Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3ATM5

Protein Details
Accession G3ATM5    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-31IEDTVPAKHKRSKYKPSTPSKEATPHydrophilic
128-149IAANCKSKVKKRTYCRNCDTFSHydrophilic
350-370SGLIESSKANSKKKKNKIMKYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
357-367KANSKKKKNKI
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 15, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016713  Air1/2_Saccharomycetales  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0043633  P:polyadenylation-dependent RNA catabolic process  
KEGG spaa:SPAPADRAFT_62892  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSELPFIEDTVPAKHKRSKYKPSTPSKEATPVENTSSIVSLSFDQVNDDASELIELRGEGRYFGVTDPDDVNAQQSLGPLCANCHKRGHIRAKCKTVVCHKCGIVGDHYETHCPTTLICARCGEKGHIAANCKSKVKKRTYCRNCDTFSHGDENCPSIWRSYLTKPNNDQSDEESLVLPVTACYNCGSSDHYGDECPEPRSSRVPNLGTAFSGSNLPRKFRPLYFLRLKKGNNGNSRYNPESSVRDYHSYYDKSQDFYRGQQNSFGNRNQGFGNVQFNSYGNRSGAGKFPPRSNTGSKSGYLPRNGHGNDYHSRSDNRNNPTRSGFIQKSNSRNFDSGNRNGGGARPTRSGLIESSKANSKKKKNKIMKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.49
3 0.58
4 0.67
5 0.71
6 0.76
7 0.83
8 0.87
9 0.9
10 0.91
11 0.86
12 0.81
13 0.75
14 0.74
15 0.65
16 0.59
17 0.54
18 0.48
19 0.45
20 0.41
21 0.36
22 0.28
23 0.27
24 0.22
25 0.16
26 0.14
27 0.11
28 0.13
29 0.14
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.15
34 0.14
35 0.13
36 0.11
37 0.09
38 0.1
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.15
52 0.13
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.09
67 0.11
68 0.19
69 0.23
70 0.25
71 0.28
72 0.33
73 0.4
74 0.5
75 0.58
76 0.59
77 0.66
78 0.71
79 0.74
80 0.76
81 0.71
82 0.68
83 0.68
84 0.68
85 0.61
86 0.59
87 0.51
88 0.49
89 0.47
90 0.43
91 0.35
92 0.29
93 0.28
94 0.26
95 0.26
96 0.24
97 0.23
98 0.22
99 0.2
100 0.16
101 0.14
102 0.17
103 0.22
104 0.22
105 0.23
106 0.25
107 0.26
108 0.28
109 0.3
110 0.26
111 0.23
112 0.24
113 0.26
114 0.26
115 0.28
116 0.3
117 0.35
118 0.36
119 0.36
120 0.38
121 0.42
122 0.49
123 0.55
124 0.6
125 0.63
126 0.71
127 0.77
128 0.83
129 0.83
130 0.81
131 0.73
132 0.67
133 0.64
134 0.56
135 0.48
136 0.44
137 0.36
138 0.3
139 0.28
140 0.27
141 0.2
142 0.18
143 0.16
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.15
148 0.19
149 0.28
150 0.3
151 0.36
152 0.4
153 0.45
154 0.46
155 0.44
156 0.4
157 0.33
158 0.34
159 0.29
160 0.26
161 0.2
162 0.16
163 0.14
164 0.13
165 0.1
166 0.05
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.2
188 0.21
189 0.24
190 0.29
191 0.28
192 0.3
193 0.31
194 0.3
195 0.25
196 0.25
197 0.2
198 0.14
199 0.16
200 0.13
201 0.17
202 0.17
203 0.2
204 0.19
205 0.24
206 0.27
207 0.25
208 0.31
209 0.29
210 0.37
211 0.44
212 0.5
213 0.49
214 0.53
215 0.52
216 0.54
217 0.59
218 0.58
219 0.57
220 0.56
221 0.58
222 0.57
223 0.63
224 0.57
225 0.5
226 0.44
227 0.38
228 0.37
229 0.33
230 0.33
231 0.3
232 0.3
233 0.29
234 0.3
235 0.33
236 0.32
237 0.3
238 0.33
239 0.31
240 0.31
241 0.31
242 0.35
243 0.3
244 0.32
245 0.4
246 0.37
247 0.36
248 0.4
249 0.43
250 0.42
251 0.45
252 0.42
253 0.4
254 0.36
255 0.37
256 0.31
257 0.29
258 0.25
259 0.22
260 0.26
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.19
265 0.2
266 0.2
267 0.2
268 0.14
269 0.15
270 0.16
271 0.16
272 0.2
273 0.24
274 0.3
275 0.31
276 0.36
277 0.39
278 0.42
279 0.46
280 0.47
281 0.47
282 0.46
283 0.46
284 0.42
285 0.42
286 0.47
287 0.47
288 0.48
289 0.45
290 0.4
291 0.46
292 0.45
293 0.44
294 0.38
295 0.38
296 0.37
297 0.41
298 0.42
299 0.37
300 0.4
301 0.41
302 0.48
303 0.5
304 0.53
305 0.57
306 0.57
307 0.57
308 0.58
309 0.57
310 0.51
311 0.52
312 0.48
313 0.47
314 0.53
315 0.56
316 0.61
317 0.65
318 0.67
319 0.62
320 0.6
321 0.55
322 0.54
323 0.55
324 0.51
325 0.49
326 0.45
327 0.41
328 0.39
329 0.39
330 0.36
331 0.33
332 0.31
333 0.28
334 0.29
335 0.3
336 0.31
337 0.3
338 0.28
339 0.3
340 0.3
341 0.29
342 0.32
343 0.39
344 0.44
345 0.51
346 0.57
347 0.61
348 0.67
349 0.76
350 0.83