Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BVV0

Protein Details
Accession G8BVV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-164IKSFVKRNKKSAHSSVKKKLTKNPIKRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-164KRNKKSAHSSVKKKLTKNPIKRS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG tpf:TPHA_0G01920  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSKFGRRTWDREEYAQLASETSNNSSAITASLSPTQVDDLKQKYTNYDFLLKNSIADLNKKILTTGLSSFKKGKQFGFYCELCDLTFKDNLQYIDHLNHKTHNIKFELLFEEPLVLDLRDNEDIERNEFEIAYNYLIKSFVKRNKKSAHSSVKKKLTKNPIKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.45
3 0.36
4 0.27
5 0.23
6 0.21
7 0.17
8 0.16
9 0.16
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.12
16 0.1
17 0.1
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.19
26 0.2
27 0.24
28 0.27
29 0.27
30 0.3
31 0.31
32 0.33
33 0.31
34 0.35
35 0.31
36 0.3
37 0.34
38 0.3
39 0.27
40 0.23
41 0.24
42 0.17
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.16
53 0.21
54 0.21
55 0.23
56 0.25
57 0.28
58 0.33
59 0.32
60 0.31
61 0.3
62 0.31
63 0.33
64 0.37
65 0.33
66 0.3
67 0.28
68 0.27
69 0.19
70 0.18
71 0.15
72 0.11
73 0.12
74 0.1
75 0.11
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.16
82 0.2
83 0.2
84 0.18
85 0.19
86 0.23
87 0.27
88 0.28
89 0.29
90 0.28
91 0.27
92 0.27
93 0.28
94 0.27
95 0.22
96 0.21
97 0.16
98 0.14
99 0.12
100 0.13
101 0.11
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.16
110 0.17
111 0.2
112 0.21
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.16
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.16
126 0.24
127 0.3
128 0.4
129 0.45
130 0.54
131 0.63
132 0.7
133 0.75
134 0.76
135 0.79
136 0.78
137 0.83
138 0.84
139 0.85
140 0.84
141 0.81
142 0.8
143 0.8
144 0.81