Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3IRT9

Protein Details
Accession A0A2H3IRT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-55LSKTWAQVKRRNSKSDEKKVIPHydrophilic
168-191EDQPQKRPRSSSPRKQPPKLSPYFHydrophilic
293-313ESPPERGKRYRKLNYPLKRDGBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR045138  MeCP2/MBD4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
Amino Acid Sequences MPNRNVTTIKRTAKTSSYFVRSRGNNRKSGDGDLSKTWAQVKRRNSKSDEKKVIPICASGKELLSAIDDAGSSSCQDVSVLTQTRTCDLVLTAQTELQNRTARAESEVYEDHEHAVTTSSASDIQALAEQLLLQPIDAAEIAQRGDTDDDNTNPEAEIPSQIPPQNPEDQPQKRPRSSSPRKQPPKLSPYFPKPLPLIETSCLPFPPISAPTFGLIQEQLSLSPFRLLIATIFLNRTRGPVAIPVLFKLFELYPTIEDMARATHDDIVSIIRGLGFQNQRATKFIALAQKWLESPPERGKRYRKLNYPLKRDGADVAPDEVVPDEADYEVDGQKCDTRVAWEIAHLPGVGAYAIDSWRIFCRDHLRFGPSPSTTSDDSYYEPEWKRVLPQDKELRAYLSWKWLQEGWVWNCENGSRTKADAEMMKRAEKGGVAFEGGDGHLVVMNIQASSSGVHGLQDIKKAGFSLDCS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.56
3 0.55
4 0.54
5 0.54
6 0.53
7 0.57
8 0.57
9 0.63
10 0.67
11 0.65
12 0.65
13 0.65
14 0.7
15 0.64
16 0.63
17 0.61
18 0.55
19 0.52
20 0.47
21 0.48
22 0.41
23 0.4
24 0.4
25 0.37
26 0.4
27 0.43
28 0.51
29 0.57
30 0.65
31 0.72
32 0.72
33 0.77
34 0.8
35 0.84
36 0.83
37 0.77
38 0.77
39 0.73
40 0.72
41 0.62
42 0.56
43 0.48
44 0.41
45 0.4
46 0.32
47 0.28
48 0.23
49 0.22
50 0.18
51 0.16
52 0.13
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.09
66 0.16
67 0.19
68 0.19
69 0.22
70 0.23
71 0.24
72 0.25
73 0.22
74 0.16
75 0.13
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.2
82 0.22
83 0.23
84 0.23
85 0.26
86 0.24
87 0.27
88 0.27
89 0.25
90 0.26
91 0.27
92 0.22
93 0.23
94 0.24
95 0.24
96 0.24
97 0.23
98 0.21
99 0.19
100 0.18
101 0.13
102 0.14
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.08
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.16
138 0.17
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.11
145 0.1
146 0.12
147 0.15
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.23
152 0.28
153 0.27
154 0.3
155 0.37
156 0.4
157 0.48
158 0.55
159 0.6
160 0.56
161 0.59
162 0.62
163 0.64
164 0.69
165 0.71
166 0.72
167 0.75
168 0.81
169 0.84
170 0.84
171 0.82
172 0.82
173 0.76
174 0.71
175 0.68
176 0.66
177 0.66
178 0.58
179 0.52
180 0.43
181 0.4
182 0.36
183 0.31
184 0.26
185 0.2
186 0.22
187 0.19
188 0.19
189 0.17
190 0.15
191 0.12
192 0.1
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.13
201 0.11
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.07
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.2
265 0.22
266 0.23
267 0.25
268 0.26
269 0.21
270 0.2
271 0.23
272 0.24
273 0.23
274 0.24
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.22
279 0.21
280 0.15
281 0.21
282 0.28
283 0.36
284 0.38
285 0.45
286 0.53
287 0.59
288 0.68
289 0.7
290 0.7
291 0.71
292 0.78
293 0.81
294 0.81
295 0.78
296 0.72
297 0.64
298 0.56
299 0.48
300 0.4
301 0.34
302 0.26
303 0.21
304 0.17
305 0.16
306 0.15
307 0.12
308 0.1
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.07
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.16
326 0.19
327 0.18
328 0.18
329 0.2
330 0.19
331 0.2
332 0.16
333 0.12
334 0.1
335 0.1
336 0.08
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.07
342 0.06
343 0.08
344 0.11
345 0.13
346 0.13
347 0.16
348 0.26
349 0.29
350 0.36
351 0.38
352 0.42
353 0.43
354 0.46
355 0.49
356 0.4
357 0.38
358 0.34
359 0.34
360 0.29
361 0.29
362 0.28
363 0.22
364 0.23
365 0.25
366 0.24
367 0.28
368 0.28
369 0.28
370 0.28
371 0.27
372 0.3
373 0.35
374 0.43
375 0.4
376 0.48
377 0.55
378 0.58
379 0.61
380 0.57
381 0.51
382 0.42
383 0.42
384 0.35
385 0.34
386 0.33
387 0.3
388 0.32
389 0.3
390 0.3
391 0.32
392 0.39
393 0.34
394 0.38
395 0.38
396 0.35
397 0.35
398 0.34
399 0.32
400 0.26
401 0.26
402 0.2
403 0.21
404 0.23
405 0.23
406 0.25
407 0.29
408 0.3
409 0.35
410 0.36
411 0.37
412 0.36
413 0.36
414 0.34
415 0.29
416 0.26
417 0.21
418 0.19
419 0.17
420 0.16
421 0.15
422 0.15
423 0.14
424 0.13
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.1
442 0.16
443 0.19
444 0.23
445 0.25
446 0.24
447 0.25
448 0.25
449 0.25