Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8C0Q0

Protein Details
Accession G8C0Q0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-31PNEGNRQRHDHGKKDNNNSPLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.333, cyto 6, cyto_mito 3.833, plas 2, pero 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
KEGG tpf:TPHA_0M01900  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFNSKLPNEGNRQRHDHGKKDNNNSPLDFEDTYKGYGEYEREEDDYLNDETFGDDVAFGTDFDFGHGSSSANSGMISTNQSQGQQGFNDPVGMQGAQAQQQQFQMHSSYAAAASTTVPQQQAQMNVTMDMRPMESLWSNQPDMSTQVGQNEVLSMEELERQQIQMQQQQQHPPPQMFMPNYPNQQPQQPQQQFQNNYQNNFQNNFQNPQNMNNQFQQPPPPQIFNQPPPPNQQQTQAQMNQAPVHMDSPGQFNPQHMHAMHAVPGGMPMPMQMNNQISNHLHHQQFDPSLELKNQNQHRQQQVMGQNIGQNELLENDQALSTPSPKPTHQVLQREDGSIASNGNNNQSYIHIKDKGPRRMSRRSEPLSSEEQKRLQIRHAKVEKILKNAGLMTPRDKDFITRYQLSQIVTEDPYNEDFYFQVYKIIQTGGVAGKSNKDLIARAYLEHSGHRLGGRYKRADVALQRMQNQVEKAVTVAKERPQKNKDNTDSAREGVLGKISSSLNSKAPRRQLQIPSPKLSDEEDESKLSSHASSESLEEVTESLNNVGINQSSRSRRRSSYAFSSVDQISVLSRSGGRKFVLSLIETVYEEVLELEAQLRSGNETDSTGLWESLHIGDEAYDVSPFISMLSFDKGVKIMPRIFNFLDKASKLKLLQTFFNELSHLNVIIISSFKTNPTPTEAQLKKIELFQGVFLKIIVSFLSSSADFIEIMGLLLHLIRNNNVSFISTSTLGLNLITILISRAAIIKQDCNRTNSLSSPDIQAWNEIYDKLFISLETKLSLVFPPQEYRDTVVKETSQSGQLQQSNTQYFDQSYIWQFLASLALSGKLNHQRIIIDEVRDEIFGTINCAEQMKSLPDQSSAYRRDKLYQDLNLFLNVMGLVARDGEISELK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.55
3 0.61
4 0.62
5 0.71
6 0.72
7 0.72
8 0.73
9 0.75
10 0.77
11 0.8
12 0.83
13 0.79
14 0.76
15 0.68
16 0.61
17 0.53
18 0.49
19 0.4
20 0.35
21 0.33
22 0.29
23 0.29
24 0.26
25 0.23
26 0.19
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.22
31 0.24
32 0.24
33 0.25
34 0.25
35 0.23
36 0.24
37 0.21
38 0.18
39 0.15
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.08
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.15
68 0.15
69 0.18
70 0.2
71 0.21
72 0.22
73 0.23
74 0.24
75 0.21
76 0.22
77 0.22
78 0.2
79 0.21
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.15
84 0.12
85 0.14
86 0.16
87 0.18
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.26
92 0.27
93 0.23
94 0.23
95 0.22
96 0.18
97 0.18
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.12
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.12
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.17
111 0.2
112 0.23
113 0.23
114 0.25
115 0.23
116 0.23
117 0.24
118 0.21
119 0.19
120 0.16
121 0.15
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.15
127 0.2
128 0.24
129 0.24
130 0.24
131 0.25
132 0.23
133 0.24
134 0.25
135 0.21
136 0.18
137 0.19
138 0.2
139 0.2
140 0.18
141 0.16
142 0.13
143 0.1
144 0.1
145 0.08
146 0.07
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.18
154 0.22
155 0.25
156 0.32
157 0.37
158 0.42
159 0.5
160 0.53
161 0.56
162 0.57
163 0.51
164 0.46
165 0.43
166 0.44
167 0.38
168 0.38
169 0.38
170 0.39
171 0.42
172 0.44
173 0.46
174 0.41
175 0.45
176 0.46
177 0.45
178 0.5
179 0.51
180 0.51
181 0.54
182 0.62
183 0.59
184 0.62
185 0.66
186 0.59
187 0.57
188 0.58
189 0.56
190 0.51
191 0.49
192 0.44
193 0.41
194 0.4
195 0.42
196 0.38
197 0.41
198 0.38
199 0.4
200 0.47
201 0.42
202 0.42
203 0.42
204 0.45
205 0.39
206 0.4
207 0.43
208 0.38
209 0.41
210 0.41
211 0.4
212 0.36
213 0.42
214 0.48
215 0.47
216 0.53
217 0.53
218 0.52
219 0.56
220 0.62
221 0.59
222 0.53
223 0.53
224 0.49
225 0.48
226 0.53
227 0.48
228 0.44
229 0.4
230 0.41
231 0.35
232 0.29
233 0.25
234 0.18
235 0.16
236 0.13
237 0.11
238 0.1
239 0.14
240 0.15
241 0.17
242 0.16
243 0.17
244 0.19
245 0.2
246 0.24
247 0.19
248 0.2
249 0.19
250 0.2
251 0.2
252 0.18
253 0.16
254 0.12
255 0.12
256 0.1
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.12
264 0.14
265 0.17
266 0.18
267 0.21
268 0.2
269 0.21
270 0.25
271 0.28
272 0.26
273 0.25
274 0.26
275 0.27
276 0.28
277 0.26
278 0.24
279 0.18
280 0.19
281 0.21
282 0.23
283 0.22
284 0.28
285 0.34
286 0.39
287 0.45
288 0.5
289 0.52
290 0.51
291 0.5
292 0.49
293 0.49
294 0.45
295 0.39
296 0.34
297 0.31
298 0.28
299 0.28
300 0.2
301 0.14
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.06
312 0.09
313 0.11
314 0.15
315 0.17
316 0.18
317 0.22
318 0.25
319 0.32
320 0.36
321 0.42
322 0.41
323 0.46
324 0.46
325 0.44
326 0.4
327 0.32
328 0.27
329 0.19
330 0.17
331 0.11
332 0.12
333 0.11
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.14
339 0.16
340 0.17
341 0.21
342 0.22
343 0.22
344 0.29
345 0.38
346 0.45
347 0.49
348 0.52
349 0.55
350 0.61
351 0.67
352 0.69
353 0.7
354 0.65
355 0.62
356 0.59
357 0.56
358 0.54
359 0.51
360 0.47
361 0.41
362 0.38
363 0.39
364 0.4
365 0.37
366 0.36
367 0.4
368 0.38
369 0.44
370 0.47
371 0.43
372 0.45
373 0.52
374 0.48
375 0.44
376 0.43
377 0.33
378 0.3
379 0.29
380 0.26
381 0.2
382 0.18
383 0.17
384 0.18
385 0.18
386 0.19
387 0.18
388 0.18
389 0.19
390 0.24
391 0.27
392 0.25
393 0.25
394 0.27
395 0.29
396 0.28
397 0.25
398 0.2
399 0.16
400 0.15
401 0.15
402 0.12
403 0.11
404 0.12
405 0.13
406 0.12
407 0.1
408 0.09
409 0.11
410 0.12
411 0.1
412 0.12
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.07
419 0.09
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.14
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.14
444 0.2
445 0.25
446 0.26
447 0.26
448 0.27
449 0.28
450 0.28
451 0.26
452 0.28
453 0.28
454 0.28
455 0.29
456 0.29
457 0.29
458 0.28
459 0.26
460 0.2
461 0.15
462 0.12
463 0.1
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.14
468 0.18
469 0.26
470 0.3
471 0.38
472 0.41
473 0.5
474 0.55
475 0.63
476 0.61
477 0.63
478 0.61
479 0.58
480 0.54
481 0.45
482 0.38
483 0.29
484 0.25
485 0.16
486 0.16
487 0.09
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.1
492 0.11
493 0.13
494 0.16
495 0.21
496 0.25
497 0.27
498 0.35
499 0.4
500 0.43
501 0.49
502 0.51
503 0.56
504 0.63
505 0.63
506 0.59
507 0.54
508 0.49
509 0.43
510 0.37
511 0.29
512 0.22
513 0.21
514 0.2
515 0.19
516 0.19
517 0.18
518 0.17
519 0.16
520 0.12
521 0.08
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.08
541 0.09
542 0.14
543 0.21
544 0.26
545 0.31
546 0.35
547 0.37
548 0.41
549 0.45
550 0.46
551 0.47
552 0.49
553 0.46
554 0.42
555 0.44
556 0.39
557 0.34
558 0.27
559 0.19
560 0.12
561 0.1
562 0.1
563 0.06
564 0.08
565 0.11
566 0.13
567 0.16
568 0.16
569 0.16
570 0.16
571 0.19
572 0.19
573 0.17
574 0.16
575 0.14
576 0.15
577 0.14
578 0.14
579 0.1
580 0.08
581 0.07
582 0.06
583 0.05
584 0.04
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.06
592 0.07
593 0.08
594 0.07
595 0.08
596 0.09
597 0.09
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.09
603 0.1
604 0.09
605 0.1
606 0.08
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.06
612 0.06
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.04
619 0.05
620 0.06
621 0.09
622 0.1
623 0.1
624 0.11
625 0.11
626 0.13
627 0.15
628 0.18
629 0.21
630 0.25
631 0.27
632 0.32
633 0.32
634 0.35
635 0.34
636 0.32
637 0.31
638 0.26
639 0.27
640 0.24
641 0.27
642 0.23
643 0.27
644 0.3
645 0.28
646 0.31
647 0.32
648 0.36
649 0.33
650 0.33
651 0.28
652 0.23
653 0.23
654 0.2
655 0.16
656 0.11
657 0.1
658 0.09
659 0.09
660 0.09
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.1
665 0.13
666 0.14
667 0.15
668 0.22
669 0.24
670 0.24
671 0.34
672 0.34
673 0.36
674 0.4
675 0.41
676 0.35
677 0.34
678 0.35
679 0.26
680 0.26
681 0.24
682 0.24
683 0.22
684 0.21
685 0.18
686 0.16
687 0.13
688 0.13
689 0.1
690 0.07
691 0.06
692 0.07
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.05
705 0.04
706 0.05
707 0.05
708 0.07
709 0.07
710 0.09
711 0.12
712 0.12
713 0.14
714 0.13
715 0.15
716 0.14
717 0.14
718 0.16
719 0.13
720 0.14
721 0.13
722 0.13
723 0.12
724 0.11
725 0.09
726 0.06
727 0.06
728 0.05
729 0.04
730 0.05
731 0.05
732 0.05
733 0.05
734 0.07
735 0.07
736 0.12
737 0.13
738 0.2
739 0.25
740 0.35
741 0.39
742 0.41
743 0.43
744 0.44
745 0.45
746 0.41
747 0.41
748 0.34
749 0.32
750 0.32
751 0.32
752 0.31
753 0.28
754 0.27
755 0.23
756 0.22
757 0.22
758 0.19
759 0.17
760 0.15
761 0.15
762 0.14
763 0.13
764 0.11
765 0.12
766 0.14
767 0.14
768 0.13
769 0.13
770 0.12
771 0.13
772 0.14
773 0.15
774 0.17
775 0.19
776 0.23
777 0.25
778 0.28
779 0.28
780 0.32
781 0.35
782 0.34
783 0.34
784 0.33
785 0.32
786 0.32
787 0.33
788 0.31
789 0.29
790 0.27
791 0.28
792 0.32
793 0.34
794 0.34
795 0.35
796 0.4
797 0.39
798 0.4
799 0.37
800 0.31
801 0.28
802 0.29
803 0.26
804 0.23
805 0.23
806 0.24
807 0.22
808 0.21
809 0.2
810 0.17
811 0.18
812 0.14
813 0.12
814 0.09
815 0.11
816 0.11
817 0.12
818 0.19
819 0.26
820 0.28
821 0.29
822 0.3
823 0.29
824 0.32
825 0.39
826 0.36
827 0.29
828 0.27
829 0.28
830 0.27
831 0.26
832 0.24
833 0.16
834 0.15
835 0.12
836 0.16
837 0.14
838 0.14
839 0.14
840 0.15
841 0.15
842 0.14
843 0.17
844 0.18
845 0.2
846 0.23
847 0.24
848 0.25
849 0.28
850 0.32
851 0.37
852 0.4
853 0.43
854 0.46
855 0.46
856 0.51
857 0.53
858 0.56
859 0.56
860 0.57
861 0.55
862 0.53
863 0.52
864 0.46
865 0.42
866 0.33
867 0.25
868 0.17
869 0.13
870 0.08
871 0.07
872 0.06
873 0.06
874 0.07
875 0.06
876 0.06