FuNGI

G8C155

Protein Details

Accession

G8C155

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
325-352	PDFSKTKKVSGSKKRKDRHKKGAMSDIS	Basic
443-471	DEVSKGKLSMRRKREQKKNQNQKPNGLAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
330-346	TKKVSGSKKRKDRHKKG
430-460	KKSAERDRLKEAADEVSKGKLSMRRKREQKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	tpf:TPHA_0N01020 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MSKKFDKKSSQRYVVVHRPHDDPHFYDEDASKHILVPVTNPNERHGKGKGVDVSALPSLMGASKKKPSVDLANDHVGEAALYGITFDDSKYDYTQHLKPIGLDPANSVFIPSKDEAKEVPKKNIEDLFVEPSYRSTSDVAPVAVFQRGVATQEYLKHQEDAANEISGFRPDLDPSLREILEALDDEAYVVNEDVDVTEAIKKKGADAKKLEQQLAVEQDDDFFSELLAGGEAEDEEDVANEWDIDAEMNAYEDEHYQAELAQFDDINNLEDLQEMHYQADVMRFQKDRKHNEDLSGDELSQDDLESVDPQDEVEEEDGDFVGALPDFSKTKKVSGSKKRKDRHKKGAMSDISGFSMSSSAIARTEVMTVLDDHYDTIITGYDNYEEEQELDEEETTQPFDMEAERGDFESMLDDFLDNYELDNSGRKLVKKSAERDRLKEAADEVSKGKLSMRRKREQKKNQNQKPNGLAGLSNSLNGLHL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.78
3	0.74
4	0.66
5	0.61
6	0.59
7	0.59
8	0.55
9	0.48
10	0.45
11	0.42
12	0.39
13	0.39
14	0.37
15	0.33
16	0.31
17	0.31
18	0.24
19	0.21
20	0.24
21	0.22
22	0.19
23	0.22
24	0.27
25	0.32
26	0.36
27	0.36
28	0.38
29	0.44
30	0.45
31	0.46
32	0.39
33	0.4
34	0.37
35	0.44
36	0.45
37	0.39
38	0.4
39	0.35
40	0.35
41	0.28
42	0.26
43	0.18
44	0.13
45	0.11
46	0.12
47	0.15
48	0.14
49	0.18
50	0.25
51	0.29
52	0.3
53	0.32
54	0.35
55	0.41
56	0.46
57	0.47
58	0.47
59	0.5
60	0.49
61	0.46
62	0.41
63	0.31
64	0.23
65	0.17
66	0.11
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.04
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.06
75	0.08
76	0.1
77	0.12
78	0.13
79	0.16
80	0.21
81	0.25
82	0.29
83	0.31
84	0.29
85	0.3
86	0.32
87	0.36
88	0.32
89	0.28
90	0.25
91	0.25
92	0.26
93	0.24
94	0.21
95	0.16
96	0.15
97	0.19
98	0.18
99	0.2
100	0.19
101	0.21
102	0.22
103	0.29
104	0.38
105	0.38
106	0.45
107	0.46
108	0.47
109	0.5
110	0.52
111	0.45
112	0.39
113	0.37
114	0.35
115	0.29
116	0.28
117	0.23
118	0.21
119	0.22
120	0.19
121	0.18
122	0.14
123	0.14
124	0.17
125	0.18
126	0.17
127	0.14
128	0.14
129	0.14
130	0.13
131	0.12
132	0.08
133	0.09
134	0.08
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.11
139	0.15
140	0.19
141	0.22
142	0.22
143	0.22
144	0.21
145	0.23
146	0.22
147	0.23
148	0.2
149	0.16
150	0.15
151	0.15
152	0.15
153	0.12
154	0.12
155	0.09
156	0.08
157	0.07
158	0.11
159	0.12
160	0.12
161	0.15
162	0.18
163	0.17
164	0.16
165	0.16
166	0.14
167	0.13
168	0.12
169	0.1
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.05
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.03
179	0.04
180	0.03
181	0.04
182	0.04
183	0.05
184	0.09
185	0.11
186	0.11
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.22
191	0.25
192	0.29
193	0.33
194	0.38
195	0.42
196	0.45
197	0.43
198	0.37
199	0.34
200	0.3
201	0.27
202	0.22
203	0.16
204	0.13
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.09
209	0.05
210	0.05
211	0.04
212	0.05
213	0.04
214	0.04
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.02
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.06
253	0.07
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.1
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.11
267	0.11
268	0.1
269	0.14
270	0.15
271	0.17
272	0.25
273	0.33
274	0.39
275	0.43
276	0.5
277	0.48
278	0.51
279	0.52
280	0.46
281	0.41
282	0.34
283	0.27
284	0.19
285	0.18
286	0.13
287	0.11
288	0.09
289	0.05
290	0.04
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.07
314	0.08
315	0.14
316	0.14
317	0.17
318	0.24
319	0.32
320	0.41
321	0.51
322	0.62
323	0.67
324	0.76
325	0.82
326	0.86
327	0.9
328	0.9
329	0.9
330	0.89
331	0.87
332	0.84
333	0.85
334	0.76
335	0.69
336	0.61
337	0.51
338	0.41
339	0.32
340	0.26
341	0.16
342	0.14
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.1
383	0.1
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.12
395	0.11
396	0.12
397	0.11
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.1
404	0.07
405	0.08
406	0.08
407	0.09
408	0.1
409	0.14
410	0.15
411	0.2
412	0.24
413	0.26
414	0.3
415	0.36
416	0.45
417	0.49
418	0.56
419	0.61
420	0.68
421	0.72
422	0.72
423	0.72
424	0.68
425	0.61
426	0.55
427	0.46
428	0.43
429	0.39
430	0.36
431	0.3
432	0.29
433	0.28
434	0.26
435	0.29
436	0.27
437	0.35
438	0.43
439	0.51
440	0.58
441	0.68
442	0.79
443	0.85
444	0.9
445	0.92
446	0.93
447	0.95
448	0.95
449	0.95
450	0.92
451	0.9
452	0.86
453	0.8
454	0.71
455	0.6
456	0.51
457	0.42
458	0.41
459	0.32
460	0.25
461	0.2

G8C155

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer