527 0.48
528 0.45
529 0.4
530 0.34
531 0.28
532 0.25
533 0.21
534 0.21
535 0.23
536 0.22
537 0.21
538 0.21
539 0.19
540 0.2
541 0.2
542 0.24
543 0.24
544 0.23
545 0.23
546 0.24
547 0.26
548 0.27
549 0.27
550 0.25
551 0.3
552 0.34
553 0.4
554 0.46
555 0.54
556 0.59
557 0.64
558 0.69
559 0.68
560 0.7
561 0.69
562 0.69
563 0.66
564 0.64
565 0.66
566 0.65
567 0.65
568 0.62
569 0.57
570 0.49
571 0.43
572 0.39
573 0.38
574 0.37
575 0.34
576 0.37
577 0.38
578 0.46
579 0.56
580 0.62
581 0.63
582 0.69
583 0.77
584 0.81
585 0.89
586 0.91
587 0.9
588 0.92
589 0.87
590 0.85
591 0.84
592 0.82
593 0.8
594 0.8
595 0.78
596 0.73
597 0.75
598 0.74
599 0.75
600 0.78
601 0.8
602 0.8
603 0.82
604 0.86
605 0.87
606 0.87
607 0.85
608 0.83
609 0.82
610 0.76
611 0.72
612 0.64
613 0.58
614 0.53
615 0.48
616 0.49
617 0.48
618 0.52
619 0.54
620 0.59
621 0.62
622 0.67
623 0.73