Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A286UMB6

Protein Details
Accession A0A286UMB6    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-141EEKEKDRSEKRFKRRFGRRGTKAVPBasic
161-189EAGGENKPKKKKKSTFKKYKKQNREAGAEBasic
202-228GGEGEKKKSPRPKRVPRPRRNAGEEPTBasic
261-282VSSARVVRRRWGHPRKSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-138RAKPLEEKEKDRSEKRFKRRFGRRGTK
166-185NKPKKKKKSTFKKYKKQNRE
204-222EGEKKKSPRPKRVPRPRRN
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTDAPASQGQAEAAQPVTQKVDEMPGIKIFVGNLDYSVTNDDLRKFFNVVESDILAHEVIQRRFYKSPTGFRSAGYGFVAVKTDDAAQKAIDALNGTEFKVGEKSRAAIVERAKPLEEKEKDRSEKRFKRRFGRRGTKAVPGEVTEAEANGETEKPAADTEAGGENKPKKKKKSTFKKYKKQNREAGAEAAATGEGAEATSGGEGEKKKSPRPKRVPRPRRNAGEEPTGEQSKTTLFVANLPFSLDDEGLSALFTEAGFSVSSARVVRRRWGHPRKSKGYGFVELEDETQQQAAMTALQNKEIGTGKEARQIAIKVAVNLPAEETEEGEEKAPVAEGGAEEVAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.17
5 0.15
6 0.16
7 0.15
8 0.19
9 0.2
10 0.21
11 0.22
12 0.21
13 0.22
14 0.22
15 0.21
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.12
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.15
25 0.14
26 0.14
27 0.17
28 0.2
29 0.19
30 0.22
31 0.23
32 0.22
33 0.21
34 0.25
35 0.25
36 0.23
37 0.23
38 0.22
39 0.2
40 0.19
41 0.2
42 0.13
43 0.11
44 0.14
45 0.19
46 0.2
47 0.25
48 0.27
49 0.32
50 0.34
51 0.36
52 0.41
53 0.41
54 0.5
55 0.49
56 0.54
57 0.5
58 0.48
59 0.51
60 0.42
61 0.37
62 0.28
63 0.23
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.2
94 0.21
95 0.2
96 0.24
97 0.29
98 0.3
99 0.3
100 0.29
101 0.27
102 0.29
103 0.34
104 0.34
105 0.32
106 0.37
107 0.45
108 0.51
109 0.55
110 0.62
111 0.63
112 0.69
113 0.74
114 0.76
115 0.74
116 0.79
117 0.85
118 0.84
119 0.84
120 0.85
121 0.81
122 0.81
123 0.77
124 0.75
125 0.65
126 0.58
127 0.47
128 0.38
129 0.32
130 0.23
131 0.21
132 0.12
133 0.11
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.15
152 0.2
153 0.27
154 0.35
155 0.41
156 0.43
157 0.53
158 0.63
159 0.7
160 0.76
161 0.81
162 0.84
163 0.88
164 0.91
165 0.91
166 0.93
167 0.93
168 0.91
169 0.87
170 0.82
171 0.76
172 0.68
173 0.59
174 0.49
175 0.38
176 0.28
177 0.2
178 0.14
179 0.08
180 0.06
181 0.04
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.03
190 0.06
191 0.07
192 0.1
193 0.16
194 0.19
195 0.25
196 0.35
197 0.45
198 0.53
199 0.64
200 0.72
201 0.78
202 0.87
203 0.92
204 0.93
205 0.94
206 0.92
207 0.89
208 0.86
209 0.82
210 0.74
211 0.71
212 0.62
213 0.55
214 0.5
215 0.43
216 0.34
217 0.27
218 0.23
219 0.15
220 0.15
221 0.13
222 0.11
223 0.1
224 0.14
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.16
229 0.15
230 0.14
231 0.15
232 0.11
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.1
250 0.1
251 0.14
252 0.19
253 0.21
254 0.29
255 0.35
256 0.43
257 0.52
258 0.62
259 0.69
260 0.74
261 0.82
262 0.83
263 0.84
264 0.79
265 0.76
266 0.71
267 0.67
268 0.59
269 0.51
270 0.45
271 0.37
272 0.35
273 0.27
274 0.22
275 0.16
276 0.13
277 0.11
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.16
284 0.16
285 0.18
286 0.19
287 0.18
288 0.21
289 0.23
290 0.21
291 0.19
292 0.25
293 0.25
294 0.32
295 0.32
296 0.3
297 0.31
298 0.31
299 0.29
300 0.31
301 0.31
302 0.26
303 0.27
304 0.31
305 0.28
306 0.27
307 0.26
308 0.19
309 0.2
310 0.17
311 0.17
312 0.14
313 0.15
314 0.16
315 0.15
316 0.15
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.1
325 0.09