Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8C0B0

Protein Details
Accession G8C0B0    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-69NQGDWNAKGKHKKGRRPENNASNATQGKSRSQRSRHRRKAKDKEVSGFKLVHydrophilic
245-325AGAVESEKKSKKKKKKKKKSEKKKEEETASKDSSSVAKTKSKPKGKPKLKSKSKLESKSKTNAKSKKVKEHDSLKKEKNNNBasic
329-356LEAAGKKELQRRKRTLAKKENDLKNVQKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-61AKGKHKKGRRPENNASNATQGKSRSQRSRHRRKAKDK
252-323KKSKKKKKKKKKSEKKKEEETASKDSSSVAKTKSKPKGKPKLKSKSKLESKSKTNAKSKKVKEHDSLKKEKN
332-347AGKKELQRRKRTLAKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG tpf:TPHA_0M00500  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MAETTAKMELPTGEAAGKNQGDWNAKGKHKKGRRPENNASNATQGKSRSQRSRHRRKAKDKEVSGFKLVLQSLPPALTETEFWDAVKSVVNDTNEYQINLNSFYFVQGKLSDKPFHDPVYSRSYIMFKDMENLRKFALKIQDVTFTDANNDSSVASIKISPYNRSYNSALEKKKPAANKKVLEGTIKDDPLFKAFVQSMKIMAESDQYMYSEINLFKPLKKELDKQKQVNEAILKQTEKALVELAGAVESEKKSKKKKKKKKKSEKKKEEETASKDSSSVAKTKSKPKGKPKLKSKSKLESKSKTNAKSKKVKEHDSLKKEKNNNVVILEAAGKKELQRRKRTLAKKENDLKNVQKNSFTKLPSLMPNTPNPTPSSNPKMKILKRPNTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.22
4 0.22
5 0.2
6 0.22
7 0.26
8 0.29
9 0.31
10 0.37
11 0.38
12 0.46
13 0.54
14 0.59
15 0.63
16 0.69
17 0.76
18 0.79
19 0.83
20 0.86
21 0.87
22 0.91
23 0.91
24 0.9
25 0.84
26 0.75
27 0.71
28 0.63
29 0.54
30 0.47
31 0.39
32 0.39
33 0.43
34 0.49
35 0.52
36 0.58
37 0.68
38 0.75
39 0.84
40 0.87
41 0.89
42 0.91
43 0.93
44 0.95
45 0.95
46 0.95
47 0.9
48 0.88
49 0.87
50 0.8
51 0.72
52 0.62
53 0.51
54 0.46
55 0.39
56 0.3
57 0.22
58 0.19
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.17
74 0.14
75 0.14
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.21
80 0.26
81 0.23
82 0.23
83 0.21
84 0.17
85 0.18
86 0.17
87 0.16
88 0.12
89 0.11
90 0.13
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.17
96 0.2
97 0.25
98 0.27
99 0.27
100 0.32
101 0.33
102 0.33
103 0.33
104 0.3
105 0.3
106 0.34
107 0.33
108 0.28
109 0.27
110 0.27
111 0.24
112 0.26
113 0.22
114 0.14
115 0.2
116 0.24
117 0.31
118 0.3
119 0.31
120 0.29
121 0.3
122 0.31
123 0.28
124 0.31
125 0.25
126 0.27
127 0.27
128 0.33
129 0.31
130 0.35
131 0.31
132 0.23
133 0.23
134 0.21
135 0.2
136 0.13
137 0.13
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.13
146 0.14
147 0.17
148 0.2
149 0.25
150 0.26
151 0.3
152 0.31
153 0.3
154 0.36
155 0.41
156 0.4
157 0.39
158 0.42
159 0.4
160 0.43
161 0.45
162 0.46
163 0.48
164 0.54
165 0.51
166 0.51
167 0.52
168 0.5
169 0.45
170 0.38
171 0.32
172 0.27
173 0.25
174 0.22
175 0.18
176 0.17
177 0.17
178 0.17
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.13
202 0.13
203 0.15
204 0.18
205 0.2
206 0.23
207 0.26
208 0.33
209 0.41
210 0.51
211 0.58
212 0.59
213 0.62
214 0.64
215 0.6
216 0.57
217 0.49
218 0.4
219 0.35
220 0.34
221 0.28
222 0.21
223 0.22
224 0.2
225 0.17
226 0.15
227 0.12
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.11
238 0.16
239 0.22
240 0.33
241 0.44
242 0.55
243 0.64
244 0.75
245 0.83
246 0.89
247 0.95
248 0.96
249 0.97
250 0.98
251 0.98
252 0.98
253 0.96
254 0.95
255 0.92
256 0.89
257 0.86
258 0.81
259 0.77
260 0.67
261 0.58
262 0.47
263 0.4
264 0.34
265 0.28
266 0.26
267 0.22
268 0.28
269 0.33
270 0.42
271 0.51
272 0.58
273 0.65
274 0.72
275 0.79
276 0.81
277 0.87
278 0.88
279 0.89
280 0.9
281 0.91
282 0.89
283 0.88
284 0.89
285 0.89
286 0.88
287 0.85
288 0.81
289 0.81
290 0.81
291 0.78
292 0.78
293 0.76
294 0.75
295 0.77
296 0.79
297 0.8
298 0.8
299 0.79
300 0.78
301 0.8
302 0.82
303 0.81
304 0.83
305 0.8
306 0.81
307 0.79
308 0.77
309 0.75
310 0.7
311 0.64
312 0.55
313 0.47
314 0.38
315 0.33
316 0.3
317 0.22
318 0.17
319 0.15
320 0.14
321 0.17
322 0.25
323 0.33
324 0.39
325 0.48
326 0.56
327 0.65
328 0.74
329 0.8
330 0.84
331 0.86
332 0.84
333 0.84
334 0.87
335 0.86
336 0.83
337 0.8
338 0.78
339 0.77
340 0.77
341 0.69
342 0.67
343 0.6
344 0.61
345 0.6
346 0.54
347 0.47
348 0.42
349 0.45
350 0.44
351 0.49
352 0.49
353 0.46
354 0.52
355 0.55
356 0.54
357 0.51
358 0.47
359 0.45
360 0.44
361 0.48
362 0.5
363 0.52
364 0.53
365 0.59
366 0.66
367 0.68
368 0.74
369 0.76