Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BND0

Protein Details
Accession G8BND0    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-134CSEKGHYKSQCPKKWKRVFCILCHydrophilic
258-304GNSSNSNSRNKNKKRQYSNFNPPPYQDERRHKRSKKSDNGRNSRSGNHydrophilic
347-384NGARNTDKTRHGKSKSNKSKDSRHNKHRSHNAHKFERQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-293RRHKRSKK
354-379KTRHGKSKSNKSKDSRHNKHRSHNAH
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016713  Air1/2_Saccharomycetales  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043633  P:polyadenylation-dependent RNA catabolic process  
KEGG tpf:TPHA_0A03310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSSLNETESMDSLPFVKEVTPSRESSVVKIVAPSIEEVTGNPEELRALRGQGRYFGMSEADGGFMESEPKCNNCSQRGHYKRDCPHVICTYCGSMDDHYSQHCPKAIMCSNCSEKGHYKSQCPKKWKRVFCILCNSKLHSRDRCPSVWRVYLLKETKKNEKRHLPMHLIFCYNCGLKGHFGDDCNRRRSSRVPLDDGSAFSGDNVCDELKEEYFQNLTDFKRESRYDYDITNDSFDYNDYEYENEAYDGNDYVGRYNGNSSNSNSRNKNKKRQYSNFNPPPYQDERRHKRSKKSDNGRNSRSGNSSNNNNNNNNNNNNNNKTSTTSHPLDFPRNNNRSNNRSNSNSNGARNTDKTRHGKSKSNKSKDSRHNKHRSHNAHKFERQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.11
4 0.15
5 0.2
6 0.27
7 0.3
8 0.3
9 0.34
10 0.4
11 0.4
12 0.39
13 0.4
14 0.36
15 0.32
16 0.31
17 0.29
18 0.24
19 0.23
20 0.22
21 0.15
22 0.14
23 0.13
24 0.12
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.17
33 0.12
34 0.15
35 0.2
36 0.24
37 0.25
38 0.28
39 0.31
40 0.29
41 0.29
42 0.27
43 0.22
44 0.18
45 0.18
46 0.14
47 0.12
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.12
53 0.11
54 0.13
55 0.15
56 0.17
57 0.19
58 0.24
59 0.29
60 0.32
61 0.39
62 0.43
63 0.52
64 0.59
65 0.66
66 0.68
67 0.72
68 0.72
69 0.75
70 0.76
71 0.68
72 0.67
73 0.66
74 0.6
75 0.52
76 0.47
77 0.39
78 0.32
79 0.3
80 0.24
81 0.16
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.22
87 0.22
88 0.23
89 0.24
90 0.21
91 0.2
92 0.28
93 0.32
94 0.32
95 0.33
96 0.36
97 0.38
98 0.42
99 0.42
100 0.37
101 0.37
102 0.38
103 0.46
104 0.44
105 0.48
106 0.53
107 0.63
108 0.67
109 0.71
110 0.75
111 0.77
112 0.84
113 0.83
114 0.8
115 0.8
116 0.79
117 0.76
118 0.77
119 0.7
120 0.66
121 0.61
122 0.58
123 0.53
124 0.52
125 0.52
126 0.48
127 0.5
128 0.51
129 0.53
130 0.52
131 0.5
132 0.5
133 0.5
134 0.46
135 0.42
136 0.36
137 0.34
138 0.39
139 0.4
140 0.41
141 0.42
142 0.42
143 0.51
144 0.57
145 0.62
146 0.62
147 0.66
148 0.66
149 0.65
150 0.68
151 0.65
152 0.61
153 0.59
154 0.53
155 0.45
156 0.39
157 0.34
158 0.29
159 0.21
160 0.17
161 0.13
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.19
169 0.26
170 0.31
171 0.34
172 0.35
173 0.34
174 0.35
175 0.38
176 0.42
177 0.43
178 0.42
179 0.42
180 0.41
181 0.43
182 0.41
183 0.37
184 0.28
185 0.19
186 0.14
187 0.09
188 0.1
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.21
209 0.22
210 0.25
211 0.26
212 0.3
213 0.29
214 0.28
215 0.31
216 0.27
217 0.27
218 0.24
219 0.19
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.11
244 0.14
245 0.16
246 0.19
247 0.21
248 0.3
249 0.35
250 0.41
251 0.44
252 0.5
253 0.58
254 0.65
255 0.73
256 0.73
257 0.79
258 0.83
259 0.86
260 0.87
261 0.87
262 0.89
263 0.87
264 0.83
265 0.75
266 0.65
267 0.62
268 0.6
269 0.57
270 0.55
271 0.57
272 0.6
273 0.68
274 0.78
275 0.78
276 0.82
277 0.85
278 0.87
279 0.87
280 0.88
281 0.88
282 0.88
283 0.91
284 0.87
285 0.83
286 0.76
287 0.69
288 0.63
289 0.58
290 0.54
291 0.5
292 0.53
293 0.54
294 0.6
295 0.62
296 0.61
297 0.61
298 0.62
299 0.62
300 0.6
301 0.57
302 0.56
303 0.58
304 0.59
305 0.57
306 0.52
307 0.48
308 0.46
309 0.44
310 0.43
311 0.43
312 0.41
313 0.38
314 0.41
315 0.44
316 0.48
317 0.5
318 0.51
319 0.54
320 0.57
321 0.62
322 0.65
323 0.69
324 0.69
325 0.72
326 0.73
327 0.68
328 0.68
329 0.68
330 0.65
331 0.66
332 0.64
333 0.59
334 0.56
335 0.54
336 0.53
337 0.53
338 0.54
339 0.51
340 0.55
341 0.58
342 0.62
343 0.68
344 0.68
345 0.73
346 0.76
347 0.8
348 0.82
349 0.84
350 0.84
351 0.82
352 0.87
353 0.88
354 0.89
355 0.89
356 0.89
357 0.9
358 0.89
359 0.91
360 0.91
361 0.91
362 0.91
363 0.9
364 0.89