FuNGI

A0A2H3II24

Protein Details

Accession

A0A2H3II24

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
441-467	RELKAKEEEERKRKDKKSVGKLQTHGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
445-458	AKEEEERKRKDKKS

Subcellular Location(s)

mito 12.5, mito_nucl 12, nucl 10.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034104 Lsm1 IPR010920 LSM_dom_sf IPR044642 PTHR15588 IPR047575 Sm IPR001163 Sm_dom_euk/arc
Gene Ontology	GO:0000932 C:P-body GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01423 LSM
PROSITE	View protein in PROSITE PS52002 SM
CDD	cd01728 LSm1

Amino Acid Sequences

MSRRTQKRTFIPVIVHDSTSSTTASSSESMTSAIPVPSLSGGSQSSVSDNSSTASQTLSKEMKPKINVINILETDSTGNLVASPPASLAPPADQVVYRCLFYILPCDHQSDNIDTWKTHVLSHFRGTRLPPTAICQWCPLEFRQPSNTSTSTSINTNTHQTWNAMLTHVAHDHFEKGHTLASARPNFELMKFMYNSKIITEDQLKAIQLCPSPDSPAYHPSQDPVRASIGSSDEPYCSTYSPRREKRLREQRRGISVHAKGQTDFSSRDVTFPLPSIITTFRRRSPLLAYETTTPATLLHPEQKLTYKMERLPIRESAGSPRQQGQNQPSGPPPVPQGPPQLPPQMFTTAAQLLDLTDKKLVLVLRDGRKLIGVLRSWDQFANLVLQDTVERIYSGNLYAEEHVGLYLVRGENVLLLGEIDLDKEDDLPETLTQASMKEVRELKAKEEEERKRKDKKSVGKLQTHGFEPEHSGEYRGSGDVATSEERPQDEFAGCSVALLCYVDMLFE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.51
3	0.41
4	0.36
5	0.32
6	0.29
7	0.22
8	0.14
9	0.12
10	0.12
11	0.14
12	0.13
13	0.13
14	0.13
15	0.13
16	0.13
17	0.13
18	0.14
19	0.14
20	0.13
21	0.12
22	0.11
23	0.12
24	0.11
25	0.12
26	0.11
27	0.11
28	0.11
29	0.13
30	0.14
31	0.13
32	0.15
33	0.15
34	0.16
35	0.14
36	0.14
37	0.13
38	0.13
39	0.14
40	0.12
41	0.12
42	0.14
43	0.15
44	0.22
45	0.24
46	0.26
47	0.33
48	0.38
49	0.44
50	0.44
51	0.5
52	0.5
53	0.53
54	0.55
55	0.5
56	0.51
57	0.44
58	0.44
59	0.37
60	0.3
61	0.24
62	0.19
63	0.17
64	0.1
65	0.09
66	0.07
67	0.07
68	0.08
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.08
75	0.09
76	0.1
77	0.12
78	0.13
79	0.13
80	0.14
81	0.15
82	0.2
83	0.2
84	0.18
85	0.16
86	0.16
87	0.16
88	0.15
89	0.22
90	0.19
91	0.23
92	0.24
93	0.27
94	0.26
95	0.28
96	0.31
97	0.27
98	0.28
99	0.27
100	0.27
101	0.24
102	0.26
103	0.3
104	0.27
105	0.25
106	0.27
107	0.28
108	0.3
109	0.38
110	0.4
111	0.36
112	0.38
113	0.39
114	0.41
115	0.4
116	0.38
117	0.31
118	0.31
119	0.39
120	0.38
121	0.37
122	0.34
123	0.31
124	0.31
125	0.33
126	0.3
127	0.31
128	0.31
129	0.33
130	0.37
131	0.38
132	0.38
133	0.41
134	0.4
135	0.33
136	0.33
137	0.31
138	0.25
139	0.24
140	0.25
141	0.22
142	0.22
143	0.24
144	0.23
145	0.23
146	0.23
147	0.22
148	0.2
149	0.2
150	0.19
151	0.15
152	0.14
153	0.13
154	0.13
155	0.14
156	0.13
157	0.12
158	0.12
159	0.13
160	0.13
161	0.12
162	0.11
163	0.1
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.14
168	0.21
169	0.24
170	0.24
171	0.24
172	0.24
173	0.25
174	0.24
175	0.23
176	0.16
177	0.17
178	0.17
179	0.18
180	0.18
181	0.19
182	0.18
183	0.16
184	0.17
185	0.13
186	0.15
187	0.18
188	0.16
189	0.17
190	0.18
191	0.18
192	0.16
193	0.16
194	0.16
195	0.14
196	0.14
197	0.14
198	0.13
199	0.16
200	0.17
201	0.18
202	0.17
203	0.21
204	0.22
205	0.22
206	0.22
207	0.21
208	0.23
209	0.24
210	0.23
211	0.2
212	0.19
213	0.17
214	0.17
215	0.17
216	0.15
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.11
221	0.11
222	0.12
223	0.11
224	0.1
225	0.12
226	0.17
227	0.25
228	0.35
229	0.41
230	0.49
231	0.55
232	0.62
233	0.7
234	0.75
235	0.77
236	0.77
237	0.79
238	0.75
239	0.77
240	0.72
241	0.63
242	0.6
243	0.51
244	0.47
245	0.42
246	0.37
247	0.29
248	0.29
249	0.28
250	0.23
251	0.21
252	0.17
253	0.18
254	0.18
255	0.18
256	0.18
257	0.17
258	0.15
259	0.14
260	0.14
261	0.09
262	0.08
263	0.1
264	0.12
265	0.15
266	0.21
267	0.23
268	0.25
269	0.29
270	0.3
271	0.3
272	0.31
273	0.33
274	0.33
275	0.32
276	0.31
277	0.29
278	0.3
279	0.28
280	0.23
281	0.17
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.15
287	0.15
288	0.16
289	0.17
290	0.2
291	0.22
292	0.24
293	0.26
294	0.25
295	0.27
296	0.34
297	0.36
298	0.36
299	0.37
300	0.36
301	0.35
302	0.32
303	0.3
304	0.3
305	0.32
306	0.32
307	0.31
308	0.33
309	0.35
310	0.36
311	0.41
312	0.39
313	0.41
314	0.39
315	0.39
316	0.37
317	0.37
318	0.35
319	0.3
320	0.28
321	0.25
322	0.26
323	0.27
324	0.32
325	0.3
326	0.32
327	0.35
328	0.4
329	0.34
330	0.34
331	0.34
332	0.3
333	0.27
334	0.25
335	0.24
336	0.18
337	0.18
338	0.16
339	0.13
340	0.11
341	0.14
342	0.14
343	0.12
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.14
348	0.14
349	0.11
350	0.17
351	0.24
352	0.29
353	0.32
354	0.33
355	0.3
356	0.3
357	0.29
358	0.26
359	0.23
360	0.19
361	0.19
362	0.22
363	0.23
364	0.24
365	0.24
366	0.21
367	0.17
368	0.16
369	0.16
370	0.13
371	0.12
372	0.11
373	0.11
374	0.1
375	0.1
376	0.1
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.11
386	0.12
387	0.12
388	0.11
389	0.1
390	0.09
391	0.08
392	0.07
393	0.06
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.11
421	0.1
422	0.13
423	0.16
424	0.17
425	0.22
426	0.25
427	0.27
428	0.35
429	0.36
430	0.37
431	0.42
432	0.43
433	0.45
434	0.51
435	0.59
436	0.6
437	0.69
438	0.73
439	0.74
440	0.78
441	0.81
442	0.81
443	0.81
444	0.82
445	0.83
446	0.85
447	0.84
448	0.82
449	0.78
450	0.73
451	0.65
452	0.58
453	0.48
454	0.4
455	0.36
456	0.35
457	0.31
458	0.27
459	0.26
460	0.22
461	0.23
462	0.23
463	0.18
464	0.15
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.16
472	0.19
473	0.2
474	0.22
475	0.23
476	0.23
477	0.22
478	0.21
479	0.19
480	0.2
481	0.19
482	0.17
483	0.16
484	0.12
485	0.12
486	0.12
487	0.1
488	0.08

A0A2H3II24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer