Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A286UHS4

Protein Details
Accession A0A286UHS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-55LYDNSRSKKGKGKASDKRKSRKGKSKASEAYAWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-48RSKKGKGKASDKRKSRKGKSK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04056  Ssl1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50234  VWFA  
CDD cd01453  vWA_transcription_factor_IIH_type  
Amino Acid Sequences MPPRRIEVESGSEDDFVSDNDDLYDNSRSKKGKGKASDKRKSRKGKSKASEAYAWEATYTRSWDTVREDESGSLQGAVDELIARGRRRRLLFPSTAIRRTIIRHMVVILDLSASMLDRDMRPTRFDLTLEYTRAFVTEWFDQNPLGQIAIIGMRSGIAERLGEMSGSPQDVLKSIQERHRLEPAGEPSIQNAVEMARSSMSHLPSHSSREIVLIYGSLTSVDPGNIHDTLAACIKDKIRISVIALAAEMKICREMCDKTGGQFGVALNEGHFRDILFELIPPPAQRTHNRIPGIGNSTAPSASTNPSADLMLMGFPTRVPATSAPALCVCHAALRSAGFICPRCSARLCDVPTDCDVCGLMVVSAPHLARSYHHLFPVKPYQAVTDIGTASPASDCHGCAAPFSKTVSAKVDRTLQIRKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.22
3 0.15
4 0.15
5 0.12
6 0.11
7 0.12
8 0.13
9 0.12
10 0.15
11 0.21
12 0.2
13 0.23
14 0.3
15 0.31
16 0.35
17 0.44
18 0.49
19 0.52
20 0.6
21 0.68
22 0.72
23 0.81
24 0.86
25 0.87
26 0.89
27 0.9
28 0.9
29 0.9
30 0.9
31 0.89
32 0.91
33 0.89
34 0.89
35 0.87
36 0.81
37 0.76
38 0.68
39 0.64
40 0.55
41 0.46
42 0.36
43 0.29
44 0.25
45 0.21
46 0.21
47 0.16
48 0.17
49 0.18
50 0.21
51 0.27
52 0.3
53 0.3
54 0.3
55 0.3
56 0.27
57 0.29
58 0.26
59 0.2
60 0.15
61 0.13
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.05
67 0.05
68 0.09
69 0.12
70 0.14
71 0.2
72 0.25
73 0.32
74 0.36
75 0.42
76 0.46
77 0.51
78 0.54
79 0.54
80 0.59
81 0.59
82 0.58
83 0.52
84 0.46
85 0.4
86 0.39
87 0.41
88 0.37
89 0.31
90 0.29
91 0.28
92 0.27
93 0.25
94 0.22
95 0.14
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.06
104 0.06
105 0.12
106 0.17
107 0.19
108 0.21
109 0.23
110 0.26
111 0.26
112 0.26
113 0.24
114 0.26
115 0.29
116 0.28
117 0.27
118 0.24
119 0.22
120 0.22
121 0.19
122 0.13
123 0.12
124 0.15
125 0.17
126 0.17
127 0.18
128 0.18
129 0.18
130 0.19
131 0.15
132 0.1
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.1
160 0.13
161 0.16
162 0.22
163 0.3
164 0.33
165 0.35
166 0.4
167 0.38
168 0.35
169 0.37
170 0.34
171 0.29
172 0.27
173 0.24
174 0.19
175 0.21
176 0.2
177 0.14
178 0.11
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.08
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.16
191 0.17
192 0.21
193 0.19
194 0.17
195 0.15
196 0.16
197 0.15
198 0.12
199 0.11
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.11
221 0.12
222 0.16
223 0.16
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.17
228 0.2
229 0.2
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.12
235 0.1
236 0.05
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.11
241 0.13
242 0.14
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.24
247 0.22
248 0.19
249 0.2
250 0.18
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.09
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.09
269 0.11
270 0.14
271 0.18
272 0.22
273 0.3
274 0.37
275 0.44
276 0.45
277 0.44
278 0.42
279 0.43
280 0.44
281 0.36
282 0.29
283 0.22
284 0.22
285 0.2
286 0.18
287 0.14
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.13
296 0.11
297 0.1
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.1
307 0.11
308 0.16
309 0.21
310 0.22
311 0.22
312 0.23
313 0.24
314 0.21
315 0.22
316 0.16
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.16
326 0.18
327 0.2
328 0.23
329 0.24
330 0.26
331 0.28
332 0.3
333 0.33
334 0.4
335 0.39
336 0.43
337 0.43
338 0.43
339 0.43
340 0.41
341 0.34
342 0.26
343 0.24
344 0.16
345 0.14
346 0.11
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.2
358 0.25
359 0.25
360 0.32
361 0.35
362 0.35
363 0.42
364 0.51
365 0.47
366 0.43
367 0.4
368 0.37
369 0.36
370 0.37
371 0.31
372 0.25
373 0.22
374 0.2
375 0.2
376 0.17
377 0.15
378 0.13
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.14
384 0.18
385 0.17
386 0.19
387 0.23
388 0.23
389 0.24
390 0.26
391 0.3
392 0.28
393 0.31
394 0.36
395 0.39
396 0.38
397 0.41
398 0.46
399 0.45
400 0.49