Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BYK4

Protein Details
Accession G8BYK4    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-123GVAPRAKMNQQRARRFRSARDHydrophilic
398-424LQEVRKKESMERKKQQRIDRKNISKGQHydrophilic
1092-1113GYNNKRNENSNRDRPNQNQRRYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
408-412ERKKQ
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 12, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG tpf:TPHA_0J01240  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVLEETPQIVDGVALPIDYSSENPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENRPPPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKFENEAREEILKDKEAAGQVIDEAVKQKKTWDSNAITPGTPFMDKLAAALRYWTAFKLSTDPGWKNLQVIISDATVPGEGEHKLMNFIRAQRADPEYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQGSKPKKHNFKDGLDMTEEEKQLITKEDSQKPFLWLHINVLREYLSAELWVPRLSFPFDIERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPCLDVRENSIDILLDIWKRILPNLKTYMTCDGELNLESVELLLSQLGSREADIFKTRHLQEVRKKESMERKKQQRIDRKNISKGQDRHPTNVTEQLQLYDTSGALAAGSWNLTTSDMVRLKKELMLANEGDKDAIAIVKAQNELNNKLEKDIKEQGVEKIIDEANKANLSAAELIRKKINARKHTLETEQETENDTSKKIKTDENSKTTDTLDDEIKNEIISEILDEEAEEEEEEENMEENVKNEIEQNNKQEHLLSAISNVPSANINSDTVSGVIDTDDYVKLYEPGFRERYYASKFNVDEHDIDQLKKDVVRYYIEGVSWVLLYYYQGCASWNWYYPYHYAPFAADFTNLTDISIKFDLGEPFLPFEQLMSVMPAASGHTLPEIFRPLMSDPKSEIIDFYPEQFPIDMNGKKMSWQGIALLPFIDETRLLKAVRSKYEFLSDQEKSRNVRKKAILVISNKNANYDQFVKDMYTEKVDAEKEFFFSHFKSGLSGFVSKDTEGFELNSKLLCPIETDDLPTISTNLFLKMGYRLLPLPSNNKSLLLNGFIPSTPMLSQYDIDSIKSRQNRNFYRNTRNFGDEMKENKVPSGPSGTTQYKPRMGGYKSYFHFEEQGNRAPQMNTGYIGYNNNYADSYNNDNRHYNNNDYNNNNNYNNNYNNYNNNDYNNNNNNYNNYNNYNNYNNNYNRNYNNHQNNSQSSNRYDKGNYGQFQNNNYGGRFNPQNYRGNNNGNYGNSGNNSQRGGYDNRRYGGGYNNKRNENSNRDRPNQNQRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.64
3 0.68
4 0.69
5 0.62
6 0.58
7 0.57
8 0.54
9 0.46
10 0.41
11 0.34
12 0.3
13 0.26
14 0.19
15 0.13
16 0.1
17 0.1
18 0.12
19 0.1
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.12
27 0.15
28 0.16
29 0.17
30 0.18
31 0.18
32 0.19
33 0.18
34 0.14
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.19
49 0.23
50 0.28
51 0.38
52 0.48
53 0.53
54 0.58
55 0.58
56 0.58
57 0.6
58 0.58
59 0.49
60 0.42
61 0.36
62 0.31
63 0.27
64 0.21
65 0.14
66 0.1
67 0.09
68 0.06
69 0.08
70 0.09
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.2
76 0.31
77 0.37
78 0.41
79 0.4
80 0.42
81 0.44
82 0.45
83 0.42
84 0.34
85 0.3
86 0.27
87 0.25
88 0.24
89 0.21
90 0.21
91 0.18
92 0.15
93 0.1
94 0.13
95 0.19
96 0.26
97 0.37
98 0.45
99 0.55
100 0.65
101 0.74
102 0.79
103 0.82
104 0.8
105 0.78
106 0.79
107 0.8
108 0.76
109 0.76
110 0.71
111 0.64
112 0.67
113 0.63
114 0.56
115 0.5
116 0.43
117 0.37
118 0.35
119 0.34
120 0.28
121 0.28
122 0.25
123 0.22
124 0.22
125 0.24
126 0.23
127 0.22
128 0.19
129 0.16
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.1
134 0.13
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.22
139 0.28
140 0.34
141 0.39
142 0.44
143 0.45
144 0.5
145 0.57
146 0.54
147 0.47
148 0.41
149 0.37
150 0.3
151 0.26
152 0.19
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.17
158 0.16
159 0.15
160 0.17
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.17
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.19
169 0.21
170 0.24
171 0.3
172 0.31
173 0.33
174 0.37
175 0.36
176 0.32
177 0.32
178 0.29
179 0.22
180 0.23
181 0.2
182 0.16
183 0.16
184 0.14
185 0.13
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.13
195 0.14
196 0.17
197 0.18
198 0.22
199 0.29
200 0.29
201 0.31
202 0.32
203 0.37
204 0.38
205 0.36
206 0.42
207 0.37
208 0.38
209 0.38
210 0.34
211 0.34
212 0.31
213 0.29
214 0.2
215 0.2
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.04
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.12
234 0.15
235 0.15
236 0.19
237 0.22
238 0.24
239 0.26
240 0.27
241 0.27
242 0.28
243 0.27
244 0.24
245 0.26
246 0.3
247 0.32
248 0.37
249 0.43
250 0.5
251 0.54
252 0.64
253 0.65
254 0.63
255 0.67
256 0.64
257 0.59
258 0.51
259 0.47
260 0.38
261 0.36
262 0.32
263 0.22
264 0.19
265 0.16
266 0.15
267 0.17
268 0.18
269 0.2
270 0.29
271 0.37
272 0.4
273 0.44
274 0.45
275 0.45
276 0.43
277 0.38
278 0.34
279 0.26
280 0.29
281 0.29
282 0.29
283 0.25
284 0.25
285 0.23
286 0.18
287 0.18
288 0.12
289 0.08
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.18
305 0.18
306 0.16
307 0.17
308 0.15
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.19
330 0.18
331 0.18
332 0.21
333 0.21
334 0.2
335 0.2
336 0.15
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.12
346 0.19
347 0.18
348 0.25
349 0.3
350 0.32
351 0.32
352 0.34
353 0.38
354 0.32
355 0.31
356 0.25
357 0.2
358 0.19
359 0.18
360 0.16
361 0.1
362 0.08
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.07
376 0.08
377 0.1
378 0.14
379 0.14
380 0.15
381 0.22
382 0.22
383 0.28
384 0.31
385 0.37
386 0.42
387 0.53
388 0.58
389 0.55
390 0.55
391 0.55
392 0.62
393 0.64
394 0.66
395 0.66
396 0.69
397 0.74
398 0.81
399 0.84
400 0.84
401 0.83
402 0.83
403 0.84
404 0.81
405 0.81
406 0.79
407 0.76
408 0.74
409 0.69
410 0.67
411 0.66
412 0.6
413 0.55
414 0.52
415 0.49
416 0.41
417 0.45
418 0.38
419 0.3
420 0.28
421 0.25
422 0.23
423 0.21
424 0.2
425 0.12
426 0.1
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.13
442 0.17
443 0.18
444 0.19
445 0.19
446 0.2
447 0.21
448 0.24
449 0.2
450 0.17
451 0.2
452 0.19
453 0.2
454 0.2
455 0.19
456 0.15
457 0.12
458 0.1
459 0.07
460 0.06
461 0.04
462 0.05
463 0.05
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.12
468 0.15
469 0.17
470 0.19
471 0.22
472 0.21
473 0.21
474 0.26
475 0.23
476 0.27
477 0.3
478 0.29
479 0.27
480 0.29
481 0.28
482 0.28
483 0.27
484 0.21
485 0.18
486 0.17
487 0.15
488 0.15
489 0.14
490 0.12
491 0.12
492 0.11
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.1
497 0.09
498 0.14
499 0.14
500 0.16
501 0.17
502 0.18
503 0.2
504 0.23
505 0.31
506 0.32
507 0.38
508 0.42
509 0.46
510 0.49
511 0.49
512 0.47
513 0.43
514 0.38
515 0.32
516 0.27
517 0.25
518 0.22
519 0.21
520 0.17
521 0.14
522 0.14
523 0.14
524 0.17
525 0.16
526 0.19
527 0.21
528 0.3
529 0.38
530 0.4
531 0.42
532 0.4
533 0.39
534 0.36
535 0.34
536 0.25
537 0.18
538 0.16
539 0.13
540 0.13
541 0.13
542 0.12
543 0.11
544 0.1
545 0.08
546 0.06
547 0.05
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.03
552 0.03
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.07
568 0.06
569 0.07
570 0.09
571 0.12
572 0.17
573 0.2
574 0.24
575 0.25
576 0.25
577 0.25
578 0.24
579 0.21
580 0.18
581 0.15
582 0.11
583 0.1
584 0.12
585 0.11
586 0.11
587 0.11
588 0.08
589 0.08
590 0.08
591 0.09
592 0.07
593 0.08
594 0.08
595 0.09
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.06
608 0.06
609 0.07
610 0.07
611 0.1
612 0.11
613 0.16
614 0.18
615 0.19
616 0.2
617 0.2
618 0.25
619 0.27
620 0.3
621 0.26
622 0.29
623 0.29
624 0.31
625 0.32
626 0.29
627 0.25
628 0.21
629 0.26
630 0.21
631 0.21
632 0.19
633 0.17
634 0.16
635 0.16
636 0.16
637 0.12
638 0.13
639 0.15
640 0.16
641 0.18
642 0.18
643 0.17
644 0.17
645 0.14
646 0.13
647 0.1
648 0.09
649 0.05
650 0.04
651 0.05
652 0.05
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.07
657 0.07
658 0.11
659 0.12
660 0.14
661 0.16
662 0.17
663 0.19
664 0.2
665 0.23
666 0.21
667 0.2
668 0.18
669 0.15
670 0.16
671 0.15
672 0.14
673 0.11
674 0.09
675 0.1
676 0.12
677 0.11
678 0.1
679 0.11
680 0.11
681 0.14
682 0.14
683 0.13
684 0.11
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.14
689 0.11
690 0.12
691 0.12
692 0.12
693 0.09
694 0.09
695 0.08
696 0.07
697 0.07
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.05
707 0.06
708 0.06
709 0.07
710 0.09
711 0.11
712 0.1
713 0.1
714 0.12
715 0.13
716 0.2
717 0.22
718 0.22
719 0.2
720 0.23
721 0.24
722 0.22
723 0.22
724 0.15
725 0.18
726 0.17
727 0.18
728 0.17
729 0.16
730 0.16
731 0.16
732 0.14
733 0.13
734 0.19
735 0.17
736 0.17
737 0.19
738 0.19
739 0.2
740 0.22
741 0.21
742 0.16
743 0.15
744 0.15
745 0.16
746 0.17
747 0.16
748 0.14
749 0.12
750 0.11
751 0.11
752 0.09
753 0.06
754 0.06
755 0.09
756 0.11
757 0.11
758 0.13
759 0.2
760 0.25
761 0.32
762 0.36
763 0.35
764 0.34
765 0.4
766 0.4
767 0.36
768 0.38
769 0.33
770 0.32
771 0.35
772 0.37
773 0.35
774 0.43
775 0.49
776 0.45
777 0.52
778 0.52
779 0.53
780 0.56
781 0.6
782 0.57
783 0.54
784 0.57
785 0.55
786 0.56
787 0.5
788 0.44
789 0.38
790 0.32
791 0.31
792 0.27
793 0.24
794 0.19
795 0.2
796 0.18
797 0.19
798 0.21
799 0.18
800 0.17
801 0.16
802 0.16
803 0.19
804 0.2
805 0.19
806 0.19
807 0.18
808 0.17
809 0.17
810 0.18
811 0.16
812 0.16
813 0.18
814 0.16
815 0.16
816 0.16
817 0.15
818 0.17
819 0.17
820 0.18
821 0.16
822 0.18
823 0.19
824 0.17
825 0.17
826 0.17
827 0.15
828 0.14
829 0.14
830 0.14
831 0.14
832 0.15
833 0.14
834 0.13
835 0.13
836 0.13
837 0.11
838 0.1
839 0.11
840 0.16
841 0.16
842 0.18
843 0.19
844 0.19
845 0.19
846 0.17
847 0.16
848 0.11
849 0.12
850 0.1
851 0.1
852 0.1
853 0.1
854 0.11
855 0.12
856 0.14
857 0.13
858 0.14
859 0.14
860 0.16
861 0.21
862 0.23
863 0.28
864 0.3
865 0.33
866 0.32
867 0.32
868 0.3
869 0.28
870 0.27
871 0.23
872 0.21
873 0.18
874 0.18
875 0.16
876 0.17
877 0.15
878 0.14
879 0.11
880 0.12
881 0.13
882 0.13
883 0.14
884 0.14
885 0.19
886 0.17
887 0.19
888 0.2
889 0.2
890 0.26
891 0.33
892 0.38
893 0.39
894 0.49
895 0.57
896 0.61
897 0.7
898 0.71
899 0.75
900 0.76
901 0.76
902 0.7
903 0.65
904 0.59
905 0.51
906 0.48
907 0.43
908 0.4
909 0.39
910 0.38
911 0.35
912 0.35
913 0.34
914 0.3
915 0.26
916 0.29
917 0.23
918 0.22
919 0.3
920 0.33
921 0.34
922 0.39
923 0.43
924 0.41
925 0.42
926 0.44
927 0.44
928 0.43
929 0.48
930 0.47
931 0.5
932 0.46
933 0.49
934 0.46
935 0.39
936 0.42
937 0.35
938 0.38
939 0.35
940 0.41
941 0.39
942 0.39
943 0.4
944 0.36
945 0.36
946 0.32
947 0.28
948 0.21
949 0.2
950 0.21
951 0.21
952 0.23
953 0.22
954 0.22
955 0.2
956 0.2
957 0.19
958 0.17
959 0.17
960 0.18
961 0.25
962 0.29
963 0.33
964 0.35
965 0.38
966 0.4
967 0.47
968 0.49
969 0.48
970 0.49
971 0.53
972 0.56
973 0.58
974 0.63
975 0.62
976 0.62
977 0.57
978 0.51
979 0.47
980 0.47
981 0.47
982 0.43
983 0.41
984 0.39
985 0.43
986 0.46
987 0.49
988 0.45
989 0.44
990 0.45
991 0.43
992 0.49
993 0.51
994 0.48
995 0.45
996 0.44
997 0.45
998 0.45
999 0.46
1000 0.42
1001 0.39
1002 0.4
1003 0.4
1004 0.43
1005 0.45
1006 0.46
1007 0.45
1008 0.48
1009 0.49
1010 0.52
1011 0.54
1012 0.56
1013 0.55
1014 0.58
1015 0.62
1016 0.63
1017 0.68
1018 0.67
1019 0.67
1020 0.67
1021 0.66
1022 0.65
1023 0.64
1024 0.59
1025 0.53
1026 0.54
1027 0.51
1028 0.49
1029 0.46
1030 0.45
1031 0.48
1032 0.52
1033 0.49
1034 0.47
1035 0.53
1036 0.52
1037 0.55
1038 0.55
1039 0.5
1040 0.44
1041 0.42
1042 0.39
1043 0.32
1044 0.34
1045 0.36
1046 0.34
1047 0.39
1048 0.43
1049 0.5
1050 0.51
1051 0.58
1052 0.58
1053 0.6
1054 0.6
1055 0.56
1056 0.54
1057 0.47
1058 0.48
1059 0.42
1060 0.39
1061 0.32
1062 0.33
1063 0.32
1064 0.31
1065 0.31
1066 0.27
1067 0.27
1068 0.29
1069 0.34
1070 0.39
1071 0.45
1072 0.48
1073 0.48
1074 0.49
1075 0.48
1076 0.46
1077 0.48
1078 0.49
1079 0.5
1080 0.54
1081 0.61
1082 0.66
1083 0.67
1084 0.72
1085 0.72
1086 0.71
1087 0.71
1088 0.71
1089 0.72
1090 0.73
1091 0.8
1092 0.81
1093 0.83